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Schistosoma mansoni
cluster # 9347 cluster # 9347       Sequences # 9       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9347#0 length = 1153 sequences # 9  

consensusID : consensus_9347#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 1153
fasta sequence
                              [CGCTTGTGAGGTAAACGCCTAATCCCTTAATTCACACCATCCACCTGCTTCTCATTCACGATTCTTAGTTTCATCCGCTCTGACTGTAATCTTTGACGTATATTTCAAATAAGTGGATTTCATTTCAATCAGTCAGACATTTTGGCCAACTTTAAATCGTCACCTACTATGAATCATACCAGGGCTTTACACTTTGTCTTCAAGGTGGCCAATCGTAATGAAACAATTGATTTTTACAAACGGATTCTTGGAATGAAGGTGTTACGACATGAAGAATTTACTGAAGGTTGTAAGGCTTCATGTAACGGACCATATGATGGGAAGTGGAGCAAAACCATGATAGGTTATGGACCTGAGGATAATCATTTTGTCGTTGAGTTGACTTATAATTATGGGATTGGTGCTTATCAACTTGGTAATGATTTTCA-GTATATTCGTATTCATAATAAGGATGCATATTCAAGAATTATCGGTGGATTATGGCCTATCACATTGAAAGAGTCAGATTCAGTAAAAGTGGAAGCTCCTGGTGGATATGCATTTTGGGTGCACAACTGTGATAGTGATGGGGATCCAGTTCGAATGGTGGCTTTAGCTACTTCAAATCTTAAACGATCCACTGATTATTGG-TCTCATAAACTTAATATGACACTTGTGTCATCTAGTTCAGATGAAGCAGTGTTTTGTTATTCACCAAATCAGTGTACTTTAAAACTAATATCCATTCAAAAACCTATTGATCATGCTAGCGCATTTGGTCGTATAGCTTTTGCATGCCCAAGTAGTCAATTACCAATTTTACAAAAAACGATGGATTCACAAAATGAAACGATTCTTACTCGTTTAGTCAGCTTGGATACTCCAGGAAAAGCTACTGTACAAGTGATTATTTTAGCTGATCCAGATGGTCATGAAATCTGTTTTGTTGGAGATGAAGCTTTTAGACAGTTGTCACAAGTGGATCCACAAGCGGATAATTTATTACAATCAGCTATAGCCTCAGATAAAAGTGATGAATGGTTCAATAAACATGGTGGCAAGACAACAAAATAAAACTATTGTTTTCAACTCATTGAATCTTGTGTGTATGGTATCATGAATTGTCGTGTATGGAATGTTTGTTTTTTCTACTTTTTTTTCTAAATAATATACA]

[+] EMBL CD080382             [CGCTTGTGAGGTAAACGCCTAATCCCTTAATTCACACCATCCACCTGCTTCTCATTCACGATTCTTAGTTTCATCCGCTCTGACTGTAATCTTTGACGTATATTTCAAATAAGTGGATTTCATTTCAATCAGTCAGACATTTTGGCCAACTTTAAATCGTCACCTACTATGAATCATACCAGGGCTTTACACTTTGTCTTCAAGGTGGCCAATCGTAATGAAACAATTGATTTTTACAAACGGATTCTTGGAATGAAGGTGTTACGACATGAAGAATTTACTGAAGGTTGTAAGGCTTCATGTAACGGACCATATGATGGGAAGTGGAGCAAAACCATGATAGGTTATGGACCTGAGGATAATCATTTTGTCGTTGAGTTGACTTATAATTATGGGATTGGTGCTTATCAACTTGGTAATGATTTTCA GTATATTCGTATTCATAATAAGGATGCATATTCAAGAATTATCGGTGGATTATGGCCTATCACATTGAAAGAGTCAGATTCAGTAAAAGTGGAAGCTCCTGGTGGATATGCATTTTGGGTGCACAACTGTGATAGTGATGGGGATCCAGTTCGAATGGTGGCTTTAGCTACTTCAAATCTTAAACGATCCACTGATTATTGG TCTCATAAACTTAATATGACACTTGTGTCATCTAGTTCAGATGAAGCAGTGgt                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD081236             [                                                                   gcttgtgagGCTCTGACTGT ATCTTTGACGT TATTT AAATAAGTGGATTTCATTTCAATCAGTCAGACATTTTGGCCAACTTTAAATCGTCACCTACTATGAATCATACCAGGGCTTTACACTTTGTCTTCAAGGTGGCCAATCGTAATGAAACAATTGATTTTTACAAACGGATTCTTGGAATGAAGGTGTTACGACATGAAGAATTTACTGAAGGTTGTAAGGCTTCATGTAACGGACCATATGATGGGAAGTGGAGCAAAACCATGATAGGTTATGGACCTGAGGATAATCATTTTGTCGTTGAGTTGACTTATAATTATGGGATTGGTGCTTATCAACTTGGTAATGATTTTCA GTATATTCGTATTCATAATAAGGATGCATATTCAAGAATTATCGGTGGATTATGGCCTATCACATTGAAAGAGTCAGATTCAGTAAAAGTGGAAGCTCCTGGTGGATATGCATTTTGGGTGCACAACTGTGATAGTGATGGGGATCCAGTTCGAATGGTGGCTTTAGCTACTTCAAATCTTAAACGATCCACTGATTATTGG TCTCATAAACTTAATATGACACTTGTGTCATCTAGTTCAGATGAAGCAGTGTTTTGTTATTCACCAAATCAGTGTACTTTAAAACTAATATCCATTCAAAAACCTATTGATCATGCTAGCGCATTTGGTCGTATAGCTTTTGCATGCCCAAGTAGTCAATTACCAATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD159548             [                                                                                                                                 CAGTTAAACATTTTGACCGACTTTAAATCGTCACCTCCTATGAATCATACCAGGGCTTTACACTTTGTCTTCAAAGTGGCCAATCGTAATGAAACAATTGATTTTTACAAACGGATTCTTGGAATGAAGGTGTTACGACATGAAGAATTTACTGAAGGTTGTAAGGCTTCATGTAACGGACCATATGATGGGAAGTGGAGCAAAACCATGATAGGTTATGGACCTGAGGATAATCATTTTGTCGTTGAGTTGACTTATAATTATGGGATTGGTGCTTATCAACTTGGTAATGATTTTCAGGTGTGTTTTTATTgt                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD159570             [                                                                                                                                  AGTTAAACATTTTGACCGACTTTAAATCGTCACCTCCTATGAATCACACCAGGGCTTTACACTTTGTCTTCAAAGTGGCCAATCGTAATGAAACAATTGATTTTTACAAACGGATTCTTGGAATGAAGGTGTTACGACATGAAGAATTTACTGAAGGTTGTAAGGCTTCATGTAACGGACCATATGATGGGAAGTGGAGCAAAACCATGATAGGTTATGGACCTGAGGATAATCATTTTGTCGTTGAGTTGACTTATAATTATGGGATTGGTGCTTATCAACTTGGTAATGATTTTCAGGTGTGTTTTTATTgcc                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD079244             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CGGTGGATTATGGCCTATCACATTGAAAGAGTCAGATTCAGTAAAAGTGGAAGCTCCTGGTGGATATGCATTTTGGGTGCACAACTGTGATAGTGATGGGGATCCAGTTCGAATGGTGGCTTTAGCTACTTCAAATCTTAAACGATCCACTGATTATTGG TCTCATAAACTTGGTATGACACTTGTGTCATCTAGTTCAGATGAAGCAGTGTTTTGTTATTCACCAAATCAGTGTACTTTAAAACTAATTTCCATTCAAAAACCTATTGATCATGCTAGCGCATTTGGTCGTATAGCTTTTGCATGCCCAAGTAGTCAATTACCAATTTTACAAAAAACGATGGATTCAAAAAATGAAACGATTCTTACTCGTTTAGTCAGCTTGGATACTCCAGGAAAAGCTACTGTACAAGTGATTATTTTAGCTGATCCAGATGGTCATGAAATCTTTTTTGTTGGAGATGAAGCTTTTAGACAGTTGTCACAAGTGGATCCACAAGCGGATAGTTTACTACAATCAGCTATAGCCTCAGATAAAAGTGATGAATGGTTCAATAAACATGGTGGCAAGACAACAAAATANAACTATTGTTTTCAACTCATTGAATCTTGTGTGTATGGTATCATGAATTGTCATGTATGGAATGTTNGTTNTTTCTAC TTNTTTTCTAAAT ATATAC ]
[-] EMBL CD074478             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATCACA TGAAAGAGTCAGATTCAGTAAAAGTGGAAGCTCCTGGTGGATATGCATTTTGGGTGCACAACTGTGATAGTGATGGGGATCCAGTTCGAATGGTGGCTTTAGCTACTTCAAATCTTAAACGATCCACTGATTATTGG TCTCATAAACTTAATATGACACTTGTGTCATCTAGTTCAGATGAAGCAGTGTTTTGTTATTCACCAAATCAGTGTACTTTAAAACTAATATCCATTCAAAAACCTATTGATCATGCTAGCGCATTTGGTCGTATAGCTTTTGCATGCCCAAGTAGTCAATTACCAATTTTACAAAAAACGATGGATTCACAAAATGAAACGATTCTTACTCGTTTAGTCAGCTTGGATACTCCAGGAAAAGCTACTGTACAAGTGATTATTTTAGCTGATCCAGATGGTCATGAAATCTGTTTTGTTGGAGATGAAGCTTTTAGACAGTTGTCACAAGTGGATCCACAAGCGGATAATTTATTACAATCAGCTATAGCCTCAGATAAAAGTGATGAATGGTTCAATAAACATGGTGGCAAGACAACAAAATAAAACTATTGTTTTCAACTCATTGAATCTTGTGTGTATGGTATCATGAATTGTCGTGTATGGAATGTTTGTTTTTTCTACTTTTTTTTCTAAATAATATACA]
[-] EMBL CD074297             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TTGGGTGCACAACTGTGATAGTGATGGGGATCCAGTTCGAATGGTGGCTTTAGCTACTTCAAATCTTAAACGATCCACTGATTATTGG TCTCATAAACTTAATATGACACTTGTGTCATCTAGTTCAGATGAAGCAGTGTTTTGTTATTCACCAAATCAGTGTACTTTAAAACTAATATCCATTCAAAAACCTATTGATCATGCTAGCGCATTTGGTCGTATAGCTTTTGCATGCCCAAGTAGTCAATTACCAATTTTACAAAAAACGATGGATTCACAAAATGAAACGATTCTTACTCGTTTAGTCAGCTTGGATACTCCAGGAAAAGCTACTGTACAAGTGATTATTTTAGCTGATCCAGATGGTCATGAAATCTGTTTTGTTGGAGATGAAGCTTTTAGACAGTTGTCACAAGTGGATCCACAAGCGGATAATTTATTACAATCAGCTATAGCCTCAGATAAAAGTGATGAATGGTTCAATAAACATGGTGGCAAGACAACAAAATAAAACTATTGTTTTCAACTCATTGAATCTTGTGTGTATGGTATCATGAATTGTCGTGTATGGAATGTTTGTTTTTTCTACTTTTTTTTCTAAATAATATACA]
[-] EMBL CD075067             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ACTTCAAATCTTAAACGATCCACTGA TATTGGTTCTCATAAACTTAATATGACACTTGTGTCATCTAGTTCAGATGAAGCAGTGTTTTGTTATTCACCAAATCAGTGTACTTTAAAACTAATATCCATTCAAAAACCTATTGATCATGCTAGCGCATTTGGTCGTATAGCTTTTGCATGCCCAAGTAGTCAATTACCAATTTTACAAAAAACGATGGATTCACAAAATGAAACGATTCTTACTCGTTTAGTCAGCTTGGATACTCCAGGAAAAGCTACTGTACAAGTGATTATTTTAGCTGATCCAGATGGTCATGAAATCTGTTTTGTTGGAGATGAAGCTTTTAGACAGTTGTCACAAGTGGATCCACAAGCGGATAATTTATTACAATCAGCTATAGCCTCAGATAAAAGTGATGAATGGTTCAATAAACATGGTGGCAAGACAACAAAATAAAACTATTGTTTTCAACTCATTGAATCTTGTGTGTATGGTATCATGAATTGTCGTGTATGGAATGTTTGTTTTTTCTACTTTTTTTTCTAAATAATATACA]
[-] EMBL SMW746               [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GAAACGATTCTTACTCGTTTAGTCAGCTTGGATACTCCAGGAAAAGCTACTGTACAAGTGATTATTTTAGCTGATCCAGATGGTCATGAAATCTGTTTTGTTGGAGATGAAGCTTTTAGACAGTTGTCACAAGTGGATCCNCAACCGGATAATTTATTACAATCAGCTATAGCCTCAGATAAAAGTGATGAATGGTTCAATAAACATGGTGGCAAGACAACAAAATAAAACTATTGTTTTCAACTCATTGAATCTTGTGTGTATGGTATCATGAATTGTCGTGTATGGAATGTTTGTTTTTTCTACTTTTTTTTCTAAATAATATACA]


>consensus_9347#0 CGCTTGTGAGGTAAACGCCTAATCCCTTAATTCACACCATCCACCTGCTTCTCATTCACG ATTCTTAGTTTCATCCGCTCTGACTGTAATCTTTGACGTATATTTCAAATAAGTGGATTT CATTTCAATCAGTCAGACATTTTGGCCAACTTTAAATCGTCACCTACTATGAATCATACC AGGGCTTTACACTTTGTCTTCAAGGTGGCCAATCGTAATGAAACAATTGATTTTTACAAA CGGATTCTTGGAATGAAGGTGTTACGACATGAAGAATTTACTGAAGGTTGTAAGGCTTCA TGTAACGGACCATATGATGGGAAGTGGAGCAAAACCATGATAGGTTATGGACCTGAGGAT AATCATTTTGTCGTTGAGTTGACTTATAATTATGGGATTGGTGCTTATCAACTTGGTAAT GATTTTCAGTATATTCGTATTCATAATAAGGATGCATATTCAAGAATTATCGGTGGATTA TGGCCTATCACATTGAAAGAGTCAGATTCAGTAAAAGTGGAAGCTCCTGGTGGATATGCA TTTTGGGTGCACAACTGTGATAGTGATGGGGATCCAGTTCGAATGGTGGCTTTAGCTACT TCAAATCTTAAACGATCCACTGATTATTGGTCTCATAAACTTAATATGACACTTGTGTCA TCTAGTTCAGATGAAGCAGTGTTTTGTTATTCACCAAATCAGTGTACTTTAAAACTAATA TCCATTCAAAAACCTATTGATCATGCTAGCGCATTTGGTCGTATAGCTTTTGCATGCCCA AGTAGTCAATTACCAATTTTACAAAAAACGATGGATTCACAAAATGAAACGATTCTTACT CGTTTAGTCAGCTTGGATACTCCAGGAAAAGCTACTGTACAAGTGATTATTTTAGCTGAT CCAGATGGTCATGAAATCTGTTTTGTTGGAGATGAAGCTTTTAGACAGTTGTCACAAGTG GATCCACAAGCGGATAATTTATTACAATCAGCTATAGCCTCAGATAAAAGTGATGAATGG TTCAATAAACATGGTGGCAAGACAACAAAATAAAACTATTGTTTTCAACTCATTGAATCT TGTGTGTATGGTATCATGAATTGTCGTGTATGGAATGTTTGTTTTTTCTACTTTTTTTTC TAAATAATATACA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)