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Schistosoma mansoni
cluster # 9421 cluster # 9421       Sequences # 9       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9421#0 length = 801 sequences # 9  

consensusID : consensus_9421#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 801
fasta sequence
                              [AGCTTCTCGGAACTCGTGGTTTACTGACGGGATTTACTTTTCTCACCGTAAATCATGTCGTTATCCCGTCTAGTCATTGATAACAACTCATACAGCTGGAAGTCTAAACTGTTGTCAAGAGTATCCTGGAGGACTGCAGTCACAATCGGTATCCCGCTTGGTATAGCCGGTTTGACCGTCCTTGTGTATTACCTCAGAAACAAAAGAGAGAAGAGTGAAGCTGAACTTACTCCAGAAACACCACTAGAGGCTGCTTTAGCGTTAAAGCTAAAAGGAAACAAATTTTTCAAGGGTGGGCAATACTCTCAGGCAATCAGTTTATATGATGAAGGTCTTAAGAAATGTCCATTGGATGCAGTTCAGGAACGTGCAGCTTTCTATCAAAATCGTGCAGCAGCCAAAGAGAATCAACGTCAATACGAATCCGCCATTGAAGATTGTTCACTTGCATTAACATTAACACCACATTATTTGAAAGCATTAAATCGTCGAGCTCATTTGTATGAAAAATTAAAAAAATGGGATGAATGCCTTTTAGATATGACAGCTTGTTGTATTTTTGAAAAATTTAAAAATGCTGACAACATTGTTTTCATGGATCAAGTACTTAAAACAATTGGACAACAAAAAGCTCAAGAAGAACGTTCCAAACTACTGCATGAATTACCATCAGCTTCCTTTATTCGTAATTATTTGAGCGCATTCGCATGTAATCCATTCACAGTTACTTCTTCACAACTATCCAAACATAATTCACCGACTGAAACTATTAAGACTGCAGTTAATGGGAGTAACTGGGAT]

[+] EMBL AI975835             [AGCTTCTCGGAACTCGTGGTTTACTGACGGGATTTACTTTTCTCACCGTAAATCATGTCGTTATCCCGTCTAGTCATTGATAACAACTCATACAGCTGGAAGTCTAAACTGTTGTCAAGAGTATCCTGGAGGACTGCAGTCACAATCGGTATCCCGCTTGGTATAGCCGGTTTGACCGTCCTTGTGTATTACCTCAGAAACAAAAGAGAGAAGAGTGAAGCTGAACTTACTCCAGAAACACCACTAGAGGCTGCTTTAGCGTTAAAGCTAAAAGGAAACAAATTTTTCAAGGGTGGGCAATACTCTCAGGCAATCAGTTTATATGATGAAGGTCTTAAGAAATGTCCATTGGATGCAGTTCAGGAACGTGCAGCTTTCTATCAAAATCGTGCAGCAGCCAAAGAGAATCAACGTCAATACGAATCCGCCATTGAAGATTGTTCACTTGCATTAACATTAACAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL AI975954             [AGCTTCTCGGAACTCGTGGTTTACTGACGGGATTTACTTTTCTCACCGTAAATCATGTCGTTATCCCGTCTAGTCATTGATAACAACTCATACAGCTGGAAGTCTAAACTGTTGTCAAGAGTATCCTGGAGGACTGCAGTCACAATCGGTATCCCGCTTGGTATAGCCGGTTTGACCGACCTTGTGTATTACCTCAGAAACAAAAGAGAGAAGAGTGAAGCTGAACTTACTCCAGAAACACCACTAGAGGCTGCTTTAGCGTTAAAGCTAAAAGGAAACAAATTTTTCAAGGGTGGGCAATACTCTCAGGCAATCAGTTTATATGATGAAGGTCTTAAGAAATGTCCATTGGATGCAGTTCAGGAACGTGCAGCTTTCTATCAAAATCGTGCAGCAGCCAAAGAGAATCAACGTCAATACGAATCCGCCATTGAAGATTGTTCACTTGCATTAACATTAACACCACATTATTTGAAAGCATTAAATCGTCGAGCTCATTTGTATGAAAAATTAAAAAAATGGGATGAATGCCTTTTAGAT                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL AI975779             [   TTCTCGGAACTCGTGGTTTACTGACGGGATTTACTTTTCTCACCGTAAATCATGTCGTTATCCCGTCTAGTCATTGATAACAACTCATACAGCTGGAAGTCTAAACTGTTGTCAAGAGTATCCTGGAGGACTGCAGTCACAATCGGTATCCCGCTTGGTATAGCCGGTTTGACCGTCCTTGTGTATTACCTCAGAAACAAAAGAGAGAAGAGTGAAGCTGAACTTACTCCAGAAACACCACTAGAGGCTGCTTTAGCGTTAAAGCTAAAAGGAAACAAATTTTTCAAGGGTGGGCAATACTCTCAGGCAATCAGTTTATATGATGAAGGTCTTAAGAAATGTCCATTGGATGCAGTTCAGGAACGTGCAGCTTTCTATCAAAATCGTGCAGCAGCCAAAGAGAATCAACGTCAATACGAATCCGCCATTGAAGATTGTTCACTTGCATTAACATTAACACCACATTATTTGAAAGCATTNAATCGTCGAGCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL AI975662             [                              GATTTACTTTTCTCACCGTAAATCATGTCGTTATCCCGTCTAGTCATTGATAACAACTCATACAGCTGGAAGTCTAAACTGTTGTCAAGAGTATCCTGGAGGACTGCAGTCACAATCGGTATCCCGCTTGGTATAGCCGGTTTGACCGTCCTTGTGTATTACCTCAGAAACAAAAGAGAGAAGAGTGAAGCTGAACTTACTCCAGAAACACCACTAGAGGCTGCTTTAGCGTTAAAGCTAAAAGGAAACAAATTTTTCAAGGGTGGGCAATACTCTCAGGCAATCAGTTTATATGATGAAGGTCTTAAGAAATGTCCATTGGATGCAGTTCAGGAACGTGCAGCTTTCTATCAAAATCGTGCAGCAGCCAAAGAGAATCAACGTCAATACGAATCCGCCATTGAAGATTGTTCACTTGCATTAACATTAACACCACATTATTTGAAAGCATTAAATCGTCGAGCTCATTTGTATGAAAAATT AAAAAATGGGATGAATGGCCTTTAGATATGACAGCTTGT                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL BF936259             [                                                                                                                                                    GTATCCCGCTTGGTATAGCCGGTTTGACCGTCCTTGTGTATTACCTCAGAAACAAAAGAGAGAAGAGTGAAGCTGAACTTACTCCAGAAACACCACTAGAGGCTGCTTTAGCGTTAAAGCTAAAAGGAAACAAATTTTTCAAGGGTGGGCAATACTCTCAGGCAATCAGTTTATATGATGAAGGTCTTAAGAAATGTCCATTGGATGCAGTTCAGGAACGTGCAGCTTTCTATCAAAATCGTGCAGCAGCCAAAGAGAATCAACGTCAATACGAATCCGCCATTGAAGATTGTTCACTTGCATTAACATTAACACCACATTATTTGAAAGCATTAAATCGTCGAGCTCATTTGTATGAAAAATTAAAAAAATGGGATGAATGCCTTTTAGATATGACAGCTTGTTGTATTTTTGAAAAATTTAAAAATGCTGACAACATTGTTTTCATGGATCAAGTACTTAAAACAATTGGACAACAAAAAGCTCAAGAAGAACGTTCCAAACTACTGCATGAATTACCATCAGCTTCCTTTATTCGTAATTATTTGAGCGCATTCGCATGTAATCCATTCACAGTTACTTCTTCACAA                                                               ]
[+] EMBL CD069680             [                                                                                                                                                                                                                                         AGAAACACCACTAGAGGCTGCTTTAGCGTTAAAGCTAAAAGGAAACAAATTTTTCAAGGGTGGGCAATACTCTCAGGCAATCAGTTTATATGATGAAGGTCTTAAGAAATGTCCATTGGATGCAGTTCAGGAACGTGCAGCTTTCTATCAAAATCGTGCAGCAGCCAAAGGGAATCAACGTCAATACGAATCCGCCATTGAAGATTGTTCACTTGCATTAACATTAACACCACATTATTTGAAAGCATTAAATCGTCGAGCTCATTTGTATGAAAAATTAAAAAAATGGGATGAATGCCTTTTAGATATGACAGCTTGTTGTATTTTTGAAAAATTTAAAAATGCTGACAACATTGTTTTCATGGATCAAGTACTTAAGACAATTGGACAACAAAAAGCTCAAGAAGAACGTTCCAAACTACTGCA                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD069677             [                                                                                                                                                                                                                                         AGAAACACCACTAGAGGCTGCTTTAGCGTTAAAGCTAAAAGGAAACAAATTTTTCAAGGGTGGGCAATACTCTCAGGCAATCAGTTTATATGATGAAGGTCTTAAGAAATGTCCATTGGATGCAGTTCAGGAACGTGCAGCTTTCTATCAAAATCGTGCAGCAGCCAAAGAGAATCAACGTCAATACGAATCCGCCATTGAAGATTGTTCACTTGCATTAACATTAACACCACATTATTTGAAAGCATTAAATCGTCGAGCTCATTTGTATGAAAAATTAAAAAAATGGGATGAATGCCTTTTAGATATGACAGCTTGTTGTATTTTTGAAAAATTTAAAAATGCTGACAACATTGTTTTCATGGATCAAGTACTTAAAACAATTGGACAACAAAAAGCTCAAGAAGAACGTTCCAAACTACTGCA                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD181372             [                                                                                                                                                                                                                                         AGAAACACCACTAGAGGCTGCTTTAGCGTTAAAGCTAAAAGGAAACAAATTTTTCAAGGGTGGGCAATACTCTCAGGCAATCAGTTTATATGATGAAGGTCTTAAGAAATGTCCATTGGATGCAGTTCAGGAACGTGCAGCTTTCTATCAAAATCGTGCAGCAGCCAAAGAGAATCAACGTCAATACGAATCCGCCATTGAAGATTGTTCACTTGCATTAACATTAACACCACATTATTTGAAAGCATTAAATCGTCGAGCTCATTTGTATGAAAAATTAAAAAAATGGGATGAATGCCTTTTAGA                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD129463             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ATGAAGGTCTTAAGAAATGTCCATTGGATGCAGTTCAGGAACGTGCAGCTTTCTATCAAAATCGTGCAGCAGCCAAAGAGAATCAACGTCAATACGAATCCGCCATTGAAGATTGTTCACTTGCATTAACATTAACACCACATTATTTGAAAGCATTAAATCGTCGAGTTCATTTGTATGAAAAATTAAAAAAATGGGATGAATGCCTTTTAGATATGACAGCTTGTTGTATTTTTGAAAAATTTAAAAATGCTGACAACATTGTTTTCATGGATCAAGTACTTAAAACAATTGGACAACAAAAAGCTCAAGAAGAACGTTCCAAACTACTGCATGAATTACCATCAGCTTCCTTTATTCGTAATTATTTGAGCGCATTCGCATGTAATCCATTCACAGTTACTTCTTCACAACTATCCAAACATAATTCACCGACTGAAACTATTAAGACTGCAGTTAATGGGAGTAACTGGGAT]


>consensus_9421#0 AGCTTCTCGGAACTCGTGGTTTACTGACGGGATTTACTTTTCTCACCGTAAATCATGTCG TTATCCCGTCTAGTCATTGATAACAACTCATACAGCTGGAAGTCTAAACTGTTGTCAAGA GTATCCTGGAGGACTGCAGTCACAATCGGTATCCCGCTTGGTATAGCCGGTTTGACCGTC CTTGTGTATTACCTCAGAAACAAAAGAGAGAAGAGTGAAGCTGAACTTACTCCAGAAACA CCACTAGAGGCTGCTTTAGCGTTAAAGCTAAAAGGAAACAAATTTTTCAAGGGTGGGCAA TACTCTCAGGCAATCAGTTTATATGATGAAGGTCTTAAGAAATGTCCATTGGATGCAGTT CAGGAACGTGCAGCTTTCTATCAAAATCGTGCAGCAGCCAAAGAGAATCAACGTCAATAC GAATCCGCCATTGAAGATTGTTCACTTGCATTAACATTAACACCACATTATTTGAAAGCA TTAAATCGTCGAGCTCATTTGTATGAAAAATTAAAAAAATGGGATGAATGCCTTTTAGAT ATGACAGCTTGTTGTATTTTTGAAAAATTTAAAAATGCTGACAACATTGTTTTCATGGAT CAAGTACTTAAAACAATTGGACAACAAAAAGCTCAAGAAGAACGTTCCAAACTACTGCAT GAATTACCATCAGCTTCCTTTATTCGTAATTATTTGAGCGCATTCGCATGTAATCCATTC ACAGTTACTTCTTCACAACTATCCAAACATAATTCACCGACTGAAACTATTAAGACTGCA GTTAATGGGAGTAACTGGGAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)