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Schistosoma mansoni
cluster # 9341 cluster # 9341       Sequences # 9       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9341#0 length = 1185 sequences # 9  

consensusID : consensus_9341#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 1185
fasta sequence
                              [ATAAATCTAATTGTCGACCTATAATTGAACCGAATAAATTACTTAATAATATACCGAACACATCAAATGTTGATCCATTATTAATTACAGAATTAGAAAATTCTATATATCATATTAAATGGATTAAATTTAATAATCAAACACGTCCAATTATAACACAAAATAATAATGGTCCATGCCCAATGATTGCTATAGCAAATGTACTTTTATTACGTGGAACAATTAATTTATCAAATGATAGTGAATTAATCAGTGGTAATCGTTTATTGGCTATTCTTAGTGAATTACTTTTGTCGAAAGCTCCTAATGATCTTGATTACGACCAACAAATTAATTATGAGTCAAATTTCCGTGATGTACTTTGCTTATTTCCCAGTTTACAAACTGGACTTGATATAAATATCAGGTTTA-CT-GGTGTGGCAGATTTTGAATACACCTCAACATTAAGCTTATTTGATTTGTTCAACATACACATTTATCATGGTTGGCTTGTGGATCCTGATGAACATGATTTAGCTGCAACTGTTGGTAACAGAACTTATAATCAATTAACTGAAGAGTTACTCCGACTAGAATCATCTGATAATGATGAGGATTTAAAAAGAAGTATACTTGTTGAATGGTTTCTAAACGAAAGCGGTTCACAGCTAACTTTTCATGGTCTAAGCCAGCTAGTTACAACGTTACACGATGAAGAATTGGCCGTGTTTTTTCGAAATAATCACTTTAACACCATATTAAAACATAAAGATTCAATATTTGTATTAGTCACAGACATGGGTCTTCTCAATGAACCAAATATTGTTTGGGAGTTACTAAATGATTTAGATGGTGATACACAATTTGTTGATTGTTCATTTCAATTATTTTGTCCAACAACATCTAATTCATCAGTTCGAAAAACGTCTGATGCTG-TTCGTGTTATTACAATTAAATCGGATAAGTTGGATTCAAAATCTAAAACCGATTGTATAAATACTACTAATAGTAGTAATAGTAAAGATAATTTTGTTGAAAAACAATGCTATCCTGATTCCATACCTGTGTATAATTTCACTGAGAGTAATTCAACTTCATTAGATTATGATTTATGCAAAATGCTTCAAGAAGAAGAAATCAGAGCTTCAAATCAAGATCCGGAAACATTTTGGAAATTATACAAATGAAATATATACCTCAGCTTGT]

[-] EMBL CD167532             [ATAAATCTAATTGTCGACCTATAATTGAACCGAATAAATTACTTAATAATATACCGAACACATCAAATGTTGATCCATTATTAATTACAGAATTAGAAAATTCTATATATCATATTAAATGGATTAAATTTAATAATCAAACACGTCCAATTATAACACAAAATAATAATGGTCCATGCCCAATGATTGCTATAGCAAATGTACTTTTATTACGTGGAACAATTAATTTATCAAATGATAGTGAATTAATCAGTGGTAATCGTTTATTGGCTATTCTTAGTGAATTACTTTTGTCGAAAGCTCCTAATGATCTTGATTACGACC ACCAATTAATTATGAGTCCAATTTCCGTGATGTACTGTGCTTATTTCCCAGTTTACAAACTGGACTTGATATAAATATCA GTTTACCTCGGTGTGGCAt                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD191733             [                                                             ATCAAATGTTGATCCATTATTAATTACAGAATTAGAAAATTCTATATATCATATTAAATGGATTAAATTTAATAATCAAACACGTCCAATTATAACACAAAATAATAATGGTCCATGCCCAATGATTGCTATAGCAAATGTACTTTTATTACGTGGAACAATTAATTTATCAAATGATAGTGAATTAATCAGTGGTAATCGTTTATTGGCTATTCTTAGTGAATTACTTTTGTCGAAAGCTCCTAATGATCTTGATTACGACCAACAAATTAATTATGAGTCAAATTTCCGTGATGTACTTTGCTTATTTCCCAGTTTACAAACTGGACTTGATATAAATATCAGGTTTA CT GGTGTGGCAGATTTTGAATACACCTCAACATTAAGCTTATTTGATTTGTTCAACATACACATTTATCATGGTTGGCTTGTGGATCCTGATGAACATGATTTAGCTGCAACTGTTGGTAACAGAACTTATAATCAATTAGCTGAAGAGTTACTCCGACTAGAATCATCTGATAATGATGAGGATNTAAAAAGAAGTATACTTGTTGAATGGTTTCTAAACGAAAGCGGTTCACAGCTAACTTTTCATGGTCTAAcc                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD191772             [                                                                                                                                                                                                          ACTTTTATTACGTGGAACAATTAATTTATCAAATGATAGTGAATTAATCAGTGGTAATCGTTTATTGGCTATTCTTAGTGAATTACTTTTGTCGAAAGCTCCTAATGATCTTGATTACGACCAACAAATTAATTATGAGTCAAATTTCCGTGATGTACTTTGCTTATTTCCCAGTCTACAAACTGGACTTGATATAAATATCAGGTTTA CT GGTGTGGCAGATTTTGAATACACCTCAACATTAAGCTTATTTGATTTGTTCAACATACACATTTATCATGGTTGGCTTGTGGATCCTGATGAACATGATTTAGCTGCAACTGTTGGTAACAGAACTTATAATCAATTAACTGAAGAGTTACTCCGACTAGAATCATCTGATAATGATGAGGATTTAAAAAGAAGTATACTTGTTGAATGGTTTCTAAACGAAAGCGGTTCACAGCTAACTTTTCATGGTCTAAGCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL AI975360             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AATACACCTCAACATTAAGCTTATTTGATTTGTTCAACATACACATTTATCATGGTTGGCTTGTGGATCCTGATGAACATGATTTAGCTGCAACTGTTGGTAACAGAACTTATAATCAATTAACTGAAGAGTTACTCCGACTAGAATCATCTGATAATGATGAGGATTTAAAAAGAAGTATACTTGTTGAATGGTTTCTAAACGAAAGCGGTTCACAGCTAACTTTTCATGGTCTAAGCCAGCTAGTTACAACGTTACACGATGAAGAATTGGCCGTGTTTTTTCGAAATAATCACTTTAACACCATATTAAAACATAAAGATTCAATATTTGTATTAGTCACAGACATGGGTCTTCTCAACGAACCAAATATTGTTTGGGAGTTACTAAATGATTTAGATGGTGATACACAATTTGTTGATTGTTCATTTCAATTATTTTGTCCAACAACATCTAATTCATCAGTTCGAAAAACGTCTAATGCTG TTCGTGTTATTACAATTAAATCGGATAAGTTGGGTTCAAAATCTAA                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD152250             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAGTATACTTGTTGAATGGTTTCTAAACGAAAGCGGTTCACAGCTAACTTTTCATGGTCTAAGCCAGCTAGTTACAACGTTACACGATGAAGAATTGGCCGTGTTTTTTCGAAATAATCACTTTAACACCATATTAAAACATAAAGATTCAATATTTGTATTAGTCACAGACATGGGTCTTCTCAATGAACCAAATATTGTTTGGGAGTTACTAAATGATTTAGATGGTGATACACAATTTGTTGATTGTTCATTTCAATTATTTTGTCCAACAACATCTAATTCATCAGTTCGAAAAACGTCTGATGCTG TTCGTGTTATTACAATTAAATCGGATAAGTTGGATTCAAAATCCAAAACCGATTGTATAAATACTACTAATAGTAGTAATAGTAAAGATAATTTTGTTGAAAAACAATGCTATCCTGATCCCATACCTGTGTA                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD152350             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAGTATACTTGTTGAATGGTTTCTAAACGAAAGCGGTTCACAGCTAACTTTTCATGGTCTAAGCCAGCTAGTTACAACGTTACACGATGAAGAATTGGCCGTGTTTTTTCGAAATAATCACTTTAACACCATATTAAAACATAAAGATTCAATATTTGTATTAGTCACAGACATGGGTCTTCTCAATGAACCAAATATTGTTTGGGAGTTACTAAATGATTTAGATGGTGATACACAATTTGTTGATTGTTCATTTCAATTATTTTGTCCAACAACATCTAATTCATCAGTTCGAAAAACGTCTGATGCTG TTCGTGTTATTACAATTAAATCGGATAAGTTGGATTCAAAATCTAAAACCGATTGTATAAATACTACTAATAGTAGTAATAGTAAAGATAATTTTGTTGAAAAACAATGCTATCCTGATTCCATAC                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD152317             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAGTATACTTGTTGAATGGTTTCTAAACGAAAGCGGTTCACAGCTAACTTTTCATGGTCTAAGCCAGCTAGTTACAACGTTACACGATGAAGAATTGGCCGTGTTTTTTCGAAATAATCACTTTAACACCATATTAAAACATAAAGATTCAATATTTGTATTAGTCACAGACATGGGTCTTCTCAATGAACCAAATATTGTTTGGGAGTTACTAAACGATTTAGATGGTGATACACAATTTGTTGATTGTTCATTTCAATTATTTTGTCCAACAACATCTAATTCATCAGTTCGAAAAACGTCTGATGCTG TTCGTGTTATTACAATTAAATCGGATAAGTTGGATTCAAAATCTAAAACCGATTGTATAAATACTACTAATAGTAGTAATAGTAAAGATAATTTTGTTGAAAAACAATGCTAT                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD152342             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAGTATACTTGTTGAATGGTTTCTAAACGAAAGCGGTTCACAGCTAACTTTTCATGGTCTAAGCCAGCTAGTTACAACGTTACACGATGAAGAATTGGCCGTGTTTTTTCGAAATAATCACTTTAACACCATATTAAAACATAAAGATTCAATATTTGTATTAGTCACAGACATGGGTCTTCTCAATGAACCAAATATTGTTTGGGAGTTACTAAATGATTTAGATGGTGATACACAATTTGTTGATTGTTCATTTCAATTATTTTGTCCAACAACATCTAATTCATCAGTTCGAAAAACGTCTGATGCTG TTCGTGTTATTACAATTAAATCGGATAAGTTGGATTCAAAATCTAAAACCGATTGTATAAATACTACTAATAGTAGTAATAGTAAAGATAATTTTGTTGAAAAACAATGCTATCCTGATTCCATACCTGTGTATAATTTCACTG                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD152208             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TATTAACACATAAAGATTCAATATTTGTATCAGTCACAGACATGGGTCTTCTCAATGAACCAAATATTGTTTGGGAGTTACTAAATGATTTAGATGGTGATACACAATTTGTTGATTGTTCATTTCAATTATGTTGTCCAACAACATCTAATTCATCAGTTCGAAAAACGTCTGATGCTGCTTCGTGTTATTACAATTAAATCGGATAAGTTGGATTCACAATCTAAAACCGATTGTATATATACTACTAATAGTAGTAATAGTAAAGATAATTTTGTTGAAAAACAATGCTATCCTGATTCCATACCTGTGTATAATTTCACTGAGAGTAATTCAACTTCATTAGATTATGATTTATGCAAAATGCTTCAAGAAGAAGAAATCAGAGCTTCAAATCAAGATCCGGAAACATTTTGGAAATTATACAAATGAAATATATACCTCAGCTTGT]


>consensus_9341#0 ATAAATCTAATTGTCGACCTATAATTGAACCGAATAAATTACTTAATAATATACCGAACA CATCAAATGTTGATCCATTATTAATTACAGAATTAGAAAATTCTATATATCATATTAAAT GGATTAAATTTAATAATCAAACACGTCCAATTATAACACAAAATAATAATGGTCCATGCC CAATGATTGCTATAGCAAATGTACTTTTATTACGTGGAACAATTAATTTATCAAATGATA GTGAATTAATCAGTGGTAATCGTTTATTGGCTATTCTTAGTGAATTACTTTTGTCGAAAG CTCCTAATGATCTTGATTACGACCAACAAATTAATTATGAGTCAAATTTCCGTGATGTAC TTTGCTTATTTCCCAGTTTACAAACTGGACTTGATATAAATATCAGGTTTACTGGTGTGG CAGATTTTGAATACACCTCAACATTAAGCTTATTTGATTTGTTCAACATACACATTTATC ATGGTTGGCTTGTGGATCCTGATGAACATGATTTAGCTGCAACTGTTGGTAACAGAACTT ATAATCAATTAACTGAAGAGTTACTCCGACTAGAATCATCTGATAATGATGAGGATTTAA AAAGAAGTATACTTGTTGAATGGTTTCTAAACGAAAGCGGTTCACAGCTAACTTTTCATG GTCTAAGCCAGCTAGTTACAACGTTACACGATGAAGAATTGGCCGTGTTTTTTCGAAATA ATCACTTTAACACCATATTAAAACATAAAGATTCAATATTTGTATTAGTCACAGACATGG GTCTTCTCAATGAACCAAATATTGTTTGGGAGTTACTAAATGATTTAGATGGTGATACAC AATTTGTTGATTGTTCATTTCAATTATTTTGTCCAACAACATCTAATTCATCAGTTCGAA AAACGTCTGATGCTGTTCGTGTTATTACAATTAAATCGGATAAGTTGGATTCAAAATCTA AAACCGATTGTATAAATACTACTAATAGTAGTAATAGTAAAGATAATTTTGTTGAAAAAC AATGCTATCCTGATTCCATACCTGTGTATAATTTCACTGAGAGTAATTCAACTTCATTAG ATTATGATTTATGCAAAATGCTTCAAGAAGAAGAAATCAGAGCTTCAAATCAAGATCCGG AAACATTTTGGAAATTATACAAATGAAATATATACCTCAGCTTGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)