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Schistosoma mansoni
cluster # 9406 cluster # 9406       Sequences # 9       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9406#0 length = 802 sequences # 9  

consensusID : consensus_9406#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 802
fasta sequence
                              [GGAGTGGCTTCCTAAGAAAACCATCTTATTCGGTTTGGGCGCTCGGGCAGTACTCCAGTCCTCATAAAAATCAAATGACGAAGTGTGGTGCATATATATATATATATTTGGTGCCTCCCTGTATCAATGTTTACGTATCTCAACAGATAAATAAATAAACAGGTATGTATGTAGAAAAAAACAAATTCAGTCATCCACCTTAATAATATCAGTATGAAATGATGAAGGGTTATTTTTTAAAATAGTAAATTCAATTAGAGGTTGATCACCAAAAACACACATGATTTGTTTGAGATTAATGCCAGTAGAGAAAAATATATTATAAGCTTAAGCTAATGCTTTCTAAACAGAAAGAATTATCACCCGTGGTTTAAGAGGCCATGTGTCTAGACATTACATTTTGTCCTATATGGTCTGCAACATTTATAAATATGAAACTAGTAATGATGTACGCACTTACACACACGAGAATTCCCAAGATATACTTTTGTTTATAAGTCGATACACAGACTATTTAGTAATACAAATGAGAACATTAAAGACTTACCGTTAGAAAATTAAGGTAGGATAAAAAAAACAGCAATTGTTATTTAGACAGAATCCTTAAAAAAAACTGATTAAAACGACCATTATACCTGATCTGTGACAGTGAGAGTAAAACGTGATTGTTCATTGAGTGTGGACAAACAGATGTTACCCTAACGACTATTAAGTATGTGATTTCCTTTTTTCTCATTAATTTCTACTAAGTGTGATTGCTTGTAGCTGCGTTGAATAAAGCATTATCTAGTGTTATTACGGT]

[+] EMBL CD121211             [GGAGTGGCTTCCTAAGAAAACCATCTTATTCGGTTTGGGCGCTCGGGCAGTACTCCAGTCCTCATAAAAATCAAATGACGAAGTGTGGTGCGTATATATATATATATTTGGTGCCTCCCTGTATCAATGTTTACGTATCTCAACAGATAAATAAATAAACAGGTATGTATGTAGAAAAAAACAAATTCAGTCATCCACCTTAATAATATCAGTATGAAATGATGAAGGGTTATTTTTTAAAATAGTAAATTCAATTAGAGGTTGATCACCAAAAACACACATGATTTGTTTGAGATTAATGCCAGTAGAGAAAAATATATTATAAGCTTAAGCTAATGCTTTCTAAACAGAAAGAATTATCACCCGTGGTTTAAGAGGCCATGTGTCTAGACATTACATTTTGTCCTATATGGTCTGCAACATTTATAAATATGAAACTAGTAATGATGTACGCACTTACACACACGAGAATTCCCAAGATATACTTTTGTTTATAAGTCGATACACAGACTATTTAGTAATACAAATGAGAACATTAAAGACTTACCGTTAGAAAGTTAAGGTAGGAT AAAAAAACAGCAATTGNTATTT                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD121148             [GGAGTGGCTTCCTAAGAAAACCATCTTATTCGGTTTGGGCGCTCGGGCAGTACTCCAGTCCTCATAAAAATCAAATGACGAAGTGTGGTGCATATATATATATATATTTGGTGCCTCCCTGTATCAATGTTTACGTATCTCAACAGATAAATAAATAAACAGGTATGTATGTAGAAAAAAACAAATTCAGTCATCCACCTTAATAATATCAGTATGAAATGATGAAGGGTTATTTTTTAAAATAGTAAATTCAATTAGAGGTTGATCACCAAAAACGCACATGATTTGTTTGAGATTAATGCCAGTAGAGAAAAATATATTATAAGCTTAAGCTAATGCTTTCTAAACAGAAAGAATTATCACCCGTGGTTTAAGAGGCCATGTGTCTAGACATTACATTTTGTCCTATATGGTCTGCAACATTTATAAATATGAAACTAGTAATGATGTACGCACTTACACACACGAGAATTCCCAAGATATACTTTTGTTTATAAGTCGATACACAGACTATTTAGTAATACAAATGAGAACATTANAGACTTACCGTTAGAAAATTAAGGTAGa                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD121742             [GGAGTGGCTTCCTAAGAAAACCATCTTATTCGGTTTGGGCGCTCGGGCAGTACTCCAGTCCTCATAAAAATCAAATGACGAAGTGTGGTGCATATATATATATATATTTGGTGCCTCCCTGTATCAATGTTTACGTATCTCAACAGATAAATAAATAAACAGGTATGTATGTAGAAAAAAACAAATTCAGTCATCCACCTTAATAATATCAGTATGAAATGATGAAGGGTTATTTTTTAAAATAGTAAATTCAATTAGAGGTTGATCACCAAAAACACACATGATTTGTTTGAGATTAATGCCAGTAGAGAAAA  ATATTATAAGCTTAAGCTAATGCTTTCTAAACAGAAAGAATTATCACCCGTGGTTTAAGAGGCCATGTGTCTAGACATTACATTTTGTCCTATATGGTCTGCAACATTTATAAATATGAAACTAGTAATGATGTACGCACTTACACACACGAGAATTCCCAAGATATACTTTTGTTTATAAGTCGATACACAGACTATTTAGTAATACAAATGAGAACATTAAAGACTTACCGTTAGAAAATTAAGG                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD121216             [GGAGTGGCTTCCTAAGAAAACCATCTTATTCGGTTTGGGCGCTCGGGCAGTACTCCAGTCCTCATAAAAATCAAATGACGAAGTGTGGTGCATATATATATATATATTTGGTGCCTCCCTGTATCAATGTTTACGTATCTCAACAGATAAATAAATAAACAGGTATGTATGTAGAAAAAAACAAATTCAGTCATCCACCTTAATAATATCAGTATGAAATGATGAAGGGTTATTTTTTAAAATAGTAAATTCAATTAGAGGTTGATCACCAAAAACACACATGATTTGTTTGAGATTAATGCCAGTAGAGAAAA  ATATTATAAGCTTAAGCTAATGCTTTCTAAACAGAAAGAATTATCACCCGTGGTTTAAGAGGCCATGTGTCTAGACATTACATTTTGTCCTATATGGTCTGCAACATTTATAAATATGAAACTAGTAATGATGTACGCACTTACACACACGAGAATTCCCAAGATATACTTTTGTTTATAAGTCGATACACAGACTATTTAGTANTACANATGAGAACATTAAAGACTTACCGTTAGAAAATTAA                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD121180             [GGAGTGGCTTCCTAAGAAAACCATCTTATTCGGTTTGGGCGCTCGGGCAGTACTCCGGTCCTCATAAAAATCAAATGACGAAGTGTGGTGCATATATATATATATATTTGGTGCCTCCCTGTATCAATGTTTACGTATCTCAACAGATAAATAAATAAACAGGTATGTATGTAGAAAAAAACAAATTCAGTCATCCACCTTAATAATATCAGTATGAAATGATGAAGGGTTATTTTTTAAAATAGTCAATTCAATTAGAGGTTGATCACCAAAAACACACATGATTTGTTTGAGATTAATGCCAGTAGAGAAAAATATATTATAAGCTTAAGCTAATGCTTTCTAAACAGAAAGAATTATCACCCGTGGTTTAAGAGGCCATGTGTCTAGACATTACATTTTGTCCTATATGGTCTGCAACATTTATAAATATGAAACTAGTAATGATGTACGCACTTACACACACGAGAATTCCCAAGATATACTTTTGTTTATAAGTCGATACACAGACTATTTAGTANTACANATGAGAACA                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD121217             [                                                                                                                                                                                                                                 AGGGTTATTTNTTAAAATAGTAAATTCAATTAGAGGTTGATCACCAAAAACACACATGATTTGTNTGAGATTAATGCCAGTAGAGAAAAATATATTATAAGCTTAAGCTAATGCTTTCTAAACAGAAAGAATTATCACCCGTGGTCTAAGAGGCCATGTGTCTAGACATTACATTTTGTCCTATATGGTCTGCAACATTTATAAATATGAAACTAGTAATGATGTACGCACTTACACACACGAGAATTCCCAAGATATACTTTTGTTTATAAGTCGATACACAGACTATTTAGTAATACAAATGAGAACATTAAAGACTTACCGTTAGAAAATTAAGGTAGGATAAAAAAAACAGCAATTGTTATTTAGACAGAATCCTTAAAAAAAACTGATTAAAACGACCATTATACCTGATCTGTGACAGTGAGAGTAAAACGTGATTGTTCATTGAGTGTGGACAAACAGATGTTACCCTAACGACTATTAAGTATGTGATTTCCTTTTTTCTCATTAATTTCTACTAAGTGTGATTGCTTGTAGCTGCGTTGAATAAAGCATTATCTAGTGTTATTACGGT]
[-] EMBL CD121242             [                                                                                                                                                                                                                                            nTAAAATAGTAAATTCAATTAGAGGTTGATCACCAAAAACACACATGATNTGTNTGAGATTAATGCCAGTAGAGAAAAATATATTATAAGCTTAAGCTAATGCTTTCTAAACAGAAAGAATTATCACCCGTGGTTTAAGAGGCCATGTGTCTAGACATTACATTTTGTCCTATATGGTCTGCAACATTTATAAATATGAAACTAGTAATGATGTACGCACTTACACACACGAGAATTCCCAAGATATACTTTTGTTTATAAGTCGATACACGGACTATTTAGTAATACAAATGAGAACATTAAAGACTTACCGTTAGAAAATTAAGGTAGGATAAAAAAAACAGCAATTGTTATTTAGACAGAATCCTTAAAAAAAACTGATTAAAACGACCATTATACCTGATCTGTGACAGTGAGAGTAAAACGTGATTGTTCATTGAGTGTGGACAAACAGATGTTACCCTAACGACTATTAAGTATGTGATTTCCTTTTTTCTCATTAATTTCTACTAAGTGTGATTGCTTGTAGCTGCGTTGAATAAAGTATTATCTAGTGTTATTACGGT]
[-] EMBL CD121163             [                                                                                                                                                                                                                                                  TAGTANATTCAATTAGAGGTTGATCACCAAAAACACACATGATNTGTTTGAGATTAATGCCAGTAGAGAAAAATATATTATAAGCTTAAGCTAATGCTTTCTAAACAGAAAGAATTATCACCCGTGGTTTAAGAGGCCATGTGTCTAGACATTACATTTTGTCCTATATGGTCTGCAACATTTATAAATATGAAACTAGTAATGATGTACGCACATACACACACGAGAATTCCCAAGATATACTTTTGTTTATAAGTCGATACACAGACTATTTAGTAATACAAATGAGAACATTAAAGACTTACCGTTAGAAAATTAAGGTAGGATAAAACAAACAGCAATTGTTATTTAGACAGAATCCTTAAAAAAAACTGATTAAAACGACCATTATACCTGATCTGTGACAGTGAGAGTAAAACGTGATTGTTCATTGAGTGTGGACAAACAGATGTTACCCTAACGACTATTAAGTATGTGATTTCCTTTTTTCTCATTAATTTCTACTAAGTGTGATTGCTTGTAGCTGCGTTGAATAAAGTATTATCTAGTGTTATTACGGT]
[-] EMBL CD121252             [                                                                                                                                                                                                                                                       AATTCAATTAGAGGTTGATCACCAAAAACACACATGATNTGTNTGAGATTAATGCCAGTAGAGAAAAATATATTATAAGCTTAAGCTAATGCTTTCTAAACAGAAAGAATTATCACCCGTGGTCTAAGAGGCCATGTGTCTAGACATTACATTTTGTCCTATATGGTCTGCAACATTTATAAATATGAAACTAGTAATGATGTACGCACTTACACACACGAGAATTCCCAAGATATACTTTTGTTTATAAGTCGATACACAGACTATTTAGTAATACAAATGAGAACATTAAAGACTTACCGTTAGAAAATTAAGGTAGGATAAAAAAAACAGCAATTGTTATTTAGACAGAATCCTTAAAAAAAACTGATTAAAACGACCATTATACCTGATCTGTGACAGTGAGAGTAAAACGTGATTGTTCATTGAGTGTGGACAAACAGATGTTACCCTAACGACTATTAAGTATGTGATTTCCTTTTTTCTCATTAATTTCTACTAAGTGTGATTGCTTGTAGCTGCGTTGAATAAAGCATTATCTAGTGTTATTACGGT]


>consensus_9406#0 GGAGTGGCTTCCTAAGAAAACCATCTTATTCGGTTTGGGCGCTCGGGCAGTACTCCAGTC CTCATAAAAATCAAATGACGAAGTGTGGTGCATATATATATATATATTTGGTGCCTCCCT GTATCAATGTTTACGTATCTCAACAGATAAATAAATAAACAGGTATGTATGTAGAAAAAA ACAAATTCAGTCATCCACCTTAATAATATCAGTATGAAATGATGAAGGGTTATTTTTTAA AATAGTAAATTCAATTAGAGGTTGATCACCAAAAACACACATGATTTGTTTGAGATTAAT GCCAGTAGAGAAAAATATATTATAAGCTTAAGCTAATGCTTTCTAAACAGAAAGAATTAT CACCCGTGGTTTAAGAGGCCATGTGTCTAGACATTACATTTTGTCCTATATGGTCTGCAA CATTTATAAATATGAAACTAGTAATGATGTACGCACTTACACACACGAGAATTCCCAAGA TATACTTTTGTTTATAAGTCGATACACAGACTATTTAGTAATACAAATGAGAACATTAAA GACTTACCGTTAGAAAATTAAGGTAGGATAAAAAAAACAGCAATTGTTATTTAGACAGAA TCCTTAAAAAAAACTGATTAAAACGACCATTATACCTGATCTGTGACAGTGAGAGTAAAA CGTGATTGTTCATTGAGTGTGGACAAACAGATGTTACCCTAACGACTATTAAGTATGTGA TTTCCTTTTTTCTCATTAATTTCTACTAAGTGTGATTGCTTGTAGCTGCGTTGAATAAAG CATTATCTAGTGTTATTACGGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)