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Schistosoma mansoni
cluster # 9455 cluster # 9455       Sequences # 9       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9455#0 length = 1172 sequences # 9  

consensusID : consensus_9455#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 1172
fasta sequence
                              [GTGTGTGTGTGTGCGTGTTGATGTTGACATTGTGTATTTGTGATAATTGAGTAGTTGGATTGATTGTGTTTTGGTATTTGTGTTGATTGATGCAAGTGTGACACTACAGGTGTCTGAGTTGAGTACGAGGATGCAGAGTGTCAACTCGCTACAGTGTTGTTTCCGTCCTCTTCCCTACACAGAATATGATGTCTGTGTCAGGTGTACAGAACGGATATATCAATTAAGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGCTGCTGCATATGTGTATGTGTATATTGTGGTTTACCAGTATTGGCATCAAGATATGAGTTGTTGAGGGTTCTGAATTCTAGTTGTTTATTGTTATAACGTGTGTTATTTGTGCAAATGTAGTGAGTGTATTGATGAGAGGTAAGAGAGGATTAGTTGTGTTTGTAATTGAGAGAGTGTTGTGA-TGACTGAGTAGATGGTGATACTCGATATGAGTGAAT-TGTTTATTTGACTATTGGAGTGGATTGTGAAGTAGAATAATTCGGTGTTCTCTGAGCCTGTATTCGTGATGCGAGTAAGAGGTCAAGTGGACACCGTACAATGAGTGACAGATGTCTCACGACTTGTCTGTGTCTGGTAAGGACGGAGA-CTGTGAGTAATCTGACAGTTGTTTATCATTCGAGGGTTTTTTTAGTGAAGGTTGTTAATTTTTCGATGGGACTGTAGGGTTATTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGAAAGACAAACATTTGTTGTGTTTGGCAAATGAAGGTGTAGTGTGAATGGTTTTTTGTGAGGAGTGTTAGTGTTGATCGTTCGTACTGAGATTGTGGATGGATGGACAGACGTTGTGATCGTGGGAAGTCACTGTGTCTGTTTCTTTCATCCCTCTCTTTGTGTGTTTGGAGTTTGATCAGCTCTTCTACATGATGTTTGAAAGTTCTACCGGCTATAAACATTGTGATCCGAATGATTGTGATGGTTGGTGTTTTTAGCATTGTGTGGAGGGGGATCGGTGGAGTGTTTTTGTATTATCTCAACTATCTTCACTGAATACTTTGTAACGTCAATGTAGTGTGTTTATGCTGATGGTTTTGGCTTCGATTGTTGATGTGTTTATTTGTGGAATAGACATTATACGAGGTGTGTGTTTTGATGCTTTCTCATCGTGTGTTTGTGAG]

[+] EMBL CD086384             [GTGTGTGTGTGTGCGTGTTGATGTTGACATTGTGTATTTGTGATAATTGAGTAGTTGGATTGATTGTGTTTTGGTATTTGTGTTGATTGATGCAAGTGTGACACTACAGGTGTCTGAGTTGAGTACGAGGATGCAGAGTGTCAACTCGCTACAGTGTTGTTTCCGTCCTCTTCCCTACACAGAATATGATGTCTGTGTCAGGTGTACAGAACGGATATATCAATTAAGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGCTGCTGCATATGTGTATGTGTATATTGTGGTTTACCAGTATTGGCATCAAGATATGAGTTGTTGAGGGTTCTGAATTCTAGTTGTTTATTGTTATAACGTGTGTTATTTGTGCAAATGTAGTGAGTGTATTGATGAGAGGTAAGAGAGGATTAGTTGTGTTTGTAATTGAGAGAGTGTTGTGA TGACTGAGTAGATGGTGATACTCGATATGAGTGAAT TGTTTATTTGACTATTGGAGTGGATTGTGAAGTAGAATAATTCGGTGTTCTCTGAGCCTGTATTCGTGATGCGAGTAAGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD098493             [                                                                                                                                                                                    AGAATATGATGTCTGTGTCAGGTGTACAGAACGGATATATCAATTAAGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGCTGCTGCATATGTGTATGTGTATATTGTGGTTTACCAGTATTGGCATCAAGATATGAGTTGTTGAGGGTTCTGAATTCTAGTTGTTTATTGTTATAACGTGTGTTATTTGTGCAAATGTAGTGAGTGTATTGATGAGAGGTAAGAGAGGATTAGTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD198461             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AAATGTAGTGAGTGTATTGATGAGAGGTAAGAGAGGATTAGTTGTGTTTGTAATTGAGAGAGTGTTGTGATTGACTGAGTAGATGGTGATACTTGATATGAGTGAATATGTTTATTTGACTATTGGAGTGGATTGTGAAGTAGAATAATTCGGTGTTCTCTGAGCCTGTATTCGTGATGCGAGTAAGAGGTCAAGTGGACACCGTACAATGAGTGACAGATGTCTCACGACTTGTCTGTGTCTGGTAAGGACGGAGACCTGTGAGTAATCTGACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD085982             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aCAGGAGGACACCGTACAATGAGTGACAGATGTCTCACGACTTGTCTGTGTCTGGTAAGGACGGAGA CTGTGAGTAATCTGACAGTTGTTTATCATTCGAGGGTTTTTTTAGTGAAGGTCGTTAATTTTTCGATGGGACTGTAGGGTTATTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGAAAGACAAACATTTGTTGTGTTTGGCAAATGAAGGTGTAGTGTGAATGGTTTTTTGTGAGGAGTGTTAGTGTTGATCGTTCGTACTGAGATTGTGGGTGGATGGACAGACGTTGTGATCGTGGGAAGTCACTGTGTCTGTTTCTTTCCTCCCTCTCTTTGTGTGTTCGGAGTTTGAT                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD085892             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATGAGTGACAGATGTCTCACGACTTGTCTGTGTCTGGTAAGGACGGAGA CTGTGAGTAATCTGACAGTTGTTTATCATTCGAGGGTTTTTTTAGTGAAGGTTGTTAATTTTTCGATGGGACTGTAGGGTTAT  TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGAAAGACAAACATTTGTTGTGTTTGGCAAATGAAGGTGTAGTGTGAATGGTTTTTTGTGAGGAGTGTTAGTGTTGATCGTTCGTACTGAGATTGTGGATGGATGGACAGACGTTGTGATCGTGGGAAGTCACTGTGTCTGTTTCTTTCATCCCTCTCTTTGTGTGTTTGGAGTTTGATCAGCTCTTCTACATGATGTTTGAAAGTTCTACCGGCTATAAACATTGTGATCCGAATGATTGTGATGGTTGGTGTTTTTAGCATTGTGTGGAGGGGGATCGGTGGAGTGTTTTTGTATTATCTCAACTATCTTCACTGAATACTTTGTAACGTCCATGTAGTGTGTTTATGCTGATGGTTTTGGCTTCCACTGTTGATGTGTTTATTTGTGGAATACACTTTTTCCGAGGGGTGTGTTT                            ]
[+] EMBL CD086269             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATGAGTGACAGATGTCTCACGACTTGTCTGTGTCTGGTAAGGACGGAGA CTGTGAGTAATCTGACAGTTGTTTATCATTCGAGGGTTTTTTTAGTGAAGGTTGTTAATTTTTCGATGGGACTGTAGGGTTATTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGAAAGACAAACATTTGTTGTGTTTGGCAAATGAAGGTGTAGTGTGAATGGTTTTTTGTGAGGAGTGCTAGTGTTGATCGTTCGTACTGAGATTGTGGATGGATGGACAGACGTTGTGATCGTGGGAAGTCACTGTGTCTGTTTCTTTCATCCCTCTCTTTGTGTGTTTGGAGTTTGATCAGCTCTTCTACATGATGTTTGAAAGTTCTACCGGCTATAAACATTGTGATCCGAATGATTGTGATGGTTGGTGTTTTTAGCATTGTGTGGAGGGGGATCGGTGGAGTGTTTNTGTATTATCTCAACTATCTTCACTGAATACTGTGTAACGTCAATGTAGTGTGTTTATGCTGATGGTTTTGGCTTCGATTGTTGATGTGTNTATTTGTGGAATACACATTATACGANGTGTGTGTTT                            ]
[+] EMBL CD086282             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATGAGTGACAGATGTCTCACGACTTGTCTGTGTCTGGTAAGGACGGAGA CTGTGAGTAATCTGACAGTTGTTTATCATTCGAGGGTTTTTTTAGTGAAGGTTGTTAATTTTTCGATGGGACTGTAGGGTTATTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGAAAGACAAACATTTGTTGTGTTTGGCAAATGAAGGTGTAGTGTGAATGGTTTTTTGTGAGGAGTGTTAGTGTTGATCGTTCGTACTGAGATTGTGGATGGATGGACAGACGTTGTGATCGTGGGAAGTCACTGTGTCTGTTTCTTTCATCCCTCTCTTTGTGTGTTTGGAGTTTGATCAGCTCTTCTACATGATGTTTGAAAGTTCTACCGGCTATAAACATTGTGATCCGAATGATTGTGATGGTTGGTGTTTTTAGCATTGTGTGGAGGGGGATCGGTGGAGTGTTTTTGTATTATCTCAACTATCTTCACTGAATACTTTGTAACGTCAATGTAGTGTGTTTATGCTGATGGTTTTGGCTTCGATTGTTGATGTGTTTATTTGTGGAATAGACATTATACGAGGTGTGTGTTT                            ]
[-] EMBL CD091144             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GTGTGTGGAAAGACAAACATTTGTTGTGTTTGGCAAATGAAGGTGTAGTGTGAATGGTTTTTTGTGAGGAGTGTTAGTGTTGATCGTTCGTACTGAGATTGTGGATGGATGGACAGACGTTGTGATCGTGGGAAGTCACTGTGTCTGTTTCTTTCATCCCTCTCTTTGTGTGTTTGGAGTTTGATCAGCTCTTCTACATGATGTTTGAAAGTTCTACCGGCTATAAACATTGTGATCCGAATGATTGTGATGGTTGGTGTTTTTAGCATTGTGTGGAGGGGGATCGGTGGAGTGTTTTTGTATTATCTCAACTATCTTCACTGAATACTTTTTAACGTCAATGTAGTGTGTTTATGCTGATGGTTTTGGCTTCGATTGTTGATGTGTTTATTTGTGGAATAGACATTATACGAGGTGTGTGTTTTGATGCTTTCTCATCGTGTGTTTGTGAG]
[-] EMBL CD091133             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GGAAAGACAAACATGTGTTGTGTTTGGCAAATGAAGGTGTAGTGTGAATGGTTTTTTGTGAGGAGTGTTAGTGTTGATCGTTCGTACTGAGATTGTGGATGGATGGACAGACGTTGTGATCGTGGGAAGTCACTGTGTCTGTTTCTTTCAACCCTCTCTTTGTGTGTTTGGAGTTTGATCAGCTCTTCTACATGATGTTTGAAAGTTCTACCGGCTATAAACATTGTGATCCGAATGATTGTGATGGTTGGTGTTTTTAGCATTGTGTGGAGGGGGATCGGTGGAGTGTTTTTGTATTATCTCAACTATCTTCACTGAATACTTTTTAACGTCAATGTAGTGTGTTTATGCTGATGGTTTTGGCTTCGATTGTTGATGTGTTTATTTGTGGAATAGACATTATACGAGGTGTGTGTTTTGATGCTTTCTCATCGTGTGTTTGTGAG]


>consensus_9455#0 GTGTGTGTGTGTGCGTGTTGATGTTGACATTGTGTATTTGTGATAATTGAGTAGTTGGAT TGATTGTGTTTTGGTATTTGTGTTGATTGATGCAAGTGTGACACTACAGGTGTCTGAGTT GAGTACGAGGATGCAGAGTGTCAACTCGCTACAGTGTTGTTTCCGTCCTCTTCCCTACAC AGAATATGATGTCTGTGTCAGGTGTACAGAACGGATATATCAATTAAGTTGTTGTTGTTG TTGTTGTTGTTGCTGCTGCATATGTGTATGTGTATATTGTGGTTTACCAGTATTGGCATC AAGATATGAGTTGTTGAGGGTTCTGAATTCTAGTTGTTTATTGTTATAACGTGTGTTATT TGTGCAAATGTAGTGAGTGTATTGATGAGAGGTAAGAGAGGATTAGTTGTGTTTGTAATT GAGAGAGTGTTGTGATGACTGAGTAGATGGTGATACTCGATATGAGTGAATTGTTTATTT GACTATTGGAGTGGATTGTGAAGTAGAATAATTCGGTGTTCTCTGAGCCTGTATTCGTGA TGCGAGTAAGAGGTCAAGTGGACACCGTACAATGAGTGACAGATGTCTCACGACTTGTCT GTGTCTGGTAAGGACGGAGACTGTGAGTAATCTGACAGTTGTTTATCATTCGAGGGTTTT TTTAGTGAAGGTTGTTAATTTTTCGATGGGACTGTAGGGTTATTGTGTGTGTGTGTGTGT GTGTGTGGAAAGACAAACATTTGTTGTGTTTGGCAAATGAAGGTGTAGTGTGAATGGTTT TTTGTGAGGAGTGTTAGTGTTGATCGTTCGTACTGAGATTGTGGATGGATGGACAGACGT TGTGATCGTGGGAAGTCACTGTGTCTGTTTCTTTCATCCCTCTCTTTGTGTGTTTGGAGT TTGATCAGCTCTTCTACATGATGTTTGAAAGTTCTACCGGCTATAAACATTGTGATCCGA ATGATTGTGATGGTTGGTGTTTTTAGCATTGTGTGGAGGGGGATCGGTGGAGTGTTTTTG TATTATCTCAACTATCTTCACTGAATACTTTGTAACGTCAATGTAGTGTGTTTATGCTGA TGGTTTTGGCTTCGATTGTTGATGTGTTTATTTGTGGAATAGACATTATACGAGGTGTGT GTTTTGATGCTTTCTCATCGTGTGTTTGTGAG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)