These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9513#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 10 consensus length = 1118 fasta sequence [CTATTCGCCGCAGGAATGGCTCCGGAACTTTACTTGTGCTAGTTGTCGTGTTGGTTTAGTTCGTCAAGATTTTTATGAACGTGATAATCAAGCTTATTGTACTCAATGTCATCTAAAAATGTTCTCACCTAGATGTGGTTATTGTGGTGAAGCAGTTGTTGAGAAATGTGTTTTGGCTTTGGCCCGTGCATGGCATCCTGAGCACTTTTTTTGTTACGAATGTCATTCCACTTTTAATGGATCGTTAACAGTACATGAACAAAATGGCAAATTTTACTGCTCTAACTGTTATTTCACAC-GATTTGGAACTCCATGCTCTGGTTGTCAACAACCTATTACAGATGCATATATAACTGCATTGGATATGCCTTGGCACAAAGACTGTTTTACTTGTCATGATTGTAATAGAATACTCACTGGATCAAGTTTCCATGAAATTGAAGGATATCCTTACTGTGATTCTCACTATTATTCAAGACGTGGATTATTATGCTTTTCATGCTCCCTACCAATTACTGGAAGGTGTGTAAACGCACTCGGTAAACGTTATCATCCAGAGCATTTTTTATGCGCCTATTGTTTACATCCATTACAAACTGGTACATTTAAAGAACATTCAAGTAAACCATACTGTCATCAGTGTTTTACCCAATTGTTTGGTTAGTATGGTGCACAAATATCTATATCGATATATACATACATACTACTGTTTTTTGTCTTCATGTTTAAGTTTCAGATATTGGAAGTTGAACAGTTATGTTTATTACCTTTAAACTCAAAAT-AGTATGATAAACAGTAAATGTTAAATTATTTTTAAATACTATGCTTCAAAGTATTGGAAATACTGTTTGTATCCTGCTTTTTTATTGGTTAGTCTTACATCTCATAACCTGTTTCTTGCTTAGGCTCAACAACTTACACGAAGATTTATCAAGCACATTGTGTTAGTCAACATCCCACTTTTTAATTTACATCGCCTCTGAATGAGTGTTGGGTGTATGTTTTTTATTGCCCAAACACTATTTGATGTAAAAAAAAGTGATATATTCATTTTGTAATTTCAGTATTCTGTTATTACTCCTGATCATCTTCGCCTAATTGAATATTTTAAAATGTTT] [+] EMBL CD081204 [CTATTCGCCGCAGGAATGGCTCCGGAACTTTACTTGTGCTAGTTGTCGTGTTGGTTTAGTTCGTCAAGATTTTTATGAACGTGATAATCAAGCTTATTGTACTCAATGTCATCTAAAAATGTTCTCACCTAGATGTGGTTATTGTGGTGAAGCAGTTGTTGAGAAATGTGTTTTGGCTTTGGCCCGTGCATGGCATCCTGAGCACTTTTTTTGTTACGAATGTCATTCCACTTTTAATGGATCGTTAACAGTACATGAACAAAATGGCAAATTTTACTGCTCTAACTGTTATTTCACAC GATTTGGAACTCCATGCTCTGGTTGTCAACAACCTATTACAGATGCATATATAACTGCATTGGATATGCCTTGGCACAAAGACTGTTTTACTTGTCATGATTGTAATAGAATACTCACTGGATCAAGTTTCCATGAAATTGAAGGATATCCTTACTGTGATTCTCACTATTATTCAAGACGTGGATTATTATGCTTTTCATGCTCCCTACCAATTACTGGAAGGTGTGTAAACGCACTCGGTAAACGTTATCATCCAGAGCATTTTTTATGCGCCTATTGTTTACATCCATTACAAACTGGTACATTTAAAGAACATTCAAGTAAACCATACTGTCATCAGTGTTTTACCCAATTGTTTGGTTAGTATGGTGCACAAATATCTATATCGATATATACATACATACTACTGTTTTTTGTCTTCATGTTTAAGTTTCAGATATTGGAAGTTGAACAGTTATGTTTATTACCTTTAAACTCANAAT AGTATGATAAACAGTAAATGTTAAATTATTTTTAAATACTATGCTTCANAGT ] [-] EMBL CD075034 [ TGAAGCAGTTGTTGAGAAATGTGTTTTGGCTTTGGCCCGTGCATGGCATCCTGAGCACTTTTTTTGTTACGAATGTCATTCCACTTTTAATGGATCGTTAACAGTACATGAACAAAATGGCAAATTTTACTGCTCTAACTGTTATTTCACAC GATTTGGAACTCCATGCTCTGGTTGTCAACAACCTATTACAGATGCATATATAACTGCATTGGATATGCCTTGGCACAAAGACTGTTTTACTTGTCATGATTGTAATAGAATACTCACTGGATCAAGTTTCCATGAAATTGAAGGATATCCTTACTGTGATTCTCACTATTATTCAAGACGTGGATTATTATGCTTTTCATGCTCCCTACCAATTACTGGAAGGTGTGTAAACGCACTCGGTAAACGTTATCATCCAGAGCATTTTTTATGCGCCTATTGTTTACATCCATTACAAACTGGTACATTTAAAGAACATTCAAGTAAACCATACTGTCATCAGTGTTTTACCCAATTGTTTGGTTAGTATGGTGCCCAAATATTTATATCGATATATACATACATACTACTGTTTTTTGTCTTCATGTTTAAGTTTCAGATATTGGAAGTTGAACAGTTATGTTTATTACCTTTAAACTCAAAAT AGTATGATAAAGAGTAAATGTTAAATTATTTTTAAATACTATGCTTC ] [+] EMBL CD152261 [ cccaaGTGCATGGCATCCTGAGCACTTTTTTTGTTACGAATGTCATTCCACTTTTAATGGATCGTTAACAGTACATGAACAAAATGGCAAATTTTACTGCTCTAACTGTTATTTCACAC GATTTGGAACTCCATGCTCTGGTTGTCAACAACCTATTACAGATGCATTTGTGGATGCATT ] [+] EMBL CD114726 [ AGCACTTTTTTTGTTACGAATGTCATTCCACTTTTAATGGATCGTTAACAGTACATGAACAAAATGGCAAATTTTACTGCTCTAACTGTTATTTCACACAGATTTGGAACTCCATGCTCTGGTTGTCAACAACCTATTACAGATGCATttgt ] [+] EMBL CD096840 [ TTATTCAAGACGTGGATTATTATGCTTTTCATGCTCCCTACCAATTACTGGAAGGTGTGTAAACGCACTCGGTAAACGTTATCATCCAGAGCATTTTTTATGCGCCTATTGTTTACATCCATTACAAACTGGTACATTTAAAGAACATTCAAGTAAACCATACTGTCATCAGTGTTTTACCCAATTGTTTGGTTAGTATGGTGCACAAATATCTATATCGATATATACATACATACTACTGTTTTTTGTCTTCATGTTTAAGTTTCAGATATTGGAAGTTGAACAGTTATGTTTATTACCTTTAAACTCAAAAT AGTATGATAAACAGTAAATGTTAAATTATTTTTAAATACTATGCTTCAAAGTATTGGAAATACTGTTTGTATCCTGCTTTTTTATTGGTTAGTCTTACATCTCATAACCTG ] [+] EMBL SM0231 [ GGTTAGTATGGTGCACAAATATCTATATCGATATATACATACATACTACTGTTTTTTGTCTTCATGTTTAAGTTTCAGATATTGGAAGTTGAACAGTTATGTTTATTACCTTTAAACTCAAAAT AGTATGATAAACAGTAAATGTTAAATTATTTT ] [+] EMBL SM0221 [ GGTTAGTATGGTGCACAAATATCTATATCGATATATACATACATACTACTGTTTTTTGTCTTCATGTTTAAGTTTCAGATATTGGAAGTTGAACAGTTATGTTTATTACCTTTAAAC CAAAAT AGTATGATAAACAGTAAATGTTAAATTATTTT ] [+] EMBL AA931035 [ GGTTAGTATGGTGCACAAATATCTATATCGATATATACATACATACTACTGTTTTTTGTCTTCATGTTTAAGTTTCAGATATTGGAAGTTGAACAGTTATGTTTATTACCTTTAAAC CAAAAT AGTATGATAAACAGTAAATGTTAAATTATTTT ] [+] EMBL AA931036 [ GGTTAGTATGGTGCACAAATATCTATATCGATATATACATACATACTACTGTTTTTTGTCTTCATGTTTAAGTTTCAGATATTGGAAGTTGAACAGTTATGTTTATTACCTTTAAACTCAAAAT AGTATGATAAACAGTAAATGTTAAATTATTTT ] [-] EMBL BF936536 [ TTAAGTTTCAGATATTGGAAGTTGAACAGTTATGTTTATTACCTTTAAACTCAAAATAAGTATGATAAACAGTAAATGTTAAATTATTTTTAAATACTATGCTTCAAAGTACTGTAAATACTGTTTGTATCCTGCTTTTTTATTGGTTAGTCTTACATCTCATAACCTGTTTCTTGCTTAGGCTCAACAACTTACACGAAGATTTATCAAGCACATTGTGTTAGTCAACATCCCACTTTTTAATTTACATCGCCTCTGAATGAGTGTTGGGTGTATGTTTTTTATTGCCCAAACACTATTTGATGTAAAAAAAAGTGATATATTCATTTTGTAATTTCAGTATTCTGTTATTACTCCTGATCATCTTCGCCTAATTGAATATTTTAAAATGTTT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||