cluster # 9268

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Schistosoma mansoni
cluster # 9268 cluster # 9268 Sequences # 9 consensus # 2

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consensus_9268#0 length = 1321 sequences # 6

consensus_9268#1 length = 443 sequences # 3

consensusID : consensus_9268#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1321
fasta sequence

                              [CCAATAGGTAGGTATCCGAATTAAATGCGGCCTCTCCGACTTAGGTCCACCTGTTTGTGTCAGTGGTGTTAATGACGGTATGGGAAAGTCATCTAATACTAGATTAGGCGATGGTAGTGATGTTTTGCATGGACACAATGAATACACTGTCGGTTTTCATGATAACCGGGGACATGGGTGTTCCGATGTTATGGGTTTACGTGGACTTGATTCTGGACTACTGGATTTGGGACCAAATCATGTAAGTAACGTTGGAGGTTATTTGAGTGAACATTTATTCGATCATGCTGTAAATCCTCTCAACACAATGCCTTTCGGAATACATGATCCTACAGATGAAGTGGGAAGTTTGATGCAACAACCCTTGGCCATGGGATATTACATATCTACAGCTTCTGCCGGTCCACTACCCTCGTGGTTTTGGATTGCTTGTCCGCATTCCAAATTTCAGTATCCAGTTTGTTTGAAGTCTGCTCTGCATTTACAAACTACACTAATTGGTGTTGATGATGCTGCAGCCGCAGCTCCACCAC-CAACTGGAGGTTCAAGTGGTCCGGGTGTTGGACCATCGTCAAATCGTCCAGGACATCTTCTAGATTCAAACAGCACATGTGATGTATTAAGATATGTTTTAG-AAACATATAATGCTTTATCTTGGTTAACTATTGATCCAACAACAAACGATCGTAGGACTTGCTTACCTATTCACATTCTTTCCTTATCACAAATATACCAGGCTTTTGAAGCATTCACTTGATTTTATTGCATCTCTGTAATTTATTTGTAGATATTAAGTAATGTTTTTTTTTAAAAAAAAGAAGAAAGTCATGGCAGCTTGTAATATGCCAACAAATCTTTCAAGAAAACTTAATGATTTCTCTATCCCTTATTATTTACATTTTATCCTCTCACTTATTTGTTCTTGCCAATTTGTAAATTGATATTCTTTATTTACATCAGGGTAGATGTTACTTAATAATAATGATTATAATAAGAATAATCATATTATTACCAACCATTTAATTATATTTATTGATTGACCTTATAGATATTTCATGCGTTAATCTATTGTGATTTTTTGTACAGGCTTAGTATGTATGCTTTTTTCTCTTGGACAATTCATTTCAACCTGTGTATAGATATTTTTAAACAACAGAAAAGAAGAATAAGTTAGGATCTTTTTTTTCTATGTGTTTTCTCTGTTCTGTATTCTTCATTAACTATGCATTGACGGAAAAAAGTTTGTAAACAGTGTTTACCGGCTGTGCATGAACATCTGTGTGTCTCTCTTCCCCCAGCACTATTAAGTTCTCCTTTCTGT]

[+] EMBL CD127442             [CCAATAGGTAGGTATCCGAATTAAATGCGGCCTCTCCGACTTAGGTCCACCTGTTTGTGTCAGTGGTGTTAATGACGGTATGGGAAAGTCATCTAATACTAGATTAGGCGATGGTAGTGATGTTTTGCATGGACACAATGAATACACTGTCGGTTTTCATGATAACCGGGGACATGGGTGTTCCGATGTTATGGGTTTACGTGGACTTGATTCTGGACTACTGGATTTGGGACCAAATCATGTAAGTAACGTTGGAGGTTATTTGAGTGAACATTTATTCGATCATGCTGTAAATCCTCTCAACACAATGCCTTTCGGAATACATGATCCTACAGATGAAGTGGGAAGTTTGATGCAACAACCCTTGGCCATGGGATATTACATATCTACAGCTTCTGCCGGTCCACTACCCTCGTGGTTTTGGATTGCTTGTCCGCATTCCAAATTTCAGTATCCAGTTTGTTTGAAGTCTGCTCTGCATTTACAAACTACACTAATTGGTGTTGATGATGCTGCAGCCGCAGCTCCACCAC CAACTGGAGGTTCAAGTGGTCCGGGTGTTGGACCATCGTCAAATCGTCCAGGACATCTTCTAGATTCAAACAGCACATGTGATGTATTAAGATATGTTTTAG  AACATATCATGCTTTATCTTGGTTAACTATTGATCCAACAACANACGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD178922             [                                                                                                                                                                                GGTGTTCCGATGTTATGGGTTTACGTGGACTTGATTCTGGACTACTGGATTTGGGACCAAATCATGTAAGTAACGTTGGAGGTTATTTGAGTGAACATTTATTCGATCATGCTGTAAATCCTCTCAACACAATGCCTTTCGGAATACATGATCCTACAGATGAAGTGGGAAGTTTGATGCAACAACCCTTGGCCATGGGATATTACATATCTACAGCTTCTGCCGGTCCACTACCCTCGTGGTTTTGGATTGCTTGTCCGCATTCCAAATTTCAGTATCCAGTTTGTTTGAAGTCTGCTCTGCATTTACAAACTACACTAATTGGTGTTGATGATGCTGCAGCCGCAGCTCCACCAC CAACTGGAGGTTCAAGTGGTCCGGGTGTTGGACCATCGTCAAATCGTCCAGGACATCTTCTAGATTCAAACAGCACATGTGATGTATTAAGATATGTTTTAG AAACATATAATGCTTTATCTTGGTTAACTATTGATCCAACAACAAACGATCGTAGGACTTGCTTACC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD153398             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CAGCCGCAGCTCCACCAC CAACTGGAGGTTCAAGTGGTCCGGGTGTTGGACCATCGTCAAATCGTCCAGGACATCTTCTAGATTCAAACAGCACATGTGATGTATTAAGATATGTTTTAG AAACATATAATGCTTTATCTTGGTTAACTATTGATCCAACAACAAACGATCGTAGGACTTGCTTACCTATTCACATTCTTTCCTTATCACAAATATACCAGGCTTTTGAAGCATTCACTTGATTTTATTGCATCTCTGTAATTTATTTGTAGATATTAAGTAATGTTTTTTTTTAAAAAAAAGAAGAAAGTCATGGCAGCTTGTAATATGCCAACAAATCTTTCAAGAAAACTTAATGATTTCTCTATCCCTTATTATTTACATTTTATCCTCTCACTTATTTGTTCTTGCCAATTTGTAAATTGATATTCTTTATTTACATCAGGGTAGATGTTACTTAATAATAATGATTATAATAAGAATAATCATATTATTACCAACCATTTAATTATATTTATTGATTGACCTTATAGATATTTCATGCGTTAATCTATTGTGATTTTTTGTACAGGCTTAGTATGTATGCTTTTTTCTCTTGGACAA TCATTTCAA CTGTGTATAGA                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD153375             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AGCCCCAGCTTCCCCACACAATGGGAGGTTCAAGTGGTCCGGG GTTGGACCATGGTCAAATCGTGCAGAACATCTTTTAGATTCAAACAGCACATGTGATGTATTAAGATATG TTTAGAAAACATATAATGCTTTATCTTGGTTAACTATTGATCCAACAACAAACGATCGTAGGACTTGCTTACCTATTCACATTCTTTCCTTATCACAAATATACCAGGCTTNTGAAGCATTCACTTGATTTTATTGCATCTCTGTAATTTATTTGTAGATATTAAGTAATGTTTTTTTTTAAAAAAAAGAAGAAAGTCATGGCAGCTTGTAATATGCCAACAAATCTTTCAAGAAAACTTAATGATTTCTCTATCCCTTATTATTTACATTTTATCCTCTCACTTATTTGTTCTTGCCAATTTGTAAATTGATATTCTTTATTTACATCAGGGTAGATGTTACTTAATAATAATGATTATAATAAGAATAATCATATTATTACCAACCATTTAATTATATTTATTGATTGACCTTATAGATATTTCATGCGTTAATCTATTGTGATTTTTTGTACAGGCTTAGTATGTATGCTTTTTTCTCTTGGACAATTCATTTCAACCTGTGTATAGAT                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD153264             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CGTCCAGGACATCTTCTAGATTCAAACAGCACATGTGATGTATTAAGATATGTTTTAG AAACATATAATGCTTTATCTTGGTTAACTATTGATCCAACAACAAACGATCGTAGGACTTGCTTACCTATTCACATTCTTTCCTTATCACAAATATACCAGGCTTTTGAAGCATTCACTTGATTTTATTGCATCTCTGTAATTTATTTGTAGATATTAAGTAATGTTTTTTTTTAAAAAAAAGAAGAAAGTCATGGCAACTTGTAATATGCCAACAAATCTTTCAAGAAAACTTAATGATTTCTCTATCCCTTATTATTTACATTTTATCCTCTCACTTATTTGTTCTTGCCAATTTGTAAATTGATATTCTTTATTTACATCAGGGTAGATGTTACTTAATAATAATGATTATAATAAGAATAATCATATTATTACCAACCATTTAATTATGTTTATTGATTGACCTTATAGATATTTCATGCGTTAATCTATTGTGATTTTTTGTACAGGCTTAGTATGTATGCTTTCTTCTCTTGGACAATTCATTTCAACCTGTGTATAGAT                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD128690             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ACAGGCTTAGTATGTATGCTTTTATCTCTTGGACAATTCATTTCAACCTGTGTATAGATATTTTTAAACAACAGAAAAGAAGAATAAGTTAGGATCTTTTTTTTCTATGTGTTTTCTCTGTTCTGTATTCTTCATTAACTATGCATTGACGGAAAAAAGTTTGTAAACAGTGTTTACCGGCTGTGCATGAACATCTGTGTGTCTCTCTTCCCCCAGCACTATTAAGTTCTCCTTTCTGT]




>consensus_9268#0
CCAATAGGTAGGTATCCGAATTAAATGCGGCCTCTCCGACTTAGGTCCACCTGTTTGTGT
CAGTGGTGTTAATGACGGTATGGGAAAGTCATCTAATACTAGATTAGGCGATGGTAGTGA
TGTTTTGCATGGACACAATGAATACACTGTCGGTTTTCATGATAACCGGGGACATGGGTG
TTCCGATGTTATGGGTTTACGTGGACTTGATTCTGGACTACTGGATTTGGGACCAAATCA
TGTAAGTAACGTTGGAGGTTATTTGAGTGAACATTTATTCGATCATGCTGTAAATCCTCT
CAACACAATGCCTTTCGGAATACATGATCCTACAGATGAAGTGGGAAGTTTGATGCAACA
ACCCTTGGCCATGGGATATTACATATCTACAGCTTCTGCCGGTCCACTACCCTCGTGGTT
TTGGATTGCTTGTCCGCATTCCAAATTTCAGTATCCAGTTTGTTTGAAGTCTGCTCTGCA
TTTACAAACTACACTAATTGGTGTTGATGATGCTGCAGCCGCAGCTCCACCACCAACTGG
AGGTTCAAGTGGTCCGGGTGTTGGACCATCGTCAAATCGTCCAGGACATCTTCTAGATTC
AAACAGCACATGTGATGTATTAAGATATGTTTTAGAAACATATAATGCTTTATCTTGGTT
AACTATTGATCCAACAACAAACGATCGTAGGACTTGCTTACCTATTCACATTCTTTCCTT
ATCACAAATATACCAGGCTTTTGAAGCATTCACTTGATTTTATTGCATCTCTGTAATTTA
TTTGTAGATATTAAGTAATGTTTTTTTTTAAAAAAAAGAAGAAAGTCATGGCAGCTTGTA
ATATGCCAACAAATCTTTCAAGAAAACTTAATGATTTCTCTATCCCTTATTATTTACATT
TTATCCTCTCACTTATTTGTTCTTGCCAATTTGTAAATTGATATTCTTTATTTACATCAG
GGTAGATGTTACTTAATAATAATGATTATAATAAGAATAATCATATTATTACCAACCATT
TAATTATATTTATTGATTGACCTTATAGATATTTCATGCGTTAATCTATTGTGATTTTTT
GTACAGGCTTAGTATGTATGCTTTTTTCTCTTGGACAATTCATTTCAACCTGTGTATAGA
TATTTTTAAACAACAGAAAAGAAGAATAAGTTAGGATCTTTTTTTTCTATGTGTTTTCTC
TGTTCTGTATTCTTCATTAACTATGCATTGACGGAAAAAAGTTTGTAAACAGTGTTTACC
GGCTGTGCATGAACATCTGTGTGTCTCTCTTCCCCCAGCACTATTAAGTTCTCCTTTCTG
T

consensusID : consensus_9268#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 443
fasta sequence

                              [AACATGATCCCTCAGGATTAGCTGAAGTCATCTATGGAATGGGATCTGATGATATGAACGTACTTGATTGGCTTCTTCCCAATGATCCTGGTCTTGATGATCTCGTTCCTCCAAACGGATCAACAGCAGAAATGTTGGCTGACTTCGGTAATCCATCCGAATTAAATTTCGGCCTCTCCGACTTAGGTCCACCTGTTTGTGTCAGTGGTGTTAATGACGGTATGGGAAAGTCATCTAATACTAGATTAGGCGATGGTAGTGATGTTTTGCATGGACACAATGAATACACTGTCGGTTTTCATGATAACCGGGGACATGGGTGTTCCGATGTTATGGGTTTACGTGGACTTGATTCTGGACTACTGGATTTGGGACCAAATCATGTAAGTAACGTTGGAGGTTATTTGAGTGAACATTTATTCGATCATGCTGTAAATCCTCTC]

[+] EMBL CD139115             [AACATGATCCCTCAGGATTAGCTGAAGTCATCTATGGAATGGGATCTGATGATATGAACGTACTTGATTGGCTTCTTCCCAATGATCCTGGTCTTGATGATCTCGTTCCTCCAAACGGATCAACAGCAGAAATGTTGGCTGACTTCGGTAATCCATCCGAATTAAATTTCGGCCTCTCCGACTTAGGTCCACCTGTTTGTGTCAGTGGTGTTAATGACGGTATGGGAAAGTCATCTAATACTAGATTAGGCGATGGTAGTGATGTTTTGCATGGACACAATGAATACACTGTCGGTTTTCATGATAACCGGGGACATGGGTGTTCCGATGTTATGGGTTTACGTGGACTTGATTCTGGACTACTGGATTTGGGACCAAATCATGTAAGTAACGTTGGAGGTTATTTGAGTGAACATTTATTCGATCATGCTGTAAATCCTCTC]
[+] EMBL CD163975             [                                         GGATCTGATGATATGAACGTATTTGATTGGCTTCTTCCCAATGATCCTGGTCTTGATGATCTCGTTCCTCCAAACGGATCAACAGCAGAAATGTTGGCTGACTTCGGTAATCCATCCGAATTAAATTTCGGCCTCTCCGACTTAGGTCC                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD089566             [                                                                                                                                                                                                         TCAGTGGTGTTAATGAGGGGATGGGAAAGTCATCTAATACTACATTACGCGATGGTAGTGATGTTTTGCATGGACACAATGAATACACTGTCGGGTTTCATGATAACCGtg                                                                                                                                   ]




>consensus_9268#1
AACATGATCCCTCAGGATTAGCTGAAGTCATCTATGGAATGGGATCTGATGATATGAACG
TACTTGATTGGCTTCTTCCCAATGATCCTGGTCTTGATGATCTCGTTCCTCCAAACGGAT
CAACAGCAGAAATGTTGGCTGACTTCGGTAATCCATCCGAATTAAATTTCGGCCTCTCCG
ACTTAGGTCCACCTGTTTGTGTCAGTGGTGTTAATGACGGTATGGGAAAGTCATCTAATA
CTAGATTAGGCGATGGTAGTGATGTTTTGCATGGACACAATGAATACACTGTCGGTTTTC
ATGATAACCGGGGACATGGGTGTTCCGATGTTATGGGTTTACGTGGACTTGATTCTGGAC
TACTGGATTTGGGACCAAATCATGTAAGTAACGTTGGAGGTTATTTGAGTGAACATTTAT
TCGATCATGCTGTAAATCCTCTC

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_9268#0      ------------------------------------------------------------
consensus_9268#1      AACATGATCCCTCAGGATTAGCTGAAGTCATCTATGGAATGGGATCTGATGATATGAACG 60
                                                                                  

consensus_9268#0      ------------------------------------------------------------
consensus_9268#1      TACTTGATTGGCTTCTTCCCAATGATCCTGGTCTTGATGATCTCGTTCCTCCAAACGGAT 120
                                                                                  

consensus_9268#0      ------------------CCAA--TAGGTAGGT-ATCCGAATTAAATG-CGGCCTCTCCG 38
consensus_9268#1      CAACAGCAGAAATGTTGGCTGACTTCGGTAATCCATCCGAATTAAATTTCGGCCTCTCCG 180
                                        *  *  * ****    *************  ***********

consensus_9268#0      ACTTAGGTCCACCTGTTTGTGTCAGTGGTGTTAATGACGGTATGGGAAAGTCATCTAATA 98
consensus_9268#1      ACTTAGGTCCACCTGTTTGTGTCAGTGGTGTTAATGACGGTATGGGAAAGTCATCTAATA 240
                      ************************************************************

consensus_9268#0      CTAGATTAGGCGATGGTAGTGATGTTTTGCATGGACACAATGAATACACTGTCGGTTTTC 158
consensus_9268#1      CTAGATTAGGCGATGGTAGTGATGTTTTGCATGGACACAATGAATACACTGTCGGTTTTC 300
                      ************************************************************

consensus_9268#0      ATGATAACCGGGGACATGGGTGTTCCGATGTTATGGGTTTACGTGGACTTGATTCTGGAC 218
consensus_9268#1      ATGATAACCGGGGACATGGGTGTTCCGATGTTATGGGTTTACGTGGACTTGATTCTGGAC 360
                      ************************************************************

consensus_9268#0      TACTGGATTTGGGACCAAATCATGTAAGTAACGTTGGAGGTTATTTGAGTGAACATTTAT 278
consensus_9268#1      TACTGGATTTGGGACCAAATCATGTAAGTAACGTTGGAGGTTATTTGAGTGAACATTTAT 420
                      ************************************************************

consensus_9268#0      TCGATCATGCTGTAAATCCTCTCAACACAATGCCTTTCGGAATACATGATCCTACAGATG 338
consensus_9268#1      TCGATCATGCTGTAAATCCTCTC------------------------------------- 443
                      ***********************                                     

consensus_9268#0      AAGTGGGAAGTTTGATGCAACAACCCTTGGCCATGGGATATTACATATCTACAGCTTCTG 398
consensus_9268#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9268#0      CCGGTCCACTACCCTCGTGGTTTTGGATTGCTTGTCCGCATTCCAAATTTCAGTATCCAG 458
consensus_9268#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9268#0      TTTGTTTGAAGTCTGCTCTGCATTTACAAACTACACTAATTGGTGTTGATGATGCTGCAG 518
consensus_9268#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9268#0      CCGCAGCTCCACCACCAACTGGAGGTTCAAGTGGTCCGGGTGTTGGACCATCGTCAAATC 578
consensus_9268#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9268#0      GTCCAGGACATCTTCTAGATTCAAACAGCACATGTGATGTATTAAGATATGTTTTAGAAA 638
consensus_9268#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9268#0      CATATAATGCTTTATCTTGGTTAACTATTGATCCAACAACAAACGATCGTAGGACTTGCT 698
consensus_9268#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9268#0      TACCTATTCACATTCTTTCCTTATCACAAATATACCAGGCTTTTGAAGCATTCACTTGAT 758
consensus_9268#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9268#0      TTTATTGCATCTCTGTAATTTATTTGTAGATATTAAGTAATGTTTTTTTTTAAAAAAAAG 818
consensus_9268#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9268#0      AAGAAAGTCATGGCAGCTTGTAATATGCCAACAAATCTTTCAAGAAAACTTAATGATTTC 878
consensus_9268#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9268#0      TCTATCCCTTATTATTTACATTTTATCCTCTCACTTATTTGTTCTTGCCAATTTGTAAAT 938
consensus_9268#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9268#0      TGATATTCTTTATTTACATCAGGGTAGATGTTACTTAATAATAATGATTATAATAAGAAT 998
consensus_9268#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9268#0      AATCATATTATTACCAACCATTTAATTATATTTATTGATTGACCTTATAGATATTTCATG 1058
consensus_9268#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9268#0      CGTTAATCTATTGTGATTTTTTGTACAGGCTTAGTATGTATGCTTTTTTCTCTTGGACAA 1118
consensus_9268#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9268#0      TTCATTTCAACCTGTGTATAGATATTTTTAAACAACAGAAAAGAAGAATAAGTTAGGATC 1178
consensus_9268#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9268#0      TTTTTTTTCTATGTGTTTTCTCTGTTCTGTATTCTTCATTAACTATGCATTGACGGAAAA 1238
consensus_9268#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9268#0      AAGTTTGTAAACAGTGTTTACCGGCTGTGCATGAACATCTGTGTGTCTCTCTTCCCCCAG 1298
consensus_9268#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9268#0      CACTATTAAGTTCTCCTTTCTGT 1321
consensus_9268#1      -----------------------