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Schistosoma mansoni
cluster # 9293 cluster # 9293       Sequences # 9       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9293#0 length = 1402 sequences # 9  

consensusID : consensus_9293#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 1402
fasta sequence
                              [ACAAAAGGTCGCTCAGCGTGTCGTGTTGTTTCCAAAACAGAGTAACCCAGGAAGCCAACTTATTTGGCGTGGTGGTTGTTTGCAAAGCATTTTGAGTGATGTGCCAAGTCAAAATACTCAGTCCAGTGTTGGGCAGCTAGGTAACAGCTTTGGAGAAACCTTACAAAGAAAGATAGTTAACATAAACCCTTTTGAGGACAAACCCTTATCTTTGTCATTGCCATCGGTTTGGAATCAAAATCAGCAGGATCCTACTAGAGATGGAATCTGTTCCTTAAGTTCGAAAAACAAAAACTTAAAGAGACCTAGGAATGAGTTCAATCCTAATAATCCTGAAGGTAACAGTGATTCATCTGAGGAAAAATCATCTACAAAAGTCTCAGTAACCAAACCTCGCATTCGGGCACAAACGAAACGTTCAGGGCGGCGAAATGCTCCAAAACCTGTACAACAACCTCTCCTCCTAACCTTGCGACCTTTTCATCCACCTGGAAACTTGTTACTTCCTGCACTTGATCTAATGTCTAAGTTTGATGGCTTAGTTTCATTTGAAAATGAAAAGTTAGTAACAAATAACACTTCGAGTGGTTTATCAACTATCAACGAAGAAAATGTTGACGAGACATCAACAACAGTTAGTGCTTGTGTATCAACTACCGGTCGGATGAAAAGTAGCGCAGGAATAAATGATATCGACTTTGAGGAATTTAAGCATTATAGACGTCTCAACGGGTATTCACTTTTCGTACATGTCAATAAGAAAAAATATGAATCATTTCCAGGCTCGACACCCGTTGATGATACAAATGATTCCAATGATAACATACAAACTGGCCTTGGTACCTCCAGTTCAGGAAAAGAAAACCAGAAGTCCAATCGTAGATGGCAGGCTTTATGGTTAACTGTGCCAGAAAAAGTTAAACGTGAATGGAAAAACAAGGCAAAACGTCTTTTAAAACAAATTGAACAGCATGGAAAACGGGAAGTTATATCTGAAGATAGAAAATTAAGAGAACGTGATCGTTTGGAAGTTCAACTCAGTCGCACACAAACAACATTTTATAGTTTGCTTGATCTGGCCGCTCATTTCCAGCTTTTGTGTGATCGATTCGCAACATTTTCTAAAAGTGTTAATGATTATGAGGGACCAGTTGACCCTGTAGGTGTAGAGTCGTTACTACTCGATGGTTTATTAACATGTTTAATCCCATTGATTGCACTAACAAATGAATTGGAGCCATTCACAGAAGTTCCTGATCGTAAAACTATGTGTGACGCTTTAACCAATTTAACTTTTATCGCTCCATTTTAAAATATGGAAATTTAATACATTCATATAAAGTTTTGTAAATATATCCATGTTATCCCATTTTAAATGTAGAATAATTGTGTAAATAAACTT]

[+] EMBL CD081119             [ACAAAAGGTCGCTCAGCGTGTCGTGTTGTTTCCAAAACAGAGTAACCCAGGAAGCCAACTTATTTGGCGTGGTGGTTGTTTGCAAAGCATTTTGAGTGATGTGCCAAGTCAAAATACTCAGTCCAGTGTTGGGCAGCTAGGTAACAGCTTTGGAGAAACCTTACAAAGAAAGATAGTTAACATAAACCCTTTTGAGGACAAACCCTTATCTTTGTCATTGCCATCGGTTTGGAATCAAAATCAGCAGGATCCTACTAGAGATGGAATCTGTTCCTTAAGTTCGAAAAACAAAAACTTAAAGAGACCTAGGAATGAGTTCAATCCTAATAATCCTGAAGGTAACAGTGATTCATCTGAGGAAAAATCATCTACAAAAGTCTCAGTAACCAAACCTCGCATTCGGGCACAAACGAAACGTTCAGGGCGGCGAAATGCTCCAAAACCTGTACAACAACCTCTCCTCCTAACCTTGCGACCTTTTCATCCACCTGGAAACTTGTTACTTCCTGCACTTGATCTAATGTCTAAGTTTGATGGCTTAGTTTCATTTGAAAATGAAAAGTTAGTAACAAATAACACTTCGAGTGGTTTATCAACTATCAACGAAGAAAATGTTGACGAGACATCAACAACAGTTAGTGCTTGTGTATCAACTACCGGTCGGATGAAAAGTAGCGCAGGAAT AATGATATCGACTTTGAGGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD149357             [                                                                                                                                                                                                                ttTTGGTAATGGCCATCGGTTTGGAATCAAAATCAGCAGGATCCTACTAGAGATGGAATCTGTTCCTTAAGTTCGAAAAACAAAAACTTAAAGAGACGTAGGAATGAGTTCAATCCTAATAATCCTGAAGGTAACAGTGATTCATCTGAGGAAAGATCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD149209             [                                                                                                                                                                                                                                                                                         CGAAAACCAAAAATTTAAAGAGACCTAGGAATGAGTTCAATCCTAATAATCCTGAAGGTAACAGTGATTCATCTGAGGAAAAATCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD113853             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGTTAGTAACAAATAACACTTCGAGTGCTTTATCAACTATCAACGAAGAAAATGTTGACGAGACATCAACAACAGTTAGTGCTTGTGTATCAGCTACCGGTCGGATGAAAAGTAGCGCAGGAATAAATGATATCGACTTAGAGGAATTTAAGCATTATAGACGTCTCAACGGGTATTCACTTTTCGTACATGTCAATAAGAAAAAATATGAATCATTTCCAGGCTCGACACCCGTTGATGATACAAATGATTCCAATGATAACATACAAACTGGCCTTGGTACCTCCAGTTCAGGAAAAGAAAACCAGAAGTCCAATCGTAGATGGCAGGCTTTATGGTTAACTGTGCCAGAAAAAGTTAAACGTGAATGGAAAAACAAGGCAAAACGTCTTTTAAAACAAATTGAACAGCATGGAAAACGGGAAGTTATATCTGAAGATAGAAAATTAAGAGAACGTGATCGTTTGGAAGTTCTAATCAATGGCACACATAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD164315             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AATGTTGACGAGACATCAACAACAGTTAGTGCTTGTGTATCAACTACCGGTCGGATGAAAAGTAGCGCAGGAATAAATGATATCGACTTTGAGGAATTTAAGCATTATAGACGTCTCAATGGGTATTCACTTTTCGTACATGTCAATAAGAAAAAATATGAATCATTTCCAGGCTCGACACCCGTTGATGATACAAATGATTCCAATGATAACATACAAACTGGCCTTGGTACCTCCAGTTCAGGAAAAGAGAACCAGAAGTCCAATCGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD164219             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GACATCAACAACAGTTAGTGCTTGTGTATCAACTACCGGTCGGATGAAAATTTGCGCAGGAGTAAATGATATGGACTTTGAGGAATTga                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD113733             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AGTAGCGCAGGAATAAATGATATCGACTTTGAGGAATTTAAGCATTATAGACGTTTCAACGGGTATTCACTTTTCGTACATGTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD074941             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CTCAATGGGTATTCACTTTTCGTACATGTCAATAAGAAAAAATATGAATCATTTCCAGGCTCGACACCCGTTGATGATACAAATGATTCCAATGATAACATACAAACTGGCCTTGGTACCTCCAGTTCAGGAAAAGAAAACCAGAAGTCCAATCGTAGATGGCAGGCTTTATGGTTAACTGTGCCAGAAAAAGTTAAACGTGAATGGAAAAACAAGGCAAAACGTCTTTTAAAACAAATTGAACAGCATGGAAAACGGGAAGTTATATCTGAAGATAGAAAATTAAGAGAACGTGATCGTTTGGAAGTTCAACTCAGTCGCACACAAACAACATTTTATAGTTTGCTTGATCTGGCCGCTCATTTCCAGCTTTTGTGTGATCGATTCGCAACATTTTCTAAAAGTGTTAATGATTATGAGGGACCAGTTGACCCTGTAGGTGTAGAGTCGTTACTACTCGATGGTTTATTAACATGTTTAATCCCATTGATTGCACTAACAAATGAATTGGAGCCATTCACAGAAGTTCCTGATCGTAAAACTATGTGTGACGCTTTAACCAATTTAACTTTTATCGCTCCATTTTAAAATATGGAAATTTAATACATTCATATAAAGTTTTGTAAATATATCCATGTTATCCCATTTTAAATGTAGAATAATTGTGTAAATAAACTT]
[+] EMBL CD158518             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CCAATCGTAGATGGCAGGCTTTATGGTTAACTGTGCCAGAAAAAGTTAAACGTGAATGGAAAAACAAGGCAAAACGTCTTTTAAAACAAATTGAACAGCATGGAAAACGGGAAGTTATATCTGAAGATAGAAAATTAAGAGAACGTGATCGTTTGGAAGTTCAACTCAGTCGCACACAAACAACATTTTATAGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]


>consensus_9293#0 ACAAAAGGTCGCTCAGCGTGTCGTGTTGTTTCCAAAACAGAGTAACCCAGGAAGCCAACT TATTTGGCGTGGTGGTTGTTTGCAAAGCATTTTGAGTGATGTGCCAAGTCAAAATACTCA GTCCAGTGTTGGGCAGCTAGGTAACAGCTTTGGAGAAACCTTACAAAGAAAGATAGTTAA CATAAACCCTTTTGAGGACAAACCCTTATCTTTGTCATTGCCATCGGTTTGGAATCAAAA TCAGCAGGATCCTACTAGAGATGGAATCTGTTCCTTAAGTTCGAAAAACAAAAACTTAAA GAGACCTAGGAATGAGTTCAATCCTAATAATCCTGAAGGTAACAGTGATTCATCTGAGGA AAAATCATCTACAAAAGTCTCAGTAACCAAACCTCGCATTCGGGCACAAACGAAACGTTC AGGGCGGCGAAATGCTCCAAAACCTGTACAACAACCTCTCCTCCTAACCTTGCGACCTTT TCATCCACCTGGAAACTTGTTACTTCCTGCACTTGATCTAATGTCTAAGTTTGATGGCTT AGTTTCATTTGAAAATGAAAAGTTAGTAACAAATAACACTTCGAGTGGTTTATCAACTAT CAACGAAGAAAATGTTGACGAGACATCAACAACAGTTAGTGCTTGTGTATCAACTACCGG TCGGATGAAAAGTAGCGCAGGAATAAATGATATCGACTTTGAGGAATTTAAGCATTATAG ACGTCTCAACGGGTATTCACTTTTCGTACATGTCAATAAGAAAAAATATGAATCATTTCC AGGCTCGACACCCGTTGATGATACAAATGATTCCAATGATAACATACAAACTGGCCTTGG TACCTCCAGTTCAGGAAAAGAAAACCAGAAGTCCAATCGTAGATGGCAGGCTTTATGGTT AACTGTGCCAGAAAAAGTTAAACGTGAATGGAAAAACAAGGCAAAACGTCTTTTAAAACA AATTGAACAGCATGGAAAACGGGAAGTTATATCTGAAGATAGAAAATTAAGAGAACGTGA TCGTTTGGAAGTTCAACTCAGTCGCACACAAACAACATTTTATAGTTTGCTTGATCTGGC CGCTCATTTCCAGCTTTTGTGTGATCGATTCGCAACATTTTCTAAAAGTGTTAATGATTA TGAGGGACCAGTTGACCCTGTAGGTGTAGAGTCGTTACTACTCGATGGTTTATTAACATG TTTAATCCCATTGATTGCACTAACAAATGAATTGGAGCCATTCACAGAAGTTCCTGATCG TAAAACTATGTGTGACGCTTTAACCAATTTAACTTTTATCGCTCCATTTTAAAATATGGA AATTTAATACATTCATATAAAGTTTTGTAAATATATCCATGTTATCCCATTTTAAATGTA GAATAATTGTGTAAATAAACTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)