Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 9449 cluster # 9449       Sequences # 9       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9449#0 length = 833 sequences # 9  

consensusID : consensus_9449#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 833
fasta sequence
                              [ATAATGAGTGGTTCTACCCTTCAGTTTGCCGGGATTGGAGCTGTTCGTAATATGAAGAATCCTGTAAAGGTTGCAAGGCTTCTGTTACAGTCACAAATTGACCACCCTGTGGGTGAGTTAGGACGCGTTCCTCCATCTGTACTTGTTGGTGATGGTGCTCATGTGTGGGCTGCGTCAAAAGGATATTCTGTTGATAATAGTGATCTCGTCACAAAACATTCACGGGTTTCATGGGAAAAATACAAAAGTTGGTTATTTAATGGGAACGAAATGAATGCAACTACAAGGGATCCTCATTTTAATCATCATGAAAATGTTCCTGAGTTGAAAAGGTCTCGTGTCCATAGATTTGATACTGTAGGTGCTGTTTGTATTGATATAGAAGGGAAGATTGCTGCAGCATCTTCTAGTGGTGGTATTGCAATGAAGTATGAAGGTCGTCTAGGTCAAGCGTGTACATATGGCTGTGGTTGTTGGGCAGAAGAACTCAGTTCA-TTTTCTAGTATTGGGGTTGTTACTTCAGGTACTGGTGAACAACTTATAAGAACTCAACTTGCTCAGCGTTCTGCAGAACGTTTTAATGGTGACTCTATTTCCGTTTCCGAAATAGTCCACTCATCTCTCACTGATGGGTTTTTAAATTCTAAGTATCTTTCCTGTGATATGGAG-AAATTTGCTGG-AG-TGCTGGAGTTTACGCTAATTTTGAACGAATTGACTTTCCTAATGTGGAGGTGTTTTTTTGGACACTCAACACGATCGATGAGTGTTGGCCACTACCTACCGAGTATTATGAAAAAGCCATCTGTCCATGCATCACGCAAGCAAATTGATAA]

[+] EMBL CD165039             [ATAATGAGTGGTTCTACCCTTCAGTTTGCCGGGATTGGAGCTGTTCGTAATATGAAGAATCCTGTAAAGGTTGCAAGGCTTCTGTTACAGTCACAAATTGACCACCCTGTGGGTGAGTTAGGACGCGTTCCTCCATCTGTACTTGTTGGTGATGGTGCTCATGTGTGGGCTGCGTCAAAAGGATATTCTGTTGATAATAGTGATCTCGTCACAAAACATTCACGGGTTTCATGGGAAAAATACAAAAGTTGGTTATTTAATGGGAACGAAATGAATGCAACTACAAGGGATCCTCATTTTAATCATCATGAAAATGTTCCTGAGTTGAAAAGGTCTCGTGTCCATAGATTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD146485             [                                GATTGGAGCTGTTCGTAATATGAAGAATCCTGTAAAGGTTGCAAGGCTTCTGTTACAGTCACAAATTGACCACCCTGTGGGTGAGTTAGGACGCGTTCCTCCATCTGTACTTGTTGGTGATGGTGCTCATGTGTGGGCTGCGTCAAAAGGATATTCTGTTGATAATAGTGATCTCGTCACAAAACATTCACGGGTTTCATGGGAAAAATACAAAAGTTGGTTATTTAATGGGAACGAAATGAATGCAACTACAAGGGATCCTCATTTTAATCATCATGAAAATGTTCCTGAGTTGAAAAGGTCTCGTGTCCATAGATTTGATACTGTAGGTGCTGTTTGTATTGATATAGAAGGGAAGATTGCTGCAGCATCTTCTAGTGGTGGTATTGCAATGAAGTATGAAGGTCGTCTAGGTCAAGCGTGTACATATGGCTGTGGTTGTTGGGCAGAAGAACTCAGTTCA TTNTCTAGTATTGGGGTTGTTACTTCAGGTACTGGTGAACAACTTATAAGAACTCAACTTGCTCAGCGTTCTGCAGAACGTTNTAATGGTGACTCTATTTTCGTTTCCGAAATAGTCCACTCATCTCTCACTGATGGGGTTTTAAATTCTAAGTATCTTTCCTGTGATATGGAGAAAATTTGCTGGNAG TGCTGNAGTTTACGCTAATTTTGGACGAATTGAC                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD161602             [                                 ATTGGAGCTGTTCGTAATATGAAGAATCCTGTAAAGGCTGCAAGGCTTCTGTTACAGTCACAAATTGACCACCCTGTGGGTGAGTTAGGACGCGTTCCTCCATCTGTACTTGTTGGTGATGGTGCTCATGTGTGGGCTGCGTCAAAAGGATATTCTGTTGATAATAGTGATCTCGTCACAAAACATTCACGGGTTTCATGGGAAAAATACAAAAGTTGGTTATTTAATGGGAACGAAATGAATGCAACTACAAGGGATCCTCATTTTAATCATCATGAAAATGTTCCTGAGTTGAAAAGGTCTCGTGTCCATAGATTTGATACTGTAGGTGCTGTTTGTATTGATATAGAAGGGAAGATTGCTGCAGCATCTTCTAGTGGTGGTATTGCAATGAAGTATGAAGGTCGTCTAGGTCAAGCGTGTACATAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD161643             [                                 ATTGGAGCTGTTCGTAATATGAAGAATCCTGTAAAGGTTGCAAGGCTTCTGTTACAGTCACAAATTGACCACCCTGTGGGTGAGTTAGGACGCGTTCCTCCATCTGTACTTGTTGGTGATGGTGCTCATGTGTGGGCTGCGTCAAAAGGATATTCTGTTGATAATAGTGATCTCGTCACAAAACATTCACGGGTTTCATGGGAAAAATACAAAAGTTGGTTATTTAATGGGAACGAAATGAATGCAACTACAAGGGATCCTCATTTTAATCATCATGAAAATGTTCCTGAGTTGAAAAGGTCTCGTGTCCATAGATTTGATACTGTAGGTGCTGTTTGTATTGATATAGAAGGGAAGATTGCTGCAGCATCTTCTAGTGGTGGTATTGCAATGAAGTATGAAGGTCGTCTAGGTCAAGCGTGTACATAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD166247             [                                                                          AAGGCTTCTGTTACAGTCACAAATTGACCACCCTGTGGGTGAGTTAGGACGCGTTCCTCCATCTGTACTTGTTGGTGATGGTGCTCATGTGTGGGCTGCGTCAAAAGGATATTCTGTTGATAATAGTGATCTCGTCACAAAACATTCACGGGTTTCATGGGAAAAATACAAAAGTTGGTTATTTAATGGGAACGAAATGAATGCAACTACAAGGGATCCTCATTTTAATCATCATGAAAATGTTCCTGAGTTGAAAAGGTCTCGTGTCCATAGATTTGATACTGTAGGTGCTGTTTGTATTGATATAGAAGGGAAGATTGCTGCAGCATCTTCTAGTGGTGGTATTGCAATGAAGTATGAAGGTCGTCTAGGTCAAGCGTGTACATATGGCTGTGGTTGTTGGGCAGAAGAACTCAGTTCATTTTTCTAGTATTGGGGTTGTTACTTCAGGTACTGGTGAACAACTTATAAGAACACAACTg                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD166246             [                                                                                                             TGGGTGAGTTAGGACGCGTTCCTCCATCTGTACTTGTTGGTGATGGTGCTCATGTGTGGGCTGCGTCAAAAGGATATTCTGTTGATAATAGTGATCTCGTCACAAAACATTCACGGGTTTCATGGGAAAAATACAAAAGTTGGTTATTTAATGGGAACGAAATGAATGCAACTACAAGGGATCCTCATTTTAATCATCATGAAAATGTTCCTGAGTTGAAAAGGTCTCGTGTCCATAGATTTGATACTGTAGGTGCTGTTTGTATTGATATAGAAGGGAAGATTGCTGCAGCATCTTCTAGTGGTGGTATTGCAATGAAGTATGAAGGTCGTCTAGGTCAAGCGTGTACATATGGCTGTGGTTGTTGGGCAGAAGAACTCAGTTCA TTTTCTAGTATTGGGGTTGTTACTTCAGGTACTGGTGAACAACTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD123259             [                                                                                                                                                                                                                                        GGGAAAAATACAAAAGTTGGTTATTTAATGGGAACGAAATGAATGCAACTACAAGGGATCCTCATTTTAATCATCATGAAAATGTTCCTGAGTTGAAAAGGTCTCGTGTCCATAGATTTGATACTGTAGGTGCTGTTTGTATTGATATAGAAGGGAAGATTGCTGCAGCATCTTCTAGTGGTGGTATTGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD127815             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CAAGCGTGTACATATGGCTGTGGTTGTTGGGCAGAAGAACTCAGTTCA TTTTCTAGTATTGGGGTTGTTACTTCAGGTACTGGTGAACAACTTATAAGAACTCAACTTGCTCAGCGTTCTGCAGAACGTTTTAATGGTGACTCTATTTCCGTTTCCGAAATAGTCCACTCATCTCTCACTGACGGGTTTTTAAATTCTAAGTATCTTTCCTGTGATATGGAG AAATTTGCTGG AGTTGCTGGAGTTTACGCTAATTTTGAACGAATTGACTTTCCTAATGTGGAGGTGTTTTTTTGGACACTCAACACGATCGATGAGTGTTGGCCACTACCTACCGAGTATTATGAAAAAGCCATCTGTCCATGCATCACGCAAGC          ]
[-] EMBL CD137322             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TGTTGGGCAGAAGAACTCAGTTCA TTTTCTAGTATTGGGGTTGTTACTTCAGGTACTGGTGAACAACTTATAAGAACTCAACTTGCTCAGCGTTCTGCAGAACGGTTTAATGGTGACTCTATTTCCGTTTCCGAAATAGTCCACTCATCTCTCACTGATGGGTTTTTAAATTCTAAGTATCTTTCCTGTGATATGGAG AAATTTGCTGG AGTTGCTGGAGTTTACGCTAATTTTGAACGAATTGACTTTCCTAATGTGGAGGTG TTTTTTGGACACTCAACACGATCGATGAGTGTTGGCCACTACCTACCGAGTATTATGAAAAAGCCATCTGTCCATGTATCACGCAAGCAAATTGATAA]


>consensus_9449#0 ATAATGAGTGGTTCTACCCTTCAGTTTGCCGGGATTGGAGCTGTTCGTAATATGAAGAAT CCTGTAAAGGTTGCAAGGCTTCTGTTACAGTCACAAATTGACCACCCTGTGGGTGAGTTA GGACGCGTTCCTCCATCTGTACTTGTTGGTGATGGTGCTCATGTGTGGGCTGCGTCAAAA GGATATTCTGTTGATAATAGTGATCTCGTCACAAAACATTCACGGGTTTCATGGGAAAAA TACAAAAGTTGGTTATTTAATGGGAACGAAATGAATGCAACTACAAGGGATCCTCATTTT AATCATCATGAAAATGTTCCTGAGTTGAAAAGGTCTCGTGTCCATAGATTTGATACTGTA GGTGCTGTTTGTATTGATATAGAAGGGAAGATTGCTGCAGCATCTTCTAGTGGTGGTATT GCAATGAAGTATGAAGGTCGTCTAGGTCAAGCGTGTACATATGGCTGTGGTTGTTGGGCA GAAGAACTCAGTTCATTTTCTAGTATTGGGGTTGTTACTTCAGGTACTGGTGAACAACTT ATAAGAACTCAACTTGCTCAGCGTTCTGCAGAACGTTTTAATGGTGACTCTATTTCCGTT TCCGAAATAGTCCACTCATCTCTCACTGATGGGTTTTTAAATTCTAAGTATCTTTCCTGT GATATGGAGAAATTTGCTGGAGTGCTGGAGTTTACGCTAATTTTGAACGAATTGACTTTC CTAATGTGGAGGTGTTTTTTTGGACACTCAACACGATCGATGAGTGTTGGCCACTACCTA CCGAGTATTATGAAAAAGCCATCTGTCCATGCATCACGCAAGCAAATTGATAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)