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Schistosoma mansoni
cluster # 9323 cluster # 9323       Sequences # 9       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9323#0 length = 629 sequences # 9  

consensusID : consensus_9323#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 629
fasta sequence
                              [TCTGTTTC-C-CTGTGCTGA-GGCAGTCGACCGGAAATGTGATTGAGTATGGTAAGTTTAGGTCGTTCTAAAAGTCGCGGGAATCTGATGAATAGAATGACTCGTAATTATTAAAGTGAAAAGTTGGTGGTATGATATCTAGGATTACTGAATCAAGAAGCGGCTCAACTCTAAATACGTTTGTCAAACAGTGCCACAGTTGAACTAGAATTTCGGTATAAGTCCCGCATACTGACAATAATTTGTGGGACACAGCGAAGATGCAAGAAGTTACATCCATTACAAGGGTGAACAGAATTTTTGTGAAACTTGTCAAATTAATTGTCATAAAAACTACTTGAAGATGAATAATCATAAAACTGGATTGGATAATGTAACTGGTGATATCTACTGCTGTAAGGGGTCACTTTGTGCACACTAAGCAAAAGTTTATGTGTACAGCAAAGATAAATCTGGATACATGTGACAATGGTGTGATGCGGTCTGTCTGTCGGGTATATAAACCGAGTATGCTTGAAATAAACGATCCGCATAGCAGAAGCTGCAATTGGTTTTTTTGAACTCAATTGGAAGGGCTAGGCGGACAAGGGATCAATCAACATCAGGTAGACAAGCTCAGTTACCTGGTAGAC]

[+] EMBL CD113725             [TCTATTTC C CTGTGCTGA GGCAGTCGACCGGAAATGTGATTGAGTATGGTAAGTTTAGGTCGTTCTAAAAGTCGCGGGAATCTGATGAATAGAATGACTCGTAATTATTAAAGTGAAAAGTTGGTGGTATGATATCTAGGATTACTGAATCAAGAAGCGGCTCAACTCTAAATACGTTTGTCAAACAGTGCCACAGTTGAACTAGAATTTCGGTATAAGTCCCGCATACTGACAATAATTTGTGGGACACAGCGAAGATGCAAGAAGTTACATCCATTACAAGGGTGAACAGAATTTTTGTGAAACTTGTCAAATTAATTGTCATAAAAACTACTTGAAGATGAATAATCATAAAACTGGATTGGATAATGTAACTGGTGATATCTACTGCTGTAAGGGGTCACTTTGTGCACACTAAGCAAAAGTTTATGTGTACAGCAAAGATAAATCTGGATACATGTGACAATGGTGTGATGCGGTCTGTCTGTCGGGTATATAAACCGAGTATGCTTGAAATAAACGATCCGCATAG                                                                                                 ]
[+] EMBL CD113897             [  TGTTTCTC TTGTGCAGA GGCAGTCGACCGGAAATGTGATTGAGTATGGTAAGTTTAGGTCGTTCTAAAAGTCGCGGGAATCTGATGAATAGAATGACTCGTAATTATTAAAGTGAAAAGTTGGTGGTATGATATCTAGGATTACTGAATCAAGAAGCGGCTCAACTCTAAATACGTTTGTCAAACAGTGCCACAGTTGAACTAGAATTTCGGTATAAGTCCCGCATACTGACAATAATTTGTGGGACACAGCGAAGATGCAAGAAGTTACATCCATTACAAGGGAGAACAGAATTTTTGTGAAACTTGTCAAATTAATTGTCATAAAAACTACTTGAAGATGAATAATCATAAAACTGGATTGGATAATGTAACTGGTGATATCTACTGCTGTAAGGGGTCACTTTGTGCACACTAAGCAAAAGTTTATGTGTACAGCAAAGATAAATCTGGATACATGTGACAATGGTGTGATGCGGTCTGTCTGTCGGGTATATAAACCGAGTATGCTTGAAATAAAC                                                                                                            ]
[+] EMBL CD113753             [  TGTTTC CTCTGTGCTGA GGCAGTCGACCGGAAATGTGATTGAGTATGGTAAGTTTAGGTCGTTCTAAAAGTCGCGGGAATCTGATGAATAGAATGACTCGTAATTATTAAAGTGAAAAGTTGGTGGTATGATATCTAGGATTACTGAATCAAGAAGCGGCTCAACTCTAAATACGTTTGTCAAACAGTGCCACAGTTGAACTAGAATCTCGGTATAAGTCCCGCATACTGACAATAATTTGTGGGACACAGCGAAGATGCAAGAAGTTACATCCATTACAAGGGTGAACAGAATTTTTGTGAAACTTGTCAAATTAATTGTCATAAAAACTACTTGAAGATGAATAATCATAAAACTGGATTGGATAATGTAACTGGTGATATCTACTGCTGTAAGGGGTCACTTTGTGCACACTAAGCAAAAGTTTATGTGTACAGCAAAGATAAATCTGGATACATGTGACAATGGTGTGATGCGGTCTGTCTGTCGGGTATATAAACCGAG                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD113802             [    TTTC T CTTGGGAGATGGCAGTCGACCGGAAATGTGATTGAGTATGGTAAGTTTAGGTCGTTCTAAAAGTCGCGGGAATCTGATGAATAGAATGACTCGTAATTATTAAAGTGAAAAGTTGGTGGTATGATATCTAGGATTACTGAATCAAGAAGCGGCTCAACTCTGAATACGTTTGTCAAACAGTGCCACAGTTGAACTAGAATTTCGGTATAAGTCCCGCATACTGACAATAATTTGTGGGACACAGCGAAGATGCAAGAAGTTACATCCATTACAAGGGTGAATAGAATTTTTGTGAAACTTGTCAAATTAATTGTCATAAAAACTACTTGAAGATGAATAATCATAAAACTGGATTGGATAATGTAACTGGTGATATCTACTGCTGTAAGGGGTCACTTTGTGCACACTAAGCAAAAGTTTATGTGTACAGCAAAGATAAATCTGGATACATGTGACAATGGTGTGATGCGGTCTGTCTGTCGGGTATAT AACCG                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD113835             [                                                                                             AGAATGACTCGTAATTATTAAAGTGAAAATTTGGTGGTATGATATCTAGGATTACTAAATCAAGAAGCGGCTCAACTCTAAATACGTTTGTCAAACAGTGCCACAGTTGAACTAGAATTTCGGTATAAGTCCCGCATACTGACAATAATTTGTGGGACACAGCGAAGATGCAAGAAGTTACATCCATTACAAGGGTGAACAGAATTTTTGTGAAACTTGTCAAATTAATTGTCATAAAAACTACTTGAAGATGAATAATCATAAAACTGGATTGGATAATGTAACTGGTGATATCTACTGCTGTAAGGGGTCACTTTGTGCACACTAAGCAAAAGTTTATGTGTACAGCAAAGATAAATCTGGATACATGTGACAATGGTGTGATGCGGTCTGTCTGTCGGGTATATAAACCGAGTATGCTTGAAATAAACGATCCGCATAGCAGAAGCTGCAATTGGTTTTTTTGAACTCAATTGGAAGGGCTAGGCGGACAAGGGATCAATAAACATCAGGT                         ]
[-] EMBL CD113864             [                                                                                                   ACTCGTAATTATTAAAGTGAAAAGTTGGTGGTATGATATCTAGGATTACTGAATCAAGAAGCGGCTCAACTCTAAATACGTTTGTCAAACAGTGCCACAGTTGAACTAGAATTTCGGTATAAGTCCCGCATACTGACAATAATTTGTGGGACACAGCGAAGATGCAAGAAGTTACATCCATTACAAGGGTTAACAGAATTTTTGTGAAACTTGTCAAATTAATTGTCATAAAAACTACTTGAAGATGAATAATCATAAAACTGGATTGGATAATGTAACTGGTGATATCTACTGCTGTAAGGGGTCACTTTGTGCACACTAAGCAAAAGTTTATGTGTACAGCAAAGATAAATCTGGATACATGTGACAATGGTGTGATGCGGTCTGTCTGTCGGGTATATAAACCGAGTATGCTTGAAATAAACGATCCGCATAGCAGAAGCTGCAATTGGTTTTTTTGAACTCAATTGGAAGGGCTAGTCGGACAAGGGATCAATC                                   ]
[-] EMBL CD113879             [                                                                                                           TTATTAAAGTGAAAATTTGGTGTTATGATATCTAGGATTACTGAATCAAGAAGCGGCTCAACTCTAAATACGTTTGTCAAACAGTGCCACAGTTGAACTAGAATTTCGGTATAAGTCCCGCATACTGACAATAATTTGTGGGACACAGCGAAGATGCAAGAAGTTACATCCATTACAAGGGAGAACAGAATTTTTGTGAAACTTGTCAAATTAATTGTCATAAAAACTACTTGAAGATGAATAATCATAAAACTGGATTGGATAATGTAACTGGTGATATCTACTGCTGTAAGGGGTCACTTTGTGCACACTAAGCAAAAGTTTATGTGTACAGCAAAGATAAATCTGGATACATGTGACAATGGTGTGATGCGGTCTGTCTGTCGGGTATATAAACCGAGTATGCTTGAAATAAACGATCCGCATAGCAGAAGCTGCAATTGGTTTTTTTGAACTCAATTGGAAGGGCTAGGCGGACAAGGGATTAATCAACATCAGCTAGACA                    ]
[-] EMBL CD113858             [                                                                                                                                       TATCTAGGATTACTGAATCAAGAAGCGGCTCAACTCTAGATACGTTTGTCAAACAGTGCCACAGTTGAACTAGAATTTCGGTATAAGTCCCGCATACTGACAATAATTTGTGGGACACAGCGAAGATGCAAGAAGTTACATCCATTACAAGGGTGAACAGAATTTTTGTGAAACTTGTCAAATTAATTGTCATAAAAACTACTTGAAGATGAATAATCATAAAACTGGATTGGATAATGTAACTGGTGATATCTACTGCTGTAAGGGGTCACTTTGTGCACACTAAGCAAAAGTCTATGTGTACAGCAAAGATAAATCTGGATACATGTGACAATGGTGTGATGCGGTCTGTCTGTCGGGTATATAAACCGAGTATGCTTGAAATAAACGATCCGCATAGCAGAAGCTGCAATTGGTTTTTTTGAACTCAATTGGAAGGGCTAGGCGGACAAGGGATCAATCAA ATCAGGTAGACCAGCTCAGTTACCTGGTAGAC]
[-] EMBL CD113745             [                                                                                                                                                                cgctTCAACTCTAGATACGTTTGTCAAACAGTGCCACAGTTGAACTAGAATTTCGGTGTAAGTCCCGCATACTGACAATAATTTGTGGGACACAGCGAAGATGCAAGAAGTTACATCCATTACAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]


>consensus_9323#0 TCTGTTTCCCTGTGCTGAGGCAGTCGACCGGAAATGTGATTGAGTATGGTAAGTTTAGGT CGTTCTAAAAGTCGCGGGAATCTGATGAATAGAATGACTCGTAATTATTAAAGTGAAAAG TTGGTGGTATGATATCTAGGATTACTGAATCAAGAAGCGGCTCAACTCTAAATACGTTTG TCAAACAGTGCCACAGTTGAACTAGAATTTCGGTATAAGTCCCGCATACTGACAATAATT TGTGGGACACAGCGAAGATGCAAGAAGTTACATCCATTACAAGGGTGAACAGAATTTTTG TGAAACTTGTCAAATTAATTGTCATAAAAACTACTTGAAGATGAATAATCATAAAACTGG ATTGGATAATGTAACTGGTGATATCTACTGCTGTAAGGGGTCACTTTGTGCACACTAAGC AAAAGTTTATGTGTACAGCAAAGATAAATCTGGATACATGTGACAATGGTGTGATGCGGT CTGTCTGTCGGGTATATAAACCGAGTATGCTTGAAATAAACGATCCGCATAGCAGAAGCT GCAATTGGTTTTTTTGAACTCAATTGGAAGGGCTAGGCGGACAAGGGATCAATCAACATC AGGTAGACAAGCTCAGTTACCTGGTAGAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)