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Schistosoma mansoni
cluster # 9399 cluster # 9399       Sequences # 9       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9399#0 length = 909 sequences # 9  

consensusID : consensus_9399#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 909
fasta sequence
                              [GATTGTCGAACCTGTGAAGTTGACACCTCAAATGATGTTTATACGTCATATTTTGTTAACGAAATTGGACCGAACTACCGTTAATACAACTTTACGGCTAATTCGAAAAATGGATTGGAATGATCAAGAACTTGTCGAATTTACGTGCACCCTTTTCACTAGGGCGTGGGATGTTCGTTATACGAATATAAACTGTCTAGCCAGTGTGTTATCTGGGTTAGCTACTTATCATTCGGACTTTGCCATGGCTGTTGTCGACAATGTCATCGAAGATATCCGTGTGGGAATGGAGCTCAACCTTCCCAGTTTGAATCAGCGTCGAATTGTAATGGTCAAATACCTTGGTTTGTTGTATAACTATTGTCTGGTGGATTCTCCAGTGATATTTAAAACACTTTACTCTCTTCTCACATTCGGTGTTAGCTTGGATCTTGATTTCCCAAGTATTATTGATCCACCGGATTCATTATTTCGAATTACATTAATTTGCACGC-TACTTGAAACATCT-GGAAGTTTCTTTGATCAGGGTAAAAAGCGACGAAAATTAAATATATCCCTTATATACTTTCAGCGTTACTACTGGTTCAAGCGTTCTCTTCCTATATGGGTGCAGTCGAAAAACGACGCCGAGTTATCATCAGCCAAATCAGTAGGTGAAACGAAGACAGATCTCAATACTGGTGAACTAACGTCTTCGATTGAAGAGCCTGCTGTAAATCATTCTGAAGATTCATTGATACCTAATAATCCTGAATCATCAGTTGATATCTCTGGTCCTAATTCAGATACTCAAACTCATTTACCTATGTTTATTCCTGTGCGTTTTCCTGTTGCAGTAGAGCAACAATATTTTGAAACCTTACAACAGTTCCGTGGTAATGTTGGTCGAGCGAAAAATTTCGCAGAAGC]

[+] EMBL CD199933             [GATTGTCGAACCTGTGAAGTTGACACCTCAAATGATGTTTATACGTCATATTTTGTTAACGAAATTGGACCGAACTACCGTTAATACAACTTTACGGCTAATTCGAAAAATGGATTGGAATGATCAAGAACTTGTCGAATTTACGTGCACCCTTTTCACTAGGGCGTGGGATGTTCGTTATACGAATATAAACTGTCTAGCCAGTGTGTTATCTGGGTTAGCTACTTATCATTCGGACTTTGCCATGGCTGTTGTCGACAATGTCATCGAAGATATCCGTGTGGGAATGGAGCTCAACCTTCCCAGTTTGAATCAGCGTCGAATTGTAATGGTCAAATACCTTGGTTTGTTGTATAACTATTGTCTGGTGGATTCTCCAGTGATATTTAAAACACTTTACTCTCTTCTCACATTCGGTGTTAGCTTGGATCTTGATTTCCCAAGTATTATTGATCCACCGGATTCATTATTTCGAATTACATTAATTTGCACGCTTACTTG AACATCTGGGAAG TTCTTTGATCAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD199887             [GATTGTCGAACCTGTGAAGTTGACACCTCAAATGATGTTTATACGTCATATTTTGTTAACGAAATTGGACCGAACTACCGTTAATACAACTTTACGGCTAATTCGAAAAATGGATTGGAATGATCAAGAACTTGTCGAATTTACGTGCACCCTTTTCACTAGGGCGTGGGATGTTCGTTATACGAATATAAACTGTCTAGCCAGTGTGTTATCTGGGTTAGCTACTTATCATTCGGACTTTGCCATGGCTGTTGTCGACAATGTCATCGAAGATATCCGTGTGGGAATGGAGCTCAACCTTCCCAGTTTGAATCAGCGTCGAATTGTAATGGTCAAATACCTTGGTTTGTTGTATAACTATTGTCTGGTGGATTCTCCAGTGATATTTAAAACACTTTACTCTCTTCTCACATTCGGTGTCAGCTTGGATCTTGATTTCCCAAGTATTATTGATCCACCGGATTCATTATTTCGAATTACATTTATTTGCACGC TACTTGAAACATCT GGAAGTTTCTTTGATCAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD199964             [GATTGTCGAACCTGTGAAGTTGACACCTCGAATGATGTTTATACGTCATATTTTGTTAACGAAATTGGACCGAACTACCGTTAATACAACTTTACGGCTAATTCGAAAAATGGATTGGAATGATCAAGAACTTGTCGAATTTACGTGCACCCTTTTCACTAGGGCGCGGGATGTTCGTTATACGAATATAAACTGTCTAGCCAGTGTGTTATCTGGGTTAGCTACTTATCATTCGGACTTTGCCATGGCTGTTGTCGACAATGTCATCGAAGATATCCGTGTGGGAATGGAGCTCAACCTTCCCAGTTTGAATCAGCGTCGAATTGTAATGGTCAAATACCTTGGTTTGTTGTATAACTATTGTCTGGTGGATTCTCCAGTGATATTTAAAACACTTTACTCTCTTCCCACATTCGGTGTTAGCTTGGATCTTGATTTCCCAAGTATTATTGATCCACCGGATTCATTATTTCGAATTACATTAATTTGCACGC TACTTGAAACATCT GGAAGTTTCTTTGATCAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD199814             [GATTGTCGAACCTGTGAAGTTGACACCTCAAATGATGTTTATACGTCATATTTTGTTAACGAAATTGGCCCGAACTACCGTTAATACAACTTTACGGCTAATTCGAAAAATGGATTGGAATGATCAAGAACTTGTCGAATTTACGTGCACCCTTTTCACTAGGGCGTGGGATGTTCGTTATACGAATATAAACTGTCTAGCCAGTGTGTTATCTGGGTTAGCTACTTATCATTCGGACTTTGCCATGGCTGTTGTCGACAATGTCATCGAAGATATCTGTGTGGGAATGGAGCTCAACCTTCCCAGTTTGAATCAGCGTCGAATTGTAATGGTCAAATACCTTGGTTTGTTGTATAACTATTGTCTGGTGGATTCTCCAGTGATATTTAAAACACTTTACTCTCTTCTCACATTCGGTGTTAGCTTGGATCTTGATTTCCCAAGTATTATTGATCCACCGGATTCATTATTTCGAATTACATTAATTTGCACGC TACTTGAAACATCT GGAAGTTTCTTTGATCAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD199893             [GATTGTCGAACCTGTGAAGTTGACACCTCAAATGATGTTTATACGTCATATTTTGTTAACGAAATTGGACCGAACTACCGTTAATACAACTTTACGGCTAATTCGAAAAATGGATTGGAATGATCAAGAACTTGTCGAATTTACGTGCACCCTTTTCACTAGGGCGTGGGATGTTCGTTATACGAATATAAACTGTCTAGCCAGTGTGTTATCTGGGTTAGCTACTTATCATTCGGACTTTGCCATGGCTGTTGTCGACAATGTCATCGAAGATATCCGTGTGGGAATGGAGCTCAACCTTCCCAGTTTGAATCAGCGTCGAATTGTAATGGTCAAATACCTTGGTTTGTTGTATAACTATTGTCTGGTGGATTCTCCAGTGATATTTAAAACACTTTACTCTCTTCTCACATTCGGTGTTAGCTTGGATCTTGATTTCCCAAGTATTATTGATCCACCGGATTCATTATTTCGAATTACATTAATTTGCACGC TACTTGAAACATCT GGAAGTTTCTTTGATCAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD200018             [GATTGCCGAACCTGTGAAGTTGACACCTCAAATGATGTTTATACGTCATATTTTGTTAACGAAATTGGACCGAACTACCGTTAATACAACTTTACGGCTAATTCGAAAAATGGATTGGAATGATCAAGAACTTGTCGAATTTACGTGCACCCTTTTCACTAGGGCGTGGGATGTTCGTTATACGAATATAAACTGTCTAGCCAGTGTGTTATCTGGGTTAGCTACTTATCATTCGGACTTTGCCATGGCTGTTGTCGACAATGTCATCGAAGATATCCGTGTGGGAATGGAGCTCAACCTTCCCAGTTTGAATCAGCGTCGAATTGTAATGGTCAAATACCTTGGTTTGTTGTATAACTATTGTCTGGTGGATTCTCCAGTGATATTTAAAACACTTTACTCTCTTCTCACATTCGGTGTTAGCTTGGATCTTGATTTCCCAAGCATTATTGATCCACCGGATTCATTATTTCGAATTACATTAATTTGCACGC TACTTGAAACATCT GGGAGTTTCTTTGATCAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD199810             [GATTGTCGAACCTGTGAAGTTGACACCTCAAATGATGTTTATACGTCATATTTTGTTAACGAAATTGGACCGAACTACCGTTAATACAACTTTACGGCTAATTCGAAAAATGGATTGGAATGATCAAGAACTTGTCGAATTTACGTGCACCCTTTTCACTAGGGCGTGGGATGTTCGTTATACGAATATAAACTGTCTAGCCAGTGTGTTATCTGGGTTAGCTACTTATCATTCGGACTTTGCCATGGCTGTTGTCGACAATGTCATCGAAGATATCCGTGTGGGAATGGAGCTCAACCTTCCCAGTTTGAATCAGCGTCGAATTGTAATGGTCAAATACCTTGGTTTGTTGTATAACTATTGTCTGGTGGATTCTCCAGTGATATTTAAAACACTTTACTCTCTTCTCACATTCGGTGTTAGCTTGGATCTTGATTTCCCAAGCATTATTGATCCACCGGATTCATTATTTCGAATTACATTAATTTGCACGC TACTTGAAACATCT GGAAGTTTCTTTGATCAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD199825             [GATTGTCGAACCTGTGAAGTTGACACCTCAAATGATGTTTATACGTCATATTTTGTTAACGAAATTGGACCGAACTACCGTTAATACAACTTTACGGCTAATTCGAAAAATGGATTGGAATGATCAAGAACTTGTCGAATTTACGTGCACCCTTTTCACTAGGGCGTGGGATGTTCGTTATACGAATATAAACTGTCTAGCCAGTGTGTTATCTGGGCTAGCTACTTATCATTCGGACTTTGCCATGGCTGTTGTCGACAATGTCATCGAAGATATCCGTGTGGGAATGGAGCTCAACCTTCCCAGTTTGAATCAGCGTCGAATTGTAATGGTCAAATACCTTGGTTTGTTGTATAACTATTGTCTGGTGGATTCTCCAGTGATATTTAAAACACTTTACTCTCTTCTCACATTCGGTGTTAGCTTGGATCTTGATTTCCCAAGTATTATTGATCCACCGGATTCATTATTTCGAATTACATTAATTTGCACGC TACTTGAAACATCT GGAAGTTTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD124778             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CTTCTCACATTCGGTGTTAGCTTGGATCTTGATTTCCCAAGCATTATTGATCCACCGGATTCATTATTTCGAATTACATTAATTTGCACGC TACTTGAAACATCT GGAAGTTTCTTTGATCAGGGTAAAAAGCGACGAAAATTAAATATATCCCTTATATACTTTCAGCGTTACTACTGGTTCAAGCGTTCTCTTCCTATATGGGTGCAGTCGAAAAACGACGCCGAGTTATCATCAGCCAAATCAGTAGGTGAAACGAAGACAGATCTCAATACTGGTGAACTAACGTCTTCGATTGAAGAGCCTGCTGTAAATCATTCTGAAGATTCATTGATACCTAATAATCCTGAATCATCAGTTGATATCTCTGGTCCTAATTCAGATACTCAAACTCATTTACCTATGTTTATTCCTGTGCGTTTTCCTGTTGCAGTAGAGCAACAATATTTTGAAACCTTACAACAGTTCCGTGGTAATGTTGGTCGAGCGAAAAATTTCGCAGAAGC]


>consensus_9399#0 GATTGTCGAACCTGTGAAGTTGACACCTCAAATGATGTTTATACGTCATATTTTGTTAAC GAAATTGGACCGAACTACCGTTAATACAACTTTACGGCTAATTCGAAAAATGGATTGGAA TGATCAAGAACTTGTCGAATTTACGTGCACCCTTTTCACTAGGGCGTGGGATGTTCGTTA TACGAATATAAACTGTCTAGCCAGTGTGTTATCTGGGTTAGCTACTTATCATTCGGACTT TGCCATGGCTGTTGTCGACAATGTCATCGAAGATATCCGTGTGGGAATGGAGCTCAACCT TCCCAGTTTGAATCAGCGTCGAATTGTAATGGTCAAATACCTTGGTTTGTTGTATAACTA TTGTCTGGTGGATTCTCCAGTGATATTTAAAACACTTTACTCTCTTCTCACATTCGGTGT TAGCTTGGATCTTGATTTCCCAAGTATTATTGATCCACCGGATTCATTATTTCGAATTAC ATTAATTTGCACGCTACTTGAAACATCTGGAAGTTTCTTTGATCAGGGTAAAAAGCGACG AAAATTAAATATATCCCTTATATACTTTCAGCGTTACTACTGGTTCAAGCGTTCTCTTCC TATATGGGTGCAGTCGAAAAACGACGCCGAGTTATCATCAGCCAAATCAGTAGGTGAAAC GAAGACAGATCTCAATACTGGTGAACTAACGTCTTCGATTGAAGAGCCTGCTGTAAATCA TTCTGAAGATTCATTGATACCTAATAATCCTGAATCATCAGTTGATATCTCTGGTCCTAA TTCAGATACTCAAACTCATTTACCTATGTTTATTCCTGTGCGTTTTCCTGTTGCAGTAGA GCAACAATATTTTGAAACCTTACAACAGTTCCGTGGTAATGTTGGTCGAGCGAAAAATTT CGCAGAAGC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)