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Schistosoma mansoni
cluster # 9477 cluster # 9477       Sequences # 9       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9477#0 length = 673 sequences # 9  

consensusID : consensus_9477#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 673
fasta sequence
                              [TAGACAGAGCCAGCGATATGTGGTGTGTGATCGTGGGAACGAACGGTCTCGTATGCAGCTGTTTAGCCGAAGTGGTCATTTTGTACGCCGTATCCCGATTCGGTACATCGATATTGTTGCAGGGCTTGCAATAAATCAACATGGACACATTGTTGCTATTGATAGTGTTTCGCCATCGGTTTTTGTTGTGTCAGAGGAAGGTGACCTAATTCGTTGGTTCGATTGTAGTAACCACATGAGAGAACCATCAGATGTCGCGATACATGGTCGAGAGTACTATATTTGCGATTTTAAGGCACATTGTGTCATTGTTTTTCAGGAGGATGGGTCATTTATTCGTCGTATAGGAGGCGAATCAATTACTGACTTTCCTAACGGTATAGATGTTAGCGACCATGGAGATGTACTAGTTGGAGACTCACATGGCAACCGTTTCCACATTGCTGTGTTTAGTCGATCGGGGGAACTGCTGAGCGAATTCGTTTGCAACCAAACAAAAGTCAGTCGCTCATGCTGCTTGAAAATAACGACTGAGGGATATGTTGTTACGCTTGCACGCAGTTCTAATAATGTTCTGGTCCTCAATACTCTCTATATATGTTAATTATGATTCCCAGCCGGTTACTACTCACAACACAGCCAGCATACTTCCCAAGATATCGTTCTTCCAATC]

[+] EMBL CD195120             [TAGACAGAGCCAGCGATATGTGGTGTGTGATCGTGGGAACGAACGGTCTCGTATGCAGCTGTTTAGCCGAAGTGGTCATTTTGTACGCCGTATCCCGATTCGGTACATCGATATTGTTGCAGGGCTTGCAATAAATCAACATGGACACATTGTTGCTATAGATAGTGTTTCGCCATCGGTTTTTGTTGTGTCAGAGGAAGGTGACCTAATTCGTTGGTTCGATTGTAGTAACCACATGAGAGAACCATCAGATGTCGCGATACATGGTCGAGAGTACTATATTTGCGATTTTAAGGCACATTGTGTCATTGTTTTTCAGGAGGATGGGTCATTTATTCGTCGTATAGGAGGCGAATCAATTACTGACTTTCCTAACGGTATAGATGTTAGCGACCATGGAGATGTACTAGTTGGAGACTCACATGGNCACCGTTTCCACATTGCTGTGTNTAGTCGATCGGGGGAACTGCTGAGCGAATTCGTTTGCAACCAGACAAAAGTCAGTCGCTCATGCTGCTTGAAAAT ACGACTGAGGGATATGTTTGTACGCTTGCACGCA TTCTAATAATGGTC                                                                                                  ]
[+] EMBL CD112153             [ AGACAGAGCCAGCGATATGTGGTGTGTGATCGTGGGAACGAACGGTCTCGTATGCAGCTGTTTAGCCGAAGTGGTCATTTTGTACGCCGTATCCCGATTCGGTACATCGATATTGTTGCAGGGCTTGCAATAAATCAACATGGACACATTGTTGCTATTGATAGTGTTTCGCCATCGGTTTTTGTTGTGTCAGAGGAAGGTGACCTAATTCGTTGGTTCGATTGTAGTAACCACATGAGAGAACCATCAGATGTCGCGATACATGGTCGAGAGTACTATATTTGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD200906             [                              TCGTGGGAACGAACGGTCTCGTATGCAGCTGTTTAGCCGAAGTGGTCATTTTGTACGCCGTATCCCGATTCGGTACATCGATATTGTTGCAGGGCTTGCAATAAATCAACATGGACACATTGTTGCTATTGATAGTGTTTCGCCATCGGTTTTTGTTGTGTCAGAGGAAGGTGACCTAATTCGTTGGTTCGATTGTAGTAACCACATGAGAGAACCATCAGATGTCGCGATACATGGTCGAGAGTACTATATTTGCGATTTTAAGGCACATTGTGTCATTGTTTTTCAGGAGGATGGGTCATTTATTCGTCGTATAGGAGGCGAATCAATTACTGACTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD192787             [                                                                                                                  TGTTGCAGGGCTTGCAATAAATCAACGTGGACACATTGTTGCTATTGATAGTGTTTCGCCATCGGTTTTTGTTGTGTCAGAGGAAGGTGACCTAATTCGTTGGTTCGATTGTAGTAACCACATGAGAGAACCATCAGATGTCGCGATACATGGTCGAGAGTACTATATTTGCGATTTTAAGGCACATTGTGTCATTGTTTTTCAGGAGGATGGGTCATTTATTCGTCGTATAGGAGGCGAATCAATTACTGACTTTCCTAACGGTATAGATGTTAGCGACCATGGAGATGTACTAGTTGGAGACTCACATGGCAACCGTTTCCACATTGCTGTGTTTAGTCGATCGGGGGAACTGCTGAGCGAATTCGTTTGCAACCAAACAAAAGTCAGTCGCTCATGCTGCTTGAAAATAACGACTGAGGGATATGTTGTTACGCTTGCACGCAGTTCTAATAATGTTCTGGTCCTCAATACTCTCTATATATGTTAATCATGATTCCCAGCCGGTTACTACTCACAACACAGCCAGCA                            ]
[+] EMBL CD111933             [                                                                                                                            CTTGCAATAAATCAACATGGACACATTGTTGCTATTGATAGTGTTTCGCCATCGGTTTTTGTTGTGTCAGAGGAAGGTGACCTAATTCGTTGGTTCGATTGTAGTAACCACATGAGAGAACCATCAGATGTCGCGATACATGGTCGAGAGTACTATATTTGCGATTTTAAGGCACATTGTGTCATTGTTTTTCAGGAGGATGGGTCATTTATTCGTCGTATAGGAGGCGAATCAATTACTGACTTTCCTAACGGTATAGATGTTAGCGACCATGGAGATGTACTAG                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD063876             [                                                                                                                                CAATAAATCAACATGGACACA TGTTGCTATTGATAGTGTTTCGCCATCGGTTTTTGTTGTGTCAGAGGAAGGTGACCTAATTCGTTGGTTCGA TGTAGTAACCACATGAGAGAACCATCAGATGTCGCGATACATGGTCGAGAGTACTATATTTGCGATTTTAAGGCACATTGTGTCATTGTTTTTCAGGAGGATGGGTCATTTATTCGTCGTATAGGAGGCGAATCAATTACTGACTTTCCTAACGGTATAGATGTTAGCGACCATGGAGATGTACTAGTTGGAGACTCACATGGCAACCGTTTCCACATTGCTGTGTTTAGTCGATCGGGGGAACTGCTGAGCGAATTCGTTTGCAACCAAACAAAAGTCAGTCGCTCATGCTGCTTGAAAATAACGACTGAGGGATAT                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD063919             [                                                                                                                                            ATGGACACA TGTTGCTATTGATAGTGTTTCGCCATCGG TTTTGTTGTGTCAGAGGAAGGTGACCTAATTCGTTGGTTCGATTGTAGTAACCACATGAGAGAACCATCAGATGTCGCGATACATGGTCGAGAGTACTATATTTGCGATTTTAAGGCACATTGTGTCATTGTTTTTCAGGAGGATGGGTCATTTATTCGTCGTATAGGAGGCGAATCAATTACTGACTTTCCTAACGGTATAGATGTTAGCGACCATGGAGATGTACTAGTTGGAGACTCACATGGCAACCGTTTCCACATTGCTGTGTTTAGTCGATCGGGGGAACTGCTGAGCGAATTCGTTTGCAACCAAACAAAAGTCAGTCGCTCATGCTGCTTGAAAATAACGACTGAGGGATAT                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD064726             [                                                                                                                                                                                                                                                  AACCATCAGATGTCGCGATACATGGTCGAGAGTACTATATCTGCGATTTTAAGGCAGATTGTGTCATTGTTTATCAGGAGGATGGGTCATTTATTCGTCGTATAGGAGGCGAATCAATTACTGACTTTCCTAACGGTATAGATGTTAGCGACCATGGAGATGTACTAGTTGGAGACTCACATGGCAACCGTTTCCACATTGCTGTGTTTAGTCGATCGGGGGAACTGCTGAGCGAATTCGTTTGCAACCAAACAAAAGTCAGTCGCTCATGCTGCTTGAAAATAACGACTGAGGGATATGTTGTTACGCTTGCACGCAGTTCTAATAATGTTCTGGTCCTCAATACTCTCTATATATGTTAATTATGATTCCCAGCCGGTTACTACTCACAACACAGCCAGCATACTTCCCAAGATATCGTTCTTCCAATC]
[+] EMBL CD126828             [                                                                                                                                                                                                                                                        CAGATGTCGCGATACATGGTCGAGAGTACTATATTTGCGATTATAAGGCACATTGTGTCATTGCTTTTCAGGAGGATGGGTCATTTATTCGTCGTATATGAGGCGACTCAATTACTGACTTTCCTAACGGTATAGATGTTAGCGACCATGGAGATGTACTAGTTGGAGACTCACATGGCAACCGTTTCCACATTGCTGTGTTTAGTCGATCGGGGGAACTGCTGAGCGAATTCGTTTGCAACCAAACAAAAGTCAGTCGCTCATGCTGCTTGAAAATAACGACTGAGGGATATGTTGTTACGCTTGCACGCAGTTCTAATAATGTTCCGGTCCTCAATACTCTCTATATATGTTAATTATGATTCCCAGCCGGTTACTACTCACAACACAGCCAGCATACTTCCCAAGATATCGTTCTTCCAct ]


>consensus_9477#0 TAGACAGAGCCAGCGATATGTGGTGTGTGATCGTGGGAACGAACGGTCTCGTATGCAGCT GTTTAGCCGAAGTGGTCATTTTGTACGCCGTATCCCGATTCGGTACATCGATATTGTTGC AGGGCTTGCAATAAATCAACATGGACACATTGTTGCTATTGATAGTGTTTCGCCATCGGT TTTTGTTGTGTCAGAGGAAGGTGACCTAATTCGTTGGTTCGATTGTAGTAACCACATGAG AGAACCATCAGATGTCGCGATACATGGTCGAGAGTACTATATTTGCGATTTTAAGGCACA TTGTGTCATTGTTTTTCAGGAGGATGGGTCATTTATTCGTCGTATAGGAGGCGAATCAAT TACTGACTTTCCTAACGGTATAGATGTTAGCGACCATGGAGATGTACTAGTTGGAGACTC ACATGGCAACCGTTTCCACATTGCTGTGTTTAGTCGATCGGGGGAACTGCTGAGCGAATT CGTTTGCAACCAAACAAAAGTCAGTCGCTCATGCTGCTTGAAAATAACGACTGAGGGATA TGTTGTTACGCTTGCACGCAGTTCTAATAATGTTCTGGTCCTCAATACTCTCTATATATG TTAATTATGATTCCCAGCCGGTTACTACTCACAACACAGCCAGCATACTTCCCAAGATAT CGTTCTTCCAATC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)