These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9449#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 833 fasta sequence [ATAATGAGTGGTTCTACCCTTCAGTTTGCCGGGATTGGAGCTGTTCGTAATATGAAGAATCCTGTAAAGGTTGCAAGGCTTCTGTTACAGTCACAAATTGACCACCCTGTGGGTGAGTTAGGACGCGTTCCTCCATCTGTACTTGTTGGTGATGGTGCTCATGTGTGGGCTGCGTCAAAAGGATATTCTGTTGATAATAGTGATCTCGTCACAAAACATTCACGGGTTTCATGGGAAAAATACAAAAGTTGGTTATTTAATGGGAACGAAATGAATGCAACTACAAGGGATCCTCATTTTAATCATCATGAAAATGTTCCTGAGTTGAAAAGGTCTCGTGTCCATAGATTTGATACTGTAGGTGCTGTTTGTATTGATATAGAAGGGAAGATTGCTGCAGCATCTTCTAGTGGTGGTATTGCAATGAAGTATGAAGGTCGTCTAGGTCAAGCGTGTACATATGGCTGTGGTTGTTGGGCAGAAGAACTCAGTTCA-TTTTCTAGTATTGGGGTTGTTACTTCAGGTACTGGTGAACAACTTATAAGAACTCAACTTGCTCAGCGTTCTGCAGAACGTTTTAATGGTGACTCTATTTCCGTTTCCGAAATAGTCCACTCATCTCTCACTGATGGGTTTTTAAATTCTAAGTATCTTTCCTGTGATATGGAG-AAATTTGCTGG-AG-TGCTGGAGTTTACGCTAATTTTGAACGAATTGACTTTCCTAATGTGGAGGTGTTTTTTTGGACACTCAACACGATCGATGAGTGTTGGCCACTACCTACCGAGTATTATGAAAAAGCCATCTGTCCATGCATCACGCAAGCAAATTGATAA] [+] EMBL CD165039 [ATAATGAGTGGTTCTACCCTTCAGTTTGCCGGGATTGGAGCTGTTCGTAATATGAAGAATCCTGTAAAGGTTGCAAGGCTTCTGTTACAGTCACAAATTGACCACCCTGTGGGTGAGTTAGGACGCGTTCCTCCATCTGTACTTGTTGGTGATGGTGCTCATGTGTGGGCTGCGTCAAAAGGATATTCTGTTGATAATAGTGATCTCGTCACAAAACATTCACGGGTTTCATGGGAAAAATACAAAAGTTGGTTATTTAATGGGAACGAAATGAATGCAACTACAAGGGATCCTCATTTTAATCATCATGAAAATGTTCCTGAGTTGAAAAGGTCTCGTGTCCATAGATTT ] [+] EMBL CD146485 [ GATTGGAGCTGTTCGTAATATGAAGAATCCTGTAAAGGTTGCAAGGCTTCTGTTACAGTCACAAATTGACCACCCTGTGGGTGAGTTAGGACGCGTTCCTCCATCTGTACTTGTTGGTGATGGTGCTCATGTGTGGGCTGCGTCAAAAGGATATTCTGTTGATAATAGTGATCTCGTCACAAAACATTCACGGGTTTCATGGGAAAAATACAAAAGTTGGTTATTTAATGGGAACGAAATGAATGCAACTACAAGGGATCCTCATTTTAATCATCATGAAAATGTTCCTGAGTTGAAAAGGTCTCGTGTCCATAGATTTGATACTGTAGGTGCTGTTTGTATTGATATAGAAGGGAAGATTGCTGCAGCATCTTCTAGTGGTGGTATTGCAATGAAGTATGAAGGTCGTCTAGGTCAAGCGTGTACATATGGCTGTGGTTGTTGGGCAGAAGAACTCAGTTCA TTNTCTAGTATTGGGGTTGTTACTTCAGGTACTGGTGAACAACTTATAAGAACTCAACTTGCTCAGCGTTCTGCAGAACGTTNTAATGGTGACTCTATTTTCGTTTCCGAAATAGTCCACTCATCTCTCACTGATGGGGTTTTAAATTCTAAGTATCTTTCCTGTGATATGGAGAAAATTTGCTGGNAG TGCTGNAGTTTACGCTAATTTTGGACGAATTGAC ] [-] EMBL CD161602 [ ATTGGAGCTGTTCGTAATATGAAGAATCCTGTAAAGGCTGCAAGGCTTCTGTTACAGTCACAAATTGACCACCCTGTGGGTGAGTTAGGACGCGTTCCTCCATCTGTACTTGTTGGTGATGGTGCTCATGTGTGGGCTGCGTCAAAAGGATATTCTGTTGATAATAGTGATCTCGTCACAAAACATTCACGGGTTTCATGGGAAAAATACAAAAGTTGGTTATTTAATGGGAACGAAATGAATGCAACTACAAGGGATCCTCATTTTAATCATCATGAAAATGTTCCTGAGTTGAAAAGGTCTCGTGTCCATAGATTTGATACTGTAGGTGCTGTTTGTATTGATATAGAAGGGAAGATTGCTGCAGCATCTTCTAGTGGTGGTATTGCAATGAAGTATGAAGGTCGTCTAGGTCAAGCGTGTACATAT ] [-] EMBL CD161643 [ ATTGGAGCTGTTCGTAATATGAAGAATCCTGTAAAGGTTGCAAGGCTTCTGTTACAGTCACAAATTGACCACCCTGTGGGTGAGTTAGGACGCGTTCCTCCATCTGTACTTGTTGGTGATGGTGCTCATGTGTGGGCTGCGTCAAAAGGATATTCTGTTGATAATAGTGATCTCGTCACAAAACATTCACGGGTTTCATGGGAAAAATACAAAAGTTGGTTATTTAATGGGAACGAAATGAATGCAACTACAAGGGATCCTCATTTTAATCATCATGAAAATGTTCCTGAGTTGAAAAGGTCTCGTGTCCATAGATTTGATACTGTAGGTGCTGTTTGTATTGATATAGAAGGGAAGATTGCTGCAGCATCTTCTAGTGGTGGTATTGCAATGAAGTATGAAGGTCGTCTAGGTCAAGCGTGTACATAT ] [-] EMBL CD166247 [ AAGGCTTCTGTTACAGTCACAAATTGACCACCCTGTGGGTGAGTTAGGACGCGTTCCTCCATCTGTACTTGTTGGTGATGGTGCTCATGTGTGGGCTGCGTCAAAAGGATATTCTGTTGATAATAGTGATCTCGTCACAAAACATTCACGGGTTTCATGGGAAAAATACAAAAGTTGGTTATTTAATGGGAACGAAATGAATGCAACTACAAGGGATCCTCATTTTAATCATCATGAAAATGTTCCTGAGTTGAAAAGGTCTCGTGTCCATAGATTTGATACTGTAGGTGCTGTTTGTATTGATATAGAAGGGAAGATTGCTGCAGCATCTTCTAGTGGTGGTATTGCAATGAAGTATGAAGGTCGTCTAGGTCAAGCGTGTACATATGGCTGTGGTTGTTGGGCAGAAGAACTCAGTTCATTTTTCTAGTATTGGGGTTGTTACTTCAGGTACTGGTGAACAACTTATAAGAACACAACTg ] [-] EMBL CD166246 [ TGGGTGAGTTAGGACGCGTTCCTCCATCTGTACTTGTTGGTGATGGTGCTCATGTGTGGGCTGCGTCAAAAGGATATTCTGTTGATAATAGTGATCTCGTCACAAAACATTCACGGGTTTCATGGGAAAAATACAAAAGTTGGTTATTTAATGGGAACGAAATGAATGCAACTACAAGGGATCCTCATTTTAATCATCATGAAAATGTTCCTGAGTTGAAAAGGTCTCGTGTCCATAGATTTGATACTGTAGGTGCTGTTTGTATTGATATAGAAGGGAAGATTGCTGCAGCATCTTCTAGTGGTGGTATTGCAATGAAGTATGAAGGTCGTCTAGGTCAAGCGTGTACATATGGCTGTGGTTGTTGGGCAGAAGAACTCAGTTCA TTTTCTAGTATTGGGGTTGTTACTTCAGGTACTGGTGAACAACTTA ] [-] EMBL CD123259 [ GGGAAAAATACAAAAGTTGGTTATTTAATGGGAACGAAATGAATGCAACTACAAGGGATCCTCATTTTAATCATCATGAAAATGTTCCTGAGTTGAAAAGGTCTCGTGTCCATAGATTTGATACTGTAGGTGCTGTTTGTATTGATATAGAAGGGAAGATTGCTGCAGCATCTTCTAGTGGTGGTATTGC ] [+] EMBL CD127815 [ CAAGCGTGTACATATGGCTGTGGTTGTTGGGCAGAAGAACTCAGTTCA TTTTCTAGTATTGGGGTTGTTACTTCAGGTACTGGTGAACAACTTATAAGAACTCAACTTGCTCAGCGTTCTGCAGAACGTTTTAATGGTGACTCTATTTCCGTTTCCGAAATAGTCCACTCATCTCTCACTGACGGGTTTTTAAATTCTAAGTATCTTTCCTGTGATATGGAG AAATTTGCTGG AGTTGCTGGAGTTTACGCTAATTTTGAACGAATTGACTTTCCTAATGTGGAGGTGTTTTTTTGGACACTCAACACGATCGATGAGTGTTGGCCACTACCTACCGAGTATTATGAAAAAGCCATCTGTCCATGCATCACGCAAGC ] [-] EMBL CD137322 [ TGTTGGGCAGAAGAACTCAGTTCA TTTTCTAGTATTGGGGTTGTTACTTCAGGTACTGGTGAACAACTTATAAGAACTCAACTTGCTCAGCGTTCTGCAGAACGGTTTAATGGTGACTCTATTTCCGTTTCCGAAATAGTCCACTCATCTCTCACTGATGGGTTTTTAAATTCTAAGTATCTTTCCTGTGATATGGAG AAATTTGCTGG AGTTGCTGGAGTTTACGCTAATTTTGAACGAATTGACTTTCCTAATGTGGAGGTG TTTTTTGGACACTCAACACGATCGATGAGTGTTGGCCACTACCTACCGAGTATTATGAAAAAGCCATCTGTCCATGTATCACGCAAGCAAATTGATAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||