These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9244#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 1353 fasta sequence [AGAACTCCACGGTAGGAACTCTCCCAAAAGAATGGATCATGCCCACGGTTCTCATCCTTCACCGGCAGATGCTAGTATGCAGTCGAGTGATCATTCCATGGATATGAAAATGTATTTCAATACTGATATGCATTATACATTGCTTTTTTCATCCTGGATTATTGATACAGTTGGAAAAGCGATTGTAGCATGTCTTGGCTCTTTCATACTCGCTATCATATATGAGGCCCTAGAAACATTACGACATAAATTGCTTTTACGGGCAGCATGTAACAATCAGTGTGAACGTGCTGGAAATTCCTACGGTGGTCCATCATGTCCAGGTTGTCCAAATCCATCAGATTCCAATTCCAACAAAGGATATCTTAATCCAGTTGAATCAAATGAAGAAGTTCGTGTTAACGTTTTTTCGAATTCTTATCGTGAAAAACTTCGCTCTTATTGTTCAAGTTATCATCTTGTTCAAACTATTTTGCATTTGATACATGCATTTATGGGCTATATTCTTATGTTGATTGTGATGACATACAATGTCTATTTGTTATTGGCTGTCCTATTCGGTTTCACCCTTGGTTACTTTCTATTCGCACGAAATCGAGCTCTGCTAGTCCGATCGCATAACTGCTGTCATTAGACAATGAGCGCATAATTATGTGTGTGTTGGTCAGTGAATTAGTTCAAGCTCTTCGGATTCGTTTGAAGATAATCAAATTACTTTGTTGCACACTGTTCAGATACATTTTGGACCTCTTTGCATTCTCCAT-GTTTGTGTTACTATTGTTGTTCCTGTGTTATTTATTCTCATTTTTTCAACATTGTTCTCCACCTTCATTCTTTACCTCCATTTTTTTAACCACCTTATCTAGATTTTGTGAATTCCCAATATGCATCAATATATATTATTTTGTAAAAATCTTTCTTAAAATCAAGTAGTGTGTGTGTGGTTTTGATTGTTTTGTTTGTAATTTCTGTTTTACCTTTCCTAAATCATTTCTACCACGCTTCATGTACACTAGACCATTTTACTTAGGGTTTGTTGATTCTCCCCGATCTCTATTATCAATAAAATATTTGTGATTTGTGCTCAAGACGTATTTCAATAATACCTTTTGGCTATTATGATGTTACCCTGTTATACTGTTTTGATGATTATGGTAATCAGTCATCTGAACTATGAGTTACTATTCGTAATTCATTGGTTAAGGATATCTTGTCAGTTTTGTTCTTTCACGTTTCTGTTTTGTGAAGATTTGTAAAACAGAGGTTTATTTTACGTTCTTTATGATTTCAAAAGTTATGCCTTTTCTTTTTTGCAATATGTCAATGAAATTCAATATGATTTAAAATAAACCG] [-] EMBL CD110991 [AGAACTCCACGGTAGGAACTCTCCCAAAAGAATGGATCATGCCCACGGTTCTCATCCTTCGCCGGCAGATGCTAGTATGCAGTCGAGTGATCATTCCATGGATATGAAAATGTATTTCAATACTGATATGCATTATACATTGCTTTTTTCATCCTGGATTATTGATACAGTTGGAAAAGCGATTGTAGCATGTCTTGGCTCTTTCATACTCGCTATCATATATGAGGCCCTAGAAACATTACGACATAAATTGCTTTTACGGGCAGCATGTAACAATCAGTGTGAACGTGCTGGAAATTCCTACGGTGGT ] [-] EMBL CD111366 [AGAACTCCACGGTAGGAACTCTCCCAAAAGAATGGATCATGCCCACGGTTCTCATCCTTCACCGGCAGATGTTAGTATGCAGTCGAGTGATCATTCCATGGATATGAAAATGTATTTCAATACTGATATGCATTATACATTGCTTTTTTCATCCTGGATTATTGATACAGTTGGAAAAGCGATTGTAGCATGTCTTGGCTCTTTCATACTCGCTATCATATATGAGGCCCTAGAAACATTACGACATAAATCGCTTTTACGGGCAGCATGTAACAATCAGTGTGAACGTGCTGGAAATTCCTACGGTGGT ] [+] EMBL AI975564 [ acgCCAAAAGAATGGATCATGCCCACGGTTCTCATCCTTCACCGGCAGATGCTAGTATGCAGTCGAGTGATCATTCCATGGATATGAAAATGTATTTCAATACTGATATGCATTATACATTGCTTTTTTCATCCTGGATTATTGATACAGTTGGAAAAGCGATTGTAGCATGTCTTGGCTCTTTCATACTCGCTATCATATATGAGGCCCTAGAAACATTACGACATAAATTGCTTTTACGGGCAGCATGTAACAATCAGTGTGAACGTGCTGGAAATTCCTACGGTGGTCCATCATGTCCAGGTTGTCCAAATCCATCAGATTCCAATTCCAACAAAGGATATCTTAATCCAGTTGAATCAAATGAAGAAGTTCGTGTTAACGTTTTTTCGAATTCTTATCGTGAAAAACTTCGCTCTTATTGTTCAAGTTATCATCTTGTTCAAACTATTTTGCATTTGATACATGCATTTATGGGCTATATTCTTATGTTGATTGTGATGACATACAATGTCTATTTGTTATTGGCTGGCCTATTCGGTTTCACCCTTGGTTACTTTCTAT ] [+] EMBL CD126211 [ GAAACATTACGACAT AATTGCTTTTACGGGCAGCATGTTACAATCAGTGTGAACGTGCTGGAAATTCCTACGGTGGTCCATCATGTCCAGGTTGTCCAAATCCATCAGATTCCAATTCCAACAAAGGATATCTTAATCCAGTTGAATCAAATGAAGAAGTTCGTGTTAACGTTTTTTCGAATTCTTATCGTGAAAAACTTCGCTCTTATTGTTCAAGTTATCATCTTGTTCAAACTATTTTGCATTTGATGCATGCATTTATGGGCTATATTCTTATGTTGATTGTGATGACATACAATGTCTATTTGTTATTGGCTGTCCTATTCGGTTTCACCCTTGGTTACTTCCTATTCGCACGAAATCGAGCTCTGCTAGTCCGATCGCATAACTGCTGTCATTAGACAATGAGCGCATAATTATGTGTGTGTTGGTCAGTGAATTAGTTCAAGCTCTTCGGATTCGTTTGAAGATAATCAAATTACTTTGTTGCACACTGTTCAGATACATTTTGGACCTCTTTGCATTCTCCAT GTTTGTGTTACTATTGTTGTTCCTGTGTTATTTATT ] [+] EMBL CD078870 [ ATTTTGCATTTGATACATGCATTTATGGGCTATATTCTTATGTTGATTGTGATGACATACAATGTCTATTTGTTATTGGCTGTCCTATTCGGTTTCACCCTTGGTTACTTTCTATTCGCACGAAATCGAGCTCTGCTAGTCCGATCGCATAACTGCTGTCATTAGACAATGAGCGCATAATTATGTGTGTGTTGGTCAGTGAATTAGTTCAAGCTCTTCGGATTCGTTTGAAGATAATCAAATTACTTTGTTGCACACTGTTCAGATACATTTTGGACCTCTTTGCATTCTCCAT GTTTGTGTTACTATTGTTGTTCCTGTGTTATTTATTCTCATTTTTTCAACATTGTTCTCCACCTTCATTCTTTACCTCCATTTTTTTAACCACCTTATCTAGATTTTGTGAATTCCCAATATGCATCAATATATATTATTTTGTAAAAATCTTTCTTAAAATCAAGTAGTGTGTGTGTGGTTTTGATTGTTTTGTTTGTAATTTCTGTTTTACCTTTCCTAAATCATTTCTACCACGCTTCATGTACACTAGACCATTTTACTTAGGGTTTGTTGATTCTCCCCGATCTCTATTATCAATAAAATATTTGTGATTTGTGCTCAAGACGTATTTCAATAATACCTTTTGGCTATTATGATGTTACCCT ] [+] EMBL CD169953 [ GTCCGATCGCATAACTGCTGTCATTAGACAATGAGCGCATAATTATGTGTGTGTTGGTCAGTGAATTAGTTCAAGCTCTTCGGATTCGTTTGAAGATAATCAAATTACTTTGTTGCACACTGTTCAGATACATTTTGGACCTCTTTGCATTCTCCAT GTTTGTGTTACTATTGTTGTTCCTGTGTTATTTATTCTCATTTTTTCAACATTGTTCTCCACCTTCATTCTTTACCTCCATTTTTTTAACCACCTTATCTAGATTTTGTGAATTCCCAATATGCATCAATATATATTATTTTGTAAAAATCTTTCTT AAATCAAGTAGTGT ] [+] EMBL CD090113 [ CGGATTCGTTTGAAGATAATCAAATTACTTTGTTGCACACTGTTCAGATACATTTTGGACCTCTTTGCATTCTCCAT GTTTGTGTTACTATTGTTGTTCCTGTGTTATTTATTCTCATTTTTTCAACATTGTTCTCCACCTTCATTCTTTACCTCCATTTTTTTAACCACCTTATCTAGATTTTGTGAATTCCCAATATGCATCAATATATATTATTTTGTAAAAATCTTTCTTAAAATCAAGTAGTGTGTGTGTGGTTTTGTTTGTTTTGTTTGTAATTTCTGTTTTACCTTTCCTAAATCATTTCTACCACGCTTCATGTACACTAGACAATTTTACTTAGGGTTTGTTGATTCTCCCCGATCTCTATTATCAATAAAAT ] [+] EMBL CD167507 [ TGTTCAGATACA TTTGGACCTCTTTGCATTCTCCATGGTTGGTGTTACTATTGTTGTTCCTGTGTTATTTATTCTCATTTTTTCAACATTGTTCTCCACCTTCATTCTTTACCTCCATTTTTTTAGCCACCTTATC ] [-] EMBL CD073330 [ TCTCATTTTTTCAACATTGTTCTCCACCTTCATTCTTTACCTCCATTTTTTTAACCACCTTATCTAGATTTTGTGAATTCCCAATATGCATCAATATATATTATTTTGTAAAAATCTTTCTTAAAATCAAGTAGTGTGTGTGTGGTTTTGATTGTTTTGTTTGTAATTTCTGTTTTACCTTTCCTAAATCATTTCTACCACGCTTCATGTACACTAGACCATTTTACTTAGGGTTTGTTGATTCTCCCCGATCTCTATTATCAATAAAATATTTGTGATTTGTGCTCAAGACGTATTTCAATAATACCTTTTGGCTATTATGATGTTACCCTGTTATACTGTTTTGATGATTATGGTAATCAGTCATCTGAACTATGAGTTACTATTCGTAATTCATTGGTTAAGGATATCTTGTCAGTTTTGTTCTTTCACGTTTCTGTTTTGTGAAGATTTGTAAAACAGAGGTTTATTTTACGTTCTTTATGATTTCAAAAGTTATGCCTTTTCTTTTTTGCAATATGTCAATGAAATTCAATATGATTTAAAATAAACCG] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||