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Schistosoma mansoni
cluster # 9491 cluster # 9491       Sequences # 10       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9491#0 length = 1040 sequences # 10  

consensusID : consensus_9491#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 10
consensus length = 1040
fasta sequence
                              [TTTTAGTTCGTCACGTTTCTTATACACTGTGGACCAAGAAGTTATATTCTCACTTTCCAAGAACGTATCCAAATGGATCTAT-AAAAAAAACAAATAATGGTAATGAAATTTATCACACACTTTCTTGCTCAAATCGGACCGCAGTCTGAATATACTTGGACTCGTCTAATTTACAGTACACTTAAGGCTCCTACATATCATTTGTACTTTGAATTGCTACTAATTATTGGTATTATATGGTTATTGTTTAAACGCAGTTATCGTATTAATGACGTGATTAATCTAAGTGTGGAAGAAAAAAACCAACTGATTAGTGAATGGAAACCCGATAGTTTGGTTCCGAAAGATTGGGAACCATCAAAATATCTATTAAAACAATTCCACAGATGTGCATATGGTCCTCTTGGCAAATATGTCAATTTCAACTTGGAAGTGGAAGAGTTTGAAGCTACTGAAATGAATGTTAGTAAGAACCATCTCAATTTCGCGACATTAAATTTCTTAAACTTTGTTGGGGATTCGGATTTGTCTAATGTTGCTACTGAGCAGATGAAAAAATATGGTGTTGGATCATGTGGACCAAGAGGATTTTATGGTACTTTTGATGTTCATCTTGAATTGGAAAATAAATTAGCTGAATTCCTTGGTGTTGAAAAAGCAGTAATCTATTCTTATGGAGCAGCTACATTTTCTAGTGCTATTCCATCCTATTCCAAACGAACTGATGTAATATTTGCAGATGAACGTATCAGCCATGCTACGTATCTAGGATTAGTGGCATCTAGAAGTCATGTTCGATTTTTCCGTCATAATGATATGGAGCATTTGGAACAGTTACTGATAGCACAGGCGAAAAAAGACAAAGAAGATCCTAAACGTGCATTACTAACCCGCCGATTTTTTGTTGTTGAAGGTATTTATTTCAATTCTGGAGAAATATGTCCCTTATCTGAGCTTATTGCTTTAAAGTATAAATACAAAGTTCGCATTTTGTTAGATGAGACCATTTCTTTTGGAGTATTAGGTAAAACTGGTAGGGG]

[+] EMBL CD081276             [TTTTAGTTCGTCACGTTTCTTATACACTGTGGACCAAGAAGTTATATTCTCACTTTCCAAGAACGTATCCAAATGGATCTAT AAAAAAAACAAATAATGGTAATGAAATTTATCACACACTTTCTTGCTCAAATCGGACCGCAG  TGAATATACTTGGACTCGTCTAATTTACAGTACACTTAAGGCTCCTACATATCATTTGTACTTTGAATTGCTACTAATTATTGGTATTATATGGTTATTGTTTAAACGCAGTTATCGTATTAATGACGTGATTAATCTAAGTGTGGAAGAAAAAAACCAACTGATTAGTGAATGGAAACCCGATAGTTTGGTTCCGAAAGATTGGGAACCATCAAAATATCTATTAAAACAATTCCACAGATGTGCATATGGTCCTCTTGGCAAATATGTCAATTTCAACTTGGAAGTGGAAGAGTTTGAAGCTACTGAAATGAATGTTAGTAAGAACCATCTCAATTTCGCGACATTAAATTTCTTAAACTTTGTTGGGGATTCGGATTTGTCTAATGTTGCTACTGAGCAGATGAAAAAATATGGTGTTGGATCATGTGGACCAAGAGGATTTTATGGTACTTTTGATGTTCATCTTGAATTGGAAAATAAATTAGCTGAATTCCTTGGTGTTGAAAAAGCAGNTATCTATTCTTATGGAGCAGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD195723             [                                                                     CAAATGGATCTAT AAAAAAAACAAATAATGGTAATGAAATTTATCACACACTTTCTTGCTCAAATCGGACCGCAGTCTGAATATACTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD068414             [                                                                           GATCTATAAAAAAAAACAAATAATGGTAATGAAATTTATCACACACTTTCTTGCTCAAATCGGACCGCAGTCTGAATATACTTGGACTCGTCTAATTTACAGTACACTTAAGGCTCCTACATATCATTTGTACTTTGAATTGCTACTAATTATTGGTATTATATGGTTATTGTTTAAACGCAGTTATCGTATTAATGACGTGATTAATCTAAGTGTGGAAGAAAAAAACCAACTGATTAGTGAATGGAAACCCGATAGTTTGGTTCCGAAAGATGGGGAACCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD163378             [                                                                                                                   ACACACTTTCTTGCTCAAATCGGACCGCAGTCTGAATATACTTGGACTCGTCTAATTTACAGTACACTTAAGGCTCCTACATATCATTTGTACTTTGAATCGCTACTAATTATTGGTATTATATGGTTATTGTTTAAACGCAGTTATCGTATTAATGACGTGATTAATCTAAGTGTGGAAGAAAAAAACCAACTGATTAGTGAATGGAAACCCGATAGTTTGGTTCCGAAAGATTGGGAACCATCAAAATATCTATTAAAACAATTCCACAGATGTGCATATGGTCCTCTTGGCAAATATGTCAATTTCAACTTGGAAGTGGAAGAGTTTGAAGCTACTGAAATGAATGTTAGTAAGAACCATCTCAATTTCGCGACATTAAATTTCTTAAACTTTGTTGGGGATTCGGATTTGTCTAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD117318             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AGATGAAAAAATATGGTGTTGGATCATGTGGACCAAGAGGATTTTATGGTACTTTTGATGTTCATCTTGAATTGGAAAATAAATTAGCTGAATTCCTTGGTGTTGAAAAAGCAGTAATCTATTCTTATGGAGCAGCTACATTTTCTAGTGCTATTCCATCCTATTCCAAACGAACTGATGTAATATTTGCAGATGAACGTATCAGCCATGCTACGTATCTAGGATTAGTGGCATCTAGAAGTCATGTTCGATTTTTCCGTCATAATGATATGGAGCATTTGGAACAGTTACTGATAGCACAGGCGAAAAAAGACAAAGAAGATCCTAAACGTGCATTACTAACCCGCCGATTTTTTGTTGTTGAAGGTATTTATTTCAATTCTGGAGAAATATGTCCCTTATCTGAGCTTATTGCTTTAAAGTATAAATACAAAGTTCGCATTTTGTTAGATAAGACCATT                                ]
[+] EMBL CD139736             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GGTGTTGGATCATGTGGACCAAGAGGATTTTATGGTACTTTTGATGTTCATCTTGAATTGGAAAATAAATTAGCTGAATTCCTTGGTGTTGAAAAAGCAGTAATCTATTCTTATGGAGCAGCTACATTTTCTAGTGCTATTCCATCCTATTCCAAACGAACTGATGTAATATTTGCAGATGAACGTATCAGCCATGCTACGTATCTAGGATTAGTGGCATCTAGAAGTCATGTTCGATTTTTCCGTCATAATGATATGGAGCATTTGGAACAGTT                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD121244             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cTTATGGTACTTTTGATGTTCATCTTGAATTGGAAAATAAATTAGCTGAATTCCTTGGTGTTGAAAAAGCAGTAATCTATTCTTATAGAGCAGCTACATTTTCTAGTGCTATTCCATCCTATTCCAAACGAACTGATGTAATATTTGCAGATGAACGTATCAGCCATGCTACGTATCTAGGATTAGTGGCATCTAGAAGTCATGTTCGATTTTTCCGTCATAATGATATGGAGCATTTGGAACAGTTACTGATAGCACAGGCGAAAAGAGACAAAGAAGATCCTAAACGTGCATTACTAACCCGCCGATTTTTTGTTGTTGAAGGTATTTATTTCAATTCTGGGGAAATATGTCCCTTATCTGAGCTTATTGCTTTAAAGTATAAATACAAAGTTCGCATTTTGTTAGATGAGACCATTTCTTTTGGAGTATTAGGTAAAACTG       ]
[-] EMBL CD121222             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cTTATGGTACTTTTGATGTTCATCTTGAATTGGAAAATAAATTAGCTGAATTCCTTGGTGTTGAAAAAGCAGTAATCTATTCTTATAGAGCAGCTACATTTTCTAGTGCTATTCCATCCTATTCCAAACGAACTGATGTAATATTTGCAGATGAACGTATCAGCCATGCTACGTATCTAGGATTAGTGGCATCTAGAAGTCATGTTCGATTTTTCCGTCATAATGATATGGAGCATTTGGAACAGTTACTGATAGCACAGGCGAAAAGAGACAAAGAAGATCCTAAACGTGCATTACTAACCCGCCGATTTTTTGTTGTTGAAGGTATTTATTTCAATTCTGGGGAAATATGTCCCTTATCTGAGCTTATTGCTTTAAAGTATAAATACAAAGTTCGCATTTTGTTAGATGAGACCATTTCTTTTGGAGTATTAGGTAAAACTG       ]
[+] EMBL CD139773             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AGCTGAATTCCTTGGTGTTGAAAAAGCAGTAATCTATTCTTATGGAGCAGCTACATTTTCTAGTGCTATTCCATCCTATTCCAAACGAACTGATGTAATATTTGCAGATGAACGTATCAGCCATGCTACGTATCTAGGATTAGTGGCATCTAGAAGTCATGTTCGATTTTTCCGTCATAATGATATGGAGCATTTGGAACAGT                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD139598             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AACGTATCAGCCATGCTACGTATCTAGGATTAGTGGCATCTAGAAGTCATGTTCGATTTTTCCGTCATAATGATATGGAGCATTTGGAACAGTTACTGATAGCACAGGCGAAAAAAGACAAAGAAGATCCTAAACGTGCATTACTAACCCGCCGATTTTTTGTTGTTGAAGGTATTTATTTCAATTCTGGAGAAATATGTCCCTTATCTGAGCTTATTGCTTTAAAGTATAAATACAAAGTCCGCATTTTGTTAGATGAGACCATTTCTTTTGGAGTATTAGGTAAAACTGGTAGGGG]


>consensus_9491#0 TTTTAGTTCGTCACGTTTCTTATACACTGTGGACCAAGAAGTTATATTCTCACTTTCCAA GAACGTATCCAAATGGATCTATAAAAAAAACAAATAATGGTAATGAAATTTATCACACAC TTTCTTGCTCAAATCGGACCGCAGTCTGAATATACTTGGACTCGTCTAATTTACAGTACA CTTAAGGCTCCTACATATCATTTGTACTTTGAATTGCTACTAATTATTGGTATTATATGG TTATTGTTTAAACGCAGTTATCGTATTAATGACGTGATTAATCTAAGTGTGGAAGAAAAA AACCAACTGATTAGTGAATGGAAACCCGATAGTTTGGTTCCGAAAGATTGGGAACCATCA AAATATCTATTAAAACAATTCCACAGATGTGCATATGGTCCTCTTGGCAAATATGTCAAT TTCAACTTGGAAGTGGAAGAGTTTGAAGCTACTGAAATGAATGTTAGTAAGAACCATCTC AATTTCGCGACATTAAATTTCTTAAACTTTGTTGGGGATTCGGATTTGTCTAATGTTGCT ACTGAGCAGATGAAAAAATATGGTGTTGGATCATGTGGACCAAGAGGATTTTATGGTACT TTTGATGTTCATCTTGAATTGGAAAATAAATTAGCTGAATTCCTTGGTGTTGAAAAAGCA GTAATCTATTCTTATGGAGCAGCTACATTTTCTAGTGCTATTCCATCCTATTCCAAACGA ACTGATGTAATATTTGCAGATGAACGTATCAGCCATGCTACGTATCTAGGATTAGTGGCA TCTAGAAGTCATGTTCGATTTTTCCGTCATAATGATATGGAGCATTTGGAACAGTTACTG ATAGCACAGGCGAAAAAAGACAAAGAAGATCCTAAACGTGCATTACTAACCCGCCGATTT TTTGTTGTTGAAGGTATTTATTTCAATTCTGGAGAAATATGTCCCTTATCTGAGCTTATT GCTTTAAAGTATAAATACAAAGTTCGCATTTTGTTAGATGAGACCATTTCTTTTGGAGTA TTAGGTAAAACTGGTAGGGG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)