These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9405#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 632 fasta sequence [ACCTGATGGCATCGTGGGAGGACCAATTAGGTTCAAATGGTTCTGTTACTACCAAATTCTCTCAGTTGGATGTAAATGCACCAGAGTTTATACCAGGTCAGCCATTTTACTACAAGCCTGAGGGAGTGATTTCTTGTAATACGGATAGTGAACCATCTACCGAAACCGTAAAATTGATTAATGTGCTTGAAGAAGAAACAGAAGTTGGATCTGAAAGAGATGAAGATCTCCCCAAAAGTACTATGGCTATCGCTCCGGACAAAGACACACTTAATTTGGTATTTATTGGACATGTCGATGCTGGAAAATCAACAATTGGGGGCCACTTACTGTACTTGACAGATATGGTGGACAAAAGAACTCTGGAGAAGTATGAGCGTGAAGCGAGAGAAAAAAATCGAGAGAGTTGGTATTTGTCATGGGCTTTGGATACAAATCCTGAGGAACGTGATAAAGGTAAAACGGTTGAATGTGGTCGTGCCTACTTCGAAACCTCTAAAAAGCGATTTGTCCTAATTGATGCCCCTGGTCATAAATCCTTCGTACCCAACATGATATCAGGTGCAGCAATTGCTGATATCGCCATACTTGTGATATCGGCTAGGCGTGGTGAATTTGAAACGGGGTTTGAC] [+] EMBL CD181148 [ACCTGATGGCATCGTGGGAGGACCAATTAGGTTCAAATGGTTCTGTTACTACCAAATTCTCTCAGTTGGATGTAAATGCACCAGAGTTTATACCAGGTCAGCCATTTTACTACAAGCCTGAGGGAGTGATTTCTTGTAATACGGATAGTGAACCATCTACCGAAACCGTAAAATT ] [+] EMBL AI976138 [ AATTAGGTTCAAATGGTTCTGTTACTACCAAATTCTCTCAGTTGGATGTAAATGCACCAGAGTTTATACCAGGTCAGCCATTTTACTACAAGCCTGAGGGAGTGATTTCTTGTAATACGGATAGTGAACCATCTACCGAAACCGTAAAATTGATTAATGTGCTTGAAGAAGAAACAGAAGTTGGATCTGAAAGAGATGAAGATCTCCCCAAAAGTACTATGGCTATCGCTCCGGACAAAGACACACTTAATTTGGTATTTATTGGACATGTCGATGCTGGAAAATCAACAATTGGGGGCCACTTACTGTACTTGACAGATATGGTGGACAAAAGAACTCTGGAGAAGTATGAGCGTGAAGCGAGAGAAAAAAATCGAGAGAGTTGGTATTTGTCATGGGCTTTGGATACAAATCCTGAGGAACGTGATAAAGGTAAAACGGTTGAATGTGGTCGTGCCTACTTCGAAACCTCTAAAAAGCGATTTGTCCTAATTGATGCCCCTGGTCATAAATCCTTCGTACCCAACATGATATCAGGTGCAGCAATT ] [+] EMBL CD082977 [ GTTCTGTTACTACCAAATTCTCTCAGTTGGATGTAAATGCACCAGAGTTTATACCAGGTCAGCCATTTTACTACAAGCCTGAGGGAGTGATTTCTTGTAATACGGATAGTGAACCATCTACCGAAACCGTAAAATTGATTAATGTGCTTGAAGAAGAAACAGAAGTTGGATCTGAAAGAGATGAAGATCTCCCCAAAAGTACTATGGCTATCGCTCCGGACAAAGACACACTTAATTTGGTATTTATTGGACATGTCGATGCTGGAAAATCAACAATTGGGGGCCACTTACTGTACTTGACAGATATGGTGGACAAAAGAACTCTGGAGAAGTATGAGCGTGAAGCGAGAGAAAAAAATCGAGAGAGTTGGTATTTGTCATGGGCTTTGGATACAAATCCTGAGGAACGTGATAAAGGTAAAACGGTTGAATGTGGTCGTGCCTACTTCGAAACCTCTAAAAAGCGATTTGTCCTAATTGATGCCCCTGGTCATAAATCCTTCGTACCCAACATGATATCAGGTGCAGCAATTGCTGATATCGCCATACTTGTGATATCGGCTAGGCGTGG ] [-] EMBL CD123141 [ AGTTTATACCAGGTCAGCCATTTTATTACAAGCCTGAGGGAGTGATTTCTTGTAATACGGATAGTGAACCATCTACCGAAACCGTAAAATTGATTAATGTGCTTGAAGAAGAAACAGAAGTTGGATCTGAAAGAGATGAAGATCTCCCCAAAAGTACTATGGCTATCGCTCCGGACAAAGACACACTTAATTTGGTATTTATTGGACATGTCGATGCTGGAAAATCAACAATTGGGGGCCACTTACTGTACTTGACAGATATGGTGGACAAAAGAACTCTGGAGAAGTATGAGCGTGAAGCGAGAGAAAAAAATCGAGAGAGTTGGTATTTGTCATGGGCTTTGGATACAAATCCTGAGGAACGTGATAAAGGTAAAACGGTTGAATGTGGTCGTGCCTACTTCGAAACCTCTAAAAAGCGATTTGTCCTAATTGATGCCCCTGGTCATAAATCCTTCGTACCCAACATGATATCAGGTGCAGCAATTGCTGATATCGCCATACTTGTGATATCGGCTAGGCGTGGTGAATTTGAAACGGGGTTTGAC] [-] EMBL CD123148 [ TTTATACCAGGTCAGCCATTTTACTACAAGCCTGAGGGAGTGATTTCTTGTAATACGGATAGTGAACCATCTACCGAAACCGTAAAATTGATTAATGTGCTTGAAGAAGAAACAGAAGTTGGATCTGAAAGAGATGAAGATCTCCCCAAAAGTACTATGGCTATCGCTCCGGACAAAGACACACTTAATTTGGTATTTATTGGACATGTCGATGCTGGAAAATCAACAATTGGGGGCCACTTACTGTACTTGACAGATATGGTGGACAAAAGAACTCTGGAGAAGTATGAGCGTGAAGCGAGAGAAAAAAATCGAGAGAGTTGGTATTTGTCATGGGCTTTGGATACAAATCCTGAGGAACGTGATAAAGGTAAAACGGTTGAATGTGGTCGTGCCTACTTCGAAACCTCTAAAAAGCGATTTGTCCTAATTGATGCCCCTGGTCATAAATCCTTCGTACCCAACATGATATCAGGTGCAGCAATTGCTGATATCGCCATACTTGTGATATCGGCTAGGCGTGGTGAATTTGAAACGGGGTTTGAC] [+] EMBL CD179270 [ TACAAGCCTGAGGGAGTGATTTCTTGTAATACGGATAGTGAACCATCTACCGAAACCGTAAAATTGATTAATGTGCTTGAAGAAGAAACAGAAGTTGGATCTGAAAGAGATGAAGATCTCCCCAAAAGTACTATGGCTATCGCTCCGGACAAAGACACACTTAATTTGGTATTTATTGGACATGTCGATGCTGGAAAATCAACAATTGGGGGCCACTTACTGTACTTGACAGATATGGTGGACAAAAGAACTCTGGAGAAGTATGAGCGTGAAGCGAGAGAAAAAAATCGAGAGAGTTGGTATTTGTCATGGGCTTTG ] [-] EMBL CD179345 [ ACAAGCCTGAGGGAGTGATTTCTTGTAATACGGATAGTGAACCATCTACCGAAACCGTAAAATTGATTAATGTGCTTGAAGAAGAAACAGAAGTTGGATCTGAAAGAGATGAAGATCTCCCCAAAAGTACTATGGCTATCGCTCCGGACAAAGACACACTTAATTTGGTATTTATTGGACATGTCGATGCTGGAAAATCAACAATTGGGGGCCACTTACTGTACTTGACAGATATGGTGGACAAAAGAACTCTGGAGAAGTATGAGCGTGAAGCGAGAGAAAAAAATCGAGAGAGTTGGTATTTGTCATGGGCTTTGG ] [-] EMBL CD063774 [ GTAAAATTGATTAATGTGCTTGAAGAAGAAACAGAAGTTGGATCTGAAAGAGATGAAGATCTCCCCAAAAGTACTATGGCTATCGCTCCGGACAAAGACACACTTAATTTGGTATTTATTGGACATGTCGATGCTGGAAAATCAACAATTGGGGGCCACTTACTGTACTTGACAGATATGGTGGACAAAAGAACTCTGGAGAAGTATGAGCGTGAAGCGAGAGAAAAAAATCGAGAGAGTTGGTATTTGTCATGGGCTTTGGATACAAATCCTGAGGAACGTGATAAAGGTAAAACGGTTGAATGTGGTCGTGCCTACTTCGAAACCTCTAAAAAGCGATTTGTCCTAATTGATGCCCCTGGTCATAAATCCTTCGTACCCAACATGATATCAGGTGCAGCAATTGCTGATATCGCCATACTTGTGATATC ] [-] EMBL CD064781 [ TCGAGAGAGTTGGTATTTGTCATGGGCTTTGGATACAAATCCTGAGGAACGTGATAAAGGTAAAACGGTTGAATGTGGTCGTGCCTACTTCGAAACCTCTAAAAAGCGATTTGTCCTAATTGATGCCCCTGGTCATAAATC ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||