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Schistosoma mansoni
cluster # 9252 cluster # 9252       Sequences # 9       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9252#0 length = 1472 sequences # 9  

consensusID : consensus_9252#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 1472
fasta sequence
                              [AAGAACGCTATTAGTCATGCAGAACACTCACTTAACCCAGATCGAGAAACACAGCCCAAGGGAAGTACAATGCGAAGTAAGGCTACCATCAAGCGACTTAATATGTACCGTAATTTCAAGGCAAAAAGAAACAAAAATGGAAAAATAGTTCGCCCTGCACCTTAGCAATCAACTGTACCTTCCGGCACAGATGCACGGGTTGAGCATAATAGACGATGGTTTGGCAATACACGTGTTATAAGTCAAGATACGTTACAAAGTTTCAAAGAAGCAATGAAGATTCGAAATCCTTACGAAATCATTTTACGTCAAACTCGCTTGCCTATATCACTTTTAGATGAGAAAAAGACGAAAACGAAAAGTGCTCTCTTAACATCACAGAGCTACTCCTATGTATTTGGGGGTAAAGCACAGCGCAAAAGACCTTCGTTGGAGTTTGATGATCTATCGTCACTTGTACGAAACGCTGAATCAAATCAGTATTTGTATAGCTCGACGGACGATAAACATATGATTCGATGCGATGATGGTGTTCGAGAATTAACACAGGATCCTCACTTCAAAGCTGGCCGATCGAAGAGACTATGGAATGAGTTATTTAAGGTTTTAGACTCTTCAGATGTTGTGCTGTACATTTTGGATGCGCGCGATCCAATGGGCACACGATCTCCTTATATTGAGAAGTACTTAAAAACTGAAAAACCACATAAACATTTCATTTTTATCATCAACAAAGTGGATTTAGTCCCTGTATGGATAACAAAACGATGGAAAGCCATCTTATCTGAAGAATATCCTACACTTATATTCCACGCTGATATGACTAAACCTTTGGGTAAAGTTGCTCTCATGGGTCTTTTAAGGCAATTGGCATCACTTCATAGTAAAGAACGACCACAAATATCGGTTGGTATCATTGGTTATCCAAATGTTGGAAAAAGTAGCATCATTAATGCTCTTAGAAATAAAAAGGTGTGTAATGTCGCCCCGTTGGCTGGCGAAACAAAAGTATGGCAGTATGTTACTCTAATGAAATCTATATTCTTAATCGATTGTCCTGGAGTTGTCTATCCTGATGGTAATACTGAAGCAGAATTAGTTATGAAAGGAGTTGTGAGAGTAGAATACTTACAGCAGCCTGATCTGTATATTCGTGATGTATTGGAACGTGTTAAACCAGAATTCCTACAAGCCAAGTATAATCTACCACCATTGTCATCTAACGATGTTCAGAATTATTTGCAAAAGCAAATTATGGATAATGAAGCAAATAATGAAAGTAGTAAGGATATTAATTCAACTTTATCAGAATCCTCTACTAAACCTTTATTATGGAATGACTATCCAGAATTGTTTTTAGAAACCTTAGCTCGACAAAGTGGTAAATTACTAAAGGCTGGTGAGCCGGATTTAAACACGACTGCTAAGCGTGTACTGAATGACTTTCAACGTGGTCGACTACCCTACTTTGT]

[-] EMBL CD113565             [AAGAACGCTATTAGTCATGCAGAACACTCACTTAACCCAGATCGAGAAACACAGCCCAAGGGAAGTACAATGCGAAGTAAGGCTACCATCAAGCGACTTAATATGTACCGTAATTTCAAGGCAAAAAGAAACAAAAATGGAAAAATAGTTCGCCCTGCACCTTAGCAATCAACTGTACCTTCCGGCACAGATGCACGGGTTGAGCATAATAGACGATGGTTTGGCAATACACGTGTTATAAGTCAAGACACGTTACAAAGTTTCAAAGAAGCAATGAAGATTCGAAATCCTAACGAAATCATTATACGTCAAACTCGCTTGCTTATATCACTTTTAGATGAGAAAAAGACGAAAACGAAAAGTGCTCTCTTAACATCACAGAGCTACTCCTATGTATTTGGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD147770             [                                                                                                                ATTTCAAGGCAAAAAGAAACAAAAATGGAAAAATAGTTCGCCCTGCACCTTGTCAATCAACTCTACCTTCCGGTACAGTTGCACGGGTTGAGCCTAATAGACGATGGTTTGGCAATACACGTGTTATAAGTCAAGATACGTTACAAAGTTTCAAAGAAGCAATGAAGATTCGAAATCCTTACGAAATCATTTTACGTCAAACTCGCTTGCCTATATCACTTTTAGATGAGAAAAAGACGAAAACGAAAAGTGCTCTCTTAACATCACAGAGCTACTCCTATGTATTTGGGGGTAAAGCACAGCGCAAAAGACCTTCGTTGGAGTTTGATGATCTATCGTCACTTGTACGAAACGCTGAATCAAATCAGTATTTGTATAGCTCGACGGACGATAAACATATGATTCGATGCGATGATGGTGTTCGAGAATTAACACAGGATCCTCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD096854             [                                                                                                                                                                                                                         GGTTTGGCAATACACGTGTTATAAGTCAAGATACGTTACAAAGTTTCAAAGAAGCAATGAAGATTCGAAATCCTTACGAAATCATTTTACGTCAAACTCGCTTGCCTATATCACTTTTAGATGAGAAAAAGACGAAAACGAAAAGTGCTCTCTTAACATCACAGAGCTACTCCTATGTATTTGGGGGTAAAGCACAGCGCAAAAGACCTTCGTTGGAGTTTGATGATCTATCGTCACCTGTACGAAACGCTGAATCAAATCAGTATTTGTATAGCTCGACGGACGATAAACATATGATTCGATGCGATGATGGTGTTCGAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL BF936844             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GAATCAAATCAGTATTTGTATAGCTCGACGGACGATAAACATATGATTCGATGCGATGATGGTGTTCGAGAATTAACACAGGATCCTCACTTCAAAGCTGGCCGATCGAAGAGACTATGGAATGAGTTATTTAAGGTTTTAGACTCTTCAGATGTTGTGCTGTACATTTTGGATGCGCGCGATCCAATGGGCACACGATCTCCTTATATTGAGAAGTACTTAAAAACTGAAAAACCACATAAACATTTCATTTTTATCATCAACAAAGTGGATTTAGTCCCTGTATGGATAACAAAACGATGGAAAGCCATCTTATCTGAAGAATATCCTACACTTATATTCCACGCTGATATGACTAAACCTTTGGGTAAAGTTGCTCTCATGGGTCTTTTAAGGCAATTGGCATCACTTCATAGTAAAGAACGACCACAAATATCGGTTGGTATCATTGGTTATCCAAATGTTGGAAAAAGTAGCATCATTAATGCTCTTAGAAATAAAAAGGTGTGTAATGTCGCCCCGTTGGCTGGCGAAACAAAAGTATGGCAGTATGTTACTCTAATGAAATCTATATTCTTAATCGATTGTCCTGGAGTTGTCTATCCTGATGGTAATACTGAAGCAGAATTAGTTATGAAAGGAGTTGTGAGAGTAGAATACTTACAGCAGCCTGATCTGTATATTCGTGATGTATTGGAACGTGTTAAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL AI975898             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GAATCAAATCAGTATTTGTATAGCTCGACGGACGATAAACATATGATTCGATGCGATGATGGTGTTCGAGAATTAACACAGGATCCTCACTTCAAAGCTGGCCGATCGAAGAGACTATGGAATGAGTTATTTAAGGTTTTAGACTCTTCAGATGTTGTGCTGTACATTTTGGATGCGCGCGATCCAATGGGCACACGATCTCCTTATATTGAGAAGTACTTAAAAACTGAAAAACCACATAAACATTTCATTTTTATCATCAACAAAGTGGATTTAGTCCCTGTATGGATAACAAAACGATGGAAAGCCATCTTATCTGAAGAATATCCTACACTTATATTCCACGCTGATATGACTAAACCTTTGGGTAAAGTTGCTCTCATGGGTCTTTTAAGGCAATTGGCATCACTTCATAGTAAAGAACGACCACAAATATCGGTTGGTATCATTGGTTATCCAAATGTTGGAAAAAGTAGCATCATTAATGCTCTTAGAAATAAAAAGGTGTGTAATGTCGCCCCGTTGGCTGGCGAAACANAAGTATGGCAGTATGTTACTCTAATGAAATCTATATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD165774             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GTTATTTAAGGTTTTAGACTCTTCAGATGTTGTGCTGTACATTTTGGATGCGCGCGATCCAATGGGCACACGATCTCCTTATATTGAGAAGTACTTAAAAACTGAAAAACCACATAAACATTTCATTTTTATCATCAACAAAGTGGATTTAGTCCCTGTATGGATAACAAAACGATGGAAAGCCATCTTATCTGAAGAATATCCTACACTTATATTCCACGCTGATATGACTAAACCTTTGGGTAAAGTTGCTCTCATGGGTCTTTTAAGGCAATTGGCATCACTTCATAGTAAAGAACGACCACAAATATCGGTTGGTATCATTGGTTATCCAAATGTTGGAAAAAGTAGCATCATTAATGCTCTTAGAAATAAAAAGGTGTGTAATGTCGCCCCGTTGGCTGGCGAAACAAAAGTATGGCAGTATGTTACTCTAATGAAATCTATATTCTTAATCGATTGTCCTGGAGTTGTCTATCCTGATGGTAATACTGAAGCAGAATTAGTTATGAAAGGAGTTGTGAGAGTAGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD083443             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTTATCATCAACAAAGTGGA TTAGTCCCTGTATGGATAACAAAACGATGGAAAGCCATCTTATCTGAAGAATATCCTACACTTATATTCCACGCTGATATGACTAAACCTTTGGGTAAAGTTGCTCTCATGGGTCTTTTAAGGCAATTGGCATCACTTCATAGTAAAGAACGACCACAAATATCGGTTGGTATCATTGGTTATCCAAATGTTGGAAAAAGTAGCATCATTAATGCTCTTAGAAATAAAAAGGTGTGTAATGTCGCCCCGTTGGCTGGCGAAACAAAAGTATGGCAGTATGTTACTCTAATGAAATCTATATTCTTAATCGATTGTCCTGGAGTTGTCTATCCTGATGGTAATACTGAAGCAGAATTAGTTATGAAAGGAGTTGTGAGAGTAGAATACTTACAGCAGCCTGATCTGTATATTCGTGATGTATTGGAACGTGTTACACCAGAATTCCTACAAGCCAAGTATAATCTAACAACATTG                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD136669             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ACCACAAATATCGGTTGGTATCATTGGTTATCCAAATGTTGGAAAAAGTAGCATCATTAATGCTCTTAGAAATAAAAAGGTGTGTAATGTCGCCCCGTTGGCTGGCGAAACAAAAGTATGGCAGTATGTTACTCTAATGAAATCTATATTCTTAATCGATTGTCCTGGAGTTGTCTATCCTGATGGTAATACTGAAGCAGAATTAGTTATGAAAGGAGTTGTGAGAGTAGAATACTTACAGCAGCCTGATCTGTATATTCGTGATGTATTGGAACGTGTTAAACCAGAATTCCTACAAGCCAAGTATAATCTACCACCATTGTCATCTAACGATGTTCAGAATTATTTGCAAAAGCAAATTATGGATAATGAAGCAAATAATGAAAGTAGTAAGGATATTAATTCAACTTTATCAGAATCCTCTACTAAACCTTTATTATGGAATGACTATCCAGAATTGTTTTTAGAAACCTTAGCTCGACAAAGTGGTAAATTACTAAAGGCTGGTGAGCCGGATTTAAACACGACTGCTAAGCGTGTACTGAATGACTTTCAACGTGGTCGACTACCCTACTTTGT]
[-] EMBL CD137216             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GTTGGAAAAAGTAGCATCATTAATGCTCTTAGAAATAAAAAGGTGTGTAATGTCGCCCCGTTGGCTGGCGAAACAAAAGTATGGCAGTATGTTACTCTAATGAAATCTATATTCTTAATCGATTGTCCTGGAGTTGTCTATCCTGATGGTAATACTGAAGCAGAATTAGTTATGAAAGGAGTTGTGAGAGTAGAATACTTACAGCAGCCTGATCTGTATATTCGTGATGTATTGGAACGTGTTAAACCAGAATTCCTACAAGCCAAGTATAATCTACCACCATTGTCATCTAACGATGTTCAGAATTATTTGCAAAAGCAAATTATGGATAATGAAGCAAATAATGAAAGTAGTAAGGATATTAATTCAACTTTATCAGAATCCTCTACTAAACCTTTATTATGGAATGACTATCCAGAATTGTTTTTAGAAACCTTAGCTCGACAAAGTGGTAAATTACTAAAGGCTGGTGAGCCGGATTTAAACACGACTGCTAAGCGTGTACTGAATGACTTTCAACGTGGTCGACTACCCTACTTTGT]


>consensus_9252#0 AAGAACGCTATTAGTCATGCAGAACACTCACTTAACCCAGATCGAGAAACACAGCCCAAG GGAAGTACAATGCGAAGTAAGGCTACCATCAAGCGACTTAATATGTACCGTAATTTCAAG GCAAAAAGAAACAAAAATGGAAAAATAGTTCGCCCTGCACCTTAGCAATCAACTGTACCT TCCGGCACAGATGCACGGGTTGAGCATAATAGACGATGGTTTGGCAATACACGTGTTATA AGTCAAGATACGTTACAAAGTTTCAAAGAAGCAATGAAGATTCGAAATCCTTACGAAATC ATTTTACGTCAAACTCGCTTGCCTATATCACTTTTAGATGAGAAAAAGACGAAAACGAAA AGTGCTCTCTTAACATCACAGAGCTACTCCTATGTATTTGGGGGTAAAGCACAGCGCAAA AGACCTTCGTTGGAGTTTGATGATCTATCGTCACTTGTACGAAACGCTGAATCAAATCAG TATTTGTATAGCTCGACGGACGATAAACATATGATTCGATGCGATGATGGTGTTCGAGAA TTAACACAGGATCCTCACTTCAAAGCTGGCCGATCGAAGAGACTATGGAATGAGTTATTT AAGGTTTTAGACTCTTCAGATGTTGTGCTGTACATTTTGGATGCGCGCGATCCAATGGGC ACACGATCTCCTTATATTGAGAAGTACTTAAAAACTGAAAAACCACATAAACATTTCATT TTTATCATCAACAAAGTGGATTTAGTCCCTGTATGGATAACAAAACGATGGAAAGCCATC TTATCTGAAGAATATCCTACACTTATATTCCACGCTGATATGACTAAACCTTTGGGTAAA GTTGCTCTCATGGGTCTTTTAAGGCAATTGGCATCACTTCATAGTAAAGAACGACCACAA ATATCGGTTGGTATCATTGGTTATCCAAATGTTGGAAAAAGTAGCATCATTAATGCTCTT AGAAATAAAAAGGTGTGTAATGTCGCCCCGTTGGCTGGCGAAACAAAAGTATGGCAGTAT GTTACTCTAATGAAATCTATATTCTTAATCGATTGTCCTGGAGTTGTCTATCCTGATGGT AATACTGAAGCAGAATTAGTTATGAAAGGAGTTGTGAGAGTAGAATACTTACAGCAGCCT GATCTGTATATTCGTGATGTATTGGAACGTGTTAAACCAGAATTCCTACAAGCCAAGTAT AATCTACCACCATTGTCATCTAACGATGTTCAGAATTATTTGCAAAAGCAAATTATGGAT AATGAAGCAAATAATGAAAGTAGTAAGGATATTAATTCAACTTTATCAGAATCCTCTACT AAACCTTTATTATGGAATGACTATCCAGAATTGTTTTTAGAAACCTTAGCTCGACAAAGT GGTAAATTACTAAAGGCTGGTGAGCCGGATTTAAACACGACTGCTAAGCGTGTACTGAAT GACTTTCAACGTGGTCGACTACCCTACTTTGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)