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Schistosoma mansoni
cluster # 9255 cluster # 9255       Sequences # 9       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9255#0 length = 1176 sequences # 9  

consensusID : consensus_9255#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 1176
fasta sequence
                              [CTCGCAGGCCGNAATTCGGCACGAGGAATTTTTCAGTTGACGTCCTAATCTATGGAAAGTCACCTCTTCTTATAAGCAAACACAGAAGTTGATTTGTATTTAGGATTTATATCTTCACATGAAATTATCCTTATAATTATTACTCTCAGTCAACTGTAACTCAGAATCTCATCCAATTATGTTTTGTGTTCATTTCACGCTTCTGTCACTATCAATATAGATAGATATGACAAAGTACATTCATTTTTACAACCAAATTATGGCTGACCGGTTGTTTTTTGTTATGATTATTATTTTTGTTTTCCTTCACGTCCATTTTCAGATTTAAAACAAAATACATTTTAAATTCTTTTGTACATGTATTTGATCAGTTTTGCATCTTTTGTTACCTTATGTATACTTGGGGTTTTTTTGTTCATCCTTATATTATTATGTGTTGAATTGTTAATGTTTTATGCGCTCTTTTGGTTCAGTTGGATTCCATTCAATCTTCATCGTCAAGTTATTGCTACTACAAGAGTATTATCTGTCACAACTGCCGACCCAATAATGAAACCTGTTGTTATATCCAATTGCACTGCCTTCCAGTGTCAGACTTAAAACATGTTTAGAATGAAACAAGAAATTCTATGTGATATATTAATCTGTTTTAAGTTTAATTTTCTCTCGCTTATATTTACAGTGAATCAGTCTGTCGATTTTTAAAATTCTATTTTACTTATTAATGTTTCAAATCACATATATATTGGACATTTGCCTATTTAGCTTGTGGGAGGTGTTTTTTTCCAATGCAAATGACATATACTACTGACTATGTTCCTCATTTCCTTGCTTTTTTGTGTTATTGTGTATAGCTAAAATTGTATCATCAAGCGCTTTTAGATGTCTTCCCAGATCATTGGTTTAAAGAGGTACTGATATTTAACCTGAAAATCTATTTAGTTCTGTAATCTTATAATTTCACTGAAGATTCGATGTGTCAATAAAATTTCCATTCATTTGGTTTATTGAGATCATTTAGGTTGACAATTCAATGCCGGTCGTTAAAAATATTTTTTCAACGTACAATCGCAAGATATTTTGTAAATAAACTGTCATTTATTAGATTTCCTCCCCACTTATATATCAAGATTAATCATTTTTACTATTATTCGATAAGTCAACATCTTGCATATT]

[+] EMBL CD077985             [CTCGCAGGCCGNAATTCGGCACGAGGAATTTTTCAGTTGACGTCCTAATCTATGGAAAGTCACCTCTTCTTATAAGCAAACACAGAAGTTGATTTGTATTTAGGATTTATATCTTCACATGAAATTATCCTTATAATTATTACTCTCAGTCAACTGTAACTCAGAATCTCATCCAATTATGTTTTGTGTTCATTTCACGCTTCTGTCACTATCAATATAGATAGATATGACANAGTACt                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD178795             [                           ATTTNTCAGTTGACGTCNTAATCTATGGANAGTCACCTCTTCTTATAAGCAAACACAGAAGTTGATTTGTATTTAGGATTTATATCTTCACATGAAATTATCCTTATAATTATTACTCTCAGTCAACTGTAACTCAGAATCTCATCCAATTATGTTTTGTGTTCATTTCACGCTTCTGTCACTATCAATATAGATAGATATGACAAAGTACATTCATTTTTACAACCAAATTATGGCTGACCGGTTGTTTTTTGTTATGATTATTATTTTTGTTTTCCTTCACGTCCATTTTCAGATTTAAAACAAAATACATTTTAAATTCTTTTGTACATGTATTTGATCAGTTTTGCATCTTTTGTTACCTTATGTATACTTGGGGTTTTTTTGTTCATCCTTATATTATTATGTGTTGAATTGTTAATGTTTTATGCGCTCTTTTGGTTCAGTTGGATTCCATTCAATCTTCATCGTCAAGTTATTGCTACTACAAGAGTATTATCTGTCACAACTGCCGACCCAATAATAAAACCTGTTGTTATATCCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD178784             [                                                                                     AAGTTGATTTGTATTTAGGATTTATATCTTCACATGAAATTATCCTTATAATTATTACTCTCAGTCAACTGTAACTCAGAATCTCATCCAATTATGTTTTGTGTTCATTTCACGCTTCTGTCACTATCAATATAGATAGATATGACAAAGTACATTCATTTTTACAACCAAATTATGGCTGACCGGTTGTTTTTTGTTATGATTATTATTTTTGTTTTCCTTCACGTCCATTTTCAGATTTAAAACAAAATACATTTTAAATTCTTTTGTACATGTATTTGATCAGTTTTGCATCTTTTGTTACCTTATGTATACTTGGGTTTTTTTTGTTCATCCTTATATTATTATGTGTTGAATTGTTAATGTTTTATGCGCTCTTTTGGTTCAGTTGGATTCCATTCAATCTTCATCGTCAAGTTATTGCTACTACAAGAGTATTATCTGTCACAACTGCCGACCCAATAATGAAACCTGTTGTTATATCCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD081840             [                                                                                                          gaggATCTT ACATGAAATTATCCTTATAATTATTACTCTCAGTCAACTGTAACTCAGAATCTCATCCAATTATGTTTTGTGTTCATTTCACGCTTCTGTCACTATCAATATAGATAGATATGACAAAGTACATTCATTTTTACAACCAAATTATGGCTGACCGGTTGTTTTTTGTTATGATTATTATTTTTGTTTTCCTTCACGTCCATTTTCAGATTTAAAACAAAATACATTTTAAATTCTTTTGTACATGTATTTGATCAGTTTTGCATCTTTTGTTACCTTATGTATACTTGGGTTTTTTTTGTTCATCCTTATATTATTATGTGTTGAATTGTTAATGTTTTATGCGCTCTTTTGGTTCAGTTGGATTCCATTCAATCTTCATCGTCAAGTTATTGCTACTACAAGAGTATTATCTGTCACAACTGCCGACCCAATAATGAAACCTGTTGTTATATCCAATTGCACTGCCTTCCAGTGTCAGACTTAAAACATGTTTAGAATGAAACAAGAAATTCTATGTGATATATTAATCTGTTTTAAGTTTAATTTTCTCTCGCTTATATTTACAGTGAATCAGTCTGTCGATTNTTAAAATTCTATTTTACTTATTAATGTTTCANATCACATATATATTGGACATTTGCCTATTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD114714             [                                                                                                                                                                                                            GTCACTATCAATATAGATAGATATGACAAAGTACATTCATTTTTACAACCAAATTATGGCTGACCGGTTGTTTTTTGTTATGATTATTATTTTTGTTTTCCTTCACGTCCATTTTCAGATTTAAAACAAAATACATTTTAAATTCTTTTGTACATGTATTTGATCAGTTTTGCATCTTTTGTTACCTTATGTATACTTGGGGTTTTTTTGTTCATCCTTATATTATTATGTGTTGAATTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD077111             [                                                                                                                                                                                                                           GATAGATATGACAAAGTACATTCATTTTTACAACCAAATTATGGCTGACCGGTTGTTTTTTGTTATGATTATTATTTTTGTTTTCCTTCACGTCCATTTTCAGATTTAAAACAAAATACATTTTAAATTCTTTTGTACATGTATTTGATCAGTTTTGCATCTTTTGTTACCTTATGTATACTTGGGTTTTTTTTGTTCATCCTTATATTATTATGTGTTGAATTGTTAATGTTTTATGCGCTCTTTTGGTTCAGTTGGATTCCATTCAATCTTCATCGTCAAGTTATTGCTACTACAAGAGTATTATCTGTCACAACTGCCGACCCAATAATGAAACCTGTTGTTATATCCAATTGCACTGCCTTCCAGTGTCAGACTTAAAACATGTTTAGAATGAAACAAGAAATTCTATGTGATATATTAATCTGTTTTAAGTTTAATTTTCTCTCGCTTATATTTACAGTGAATCAGTCTGTCGATTTTTAAAATTCTATTTTACTTATTAATGTTTCAAATCACATATATATTGGACATTTGCCTATTTAGCTTGTGGGAGGTGTTTTTTTCCAATGCAAATGACATATACTACTGACTATGTTCCTCATTTCCTTGCTTTTTTGTGTTATTGTGTATAGCTAAAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD066384             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CAGTTTTGCATCTTTTGTTACCTTATGTATACTTGGGGTTTTTTTGTTCATCCTTATATTATTATGTGTTGAATTGTTAATGTTTTATGCGCTCTTTTGGTTCAGTTGGATTCCATTCAATCTTCATCGTCAAGTTATTGCTACTACAAGAGTATTATCTGTCACAACTGCCGACCCAATAATAAAACCTGTTGTTATATCCAATTGCACTGCCTTCCAGTGTCAGACTTAAAACATGTTTAGAATGAAACAAGAAATTCTATGTGATATATTAATCTGTTTTAAGTTTAATTTTCTCTCGCTTATGTTTACAGTGAATCAGTCTGACGATTTTTAAAATTCTATTTTACTTATTAATGTTTCAAATCACATATATATTGGACATTTGCCTATTTAGCTTGTGGGAGGTGTTTTTTCCCAATGCAAATGACATATACTAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD075559             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CTGTNNTAAGTTTAATTTTCTCTCGCTTATATTTACAGTGAATCAGTCTGTCGATTTTTAAAATTCTATTTTACTTATTAATGTTTCAAATCACATATATATTGGACATTTGCCTATTTAGCTTGTGGGAGGTGTTTTTTTCCAATGCAAATGACATATACTACTGACTATGTTCCTCATTTCCTTGCTTTTTTGTGTTATTGTGTATAGCTAAAATTGTATCATCAAGCGCTTTTAGATGTCTTCCCAGATCATTGGTTTAAAGAGGTACTGATATTTAACCTGAAAATCTATTTAGTTCTGTAATCTTATAATTTCACTGAAGATTCGATGTGTCAATAAAATTTCCATTCATTTGGTTTATTGAGATCATTTAGGTTGACAATTCAATGCCGGTCGTTAAAAATATTTTTTCAACGTACAATCGCAAGATATTTTGTAAATAAACTGTCATTTATTAGATTTCCTCCCCACTTATATATCAAGATTAATCATTTTTACTATTATTCGATAAGTCAACATCTTGCATATT]
[-] EMBL CD066520             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           cAGTTTAATTTTCTCTCGCTTATATTTACAGTGAATCAGTCTGACGATTTTTAAAATTCTATTTTACTTATTAATGTTTCAAATCACATATATATTGGACATTTGCCTATTTAGCTTGTGGGAGGTGTTTTTTTCCAATGCAAATGACATATACTACTGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]


>consensus_9255#0 CTCGCAGGCCGNAATTCGGCACGAGGAATTTTTCAGTTGACGTCCTAATCTATGGAAAGT CACCTCTTCTTATAAGCAAACACAGAAGTTGATTTGTATTTAGGATTTATATCTTCACAT GAAATTATCCTTATAATTATTACTCTCAGTCAACTGTAACTCAGAATCTCATCCAATTAT GTTTTGTGTTCATTTCACGCTTCTGTCACTATCAATATAGATAGATATGACAAAGTACAT TCATTTTTACAACCAAATTATGGCTGACCGGTTGTTTTTTGTTATGATTATTATTTTTGT TTTCCTTCACGTCCATTTTCAGATTTAAAACAAAATACATTTTAAATTCTTTTGTACATG TATTTGATCAGTTTTGCATCTTTTGTTACCTTATGTATACTTGGGGTTTTTTTGTTCATC CTTATATTATTATGTGTTGAATTGTTAATGTTTTATGCGCTCTTTTGGTTCAGTTGGATT CCATTCAATCTTCATCGTCAAGTTATTGCTACTACAAGAGTATTATCTGTCACAACTGCC GACCCAATAATGAAACCTGTTGTTATATCCAATTGCACTGCCTTCCAGTGTCAGACTTAA AACATGTTTAGAATGAAACAAGAAATTCTATGTGATATATTAATCTGTTTTAAGTTTAAT TTTCTCTCGCTTATATTTACAGTGAATCAGTCTGTCGATTTTTAAAATTCTATTTTACTT ATTAATGTTTCAAATCACATATATATTGGACATTTGCCTATTTAGCTTGTGGGAGGTGTT TTTTTCCAATGCAAATGACATATACTACTGACTATGTTCCTCATTTCCTTGCTTTTTTGT GTTATTGTGTATAGCTAAAATTGTATCATCAAGCGCTTTTAGATGTCTTCCCAGATCATT GGTTTAAAGAGGTACTGATATTTAACCTGAAAATCTATTTAGTTCTGTAATCTTATAATT TCACTGAAGATTCGATGTGTCAATAAAATTTCCATTCATTTGGTTTATTGAGATCATTTA GGTTGACAATTCAATGCCGGTCGTTAAAAATATTTTTTCAACGTACAATCGCAAGATATT TTGTAAATAAACTGTCATTTATTAGATTTCCTCCCCACTTATATATCAAGATTAATCATT TTTACTATTATTCGATAAGTCAACATCTTGCATATT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)