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Schistosoma mansoni
cluster # 945 cluster # 945       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_945#0 length = 777 sequences # 2  

consensusID : consensus_945#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 777
fasta sequence
                              [TTTTATTGGTCGACAAACTGGTAGTAAAATTAAGAAGTCTGTATGCTTGAAGGAACACAATTCTGCAGTAATCGCTGTTAGTATGGAAAGCAAATTTTTTGTGACAGCTTCTAAAACCAGACAATTGGCGTTGTATAAGTTCAATCCATTAGAACGAACTGTAACCTTATGGCATTTAATCAATGATGTTGGAACAGCTACAATCACTTCTTTCTATTTACTACGTATGTTCATTGGTGTGAAGACAATCAGTATATCGGTGTATATTGGTGATAGTAATAATCTACTGCATAATTACGCAGTAATTGATAAAAAATTGGAATTGAAACAAACATTTCATGCAAACAAATCTCCTATAAAATTTATGGAACGTGTTTCGAATCATTTGTTAGCTGCTTCGGATGATGGTGAAGTTAGTGCCTGGAAGCATGATAAATATGGTGTTTTGCAATTGTCTCATCGTCTCAATGTCTGCACAGATATACCGTCAAAGAATAATAGTAATAATAGCAACGTGGAAAAATCATATTATTTGACCAGCTNTTTCATGTTCTACGCTGGTTATGATCCCTTGAAATTTGAACCAACACTGCACGATCCAACTATTGAAACAATCAATAAATTGATGATATCTAATGCTGATAATCAACATACTGAGTCTGATGACCAAGTGAAGGATCCGGATTCTGAAGTGACTTCACTTAGTGGATGTTGCATGTCAAGTAGTAATAGTTATGTAACAGGTTCTGATCAAGAGATTTATGAATGTGGTTACAA]

[+] EMBL CD124083             [TTTTATTGGTCGACAAACTGGTAGTAAAATTAAGAAGTCTGTATGCTTGAAGGAACACAATTCTGCAGTAATCGCTGTTAGTATGGAAAGCAAATTTTTTGTGACAGCTTCTAAAACCAGACAATTGGCGTTGTATAAGTTCAATCCATTAGAACGAACTGTAACCTTATGGCATTTAATCAATGATGTTGGAACAGCTACAATCACTTCTTTCTATTTACTACGTATGTTCATTGGTGTGAAGACAATCAGTATATCGGTGTATATTGGTGATAGTAATAATCTACTGCATAATTACGCAGTAATTGATAAAAAATTGGAATTGAAACAAACATTTCATGCAAACAAATCTCCTATAAAATTTATGGAACGTGTTTCGAATCATTTGTTAGCTGCTTCGGATGATGGTGAAGTTAGTGCCTGGAAGCATGATAAATATGGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL AW017405             [                                                                                                                                                                                                                                                                              TGATAGTAATAATCTACTGCATAATTACGCAGTAATTGATAAAAAATTGGAATTGAAACAAACATTTCATGCAAACAAATCTCCTATAAAATTTATGGAACGTGTTTCGAATCATTTGTTAGCTGCTTCGGATGATGGTGAAGTTAGTGCCTGGAAGCATGATAAATATGGTGTTTTGCAATTGTCTCATCGTCTCAATGTCTGCACAGATATACCGTCAAAGAATAATAGTAATAATAGCAACGTGGAAAAATCATATTATTTGACCAGCTNTTTCATGTTCTACGCTGGTTATGATCCCTTGAAATTTGAACCAACACTGCACGATCCAACTATTGAAACAATCAATAAATTGATGATATCTAATGCTGATAATCAACATACTGAGTCTGATGACCAAGTGAAGGATCCGGATTCTGAAGTGACTTCACTTAGTGGATGTTGCATGTCAAGTAGTAATAGTTATGTAACAGGTTCTGATCAAGAGATTTATGAATGTGGTTACAA]


>consensus_945#0 TTTTATTGGTCGACAAACTGGTAGTAAAATTAAGAAGTCTGTATGCTTGAAGGAACACAA TTCTGCAGTAATCGCTGTTAGTATGGAAAGCAAATTTTTTGTGACAGCTTCTAAAACCAG ACAATTGGCGTTGTATAAGTTCAATCCATTAGAACGAACTGTAACCTTATGGCATTTAAT CAATGATGTTGGAACAGCTACAATCACTTCTTTCTATTTACTACGTATGTTCATTGGTGT GAAGACAATCAGTATATCGGTGTATATTGGTGATAGTAATAATCTACTGCATAATTACGC AGTAATTGATAAAAAATTGGAATTGAAACAAACATTTCATGCAAACAAATCTCCTATAAA ATTTATGGAACGTGTTTCGAATCATTTGTTAGCTGCTTCGGATGATGGTGAAGTTAGTGC CTGGAAGCATGATAAATATGGTGTTTTGCAATTGTCTCATCGTCTCAATGTCTGCACAGA TATACCGTCAAAGAATAATAGTAATAATAGCAACGTGGAAAAATCATATTATTTGACCAG CTNTTTCATGTTCTACGCTGGTTATGATCCCTTGAAATTTGAACCAACACTGCACGATCC AACTATTGAAACAATCAATAAATTGATGATATCTAATGCTGATAATCAACATACTGAGTC TGATGACCAAGTGAAGGATCCGGATTCTGAAGTGACTTCACTTAGTGGATGTTGCATGTC AAGTAGTAATAGTTATGTAACAGGTTCTGATCAAGAGATTTATGAATGTGGTTACAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)