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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9466#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 880 fasta sequence
[CCAAGAGACAATAGGGTTTATGCCACACAATTTCCAGATCCGAATTCAATTGTCCCCACTCAAAGTGGTGCTAGTATACCTAGTTATAACAT-GTC-TTACACACCACAA-TTTAGTTC-ATATGT-TCCTGATCCAGTTGGCCATAA-TATCCAACCCCATCGTTCGTTCTCTCAAGGAAACCAAAATCCAGTCCCGCCTGGCTCATTTTCGATGCAAAGTATACAAGCATCTTTGCCAACTTATACAAGACAGGATGATTCAAAAGGATACCCTGGGAATCAAACTTATCCATCTAGCCAACATGTAATGGACGAAAAGAATGTACCTAGGTACACACAGGTTGTGACCCATCCAAGTGATGCACCTAACAACTATACTGAGCCGGGTGCTGTGGAGGCTCAGTTGATATCTTTCGATTAAACGAAGTTGATTTTCTTTATTCTATGAAGCGAATTATTCGTGATATTTCCCCTGTAATTAAATATTGTTGACGTTAGCTAGCCGTTATTAGTTTGGTCTCTTT-CGTTGTTTTGCCAAATCTGA-CGCTTATGTTGCAAGCATAACATTTGTGATAGCGTGATTGAATATGCTATGTTAACTCATTATTATGTCAATCTCTTAATATATGTCAACTGGGAGTGAATGATGCGGCCACATTTTGATCAAAGGCCAAATAAGTAAAAAGCTGATATGCCCTTAAAATATTCATGTTTCCAATCCACTTTGATTTCCTCGAAAATTTGGNATAATATTAGATGTTAATCATAATAGTGNAGTNTCTTACTCTACCATATTAAATTTGTTATTCCTTTTAATTGAATAAATCCCATCCAAAAGCTAGTCGTTTTGAATGATCTGGAAATAAAATGCCAATAAAATCGTG]
[-] EMBL SM1247322 [CCAAGAGACAATAGGGTTTATGCCACACAATTTCCAGATCCGAATTCAATTGTCCCCACTCAAAGTGGTGCTAGTATACCTAGTTATAACATMGTCTTTACACACCACAATTTTAGTTCAATATGTBTCCTGAACCAGTTG CATAATTATCCAACCCCATC ]
[-] EMBL CD112663 [ ACAATAGGGTTTATGCCACACAATTTCCAGATCCGAATTCAATTGTCCCCACTCAAAGTGGTGCTAGTATACCTAGTTATAACAT GTC TTACACACCACAA TTTAGTTC ATATGT TCCTGATCCAGTTGGCCATAA TATCCAACCCCATCGTTCGTTCTCTCAAGGAAACCAAAATCCAGTTCCGCCTGGCTCATTTTCGATGCAAAGTATACAAGCATCTTTGCCAACTTATACAAGACAGGATGATTCAAAAGGATACCCTGGGAATCAAACTTATCCATCTAGCCAACATGTAATGGACGAAAAGAATGTACCTAGGTACACACAGGTTGTGACCCATCCAAGTGACGCACCTAACAACTATACT ]
[-] EMBL CD112720 [ ACAATAGGGTTTATGCCACACAATTTCCAGATCCGAATTCAATTGTCCCCACTCAAAGTGGTGCTAGTATACCTAGTTATAACAT GTC TTACACACCACAA TTTAGTTC ATATGT TCCTGATCCAGTTGGCCATAA TATCCAACCCCAT ]
[+] EMBL CD169522 [ TTGTCCCCACTCAAAGTGGTGCTAGTATACCTAGTTATAACAT GTC TTACACACCACAA TTTAGTTC ATATGT TCCTGATCCAGTTGGCCATAA TATCCAACCCCATCGTTCGTTCTCTCAAGGAAACCAAAATCCAGTCCCGCCTGGCTCATTTTCGATGCAAAGTATACAAGCATCTTTGCCAACTTATACAAGACAGGATGATTCAAAAGGATACCCTGGGAATCAAACTTATCCATCTAGCCAACATGTAATGGACGAAAAGAATGTACCTAGGTACACACAGGTTGTGACCCATCCAAGTGATGCACCTAACAACTATACTGAGCCGGGTGCTGTGGAGGCTCAGTTGATATCTTTCGATTAAACGAAGTTGATTTTCTTTATTCTATGAAGCGAATTATTCGTGATATTTCCCCTGTAATTAAATATT ]
[+] EMBL CD169503 [ TTGTCCCCACTCAAAGTGGTGCTAGTATACCTAGTTATAACAT GTC TTACACACCACAA TTTAGTTC ATATGT TCCTGATCCAGTTGGCCATAA TATCCAACCCCATCGTTCGTTCTCTCAAGGAAACCAAAATCCAGTCCCGCCTGGCTCATTTTCGATGCAAAGTATACAAGCATCTTTGCCAACTTATACAAGACAGGATGATTCAAAAGGATACCCTGGGAATCAAACTTATCCATCTAGCCAACATGTAATGGACGAAAAGAATGTACCTAGGTACACACAGGTTGTGACCCATCCAAGTGATGCACCTAACAACTATACTGAGCCGGGTGCTGTGGAGGCTCAGTTGATATCTTTCGATTAAACGAAGTTGATTTTCTTTATTCTATGAAGCGAATTATTCGTGATATTTCCCCTGTAATTAAATATT ]
[-] EMBL CD135468 [ TGATTCAAAAGGATACCCTGGGAATCAAACTTATCCATCTAGCCAACATGTAATGGACGAAAAGAATGTACCTAGGTACACACAGGTTGTGACCCATCCAAGTGATGCACCTAACAACTATACTGAGCCGGGTGCTGTGGAGGCTCAGTTGATATCTTTCGATTAAACGAAGTTGATTTTCTTTATTCTATGAAGCGAATTATTCGTGATATTTCCCCTGTAATTAAATATTGTTGACGTTAGCTAGCCGTTATTAGTTTGGTCTCTTT CGTTGTTTTGCCAAATCTGA CGCTTATGTTGCAAGCATAACATTTGTGATAGCGTGATTGAATATGCTATGTTAA ]
[+] EMBL AA566208 [ ATCCAAGTGATGCACCTAACAACTAT CTGAGCCGGGTGCTGTGGAGGCTCAGTTGATATCTTTCGATTAAACGAAGTTGATTTTCTTTATTCTATGAAGCGAATTATTCGTGATATTTCCCCTGTAATTAAATATTGTTGACGTTAGCTAGCCGTTATTAGTTTGGTCTCTTTCCGTCG TTTGCCAAA CTGACCGCTTATGTTGCAAGCATAACA TTGTGATAGCGTG ]
[+] EMBL CD090239 [ GATTTTCTTTATTCTATGAAGCGAATTATTCGTGATATTTCCCCTGTAATTAAATATTGTTGACGTTAGCTAGCCGTTATTAGTTTGGTCTCTTT CGTTGTTTTGCCAAATCTGA CGCTTATGTTGCAAGCATAACATTTGTGATAGCGTGATTGAATATGCTATGTTAACTCATTATTATGTCAATCTCTTAATATATGTCAACTGGGAGTGAATGATGCGGCCACATTTTGATCAAAGGCCAAATAAGTAAAAAGCTGATATGCCCTTAAAATATTCATGTTTCCAATCCACTTTGATTTCCTCGAAAATTTGG ]
[-] EMBL SMT14412 [ TGATTGAATATGCTATGTTAACTCANTATTATGTCAATCTCNTNATATATGTCAACTGGGAGTGAATGATGCGGCCACATTTTGATCAAAGGCCAAATAAGNAAAAAGCTGATATGCCCNTAAAATANTCATGTTTCCAATCCACTTTGATTTCCTCGNAAATTTGGNATAATATTAGATGTTAATCATAATAGTGNAGTNTCTTACTCTACCATATTAAATTTGTTATTCCTTTTAATTGAATAAATCCCATCCAAAAGCTAGTCGTTTTGAATGATCTGGAAATAAAATGCCAATAAAATCGTG]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||