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Schistosoma mansoni
cluster # 9283 cluster # 9283       Sequences # 9       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9283#0 length = 1527 sequences # 9  

consensusID : consensus_9283#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 1527
fasta sequence
                              [GGATGACCATTACCGTCTCGGAAGATATACTGATCAAACACATTATCGACCGTTTGCATGCTATTGGTATAACTAGTGAACCGACTGTATCTTCGGTCAGTGACGCGTCAAAGTTAGAGGAGGAAAATGCAAATAACTCAGTTGTTTCTTGTTCGCTAAGCGACTTTCACAGTAATCCCCAACCAGATAAACCAAATACAACCTCAACCGATCTTTTTGACCAGTCAAAACAAACTACTGAAGGAACAACGGGCAATTTAGCCTCATTACTCAAAGGACGTTTATGCCTGAAGGATACGAGAGGGCATGATTGGTTAGCTGAATCAGAAAATACTTTAATATCTCTCCCTTGTTCTGACGCTTATAGTATCATTTTGGACTGTCAAAGTTTAGAAATACGACGTAGACTCAATGACATTCGAAGTCACATACAACAACATCCTGTTACGCGACTTAATGAAACCCTAAAACTTTCAGATTGTTTCGAACGTTTTACTGATATAGAACAATTAGGTTCAAGAGATCTGTGGTACTGTAGTCGCTGCAAAGCGGAAAAACCAGCTACAAAAAAATTTGATTTATGGAAGCTTCCTGATGTTCTTGTAGTACAATTAAAGCGTTTCCGATCTCACTTACGATTTCATGATAAGATCGATACTTTACTGGAATTCCCACTAACTGGCTTAAATTTGACTTCACGTGTACTTGAAAAGAAACCAGACGAGAAATTTATCTATGACTTAGTAGCTGTAAGCAATCATATGGGATATTTGGGTGGAGGTCATTATACAGCATTTGCTTTAAACGCTCACACTAATCGATGGTACTTTTTCGATGATTCTTCAACACGAGAATGTGATCCTTCCAAAATTGTAACTAGTGCAGCATATGTGTTAGTTTATGTACGCCGCANAGTTGGTTCTACGCANATATGCAACACGATCAACAGTGATGATGAACAAGAAGATTCTTCGTCTGAAACAGATGANNATAGTCTTTCANATGGTGCTTTATCTTCGCATTATATAACTGAAGGTTGTGTGCAAAATGGTCGGACTGGCAACGCGAACTCATCTTTCAATCTTCAGGATCAAGATCTAATGGATATTGAATAGACGTCTTTGTCTTTTCTTTTTATAGTTTCACTTCCTTTCAACTTAACCACATCGCTTCGACTTATGCAGTCACTCATTTTTTTATGAGTTTATGCATGATTACAGTGTTTGTTAACTTGTTCATTCTCGGTGAATCAAGTGAAGTAATGACATTTAGACGTTTTTTCCGAACAATATCCCTGCCCCTTATCTTATTCTTGTTCTTCAGCTAACATATAATTCTCTATCTCTCCAGTTACTTCAGTTTTAATTTTGGTCACAAAGAGAATTGTTTACTATGCAGTTTGCTTTTTGTCCCAATGAATGTATATTCACACCGCAGTAAAATAAATTCAAATCCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGCCATGCAGCTGCATTACCGTACTGCGTA]

[+] EMBL CD082868             [GGATGACCATTACCGTCTCGGAAGATATACTGATCAAACACATTATCGACCGTTTGCATGCTATTGGTATAACTAGTGAACCGACTGTATCTTCGGTCAGTGACGCGTCAAAGTTAGAGGAGGAAAATGCAAATAACTCAGTTGTTTCTTGTTCGCTAAGCGACTTTCACAGTAATCCCCAACCAGATAAACCAAATACAACCTCAACCGATCTTTTTGACCAGTCAAAACAAACTACTGAAGGAACAACGGGCAATTTAGCCTCATTACTCAAAGGACGTTTATGCCTGAAGGATACGAGAGGGCATGATTGGTTAGCTGAATCAGAAAATACTTTAATATCTCTCCCTTGTTCTGACGCTTATAGTATCATTTTGGACTGTCAAAGTTTAGAAATACGACGTAGACTCAATGACATTCGAAGTCACATACAACAACATCCTGTTACGCGACTTAATGAAACCCTAAAACTTTCAGATTGTTTCGAACGTTTTACTGATATAGAACAATTAGGTTCAAGAGATCTGTGGTACTGTAGTCGCTGCANAGCGGAAAAACCAGCTACAAAAAAATTTGATTTATGGAAGCTTCCTGATGTTCTTGTAGTACAATTAAAGCGTTTCCGATCTCACTTACGATTTCATGANTAGATCGATACTTTACTGGAATTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD201515             [                                                                                 CGACTGTATCTTCGGTCAGTGACGCGTCAAAGTTAGAGGAGGAAAATGCAAATAACTCAGTTGTTTCTTGTTCGCTAAGCGACTTTCACAGTAATCCCCAACCAGATAAACCAAATACAACCTCAACCGATCTTTTTGACCAGTCAAAACAAACTACTGAAGGAACAACGGGCAATTTAGCCTCATTACTCAAAGGACGTTTATGCCTGAAGGATACGAGAGGGCATGATTGGTTAGCTGAATCAGAAAATACTTTAATATCTCTCCCTTGTTCTGACGCTTATAGTATCATTTTGGACTGTCAAAGTTTAGAAATACGACGTAGACCCAATGACATTCGAAGTCACATACAACAACATCCTGTTACGCGACTTAATGAAACCCTAAAACTTTCAGATTGTTTCGAACGTTTTACTGATATAGAACAATTAGGTTCAAGAGATCTGTGGTACTGTAGTCGCTGCAAAGCGGAAAAACCAGCTAC AAAAAATTTGATTTATGGAAGCTTCCTGATGTTCTTGTAGTACAATTAAAGCGTTTCCGATCTCACTTACGATTTCATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD156430             [                                                                                                                                                                                                                                         ACTACTGAAGGAACAACGGGCAATTTAGCCTCATTACTCAAAGGACGTTTATGCCTGAAGGATACGAGAGGGCATGATTGGTTAGCTGAATCAGAAAATACTTTAATATCTCTCCCTTGTTCTGACGCTTATAGTATCATTTTGGACTGTCAAAGTTTAGAAATACGACGTAGACTCAATGACATTCGAAGTCACATACAACAACATCCTGTTACGCGACTTAATGAAACCCTAAAACTTTCAGATTGTTTCGAACGTTTTACTGATATAGAACAATTAGGTTCAAGAGATCTGTGGTACTGTAGTCGCTGCAAAGCGGAAAAACCAGCTACAAAAAAATTTGATTTATGGAAGCTTCCTGATGTTCTTGTAGTACAATTAAAGCGTTTCCGATCTCACTTACGATTTCATGATAAGATCGATACTTTACTGGAATTCCCACTAACTGGCTTAAATTTGACTTCACGTGTACTTGAAAAGAAACCAGACGAGAAATTTATCTATGACTTAGTAGCTGTAAGCAATCATATGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD154034             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CTTAATGAAACCCTAAAACTTTCAGATTGTTTCGAACGTTTTACTGATATAGAACAATTAGGTTCAAGAGATCTGTGGTACTGTAGTCGCTGCAAAGCGGAAAAACCAGCTACAAAAAAATTTGATTTATGGAAGCTTCCTGATGTTCTTGTAGTACAATTAAAGCGTTTCCGATCTCACTTACGATTTCATGATAAGATCGATACTTTACTGGAATTCCCACTAACTGGCTTAAATTTGACTTCACGTGTACTTGAAAAGAAACCAGACGAGAAATTTATCTATGACTTAGTAGCTGTAAGCAATCATATGGGATATTTGGGTGGAGGTCATTATACAGCATTTGCTTTAAACGCTCACACTAATCGATGGTACTTTTTCGATGATTCTTCAACACGAGAATGTGATCCTTCCAAAATTGTAACTAGTGCAGCATATGTGTTAGTTTATGTACGCCGCANAGTTGGTTCTACGCANATATGCAACACGATCAACAGTGATGATGAACAAGAAGATTCTTCGTCTGAAACAGATGANNATAGTCTTTCANATGGTGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD122408             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AACCCTAAAACTTTCAGATTGTTTCGAACGTTTTACTGATATAGAACAATTAGGTTCAAGAGATCTGTGGTACTGCAGTCGCTGCAAAGCGGAAAAACCAGCTACAAAAAAATTTGATTTATGGAAGCTTCCTGATGTTCTTGTAGTACAATTAAAGCGTTTCCGATCTCACTTACGATTTCATGATAAGATCGATACTTTACTGGAATTCCCACTAACTGGCTTAAATTTGACTTCACGTGTACTTGAAAAGAAACCCGACGAGAAATTTATCTATGACTTAGTAGCTGTAAGCAATCATATGGGATATTTGGGTGGAGGTCATTATACAGCATTTGCTTTAAACGCTCACACTAATCGATGGTACTTTTTCGATGATTCTTCAACACGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD166355             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ACCAGCTACAAAAAAATTTGATTTATGGAAGCTTCCTGATGTTCTTGTAGTACAATTAAAGCGTTTCCGATCTCACTTACGATTTCATGATAAGATCGATACTTTACTGGAATTCCCACTAACTGGCTTAAATTTGACTTCACGTGTACTTGAAAAGAAACCAGACGAGAAATTTATCTATGACTTAGTAGCTGTAAGCAATCATATGGGATATTTGGGTGGAGGTCATTATACAGCATTTGCTTTAAACGCTCACACTAATCGATGGTACTTTTTCGATGATTCTTCAACACGAGAATGTGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD126601             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CCAGCTACAAAAAAATTTGATTTATGGAAGCTTCCTGATGTTCTTGTAGTACAATTAAAGCGTTTCCGATCTCACTTACGATTTCATGATAAGATCGATACTTTACTGGAATTCCCACTAACTGGCTTAAATTTGACTTCACGTGTACTTGAAAAGAAACCAGACGAGAAATTTATCTATGACTTAGTAGCTGTAAGCAATCATATGGGATATTTGGGTGGAGGTCATTATGCAGCATTTGCTTTAAACGCTCACACTAATCGATGGTACTTTTTCGATGATTCTTCAACACGAGAATGTGATCCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD076454             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CAACACGAGAATGTGATCCTTCCAAAATTGTAACTAGTGCAGCATATGTGTTAGTTTATGTACGCCGCAAAGTTGGTTCTACGCAAATATGCAACACGATCAACAGTGATGATGAACAAGAAGATTCTTCGTCTGAAACAGATGAAAATAGTCTTTCAAATGGTGCTTTATCTTCGCATTATATAACTGAAGGTTGTGTGCAAAATGGTCGGACTGGCAACGCGAACTCATCTTTCAATCTTCAGGATCAAGATCTAATGGATATTGAATAGACGTCTTTGTCTTTTCTTTTTATAGTTTCACTTCCTTTCAACTTAACCACATCGCTTCGACTTATGCAGTCACTCATTTTTTTATGAGTTTATGCATGATTACAGTGTTTGTTAACTTGTTCATTCTCGGTGAATCAAGTGAAGTAATGACATTTAGACGTTTTTTCCGAACAATATCCCTGCCCCTTATCTTATTCTTGTTCTTCAGCTAACATATAATTCTCTATCTCTCCAGTTACTTCAGTTTTAATTTTGGTCACAAAGAGAATTGTTTACTATGCAGTTTGCTTTTTGTCCCAATGAATGTATATTCACACCGCAGTAAAATAAATT                                                                               ]
[-] EMBL AI977440             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATGGTCGGACTGGCAACGCGAACTCATCTTTCAATCTTCAGGATCAAGATCTAATGGATATTGAATAGACGTCTTTGTCTTTTCTTTTTATAGTTTCACTTCCTTTCAACTTAACCACATCGCTTCGACTTATGCAGTCACTCATTTTTTTATGAGTTTATGCATGATTACAGTGTTTGTTAACTTGTTCATTCTCGGTGAATCAAGTGAAGTAATGACATTTAGACGTTTTTTCCGAACAATATCCCTGCCCCTTATCTTATTCTTGTTCTTCAGCTAACATATAATTCTCTATCTCTCCAGTTACTTCAGTTTTAATTTTGGTCACAAAAAGAATTGTTTACTATGCAGTTTGCTTTTTGTCCCAATGAATGTATATTCACACCGCAGTAAAATAAATTCAAATCCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGCCATGCAGCTGCATTACCGTACTGCGTA]


>consensus_9283#0 GGATGACCATTACCGTCTCGGAAGATATACTGATCAAACACATTATCGACCGTTTGCATG CTATTGGTATAACTAGTGAACCGACTGTATCTTCGGTCAGTGACGCGTCAAAGTTAGAGG AGGAAAATGCAAATAACTCAGTTGTTTCTTGTTCGCTAAGCGACTTTCACAGTAATCCCC AACCAGATAAACCAAATACAACCTCAACCGATCTTTTTGACCAGTCAAAACAAACTACTG AAGGAACAACGGGCAATTTAGCCTCATTACTCAAAGGACGTTTATGCCTGAAGGATACGA GAGGGCATGATTGGTTAGCTGAATCAGAAAATACTTTAATATCTCTCCCTTGTTCTGACG CTTATAGTATCATTTTGGACTGTCAAAGTTTAGAAATACGACGTAGACTCAATGACATTC GAAGTCACATACAACAACATCCTGTTACGCGACTTAATGAAACCCTAAAACTTTCAGATT GTTTCGAACGTTTTACTGATATAGAACAATTAGGTTCAAGAGATCTGTGGTACTGTAGTC GCTGCAAAGCGGAAAAACCAGCTACAAAAAAATTTGATTTATGGAAGCTTCCTGATGTTC TTGTAGTACAATTAAAGCGTTTCCGATCTCACTTACGATTTCATGATAAGATCGATACTT TACTGGAATTCCCACTAACTGGCTTAAATTTGACTTCACGTGTACTTGAAAAGAAACCAG ACGAGAAATTTATCTATGACTTAGTAGCTGTAAGCAATCATATGGGATATTTGGGTGGAG GTCATTATACAGCATTTGCTTTAAACGCTCACACTAATCGATGGTACTTTTTCGATGATT CTTCAACACGAGAATGTGATCCTTCCAAAATTGTAACTAGTGCAGCATATGTGTTAGTTT ATGTACGCCGCANAGTTGGTTCTACGCANATATGCAACACGATCAACAGTGATGATGAAC AAGAAGATTCTTCGTCTGAAACAGATGANNATAGTCTTTCANATGGTGCTTTATCTTCGC ATTATATAACTGAAGGTTGTGTGCAAAATGGTCGGACTGGCAACGCGAACTCATCTTTCA ATCTTCAGGATCAAGATCTAATGGATATTGAATAGACGTCTTTGTCTTTTCTTTTTATAG TTTCACTTCCTTTCAACTTAACCACATCGCTTCGACTTATGCAGTCACTCATTTTTTTAT GAGTTTATGCATGATTACAGTGTTTGTTAACTTGTTCATTCTCGGTGAATCAAGTGAAGT AATGACATTTAGACGTTTTTTCCGAACAATATCCCTGCCCCTTATCTTATTCTTGTTCTT CAGCTAACATATAATTCTCTATCTCTCCAGTTACTTCAGTTTTAATTTTGGTCACAAAGA GAATTGTTTACTATGCAGTTTGCTTTTTGTCCCAATGAATGTATATTCACACCGCAGTAA AATAAATTCAAATCCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGC CATGCAGCTGCATTACCGTACTGCGTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)