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Schistosoma mansoni
cluster # 9521 cluster # 9521       Sequences # 10       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9521#0 length = 1200 sequences # 10  

consensusID : consensus_9521#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 10
consensus length = 1200
fasta sequence
                              [CCATGTGGTTTTTTAGTTCGTTCCAGTTTTCGTTATAGTTTACGTTCATCACGGCACATTGCTAACGATCCACGCTTGTTTTTGTCCCAGAAACTACCTTG-CAAGACACGAA-ACATTTTTTATGCTTCTTGTTCGTAGCTGATTCCCATT-TAGTACAGTTTCATGCAGACATTTTTTCTGCCATACCCAGGCAACTAATAAA-GGGGAAATAAAAGTGGAAAAAGGGGAGATAAAGCGGACAAAGGCGTACGCGTATTGCACAATTGTGTACAGAAGACACTGAATTCATTCTAAAATTCAA-ATACTGAACGTGATACTATGCCTCAAAATTATGAGTTTTATGATTATCTGTACAATCTTGCTCTACCTTGCATCTATTGTCCGACATTTTCTAAGTTATCTAAGAGCAATTCAACTCTGACTAATGCTTTAAGAGCAGCATTTGTACAGGTGGAGAATCAATATCCAGGATTTGGCGAACAGTTTATCATTCGCTTGTTACAGCGTCTTGGAGTCAACGATGATATAAATCTTCCAGAGACATACCTGAGAATTGCTGGTTTACACACTCAACTTTGTGAAAGCATGGAGAATAAAGGGATTAATCGGATCGAAATTTTTGCCAACGTTTTGAGGTTGTGTTTATGTAAAATACCGGACGAGATATCTAGTAATAACGGCTTTACCAACCTAATAAGAGAGATTACAGAGATAACAGATAAATTTTTGGAATCGTTACACTGTCATGATAAACAGATCTTGCAACGAAGAGCGCTGTGCAATCTTAAGTTTGAGTTTATTCGGTCATGTAAGCGATTCAGCGAAACCTTAAAAGCATATAACCGTGATGAAAACCAAACCTCAG--TTATCTTTCGAGCGAATCAACTAGTTGTATGTACAAACACTATTCTTGATGCTCTTCGTTGTGATAAATGACGGTGTGACGACCAACCCGGTTCGAAGTTAGTTGAACACCTCAGAAATGTTAGGAATCCCAGATGGTTTTCANAGCTATCTGATGTATTACTTGAAACCTCAAAAGAACATAAAAGCGGGTTGGTCACGAAACCAATATTTAAAATGACGCANAACATATTCTCTGGATTTTTATCTCTTTCTAAACGGATTATT-CATTTTTTTATTATTGNTATCCCTTTATTATTCTTGNGNTNTGNNATTGTCCCGAACGTGACCATTTCA]

[-] EMBL CD178631             [CCATGTGGTTTTTTAGTTCGTTCCAGTTTTCGTTATAGTTTACGTTCATCACGGCACATTGCTAACGATCCACGCTTGTTTTTGTCCCAGAAACTACCTTG CAAGACACGAA ACATTTTTTATGCTTCTTGTTCGTAGCTGATTCCCATT TAGTACAGTTTCATGCAGACATTTTTTCTGCCATACCCAGGCAACTAATAAA GGGGAAATAAAAGTGGAAAAAGGGGAGATAAAGCGGACAAAGGCGTACGCGTATTGCACAATTGTGTACAGAAGACACTGAATTCATTCTAAAATTCAA ATACTGAACGTGATACTATGCCTCAAAATTATGAGTTTTATGATTATCTGTACAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD153791             [                                                                     CCACGCTTGTTTTTGTCCCAGAAACTACCTTG CAAGACACGAA ACATTTTTTATGCTTCTTGTTCGTAGCTGATTCCCATT TAGTACAGTTTCATGCAGACATTTTTTCTGCCATACCCAGGCAACTAATAAA GGGGAAATAAAAGTGGAAAAAGGGGAGATAAAGCGGACAAAGGCGTACGCGTATTGCACAATTGTGTACAGAAGACACTGAATTCATTCTAAAATTCAA ATACTGAACGTGATACTATGCCTCAAAATTATGAGTTTTATGATTATCTGTACAATCTTGCTCTACCTTGCATCTATTGTCCGACATTTTCTAAGTTATCTAAGAGCAATTCAACTCTGACTAATGCTTTAAGAGCAGCATTTGTACAGGTGGAGAATCAATATCCAGGATTTGGCGAACAGTTTATCATTCGCTTGTTACAGCGTCTTGGAGTCAACGATGATATAAATCTTCCAGAGACATACCTGAGAATTGCTGGTTTACACACTCAACTNTGTGANAGCATGGAGAATAAAGGGATTAATCGGATCGAAATTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD083953             [                                                                                          AAACTACCTTGTCAAGACACGAATACATTTTTTATGCTTCTTGTTCGTAGCTGATTCCCATTCTAGTACAGTTTCATGCAGACATTTTTTCTGCCATACCCAGGCAACTAATAAATGGGGAAATAAAAGTGGAAAAAGGGGAGATAAAGCGGACAAAGGCGTACGCGTATTGCACAATTGTGTACAGAAGACACTGAATTCATTCTAAAATTCAACATACTGAACGTGATACTATGCCTCAAAATTATGAGTTTTATGATTATCTGTACAATCTTGCTCTACCTTGCATCTATTATCCGACATTTTCTAAGTTATCTAAGAGCAATTCAACTCTGACTAATGCTTTAAGAGCAGCATTTGTACAGGTGGAGAATCAATATCCAGGATTTGGCGAACAGTTTATCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD154257             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CTTCCAGAGACATACCTGAGAATTGCTGGTTTACACACTCAACTTTGTGAAAGCATGGAGAATAAAGGGATTAATCGGATCGAAATTTTTGCCAACGTTTTGAGGTTGTGTTTATGTAAAATACCGGACGAGATATCTAGTAATAACGGCTTTACCAACCTAATAAGAGAGATTACAGAGATAACAGATAAATTTTTGGAATCGTTACACTGTCATGATAAACAGATCTTGCAACGAAGAGCGCTGTGCAATCTTAAGTTTGAGTTTATTCGGTCATGTAAGCGATTCAGCGAAACCTTAAAAGCATATAACCGTGATGAAAACCAAACCTCAG  TTATCTTTCGAGCGAATCAACTAGTTGTATGTACAAACACTATTCTTGATGCTCTTCGTTGTGATAAATGACGGTGTGACGACCAACCCGGTTCGAAGTTAGTTGAACACCTCAGAAATGTTAGGAATCCCAGATGGTTTTCANAGCTATCTGATGTATTACTTGAAACCTCANAAGAACATANAAGCGGGTTGGTCACGAAACCAATATTTANAATGACGCANAACATATTCTCTGGATTNNTATCTCTNTCTAAACGGATTATT CATTTTTTTATTATTGNTATCCCTTTATTATTCTTGNGNTNTGNN                        ]
[+] EMBL CD154172             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CTTCCAGAGACATACCTGAGAATTGCTGGTTTACACACTCAACTTTGTGAAAGCATGGAGAATAAAGGGATTAATCGGATCGAAATTTTTGCCAACGTTTTGAGGTTGTGTTTATGTAAAATACCGGACGAGATATCTAGTAATAACGGCTTTACCAACCTAATAAGAGAGATTACAGAGATAACAGATAAATTTTTGGAATCGTTACACTGTCATGATAAACAGATCTTGCAACGAAGAGCGCTGTGCAATCTTAAGTTTGAGTTTATTCGGTCATGTAAGCGATTCAGCGAAACCTTAAAAGCATATAACCGTGATGAAAACCAAACCTCAG  TTATCTTTCGAGCGAATCAACTAGTTGTATGTACAAACACTATTCTTGATGCTCTTCGTTGTGATAAATGACGGTGTGACGACCAACCCGGTTCGAAGTTAGTTGAACACCTCAGAAATGTTAGGAATCCCAGATGGTTTTCANAGCTATCTGATGTATTACTTGAAACCTCANAAGAACATAAAAGCGGGTTGGTCACGAAACCAATATTTAAAATGACGCANAACATATTCTCTGGATTTTTATCTCTTTCTAAACGGATTATTNCA TTTTTTATTATTGNTATCCCTTTATTATTCCTGNGNTNTGNN                        ]
[+] EMBL CD154064             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CTTCCAGAGACATACCTGAGAATTGCTGGTTTACACACTCAACTTTGTGAAAGCATGGAGAATAAAGGGATTAATCGGATCGAAATTTTTGCCAACGTTTTGAGGTTGTGTTTATGTAAAATACCGGACGAGATATCTAGTAATAACGGCTTTACCAACCTAATAAGAGAGATTACAGAGATAACAGATAAATTTTTGGAATCGTTACACTGTCATGATAAACAGATCTTGCAACGAAGAGCGCTGTGCAATCTTAAGTTTGAGTTTATTCGGTCATGTAAGCGATTCAGCGAAACCTTAAAAGCATATAACCGTGATGAAAACCAAACCTCAG  TTATCTTTCGAGCGAATCAACTAGTTGTATGTACAAACACTATTCTTGATGCTCTTCGTTGTGATAAATGACGGTGTGACGACCAACCCGGTTCGAAGTTAGTTGAACACCTCAGAAATGTTAGGAATCCCAGATGGTTTTCANAGCTATCTGATGTATTACTTGAAACCTCAAAAGAACATAAAAGCGGGTTGGTCACGAAACCAATATTTAAAATGACGCANAACATATTCTCTGGATTTTTAT                                                                                          ]
[+] EMBL CD154193             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CTTCCAGAGACATACCTGAGAATTGCTGGTTTACACACTCAACTTGGAGAAAGCATGGAAAATAAAGGGATTAATCGGATCGAAATTTTTGCCAACGTTTTGAAGTTGTGTTTATGTAAAATACCGGACGAGATATCTAGTAATAACGGCTTTACCAACCTAATAAGAGAGATTACAGAGATAACAGATAAATTTTTGGAATCGTTACACTGTCATGATAAACAGATCTTGCAACGAAGAGCGCTGTGCAATCTTAAGTTTGAGTTTATTCGGTCATGTAAGCGATTCAGCGAAACCTTNAAAGCATATAACCGTGATGAAAACCAAACCTCAG  TTATCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD179755             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTTACACACTCAACTTTGTGAAAGCATGGAGAATAAAGGGATTAATCGGATCGAAATTTTTGCCAACGTTTTGAAGTTGTGTTTAAGTAAAATACCGGACGAGATATCTAGTAATAACGGCTTTACCAACCTAATAAGAGAGATTACAGAGATAACAGATAAATTTTTGGAATCGTTACACTGTCATGATAAACAGATCTTGCAACGAAGAGCGCTGTGCTATCTTAAGTTTGAGTTTATTCGGTCATGTAAGCGATTCAGCGAAACCTTAAAAGCATATAACCGTGATGAAAACCAAACCTCAG  TTATCTTTCGAGCGAATCAACTAGTTGTATGTACAAACACTATTGTTGATGCTCTCTGTTGTGATAAATGACGGTGTGACGACCAACCCGGTTAGAAGTc                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD197234             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TCGTAACACTGTCATGATAAACAGATCTTGCAACGAAGAGCGCTGTGCAATCTTAAGTTTGAGTTTATTCGGTCATGTAAGCGATTCAGCGAAACCTTAAAAGCATATAACCGTGATGAAAACCAAACCTCAG  TTATCTTTCGAGCGAATCAACTAGTTGTATGTACAAACACTATTCTTGATGCTCTTCGTTGTGATAAATGACGGTGTGACGACCAACCCGGTTCGAAGTTAGTTGAACACCTCAGAAATGTTAGGAATCCCAGATGGTTTTCAAAGCTATCTGATGTATTACTTGAAACCTCAAAAGAACATAAAAGCGGGTTGGTCACGAAACCAATATTTAAAATGACGCAAAACATATTCTCTGTATTTTTATCTCTTTCTAAACGGATTATT CATTTTTTTATTATTGTTATC                                                ]
[-] EMBL CD141563             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             anCCGTGATGAAAACC AACCTCAGTTTTATCTTTCGAGCGAATCAACTAGTTGTATGTACAAACACTATTCTTGATGCTCTTCGTTGTGATAAATGACGGTGTGACGACCAACCCGGTTCGAAGTTAGTTGAACACCTCAGAAATGTTAGGAATCCCAGATGGTTTTCAAAGCTATCTGATGTATTACTTGAAACCTCAAAAGAACATAAAAGCGGGTTGGTCACGAAACCAATATTTAAAATGACGCAAAACATATTCTCTGTATTTTTATCTCTTTCTAAACGGATTATT CATTTTTTTATTATTGTTATCCCTTTATTATTCTTGTGTTTTGTAATTGTCCCGAACGTGACCATTTCA]


>consensus_9521#0 CCATGTGGTTTTTTAGTTCGTTCCAGTTTTCGTTATAGTTTACGTTCATCACGGCACATT GCTAACGATCCACGCTTGTTTTTGTCCCAGAAACTACCTTGCAAGACACGAAACATTTTT TATGCTTCTTGTTCGTAGCTGATTCCCATTTAGTACAGTTTCATGCAGACATTTTTTCTG CCATACCCAGGCAACTAATAAAGGGGAAATAAAAGTGGAAAAAGGGGAGATAAAGCGGAC AAAGGCGTACGCGTATTGCACAATTGTGTACAGAAGACACTGAATTCATTCTAAAATTCA AATACTGAACGTGATACTATGCCTCAAAATTATGAGTTTTATGATTATCTGTACAATCTT GCTCTACCTTGCATCTATTGTCCGACATTTTCTAAGTTATCTAAGAGCAATTCAACTCTG ACTAATGCTTTAAGAGCAGCATTTGTACAGGTGGAGAATCAATATCCAGGATTTGGCGAA CAGTTTATCATTCGCTTGTTACAGCGTCTTGGAGTCAACGATGATATAAATCTTCCAGAG ACATACCTGAGAATTGCTGGTTTACACACTCAACTTTGTGAAAGCATGGAGAATAAAGGG ATTAATCGGATCGAAATTTTTGCCAACGTTTTGAGGTTGTGTTTATGTAAAATACCGGAC GAGATATCTAGTAATAACGGCTTTACCAACCTAATAAGAGAGATTACAGAGATAACAGAT AAATTTTTGGAATCGTTACACTGTCATGATAAACAGATCTTGCAACGAAGAGCGCTGTGC AATCTTAAGTTTGAGTTTATTCGGTCATGTAAGCGATTCAGCGAAACCTTAAAAGCATAT AACCGTGATGAAAACCAAACCTCAGTTATCTTTCGAGCGAATCAACTAGTTGTATGTACA AACACTATTCTTGATGCTCTTCGTTGTGATAAATGACGGTGTGACGACCAACCCGGTTCG AAGTTAGTTGAACACCTCAGAAATGTTAGGAATCCCAGATGGTTTTCANAGCTATCTGAT GTATTACTTGAAACCTCAAAAGAACATAAAAGCGGGTTGGTCACGAAACCAATATTTAAA ATGACGCANAACATATTCTCTGGATTTTTATCTCTTTCTAAACGGATTATTCATTTTTTT ATTATTGNTATCCCTTTATTATTCTTGNGNTNTGNNATTGTCCCGAACGTGACCATTTCA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)