Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 9280 cluster # 9280       Sequences # 9       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9280#0 length = 1316 sequences # 9  

consensusID : consensus_9280#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 1316
fasta sequence
                              [TTCAGTGCAAGCAAGATATGCCAACGGTTTCGCGAGATTATGAGACCAATGTAATACAGTTCGATTAGGCATACGTTTATCCAGTAAAACCATGCTATAGTAACCACCAGCCAAAACATATACATTACCAATCCACTTAGGTGGGGAATATGTGAGATGATCATTTGAATTCAATAAAA-ACGAGCGTTCTGAAG-TGTTGAACAGTT-GGTAAGCACTTGATGGTGCTATACGGGTGTCAAAAATTAGGATACGACGTGTGGTTGTCAGACACAATTCACCCGGATAACTTCCGAATCCTACACGTAACCAATGATAATTGGGATAATGCTGGTGTAGAAGATGTTTCCGTGATGTACGTGTACAATAAGATTCAATATCTGATTGAACCGGATCTTGTTTAGATGGCGATGATGCTATGCTCTTCAAGCACAATGAGTTTTCCTTTGTTATATTTTCCATATAATTGCCTAAATTTACGTGACCAGACCATATAGGCAGTTGAGTATCTTCTGAATTATACAACCGAATACTA-GCTTTACGATCCCTTTTTTCGTCCACATAATTACCGGCCATACACCATTCCCCTG-GAATCCATCG-ACTCATG-CATATAC-TAGTAACATAATTACTT-GATGAAATACGTAT-TAAAT-TAACGTTGTC-AATACATG-AGTTAGACATGTTCAGTTC-GTTTACCTT-AATTTGCATACGAACA-ATATTTGTCTTACTGCCCGATGTTGGCAATAAACGACCGACTATATCGATATTCTCACTTGATTCACTAAAACATGCATCAAGCTCACAAAATGATCTAGATGAAAGTTTTGTCAATGGAATGGGAAGAACTGAGAAACGATTTGGCTCATGAATATTAGTTTTCAACAGATTTGATGTTTTGCCAATACAGAAGGAATTTGTTTGAAGTGAATACCATAAGAGTATGTCAGACTGATTTGTAGACGACTGATAGTTATGTGTACTTACATTGCATAATAAACCATTCCCGAGATAATTCGGATTTACAATTCGACTTGCTAATCTGATAACTAATGGATCAAAGGATGCTAATAGCCTACTACAGTCGGATTCAAATGTTAAATTATCTGAACTACATAATGTTGTAGATGATGACGATATGGATGAGGACAATGATGAATGACCTGGATAGAGAAGTCTACCGATAGTACAAGGTAGTAACTGCTCTGATTTCCCAGATGCACTACTATCAACACCTTCACCAGTTTCGAAAGCGATAGCCTTTGTTGCTTTTGATGGCTTTGTTGTTAGCCGGAGTCGTTTTGTTGATGGCTGGTTGTTACCAA]

[-] EMBL CD065169             [TTCAGTGCAAGCAAGATATGCCAACGGTTTCGCGAGATTATGAGACCAATGTAATACAGTTCGATTAGGCATACGTTTATCCAGTAAAACCATGCTATAGTAACCACCAGCCAAAACATATACATTACCAATCCACTTAGGTGGGGAATATGTGAGATGATCATTTGAATTCAATAAAA ACGAGCGTTCTGAAG TGTTGAACAGTT GGTAAGCACTTGATGGTGCTATACGGGTGTCAAAAATTAGGATACGACGTGTGGTTGTCAGACACAATTCACCCGGATAACTTCCGAATCCTACACGTAACCAATGATAATTGGGATAATGCTGGTGTAGAAGATGTTTCCGTGATGTACGTGTACAATAAGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD118092             [                                                                                                                                                  AATATGTGAGATGATCATTTGAATTCAATAAAANACGAGCGTTTTGAAGTTGTTGAACAGTTGGGTAAGCACTTGATGGTGCTATACGGGTGTCAAAAATTAGGATACGACGTGTGGTTGTCAGACACAATTCACCCGGATAACTTCCGAATCCTACACGTAACCAATGATAATTGGGATAATGCTGGTGTAGAAGATGTTTCCGTGATGTACGTGTACAATAAGATTCAATATCTGATTGAACCGGATCTTGTTTAGATGGCGATGATGCTATGCTCTTCAAGCACAATGAGTTTTCCTTTGTTATATTTTCCATATAATTGCCTAAATTTACGTGACCAGACCATATAGGCAGTTGAGTATCTTCTGAATTATACAACCGAATACTA GCTTTACGATCCCTTTTTTCGTCCACATAATTACCGGCCATACACCATTCCCGTG GAATCCATCG ACTCATG CATATAC TAGTAACAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD118140             [                                                                                                                                                   ATATGTGAGATGATCATTTGAATCAAATACAA ACGAGCGTTCTGAAG TGTTGAACAGTT GGTAAGCACTTGATGGTGCTATACGGGTGTCAAAAATTAGGATACGACGTGTGGTTGTCAGACACAATTCACCCGGATAACTTCCGAATCCTACACGTAACCAATGATAATTGGGATAATGCTGGTGTAGAAGATGTTTCCGTGATGTACGTGTACAATAAGATTCAATATCTGATTGAACCGGATCTTGTTTAGATGGCGATGATGCTATGCTCTTCAAGCACAATGAGTTTTCCTTTGTTATATTTTCCATATAATTGCCTAAATTTACGTGACCAGACCATATAGGCAGTTGAGTATCTTCTGAATTATACAACCGAATACTA GCTTTACGATCCCTTTTTTCGTCCACATAATTACCGGCCATACACCATTCCCCTG GAATCCATCG ACTCATG CATATAC TAGTAACAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD118119             [                                                                                                                                                                                                AAG TGTTAACCAGTT GGTAAGCACTTGATGGTGCTATACGGGTGTCAAAAATTAGGATACGACGTGTGGTTGTCAGACACAATTCACCCGGATAACTTCCGAATCCTACACGTAACCAATGATAATTGGGATAATGCTGGTGTAGAAGATGTTTCCGTGATGTACGTGTACAATAAGATTCAATATCTGATTGAACCGGATCTTGTTTAGATGGCGATGATGCTATGCTCTTCAAGCACAATGAGTTTTCCTTTGTTATATTTTCCATATAATTGCCTAAATTTACGTGACCAGACCATATAGGCAGTTGAGTATCTTCTGAATTATACAACCGAATACTA GCTTTACGATCCCTTTTTTCGTCCACATAATTACCGGCCATACACCATTCCCCTG GAATCCATCG ACTCATG CATATAC TAGTAACAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD118179             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CAATAAGATTCAATATCTGATTGAACCGGATCTTGTTTAGATGGCGATGATGCTATGCTCTTCAAGCACAATGAGTTTTCCTTTGTTATATTTTCCATATAATTGCCTAAATTTACGTGACCAGACCATATAGGCAGTTGAGTATCTTCTGAATTATACAACCGAATACTA GCTTTACGATCCCTTTTTTCGTCCACATAATTACCGGCCATACACCATTCCCCTG GAATCCATCG ACTCATG CATATAC TAGTAACAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD147411             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GGCAGTTGAGTATCTTCCGAATTATACAACCGAATACTA GCTTTACGATCCCTTTTTTCGTCCACATAATTACCGGCCATACACCATTCCCCTG GAATCCATCG ACTCATG CATATAC TAGTAACATAATTACTT GATGAAATACGTAT TAAAT TAACGTTGTC AATACATG AGTTAGACATGTTCAGTTC GTTTACCTT AATTTGCATACGAACA ATATTTGTCTTACTGCCCGATGTTGGCAATAAACGACCGACTATATCGATATTCTCACTTGATTCACTAAAACATGCATCAAGCTCACAAAATGATCTAGATGAAAGTTTTGTCAATGGAATGGGAAGAACTGAGAAACGATTTGGCTCATGAATATTAGTTTTCAACAGATTTGATGTTTTGCCAATACAGAAGGAATTTGTTTGAAGTGAATACCATAAGAGTATGTCAGACTGATTTGTAGACGACTGATAGTTATGTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD147408             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GGCAGTTGAGTATCTTCCGAATTATACAACCGAATACTAGGCTTTACGATCCCTTTTTTCGTCCACATAATTACCGGCCATACACCATTCCCCTGTGAATCCATCGCACTCATGTCATATACATAGTAACATAATTACTTGGATGAAATACGTATATAAATGTAACGTTGTCAAATACATGAAGTTAGACATGTTCAGTTCTGTTTACCTTCAATTTGCATACGAACACTTATTTGTCTTACTGCCCGATGTTGGCAATAAACGACCGACTATATCGATATTCTCACTTGATTCACTAAAACATGCATCAAGCTCACAAAATGATCTATATGAAAGTTTgg                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD147469             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GGCAGTTGAGTATCTTCCGAATTATACAACCGAATACTA GCTTTACGATCCCTTTTTTCGTCCACATAATTACCGGCCATACACCATTCCCCTG GAATCCATCG ACTCATG CATATAC TAGTAACATAATTACTT GATGAAATACGTAT TAAAT TAACGTTGTC AATACATG AGTTAGACATGTTCAGTTC GTTTACCTT AATTTGCATACGAACA ATATTTGTCTTACTGCCCGATGTTGGCAATAAACGACCGACTATATCGATATTCTCACTTGATTCACTAAAACATGCATCAAGCTCACAAAATGATCTAGATGAAAGTTTTGTCAATGGAATGGGAAGAACTGAGAAACGATTTGGCTCATGAATATTAGTTTTCAACAGATTTGATGTTTTGCCCATACCGAAGGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD137779             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTTCAACAGATTTGATGTTTCGCCAATACAGAAGGAATTTGTTTGAAGTGAATACCATAAGAGTATGTCAGACTGATTTGTAGACGACTGATAGTTATGTGTACTTACATTGCATAATAAACCATTCCCGAGATAATTCGGATTTACAATTCGACTTGCTAATCTGATAACTAATGGATCAAAGGATGCTAATAGCCTACTACAGTCGGATTCAAATGTTAAATTATCTGAACTACATAATGTTGTAGATGATGACGATATGGATGAGGACAATGATGAATGACCTGGATAGAGAAGTCTACCGATAGTACAAGGTAGTAACTGCTCTGATTTCCCAGATGCACTACTATCAACACCTTCACCAGTTTCGAAAGCGATAGCCTTTGTTGCTTTTGATGGCTTTGTTGTTAGCCGGAGTCGTTTTGTTGATGGCTGGTTGTTACCAA]


>consensus_9280#0 TTCAGTGCAAGCAAGATATGCCAACGGTTTCGCGAGATTATGAGACCAATGTAATACAGT TCGATTAGGCATACGTTTATCCAGTAAAACCATGCTATAGTAACCACCAGCCAAAACATA TACATTACCAATCCACTTAGGTGGGGAATATGTGAGATGATCATTTGAATTCAATAAAAA CGAGCGTTCTGAAGTGTTGAACAGTTGGTAAGCACTTGATGGTGCTATACGGGTGTCAAA AATTAGGATACGACGTGTGGTTGTCAGACACAATTCACCCGGATAACTTCCGAATCCTAC ACGTAACCAATGATAATTGGGATAATGCTGGTGTAGAAGATGTTTCCGTGATGTACGTGT ACAATAAGATTCAATATCTGATTGAACCGGATCTTGTTTAGATGGCGATGATGCTATGCT CTTCAAGCACAATGAGTTTTCCTTTGTTATATTTTCCATATAATTGCCTAAATTTACGTG ACCAGACCATATAGGCAGTTGAGTATCTTCTGAATTATACAACCGAATACTAGCTTTACG ATCCCTTTTTTCGTCCACATAATTACCGGCCATACACCATTCCCCTGGAATCCATCGACT CATGCATATACTAGTAACATAATTACTTGATGAAATACGTATTAAATTAACGTTGTCAAT ACATGAGTTAGACATGTTCAGTTCGTTTACCTTAATTTGCATACGAACAATATTTGTCTT ACTGCCCGATGTTGGCAATAAACGACCGACTATATCGATATTCTCACTTGATTCACTAAA ACATGCATCAAGCTCACAAAATGATCTAGATGAAAGTTTTGTCAATGGAATGGGAAGAAC TGAGAAACGATTTGGCTCATGAATATTAGTTTTCAACAGATTTGATGTTTTGCCAATACA GAAGGAATTTGTTTGAAGTGAATACCATAAGAGTATGTCAGACTGATTTGTAGACGACTG ATAGTTATGTGTACTTACATTGCATAATAAACCATTCCCGAGATAATTCGGATTTACAAT TCGACTTGCTAATCTGATAACTAATGGATCAAAGGATGCTAATAGCCTACTACAGTCGGA TTCAAATGTTAAATTATCTGAACTACATAATGTTGTAGATGATGACGATATGGATGAGGA CAATGATGAATGACCTGGATAGAGAAGTCTACCGATAGTACAAGGTAGTAACTGCTCTGA TTTCCCAGATGCACTACTATCAACACCTTCACCAGTTTCGAAAGCGATAGCCTTTGTTGC TTTTGATGGCTTTGTTGTTAGCCGGAGTCGTTTTGTTGATGGCTGGTTGTTACCAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)