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Schistosoma mansoni
cluster # 9510 cluster # 9510       Sequences # 10       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9510#0 length = 928 sequences # 10  

consensusID : consensus_9510#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 10
consensus length = 928
fasta sequence
                              [TTTTGATAATCCATGAACAAACACTTAGCATCTATTGGGGAATTTTCTATTTTTGATTTCAATATAATACTATGAGCTCGCCTTCCGTGAAATTTATTAGAATTTAAACATCCTGAGGGCAGCCAATTAACAGCTTCCTTTGACCACGGTCCTGTAGTAAGTATAACTAAGCTGGCAGGGATAACTTCAGAATTTGAAGTAGATGATTCTATTACTCGAACACCACTAACTTTGGGAGCAGATGTATTCGATGTTGAAAATTCCAACCCTATAACACGAGCAATTTTTAATTTGGTTCCCTGATTTGTTAAATATTGAGCACGCCGAAATAATTCATCTGTGAGTTTTTTGGGATGTACCTGTGCAGTAGTTGTAGAGTCTCCTATCAGGGAACAACTTTTCACTTTCGCACTGACCCAAGATGGTGATTCTGAAGAGCCGGAAGATTTCCCAGGAGATAGTGATATAGAATACGTGTTAACATGTCTATAATCACATACACTACCGAACTCATCTGCTAATTCCATGTGTAAATCAAAACCTTTTTGGGCTAAAACATCCATCTCATTGTGAGAACACCAGTCCTTAGCGAGGAATCCCCCAGCTCGCCCAGATGCAGCAGATCCAAGTTGCTCTTTTTCAATTATTAGTGTGTCGATTTTCCGTTTTGATAGGTAATAAGCTGTAGAAACACCCATAATACCACCTCCGACTATGATGACTGACATTATGGGGAGCTACATATGTACAGCCTGGATCTTAGTGACGGGATATTGACACCAATACACTGGATACATATATATCCTGACTCTAGTAGACTTAGTTTCCCTCAGTTGTTGTTCGAAAAACGAACTATGTTACGACTGGTCTAATAATGAGATTTTTTGACTTTGTATTTCGTTTAGTAATGGAACACTTTTGACGTTTT]

[+] EMBL CD196365             [TTTTGATAATCCATGAACAAACACTTAGCATCTATTGGGGAATTTTCTATTTTTGATTTCAATATAATACTATGAGCTCGCCTTCCGTGAAATTTATTAGAATTTAAACATCCTGAGGGCAGCCAATTAACAGCTTCCTTTGACCACGGTCCTGTAGTAAGTATAACTAAGCTGGCAGGGATAACTTCAGAATTTGAAGTAGATGATTCTATTACTCGAACACCACTAACTTTGGGAGCAGATGTATTCGATGTTGAAAATTCCAACCCTATAACACGAGCAATTTTTAATTTGGTTCCCTGATTTGTTAAATATTGAGCACGCCGAAATAATTCATCTGTGAGTTTTTTGGGATGTACCTGTGCAGTAGTTGTAGAGTCTCCTATCAGGGAACAACTTTTCACTTTCGCACTGACCCAAGATGGTGATTCTGAAGAGCCGGAAGATTT CCAGGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD073183             [                                             TCTATTTTTGATTTCAATATAATACTATGAGCTCGCCTTCCGTGAAATTTATTAGAATTTAAACATCCTGAGGGCAGCCAATTAACAGCTTCCTTTGACCACGGTCCTGTAGTAAGTATAACTAAGCTGGCAGGGATAACTTCAGAATTTGAAGTAGATGATTCTATTACTCGAACACCACTAACTTTGGGAGCCGATGTATTCGATGTTGAAAATTCCAACCCTATAACACGAGCAATTTTTAATTTGGTTCCCTGATTTGTTAAATATTGAGCACGCCGAAATAATTCATCTGTGAGTTTTTTGGGATGTACCTGTGCAGTAGTTGTAGAGTCTCCTATCAGGGAACAACTTTTCACTTTCGCACTGACCCAAGATGGTGATTCTGAAGAGCCGGAAGATTTCCCAGGAGATAGTGATATAGAATACGTGTTAACATGTCTATAATCACATACACTACCGAACTCATCTGCTAATTCCATGTGTAAATCAAAACCTTTTTGGGCTAAAGCATCCATCTCATTGTGAGAACACCAGTCCTTAGCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD189017             [                                                                                                                                                                   TAACTAAGCTGGCAGGGATAACTTCAGAATTTGAAGTAGATGATTCTATTACTCGAACACCACTAACTTTGGGAGCAGATGTATTCGATGTTGAAAATTCCAACCCTATAACACGAGCAATTTTTAATTTGGTTCCCTGATTTGTTAAATATTGAGCACGCCGAAATAATTCATCTGTGAGTTTTTTGGGATGTACCTGTGCAGTAGTTGTAGAGTCTCCTATCAGGGAACAACTTTTCACTTTCGCACTGACCCAAGATGGTGATTCTGAAGAGCCGGAAGATTTCCCAGGAGATAGTGATATAGAATACGTGTTAACATGTCTATAATCACATACACTACCGAACTCATCTGCTAATTCCATGTGTAAATCAAAACCTTTTTGGGCTAAAACATCCATCTCATTGTGAGAACACCAGTCCTTAGCGAGGAATCCCCCAGCTCGCCCAGATGCAGCAGATCCAAGTTGCTCTTTTTCAATTATTAGTGTGTCGATTTTCCGTTTTGATAGGTAATAAGCTGTAGAAACACCCATAATACC                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD200543             [                                                                                                                                                                                              AATTTGAAGTAGATGATTCTATTACTCGAACACCACTAACTTTGGGAGCAGATGTATTCGATGTTGAAAATTCCAACCCTATAACACGAGCAATTTTTAATTAGGTTCCCTGATTTGTTAAATATTGAGCACGCCGAAATAATTCATCTGTGAGTTTTTTGGGATGTACCTGTGCAGTAGTTGTAGAGTCTCCTATCAGGGAACAACTTTTCACTTTCGCACTGACCCAAGATGGTGATTCTGAAGAGCCGGAAGATTTCCCAGGAGATAGTGATATAGAATACGTGTTAACATGTCTATAATCACATACACTACCGAACTCATCTGCTAATTCCATGTGTAAATCAAAACCTTTTTGGGCTAAAACATCCATCTCATTGTGAGAACACCAGTCCTTAGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD132078             [                                                                                                                                                                                                                                                                                  CACGAGCAATTTTTAATTTGGTTCCCTGATTTGTTAAATATTGAGCACGCCGAAATAATTCATCTGTGAGTTTTTTGGGATGTACCTGTGCAGTAGTTGTAGAGTCTCCTATCAGGGAACAACTTTTCACTTTCGCACTGACCCAAGATGGTGATTCTGAAGAGCCGGAAGATTTCCCAGGAGATAGTGATATAGAATACGTGTTAACATGTCTATAATCACATACACTACCGAACTCATCTGCTAATTCCATGTGTAAATCAAAACCTTTTTGGGCTAAAACATCCATCTCATTGTGAGAACACCAGTCCTTAGCGAGGAATCCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD155002             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CTGAAGAGCCGGAAGATTTCCCAGGAGATAGTGATATAGAATACGTGTTAACATGTCTATAATCACATACACTACCGAACTCATCTGCTAATTCCATGTGTAAATCAAAACCTTTTTGGGCTAAAACATCCATCTCATTGTGAGAACACCAGTCCTTAGCGAGGAATCCCCCAGCTCGCCCAGATGCAGCAGATCCAAGTTGCTCTTTTTCAATTATTAGTGTGTCGATTTTCCGTTTTGATAGGTAATAAGCTGTAGAAACACCCATAATAC                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD078720             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AAACATCCATCTCATTGTGAGAACACCAGTCCTTAGCGAGGAATCCCGCAGCTCGCCCAGATGCAGCAGATCCAAGTTGCTCTTTTTCAATTATTAGTGTGTCGATTTTCCGTTTTGATAGGTAATAAGCTGTAGAAACACCCATAATACCACCTCCGACTATGATGACTGACATTATGGGGAGCTACATATGTACAGCCTGGATCTTAGTGACGGGATATTGACACCAATACACTGGATACATATATATCCTGACTCTAGTAGACTTAGTTTCCCTCAGTTGTTGTTCGAAAAACGAACTATGTTACGACTGGTCTAATAATGAGATTTTTTGACTTTGTATTTCGTTTAGTAATGGAACACTTTTGACGTTTT]
[-] EMBL CD199552             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TGCAGCAGATCCAAGTTGCTCTTTTTCAATTATTAGTGTGTCGATTTTCCGTTTTGATAGGTAATAAGCTGTAGAAACACCCATAATACCACCTCCGACTATGATGACTGACATTATGGGGAGCTACATATGTACAGCCTGGATCTTAGTGACGGGATATTGACACCAATACACTGGATACATATATATCCTGACTCTAGTAGACTTAGTTTCCCTCAGTTGTTGTTCGAAAAACGAACT                                                                          ]
[-] EMBL CD199509             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TGCAGCAGATCCAAGTTGCTCTTTTTCAATTATTAGTGTGTCGATTTTCCGTTTTGATAGGTAATAAGCTGTAGAAACACCCATAATACCACCTCCGACTATGATGACTGACATTATGGGGAGCTACATATGTACAGCCTGGATCTTAGTGACGGGATATTGACACCAATACACTGAATACATATATATCCTGACTCTAGTAGACTTAGTTTCCCTCAGTTGTTGTTCGAAAAACGAACT                                                                          ]
[-] EMBL CD199497             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TGCAGCAGATCCAAGTTGCTCTTTTTCAATTATTAGTGTGTCGATTTTCCGTTTTGATAGGTAATAAGCTGTAGAAACACCCATAATACCACCTCCGACTATGATGACTGACATTATGGGGAGCTACATATGTACAGCCTGGATCTTAGTGACGGGATATTGACACCAATACACTGGATACATATATATCCTGACTCTAGTAGACTTAGTTTCCCTCAGTTGTTGTTCGAAAAACGAACT                                                                          ]


>consensus_9510#0 TTTTGATAATCCATGAACAAACACTTAGCATCTATTGGGGAATTTTCTATTTTTGATTTC AATATAATACTATGAGCTCGCCTTCCGTGAAATTTATTAGAATTTAAACATCCTGAGGGC AGCCAATTAACAGCTTCCTTTGACCACGGTCCTGTAGTAAGTATAACTAAGCTGGCAGGG ATAACTTCAGAATTTGAAGTAGATGATTCTATTACTCGAACACCACTAACTTTGGGAGCA GATGTATTCGATGTTGAAAATTCCAACCCTATAACACGAGCAATTTTTAATTTGGTTCCC TGATTTGTTAAATATTGAGCACGCCGAAATAATTCATCTGTGAGTTTTTTGGGATGTACC TGTGCAGTAGTTGTAGAGTCTCCTATCAGGGAACAACTTTTCACTTTCGCACTGACCCAA GATGGTGATTCTGAAGAGCCGGAAGATTTCCCAGGAGATAGTGATATAGAATACGTGTTA ACATGTCTATAATCACATACACTACCGAACTCATCTGCTAATTCCATGTGTAAATCAAAA CCTTTTTGGGCTAAAACATCCATCTCATTGTGAGAACACCAGTCCTTAGCGAGGAATCCC CCAGCTCGCCCAGATGCAGCAGATCCAAGTTGCTCTTTTTCAATTATTAGTGTGTCGATT TTCCGTTTTGATAGGTAATAAGCTGTAGAAACACCCATAATACCACCTCCGACTATGATG ACTGACATTATGGGGAGCTACATATGTACAGCCTGGATCTTAGTGACGGGATATTGACAC CAATACACTGGATACATATATATCCTGACTCTAGTAGACTTAGTTTCCCTCAGTTGTTGT TCGAAAAACGAACTATGTTACGACTGGTCTAATAATGAGATTTTTTGACTTTGTATTTCG TTTAGTAATGGAACACTTTTGACGTTTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)