These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9510#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 10 consensus length = 928 fasta sequence [TTTTGATAATCCATGAACAAACACTTAGCATCTATTGGGGAATTTTCTATTTTTGATTTCAATATAATACTATGAGCTCGCCTTCCGTGAAATTTATTAGAATTTAAACATCCTGAGGGCAGCCAATTAACAGCTTCCTTTGACCACGGTCCTGTAGTAAGTATAACTAAGCTGGCAGGGATAACTTCAGAATTTGAAGTAGATGATTCTATTACTCGAACACCACTAACTTTGGGAGCAGATGTATTCGATGTTGAAAATTCCAACCCTATAACACGAGCAATTTTTAATTTGGTTCCCTGATTTGTTAAATATTGAGCACGCCGAAATAATTCATCTGTGAGTTTTTTGGGATGTACCTGTGCAGTAGTTGTAGAGTCTCCTATCAGGGAACAACTTTTCACTTTCGCACTGACCCAAGATGGTGATTCTGAAGAGCCGGAAGATTTCCCAGGAGATAGTGATATAGAATACGTGTTAACATGTCTATAATCACATACACTACCGAACTCATCTGCTAATTCCATGTGTAAATCAAAACCTTTTTGGGCTAAAACATCCATCTCATTGTGAGAACACCAGTCCTTAGCGAGGAATCCCCCAGCTCGCCCAGATGCAGCAGATCCAAGTTGCTCTTTTTCAATTATTAGTGTGTCGATTTTCCGTTTTGATAGGTAATAAGCTGTAGAAACACCCATAATACCACCTCCGACTATGATGACTGACATTATGGGGAGCTACATATGTACAGCCTGGATCTTAGTGACGGGATATTGACACCAATACACTGGATACATATATATCCTGACTCTAGTAGACTTAGTTTCCCTCAGTTGTTGTTCGAAAAACGAACTATGTTACGACTGGTCTAATAATGAGATTTTTTGACTTTGTATTTCGTTTAGTAATGGAACACTTTTGACGTTTT] [+] EMBL CD196365 [TTTTGATAATCCATGAACAAACACTTAGCATCTATTGGGGAATTTTCTATTTTTGATTTCAATATAATACTATGAGCTCGCCTTCCGTGAAATTTATTAGAATTTAAACATCCTGAGGGCAGCCAATTAACAGCTTCCTTTGACCACGGTCCTGTAGTAAGTATAACTAAGCTGGCAGGGATAACTTCAGAATTTGAAGTAGATGATTCTATTACTCGAACACCACTAACTTTGGGAGCAGATGTATTCGATGTTGAAAATTCCAACCCTATAACACGAGCAATTTTTAATTTGGTTCCCTGATTTGTTAAATATTGAGCACGCCGAAATAATTCATCTGTGAGTTTTTTGGGATGTACCTGTGCAGTAGTTGTAGAGTCTCCTATCAGGGAACAACTTTTCACTTTCGCACTGACCCAAGATGGTGATTCTGAAGAGCCGGAAGATTT CCAGGA ] [+] EMBL CD073183 [ TCTATTTTTGATTTCAATATAATACTATGAGCTCGCCTTCCGTGAAATTTATTAGAATTTAAACATCCTGAGGGCAGCCAATTAACAGCTTCCTTTGACCACGGTCCTGTAGTAAGTATAACTAAGCTGGCAGGGATAACTTCAGAATTTGAAGTAGATGATTCTATTACTCGAACACCACTAACTTTGGGAGCCGATGTATTCGATGTTGAAAATTCCAACCCTATAACACGAGCAATTTTTAATTTGGTTCCCTGATTTGTTAAATATTGAGCACGCCGAAATAATTCATCTGTGAGTTTTTTGGGATGTACCTGTGCAGTAGTTGTAGAGTCTCCTATCAGGGAACAACTTTTCACTTTCGCACTGACCCAAGATGGTGATTCTGAAGAGCCGGAAGATTTCCCAGGAGATAGTGATATAGAATACGTGTTAACATGTCTATAATCACATACACTACCGAACTCATCTGCTAATTCCATGTGTAAATCAAAACCTTTTTGGGCTAAAGCATCCATCTCATTGTGAGAACACCAGTCCTTAGCG ] [+] EMBL CD189017 [ TAACTAAGCTGGCAGGGATAACTTCAGAATTTGAAGTAGATGATTCTATTACTCGAACACCACTAACTTTGGGAGCAGATGTATTCGATGTTGAAAATTCCAACCCTATAACACGAGCAATTTTTAATTTGGTTCCCTGATTTGTTAAATATTGAGCACGCCGAAATAATTCATCTGTGAGTTTTTTGGGATGTACCTGTGCAGTAGTTGTAGAGTCTCCTATCAGGGAACAACTTTTCACTTTCGCACTGACCCAAGATGGTGATTCTGAAGAGCCGGAAGATTTCCCAGGAGATAGTGATATAGAATACGTGTTAACATGTCTATAATCACATACACTACCGAACTCATCTGCTAATTCCATGTGTAAATCAAAACCTTTTTGGGCTAAAACATCCATCTCATTGTGAGAACACCAGTCCTTAGCGAGGAATCCCCCAGCTCGCCCAGATGCAGCAGATCCAAGTTGCTCTTTTTCAATTATTAGTGTGTCGATTTTCCGTTTTGATAGGTAATAAGCTGTAGAAACACCCATAATACC ] [-] EMBL CD200543 [ AATTTGAAGTAGATGATTCTATTACTCGAACACCACTAACTTTGGGAGCAGATGTATTCGATGTTGAAAATTCCAACCCTATAACACGAGCAATTTTTAATTAGGTTCCCTGATTTGTTAAATATTGAGCACGCCGAAATAATTCATCTGTGAGTTTTTTGGGATGTACCTGTGCAGTAGTTGTAGAGTCTCCTATCAGGGAACAACTTTTCACTTTCGCACTGACCCAAGATGGTGATTCTGAAGAGCCGGAAGATTTCCCAGGAGATAGTGATATAGAATACGTGTTAACATGTCTATAATCACATACACTACCGAACTCATCTGCTAATTCCATGTGTAAATCAAAACCTTTTTGGGCTAAAACATCCATCTCATTGTGAGAACACCAGTCCTTAGC ] [+] EMBL CD132078 [ CACGAGCAATTTTTAATTTGGTTCCCTGATTTGTTAAATATTGAGCACGCCGAAATAATTCATCTGTGAGTTTTTTGGGATGTACCTGTGCAGTAGTTGTAGAGTCTCCTATCAGGGAACAACTTTTCACTTTCGCACTGACCCAAGATGGTGATTCTGAAGAGCCGGAAGATTTCCCAGGAGATAGTGATATAGAATACGTGTTAACATGTCTATAATCACATACACTACCGAACTCATCTGCTAATTCCATGTGTAAATCAAAACCTTTTTGGGCTAAAACATCCATCTCATTGTGAGAACACCAGTCCTTAGCGAGGAATCCC ] [+] EMBL CD155002 [ CTGAAGAGCCGGAAGATTTCCCAGGAGATAGTGATATAGAATACGTGTTAACATGTCTATAATCACATACACTACCGAACTCATCTGCTAATTCCATGTGTAAATCAAAACCTTTTTGGGCTAAAACATCCATCTCATTGTGAGAACACCAGTCCTTAGCGAGGAATCCCCCAGCTCGCCCAGATGCAGCAGATCCAAGTTGCTCTTTTTCAATTATTAGTGTGTCGATTTTCCGTTTTGATAGGTAATAAGCTGTAGAAACACCCATAATAC ] [-] EMBL CD078720 [ AAACATCCATCTCATTGTGAGAACACCAGTCCTTAGCGAGGAATCCCGCAGCTCGCCCAGATGCAGCAGATCCAAGTTGCTCTTTTTCAATTATTAGTGTGTCGATTTTCCGTTTTGATAGGTAATAAGCTGTAGAAACACCCATAATACCACCTCCGACTATGATGACTGACATTATGGGGAGCTACATATGTACAGCCTGGATCTTAGTGACGGGATATTGACACCAATACACTGGATACATATATATCCTGACTCTAGTAGACTTAGTTTCCCTCAGTTGTTGTTCGAAAAACGAACTATGTTACGACTGGTCTAATAATGAGATTTTTTGACTTTGTATTTCGTTTAGTAATGGAACACTTTTGACGTTTT] [-] EMBL CD199552 [ TGCAGCAGATCCAAGTTGCTCTTTTTCAATTATTAGTGTGTCGATTTTCCGTTTTGATAGGTAATAAGCTGTAGAAACACCCATAATACCACCTCCGACTATGATGACTGACATTATGGGGAGCTACATATGTACAGCCTGGATCTTAGTGACGGGATATTGACACCAATACACTGGATACATATATATCCTGACTCTAGTAGACTTAGTTTCCCTCAGTTGTTGTTCGAAAAACGAACT ] [-] EMBL CD199509 [ TGCAGCAGATCCAAGTTGCTCTTTTTCAATTATTAGTGTGTCGATTTTCCGTTTTGATAGGTAATAAGCTGTAGAAACACCCATAATACCACCTCCGACTATGATGACTGACATTATGGGGAGCTACATATGTACAGCCTGGATCTTAGTGACGGGATATTGACACCAATACACTGAATACATATATATCCTGACTCTAGTAGACTTAGTTTCCCTCAGTTGTTGTTCGAAAAACGAACT ] [-] EMBL CD199497 [ TGCAGCAGATCCAAGTTGCTCTTTTTCAATTATTAGTGTGTCGATTTTCCGTTTTGATAGGTAATAAGCTGTAGAAACACCCATAATACCACCTCCGACTATGATGACTGACATTATGGGGAGCTACATATGTACAGCCTGGATCTTAGTGACGGGATATTGACACCAATACACTGGATACATATATATCCTGACTCTAGTAGACTTAGTTTCCCTCAGTTGTTGTTCGAAAAACGAACT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||