These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9529#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 10 consensus length = 541 fasta sequence [TGAGATTCGGCAAGAGGAA-AGAAGAAGAGCAAGAAAGCAAACAAAAGAGGGAATTATTTTTCGTAAAAAGAAAAGGTAAGATTAAAGAACATTCCCCATTTTCAAACCAGATGGGAAACATTAAACAATAAAAAAAAGAGTGTAAGTACACAAAATGAAACAAATTAAGTTAACTCAATGAGTTAGATCTCTTAAATTGTGAATTTCAAAGGGAATGAGGAATATTTTGATTTACTGGTGAG-AAAAAAAAGTTAAGGGATAATCTGCTTGTTTACCACTTGGTTAATTTCAAGAATTTATTTCCTCAATTTGATGT-GGTAAAAATCAAAAATTTTAACTTTTAGTTAACAAATAAAAATTGGACGGGAAAATTGGCAAGAATTGTGTTACTTTATCTAAACTGTTGGATTGTAGTTTCGATCAAGAGTTGGTAAACGATTTGATGGGCCTTTGTGCCTCTCTGTTGCATATTCCCCAATGAAAGAGCCTTCTTCATTGAATTTACCAGGATCAAGATTATAATCGTCAAGTTCACCATCTC] [+] EMBL CD145142 [TGAGATTCGGCAAGAGGAA AGAAGAAGAGCAAGAAAGCAAACAAAAGAGGGAATTATTTTTCGTAAAAAGAAAAGGTAAGATTAAAGAACATTCCCCATTTTCAAACCAGATGGGAAACATTAAACAATAAAAAAAAGAGTGTAAGTACACAAAATGAAACAAATTAAGTTAACTCAATGAGTTAGATCTCTTAAATTGTGAATTTCAAAGGGAATGAGGAATATTTTGATTTACTGGTGAG AAAAAAAAGTTAAGGGATAATCTGCTTGTTTACCACTTGGTTAATTTCAAGAATTTATTTCCTCAATTTGATGT GGTAAAAATCAAAAATTTTAACTTTTAGTTAACAAATAAAAATTGGACGGGAAAATTGGCAAGAATTGTGTTACTTTATCTAAACTGTTGGATTGTAGTTTCGATCAAGAGTTGGTAAACGATTTGATGGG ] [+] EMBL CD152707 [ AGATTCGGCAAGAGGAA AGAAGAAGAGCAAGAAAGCAAACAAAAGAGGGAATTATTTTTCGTAAAAAGAAAAGGTAAGATTAAAGAACATTCCCCATTTTCAAACCAGATGGGAAACATTAAACAATAAAAAAAAGAGTGTAAGTACACAAAATGAAACAAATTAAGTTAACTCAATGAGTTAGATCTCTTAAATTGTGAATTTCAAAGGGAATGAGGAATATTTTGATTTACTGGTGAG AAAAAAAAGTTAAGGGATAATCTGCTTGTTTACCACTTGGTTAATTTCAAGAATTTATTTCCTCAATTTGATGT GGTAAAAATCAAAAATTTTAACTTTTAGTTAACAAATAAAAATTGGACGGGAAAATTGGCAAGAATTGTGTTACTTTATCTAAACTGTTGGATTGTAGTTTCCATCAAGAGTTGGTAAACGATTTGATGGGC ] [+] EMBL CD152692 [ AGATTCGGCAAGAGGAA AGAAGAAGAGCAAGAAAGCAAACAAAAGAGGGAATTATTTTTCGTAAAAAGAAAAGGTAAGATTAAAGAACATTCCCCATTTTCAAACCAGATGGGAAACATTAAACAATAAAAAAAAGAGTGTAAGTACACAAAATGAAACAAATTAAGTTAACTCAATGAG ] [+] EMBL CD149276 [ cgatGAGGAAGAGAAGAAGAGCAAGAAAGCAAACAAAAGAGGGAATTATTTTTCGTAAAAAGAAAAGGTAAGATTAAAGAACATTCCCCATTTTCAAACCAGATGGGAAACATTAAACAAT AAAAAAAGAGTGTAAGTACACAAAATGAAACAAATTAAGTTAACTCAATGAGTTAGATCTCTTAAATTGTGAATTTCAAAGGGAATGAGGAATATTTTGATTTACTGGTGAG AAAA ] [+] EMBL CD149283 [ AGGAA AGAAGAAGAGCAAGAAAGCAAACAAAAGAGGGAATTATTTTTCGTAAAAAGAAAAGGTAAGATTAAAGAACATTCCCCATTTTCAAACCAGATGGGAAACATTAAACAATAAAAAAAAGAGTGTAAGTACACAAAATGAAACAAATTAAGTTAACTCAATGAGTTAGATCTCTTAAATTGTGAATTTCAAAGGGAATGAGGAATATTTTGATTTACTGGTGAGAAAAAAAAAGTTAAGGGATAATCTGCTTGTTTACCACTTGGTTAATTTCAAGAATTTATTTCCTCAATTTGATGTGGGTAAAAAT AAAAATTTTAACT ] [-] EMBL CD149324 [ GGAA AGAAGAAGAGCAAGAAGGCAAACAAAAGAGGGAATTATTTTTCGTAAAAAGAAAAGGTAAGATTAAAGAACATTCCCCATTTTCAAACCAGATGGGAAACATTAAACAAT AAAAAAAGAGTGTAAGTACACAAAATGAAACAAATTAAGTTAACTCAATGAGTTAGATCTCTTAAATTGTGAATTTCAAAGGGAATGAGGAATATTTTGATTTACTGGTGAG AAAAAAAAGTTAAGGGATAATCTGCTTGTTTACCACTTGGTTAATTTCAAGAATTTATTTCCTCAATTTGATGT GGTAAAAATCAAAAATTTTAACTTTTAGTTAACAAATAAAAATTGGACGGGAAAATTGGCAAGAATTGTGTTACTTTATCTAAACTGTTGGATTGTAGTTTCGATCAAGAGTTGGTAAACGATTTGATGGGC ] [-] EMBL CD149339 [ GGAA AGAAGAAGAGCAAGAAGGCAAACAAAAGAGGGAATTATTTTTCGTAAAAAGAAAAGGTAAGATTAAAGAACATTCCCCATTTTCAAACCAGATGGGAAACATTAAACAAT AAAAAAAGAGTGTAAGTACACAAAATGAAACAAATTAAGTTAACTCAATGAGTTAGATCTCTTAAATTGTGAATTTCAAAGGGAATGAGGAATATTTTGATTTACTGGTGAG AAAAAAAAGTTAAGGGATAATCTGCTTGTTTACCACTTGGTTAATTTCAAGAATTTATTTCCTCAATTTGATGT GGTAAAAATCAAAAATTTTAACTTTTAGTTAACAAATAAAAATTGGACGGGAAAATTGGCAAGAATTGTGTTACTTTATCTAAACTGTTGGATTGTAGTTTCGATCAAGAGTTGGTAAACGATTTGATGGGC ] [-] EMBL CD197122 [ GAGCAAGAAAGCAAACAAAAGAGGGAATTATTTTTCGTAAAAAGAAAAGGTAAGATTAAAGAACATTCCCCATTTTCAAACCAGATGGGAAACATTAAACAATAAAAAAAAGAGTGTAAGTACACAAAATGAAACAAATTAAGTTAACTCAATGAGTTAGATCTCTTAAATTGTGAATTTCAAAGGGAATGAGGAATATTTTGATTTACTGGTGAG AAAAAAAAGTTAAGGGATAATCTGCTTGTTTACCACTTGGTTAATTTCAAGAATTTATTTCCTCAATTTGATGT GGTAAAAATCAAAAATTTTAACTTTTAGTTAACAAATAAAAATTGGACGGGAAAATTGGCAAGAATTGTGTTA ] [+] EMBL CD131944 [ AAAGTTAAGGGATAATCTGCTTGTTTACCACTTGGTTAATTTCAAGAATTTATTTCCTCAATTTGATGT GGTAAAAATCAAAAATTTTAACTTTTAGTTAACAAATAAAAATTGGACGGGAAAATTGGCAAGAATTGTGTTACTTTATATAAACTGTTGGATTGTATTTTCGATCAATAGTTGGTAAACGATTTGATGGGCCT ] [+] EMBL CD131998 [ AAATTAAGGGATAATCTGCTTGTTTACCACTTGGTTAATTTCAAGAATTTATTTCCTCAATTTGATGT GGTAAAAATCAAAAATTTTAACTTTTAGTTAACAAATAAAAATTGGACGGGAAAATTGGCAAGAATTGTGTTACTTTATCTAAACTGTTGGATTGTAGTTTCGATCAAGAGTTGGTAAACGATTTGATGGGCCTTTGTGCCTCTCTGTTGCATATTCCCCAATGAAAGAGCCTTCTTCATTGAATTTACCAGGATCAAGATTATAATCGTCAAGTTCACCATCTC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||