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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9323#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 629 fasta sequence
[TCTGTTTC-C-CTGTGCTGA-GGCAGTCGACCGGAAATGTGATTGAGTATGGTAAGTTTAGGTCGTTCTAAAAGTCGCGGGAATCTGATGAATAGAATGACTCGTAATTATTAAAGTGAAAAGTTGGTGGTATGATATCTAGGATTACTGAATCAAGAAGCGGCTCAACTCTAAATACGTTTGTCAAACAGTGCCACAGTTGAACTAGAATTTCGGTATAAGTCCCGCATACTGACAATAATTTGTGGGACACAGCGAAGATGCAAGAAGTTACATCCATTACAAGGGTGAACAGAATTTTTGTGAAACTTGTCAAATTAATTGTCATAAAAACTACTTGAAGATGAATAATCATAAAACTGGATTGGATAATGTAACTGGTGATATCTACTGCTGTAAGGGGTCACTTTGTGCACACTAAGCAAAAGTTTATGTGTACAGCAAAGATAAATCTGGATACATGTGACAATGGTGTGATGCGGTCTGTCTGTCGGGTATATAAACCGAGTATGCTTGAAATAAACGATCCGCATAGCAGAAGCTGCAATTGGTTTTTTTGAACTCAATTGGAAGGGCTAGGCGGACAAGGGATCAATCAACATCAGGTAGACAAGCTCAGTTACCTGGTAGAC]
[+] EMBL CD113725 [TCTATTTC C CTGTGCTGA GGCAGTCGACCGGAAATGTGATTGAGTATGGTAAGTTTAGGTCGTTCTAAAAGTCGCGGGAATCTGATGAATAGAATGACTCGTAATTATTAAAGTGAAAAGTTGGTGGTATGATATCTAGGATTACTGAATCAAGAAGCGGCTCAACTCTAAATACGTTTGTCAAACAGTGCCACAGTTGAACTAGAATTTCGGTATAAGTCCCGCATACTGACAATAATTTGTGGGACACAGCGAAGATGCAAGAAGTTACATCCATTACAAGGGTGAACAGAATTTTTGTGAAACTTGTCAAATTAATTGTCATAAAAACTACTTGAAGATGAATAATCATAAAACTGGATTGGATAATGTAACTGGTGATATCTACTGCTGTAAGGGGTCACTTTGTGCACACTAAGCAAAAGTTTATGTGTACAGCAAAGATAAATCTGGATACATGTGACAATGGTGTGATGCGGTCTGTCTGTCGGGTATATAAACCGAGTATGCTTGAAATAAACGATCCGCATAG ]
[+] EMBL CD113897 [ TGTTTCTC TTGTGCAGA GGCAGTCGACCGGAAATGTGATTGAGTATGGTAAGTTTAGGTCGTTCTAAAAGTCGCGGGAATCTGATGAATAGAATGACTCGTAATTATTAAAGTGAAAAGTTGGTGGTATGATATCTAGGATTACTGAATCAAGAAGCGGCTCAACTCTAAATACGTTTGTCAAACAGTGCCACAGTTGAACTAGAATTTCGGTATAAGTCCCGCATACTGACAATAATTTGTGGGACACAGCGAAGATGCAAGAAGTTACATCCATTACAAGGGAGAACAGAATTTTTGTGAAACTTGTCAAATTAATTGTCATAAAAACTACTTGAAGATGAATAATCATAAAACTGGATTGGATAATGTAACTGGTGATATCTACTGCTGTAAGGGGTCACTTTGTGCACACTAAGCAAAAGTTTATGTGTACAGCAAAGATAAATCTGGATACATGTGACAATGGTGTGATGCGGTCTGTCTGTCGGGTATATAAACCGAGTATGCTTGAAATAAAC ]
[+] EMBL CD113753 [ TGTTTC CTCTGTGCTGA GGCAGTCGACCGGAAATGTGATTGAGTATGGTAAGTTTAGGTCGTTCTAAAAGTCGCGGGAATCTGATGAATAGAATGACTCGTAATTATTAAAGTGAAAAGTTGGTGGTATGATATCTAGGATTACTGAATCAAGAAGCGGCTCAACTCTAAATACGTTTGTCAAACAGTGCCACAGTTGAACTAGAATCTCGGTATAAGTCCCGCATACTGACAATAATTTGTGGGACACAGCGAAGATGCAAGAAGTTACATCCATTACAAGGGTGAACAGAATTTTTGTGAAACTTGTCAAATTAATTGTCATAAAAACTACTTGAAGATGAATAATCATAAAACTGGATTGGATAATGTAACTGGTGATATCTACTGCTGTAAGGGGTCACTTTGTGCACACTAAGCAAAAGTTTATGTGTACAGCAAAGATAAATCTGGATACATGTGACAATGGTGTGATGCGGTCTGTCTGTCGGGTATATAAACCGAG ]
[+] EMBL CD113802 [ TTTC T CTTGGGAGATGGCAGTCGACCGGAAATGTGATTGAGTATGGTAAGTTTAGGTCGTTCTAAAAGTCGCGGGAATCTGATGAATAGAATGACTCGTAATTATTAAAGTGAAAAGTTGGTGGTATGATATCTAGGATTACTGAATCAAGAAGCGGCTCAACTCTGAATACGTTTGTCAAACAGTGCCACAGTTGAACTAGAATTTCGGTATAAGTCCCGCATACTGACAATAATTTGTGGGACACAGCGAAGATGCAAGAAGTTACATCCATTACAAGGGTGAATAGAATTTTTGTGAAACTTGTCAAATTAATTGTCATAAAAACTACTTGAAGATGAATAATCATAAAACTGGATTGGATAATGTAACTGGTGATATCTACTGCTGTAAGGGGTCACTTTGTGCACACTAAGCAAAAGTTTATGTGTACAGCAAAGATAAATCTGGATACATGTGACAATGGTGTGATGCGGTCTGTCTGTCGGGTATAT AACCG ]
[-] EMBL CD113835 [ AGAATGACTCGTAATTATTAAAGTGAAAATTTGGTGGTATGATATCTAGGATTACTAAATCAAGAAGCGGCTCAACTCTAAATACGTTTGTCAAACAGTGCCACAGTTGAACTAGAATTTCGGTATAAGTCCCGCATACTGACAATAATTTGTGGGACACAGCGAAGATGCAAGAAGTTACATCCATTACAAGGGTGAACAGAATTTTTGTGAAACTTGTCAAATTAATTGTCATAAAAACTACTTGAAGATGAATAATCATAAAACTGGATTGGATAATGTAACTGGTGATATCTACTGCTGTAAGGGGTCACTTTGTGCACACTAAGCAAAAGTTTATGTGTACAGCAAAGATAAATCTGGATACATGTGACAATGGTGTGATGCGGTCTGTCTGTCGGGTATATAAACCGAGTATGCTTGAAATAAACGATCCGCATAGCAGAAGCTGCAATTGGTTTTTTTGAACTCAATTGGAAGGGCTAGGCGGACAAGGGATCAATAAACATCAGGT ]
[-] EMBL CD113864 [ ACTCGTAATTATTAAAGTGAAAAGTTGGTGGTATGATATCTAGGATTACTGAATCAAGAAGCGGCTCAACTCTAAATACGTTTGTCAAACAGTGCCACAGTTGAACTAGAATTTCGGTATAAGTCCCGCATACTGACAATAATTTGTGGGACACAGCGAAGATGCAAGAAGTTACATCCATTACAAGGGTTAACAGAATTTTTGTGAAACTTGTCAAATTAATTGTCATAAAAACTACTTGAAGATGAATAATCATAAAACTGGATTGGATAATGTAACTGGTGATATCTACTGCTGTAAGGGGTCACTTTGTGCACACTAAGCAAAAGTTTATGTGTACAGCAAAGATAAATCTGGATACATGTGACAATGGTGTGATGCGGTCTGTCTGTCGGGTATATAAACCGAGTATGCTTGAAATAAACGATCCGCATAGCAGAAGCTGCAATTGGTTTTTTTGAACTCAATTGGAAGGGCTAGTCGGACAAGGGATCAATC ]
[-] EMBL CD113879 [ TTATTAAAGTGAAAATTTGGTGTTATGATATCTAGGATTACTGAATCAAGAAGCGGCTCAACTCTAAATACGTTTGTCAAACAGTGCCACAGTTGAACTAGAATTTCGGTATAAGTCCCGCATACTGACAATAATTTGTGGGACACAGCGAAGATGCAAGAAGTTACATCCATTACAAGGGAGAACAGAATTTTTGTGAAACTTGTCAAATTAATTGTCATAAAAACTACTTGAAGATGAATAATCATAAAACTGGATTGGATAATGTAACTGGTGATATCTACTGCTGTAAGGGGTCACTTTGTGCACACTAAGCAAAAGTTTATGTGTACAGCAAAGATAAATCTGGATACATGTGACAATGGTGTGATGCGGTCTGTCTGTCGGGTATATAAACCGAGTATGCTTGAAATAAACGATCCGCATAGCAGAAGCTGCAATTGGTTTTTTTGAACTCAATTGGAAGGGCTAGGCGGACAAGGGATTAATCAACATCAGCTAGACA ]
[-] EMBL CD113858 [ TATCTAGGATTACTGAATCAAGAAGCGGCTCAACTCTAGATACGTTTGTCAAACAGTGCCACAGTTGAACTAGAATTTCGGTATAAGTCCCGCATACTGACAATAATTTGTGGGACACAGCGAAGATGCAAGAAGTTACATCCATTACAAGGGTGAACAGAATTTTTGTGAAACTTGTCAAATTAATTGTCATAAAAACTACTTGAAGATGAATAATCATAAAACTGGATTGGATAATGTAACTGGTGATATCTACTGCTGTAAGGGGTCACTTTGTGCACACTAAGCAAAAGTCTATGTGTACAGCAAAGATAAATCTGGATACATGTGACAATGGTGTGATGCGGTCTGTCTGTCGGGTATATAAACCGAGTATGCTTGAAATAAACGATCCGCATAGCAGAAGCTGCAATTGGTTTTTTTGAACTCAATTGGAAGGGCTAGGCGGACAAGGGATCAATCAA ATCAGGTAGACCAGCTCAGTTACCTGGTAGAC]
[-] EMBL CD113745 [ cgctTCAACTCTAGATACGTTTGTCAAACAGTGCCACAGTTGAACTAGAATTTCGGTGTAAGTCCCGCATACTGACAATAATTTGTGGGACACAGCGAAGATGCAAGAAGTTACATCCATTACAAG ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||