Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 9578 cluster # 9578       Sequences # 10       consensus # 2


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9578#0 length = 1528 sequences # 9  
consensus_9578#1 length = 887 sequences # 1  

consensusID : consensus_9578#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 1528
fasta sequence
                              [TTAATTCTTAACTTTACCATTACTTTATTAGAAGAAATCACTAAACATAAGGGACCACCAGTTTTTCATGAAAAAGAACGTTATCGGCTAATCAGAGCTATGAAATGGGTCGATGAAGTAGTAGAAGACGCACCATACTTTACCTATGTGAAAACGTTAGAAAAATATTCTTGTGATTTCTGTGTACATGGAGATGATTTGGTGGTATCCAACGATGGTTCGGATCCCTATGCAGAAGTTAAAGCAAATAATCGATACAAAGAA-GTTAAACGAACTGAGGGTATATCTACTACAGCTTTAGTTTCAAGAATGTTAAAACGTATACAACAATTGCAAGATCAAGGTACCTATGCATCGCAGTTTAGTTCAAGTACAGAGTATTCGATTCGCCGAACACAATCGTTAGATTCTATATTAAAAAGTAAAGATAAATTTATGCATCCTTGTAAGACAAATGAAACATTATCACCCATATATCCCGGTCTAAATTCAAATTGTTCTAAAGATAATGATGTGGCAGATTCAATTAATGTTTCAATTTGGTCTACTGGTGGCATGACATATATGCCGAATATTTTACGTATAAGTCAATTTTGTTCTGGACAATTTCGTGAACCTAATAGTAATGACATTGTGGTATATGTACCGGGTACATTTGACCTATTCCACATTGGTCATTTATCATTCCCTGAGCAATGCTTAAAACTTGGGAATTATCTGGTGGTTGGATTATACTCGGATAAAACATCGTCGTTTGAAAGTGGTAGAATGGGCTCAATCCTCACACTTCAAGAACGGCTGTTATCTGTACTGGCCTGTCGATACGTGAGCAATGTAATCATTGATGCACCGTATGTAATGCCTCACAGTCTTTTGGATCATTTCAATGTAAATTATGTTGCAATAGGTTGGGATAAAAATGTTACGCCAACATTAGAGGGCTTAGACCCGATGATGGTTTGTAAAGAACGAGGTATTCTTCGTAGAATCGATAGTGGATCTAATGTTACAACTTCACTTGTTATATCCCGTATTATGAAAAATAGACTTCTTTACGAAGAACGGAATCGGAAAAAAGTGAGTAAAGAAATGCAGTTGGCGAGTAAATTCTTGACAAATAATTAATCAGATTGTTTTTTTTATTGTCAAACTAACAACACAACAATTACTTACTGACTTATCTTCTTTGTTTTCTGTCAACACTATTTATTCGTTTGTTTCCGTCACTTTTTTTTGTCTTCATTTGCTTTGAATTGTTTTAATTTGATCCAAAAAAAATGAAAAGAATGTGTCTTCTCTCCATCTCTCATCCTGTCATCTCACTTTTACGTGAGAAAAAAAGACAGTGAACATGAGTATAATGGAAATCTTACTGATTGTAAATTAATCTATGTATCGGTACAACATTCTCAATTCGTTTTTTATTAATTAGAATTTCAGTAGATGTGAAAATGCAATTGACATTGCTAAATTAATCATATTAAATTGCTGATATAATTAATGATCATACTCGAAATAAACGAAAGGA]

[+] EMBL BG930730             [TTAATTCTTAACTTTACCATTACTTTATTAGAAGAAATCACTAAACATAAGGGACCACCAGTTTTTCATGAAAAAGAACGTTATCGGCTAATCAGAGCTATGAAATGGGTCGATGAAGTAGTAGAAGACGCACCATACTTTACCTATGTGAAAACGTTAGAAAAATATTCTTGTGATTTCTGTGTACATGGAGATGATTTGGTGGTATCCAACGATGGTTCGGATCCCTATGCAGAAGTTAAAGCAAATTATCGATACAAAGAAGGTTAActa                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD197720             [                                                     ACCACCAGTTTTTCATGAAAAAGAACGTTATCGGCTAATCAGAGCTATGAAATGGGTCGATGAAGTAGTAGAAGACGCACCATACTTTACCTATGTGAAAACGTTAGAAAAATATTCTTGTGATTTCTGTGTACATGGAGATGATTTGGTGGTATCCAACGATGGTTCGGATCCCTATGCAGAAGTTAAAGCAAATAATCGATACAAAGAA GTTAAACGAACTGAGGGTATATCTACTACAGCTTTAGTTTCAAGAATGTTAAAACGTATACAACAATTGCAAGATCAAGGTACCTATGCATCGCAGTTTAGTTCAAGTACAGAGTATTCGATTCGCCGAACACAATCGTTAGATTCTATATTAAAAAGTAAAGATAAATTTATGCATCCTTGTAAGAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD129980             [                                                                                                                                           TTACCTATGTGAAAACGTTAGAAAAATATTCTTGTGATTTCTGTGTACATGGAGATGATTTGGTGGTATCCAACGATGGTTCGGATCCCTATGCAGAAGTTAAAGCAAATAATCGATACAAAGAA GTTAAACGAACTGAGGGTATATCTACTACAGCTTTAGTTTCAAGAATGTTAAAACGTATACAACAATTGCAAGATCAAGGTACCTATGCATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD059948             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TCGATTCGCCGAACACAATCGTTAGATTCTATATTAAAAAGTAAAGATAAATTTATGCATCCTTGTAAGACAAATGAAACATTATCACCCATATATCCCGGTCTAAATTCAAATTGTTCTAAAGATAATGATGTGGCAGATTCAATTAATGTTTCAATTTGGTCTACTGGTGGCATGACATATATGCCGAATATTTTACGTATAAGTCAATTTTGTTCTGGACAATTTCGTGAACCTAATAGTAATGACATTGTGGTATATGTACCGGGTACATTTGACCTATTCCACATTGGTCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD060026             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TCGATTCGCCGAACACAATCGTTAGATTCTATATTAAAAAGTAAAGATAAATTTATGCATCCTTGTAAGACAAATGAAACATTATCACCCATATATCCCGGTCTAAATTCAAATTGTTCTAAAGATAATGATGTGGCAGATTCAATTAATGTTTCAATTTGGTCTACTGGTGGCATGACATATATGCCGAATATTTTACGTATAAGTCAATTTTGTTCTGGACAATTTCGTGAACCTAATAGTAATGACATTGTGGTATATGTACCGGGTACATTTGACCTATTCCACATTGGTCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD118205             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ggtagGATTCTATATAAAAAAGTAAAGATAAATTTATGCATCTTTGTAAGACGAATGAAACATTATCACCCATATATCCCGGTCTAAATTCAAATTGTTCTAAAGATAATGATGTGGCAGATCAAATTAATGTTCCAATTTGGTCTACTGGTGGCATGACATATATGCCGAATATTTTACGTATAAGTCAATTTTGTTCTGGACAATTTCGTGAACCTAATAGTAATGACATTGTGGTATATGTACCGGGTACATTTGACCTATTCCACATTGGTCATTTATCATTCCCTGAGCAATGCTTAAAACTTGGGAATTATCTGGTGGTTGGATTATACTCGGATAAAACATCGTCGTTTGAAAGTGGTAGAATGGGCTCAATCCTCACACTTCAAGAACGGCTGTTATCTGTACTGGCCTGTCGATACGTGAGCAATGTAATCATTGATGCACCGTATGTAATGCCTCACAGTCTTTTGGATCATTTCAATGTAAATTATGTTGCAATAGGTTGGGATAAAAATGTTACGCCAACATTAGAGGGCTTAGACCCGATGATGGTTTGTAAAGAACGAGGTATTCTTCGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD117000             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AATGAAACATTATCACCCATATATCCCGGTCTAAATTCAAATTGTTCTAAAGATAATGATGTGGCAGATTCAATTAATGTTTCAATTTGGTCTACTGGTGGCATGACATATATGCCGAATATTTTACGTATAAGTCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD075638             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GGGCTTAGACCCGATGATGGTTTGTAAAGAACGAGGTATTCTTCGTAGAATCGATAGTGGATCTAATGTTACAACTTCACTTGTTATATCCCGTATTATGAAAAATAGACTTCTTTACGAAGAACGGAATCGGAAAAAAGTGAGTAAAGAAATGCAGTTGGCGAGTAAATTCTTGACAAATAATTAATCAGATTGTTTTTTTTATTGTCAAACTAACAACACAACAATTACTTACTGACTTATCTTCTTTGTTTTCTGTCAACACTATTTATTCGTTTGTTTCCGTCACTTTTTTTTGTCTTCATTTGCTTTGAATTGTTTTAATTTGATCCAAAAAAAATGAAAAGAATGTGTCTTCTCTCCATCTCTCATCCTGTCATCTCACTTTTACGTGAGAAAAAAAGACAGTGAACATGAGTATAATGGAAATCTTACTGATTGTAAATTAATCTATGTATCGGTACAACATTCTCAATTCGTTTTTTATTAATTAGAATTTCAGTAGATGTGAAAATGCAATTGACATTGCTAAATTAATCATATTAAATTGCTGATATAATTAATGATCATACTCGAAATAAACGAAAGGA]
[-] EMBL CD076999             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CGAAGAACGGAATCGGAAAAAAGTGAGTAAAGAAATGCAGTTGGCGAGTAAATTCTTGACAAATAATTAATCAGATTGTTTTTTTTATTGTCAAACTAACAACACAACAATTACTTACTGACTTATCTTCTTTGTTTTCTGTCAACACTATTTATTCGTTTGTTTCCGTCACTTTTTTTTGTCTTCATTTGCTTTGAATTGTTTTAATTTGATCCAAAAAAAATGAAAAGAATGTGTCTTCTCTCCATCTCTCATCCTGTCATCTCACTTTTACGTGAGAAAAAAAGACAGTGAACATGAGTATAATGGAAATCTTACTGATTGTAAATTAATCTATGTATCGGTACAACATTCTCAATTCGTTTTTTATTAATTAGAATTTCAGTAGATGTGAAAATGCAATTGACATTGCTAAATTAATCATATTAAATTGCTGATATAATTAATGATCATACTGGAAATAAACGAAA   ]


>consensus_9578#0 TTAATTCTTAACTTTACCATTACTTTATTAGAAGAAATCACTAAACATAAGGGACCACCA GTTTTTCATGAAAAAGAACGTTATCGGCTAATCAGAGCTATGAAATGGGTCGATGAAGTA GTAGAAGACGCACCATACTTTACCTATGTGAAAACGTTAGAAAAATATTCTTGTGATTTC TGTGTACATGGAGATGATTTGGTGGTATCCAACGATGGTTCGGATCCCTATGCAGAAGTT AAAGCAAATAATCGATACAAAGAAGTTAAACGAACTGAGGGTATATCTACTACAGCTTTA GTTTCAAGAATGTTAAAACGTATACAACAATTGCAAGATCAAGGTACCTATGCATCGCAG TTTAGTTCAAGTACAGAGTATTCGATTCGCCGAACACAATCGTTAGATTCTATATTAAAA AGTAAAGATAAATTTATGCATCCTTGTAAGACAAATGAAACATTATCACCCATATATCCC GGTCTAAATTCAAATTGTTCTAAAGATAATGATGTGGCAGATTCAATTAATGTTTCAATT TGGTCTACTGGTGGCATGACATATATGCCGAATATTTTACGTATAAGTCAATTTTGTTCT GGACAATTTCGTGAACCTAATAGTAATGACATTGTGGTATATGTACCGGGTACATTTGAC CTATTCCACATTGGTCATTTATCATTCCCTGAGCAATGCTTAAAACTTGGGAATTATCTG GTGGTTGGATTATACTCGGATAAAACATCGTCGTTTGAAAGTGGTAGAATGGGCTCAATC CTCACACTTCAAGAACGGCTGTTATCTGTACTGGCCTGTCGATACGTGAGCAATGTAATC ATTGATGCACCGTATGTAATGCCTCACAGTCTTTTGGATCATTTCAATGTAAATTATGTT GCAATAGGTTGGGATAAAAATGTTACGCCAACATTAGAGGGCTTAGACCCGATGATGGTT TGTAAAGAACGAGGTATTCTTCGTAGAATCGATAGTGGATCTAATGTTACAACTTCACTT GTTATATCCCGTATTATGAAAAATAGACTTCTTTACGAAGAACGGAATCGGAAAAAAGTG AGTAAAGAAATGCAGTTGGCGAGTAAATTCTTGACAAATAATTAATCAGATTGTTTTTTT TATTGTCAAACTAACAACACAACAATTACTTACTGACTTATCTTCTTTGTTTTCTGTCAA CACTATTTATTCGTTTGTTTCCGTCACTTTTTTTTGTCTTCATTTGCTTTGAATTGTTTT AATTTGATCCAAAAAAAATGAAAAGAATGTGTCTTCTCTCCATCTCTCATCCTGTCATCT CACTTTTACGTGAGAAAAAAAGACAGTGAACATGAGTATAATGGAAATCTTACTGATTGT AAATTAATCTATGTATCGGTACAACATTCTCAATTCGTTTTTTATTAATTAGAATTTCAG TAGATGTGAAAATGCAATTGACATTGCTAAATTAATCATATTAAATTGCTGATATAATTA ATGATCATACTCGAAATAAACGAAAGGA



consensusID : consensus_9578#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 887
fasta sequence
                              [CCTCCGGGCCAANAATTCGGCACGAGGGGTATATGTACCGGGTACATTTGACCTATTCCCATTGGTCATTTATCATTCCTTGAGCAATGCTTAAAACTTGGGAATTATCTGGTGGTTGGATTATACTCGGATAAAACATCGTCATTTGAAAGTGGTCGAATGGGCTCAATCCTCACACTTCAAGAACGGCTGTTATCTGTACTGGCCTGTCGATACGTGAGCAATGTAATCATTGATGCACCGTATGTAATACCTCCCAGTCTTTTGGATCATTTCAATGTAAATTATGTTGCAATAGGTTGGGATAAAAATCTTACACCAACATTAGAGGGCTTAGACCCGATGATGGTTTGTAAAGAACGAGGTATTCTTCGTAGAATCGATAGTGGATCTAATGTTACAACTTCACTTGTTATATCCCGTATTATGAAAAATAGACTTCTTTACGAAGAACGGAATCGGAAAAAAGTGAGTAAAGAAATGCAGTTGGCGAGTAAATTCTTGACAAATAATTAATCAGATTGTTTTTTTTATTGTCAAACTAACAACACAACAATTACTTACTGACTTATCTTCTTTGTTTTCTGTCACACTATTTATTCGTTTGTTTCCGTCACTTTTTTTTGTCTTCATTTGCTTTGAATTGTTTTAATTTGATCCANANNAATGANAAGAATGTGTCTTCTCTCATCTCTCATCCTGTCATCTCACTTTTACGTGAGAAANNAGACAGTGAACATGAGTATAATGGAATCTTACTGNATGAANTNATCTATGTATCGTACACATTCTCAANTCGTTTTATTANTAGAATTCAGTGATGTGAAAATGCATGACATGCTAANTATCAATAAANTGTGAATANNTATGACCTCCTCGANAAACGA]

[+] EMBL CD082024             [CCTCCGGGCCAANAATTCGGCACGAGGGGTATATGTACCGGGTACATTTGACCTATTCCCATTGGTCATTTATCATTCCTTGAGCAATGCTTAAAACTTGGGAATTATCTGGTGGTTGGATTATACTCGGATAAAACATCGTCATTTGAAAGTGGTCGAATGGGCTCAATCCTCACACTTCAAGAACGGCTGTTATCTGTACTGGCCTGTCGATACGTGAGCAATGTAATCATTGATGCACCGTATGTAATACCTCCCAGTCTTTTGGATCATTTCAATGTAAATTATGTTGCAATAGGTTGGGATAAAAATCTTACACCAACATTAGAGGGCTTAGACCCGATGATGGTTTGTAAAGAACGAGGTATTCTTCGTAGAATCGATAGTGGATCTAATGTTACAACTTCACTTGTTATATCCCGTATTATGAAAAATAGACTTCTTTACGAAGAACGGAATCGGAAAAAAGTGAGTAAAGAAATGCAGTTGGCGAGTAAATTCTTGACAAATAATTAATCAGATTGTTTTTTTTATTGTCAAACTAACAACACAACAATTACTTACTGACTTATCTTCTTTGTTTTCTGTCACACTATTTATTCGTTTGTTTCCGTCACTTTTTTTTGTCTTCATTTGCTTTGAATTGTTTTAATTTGATCCANANNAATGANAAGAATGTGTCTTCTCTCATCTCTCATCCTGTCATCTCACTTTTACGTGAGAAANNAGACAGTGAACATGAGTATAATGGAATCTTACTGNATGAANTNATCTATGTATCGTACACATTCTCAANTCGTTTTATTANTAGAATTCAGTGATGTGAAAATGCATGACATGCTAANTATCAATAAANTGTGAATANNTATGACCTCCTCGANAAACGA]


>consensus_9578#1 CCTCCGGGCCAANAATTCGGCACGAGGGGTATATGTACCGGGTACATTTGACCTATTCCC ATTGGTCATTTATCATTCCTTGAGCAATGCTTAAAACTTGGGAATTATCTGGTGGTTGGA TTATACTCGGATAAAACATCGTCATTTGAAAGTGGTCGAATGGGCTCAATCCTCACACTT CAAGAACGGCTGTTATCTGTACTGGCCTGTCGATACGTGAGCAATGTAATCATTGATGCA CCGTATGTAATACCTCCCAGTCTTTTGGATCATTTCAATGTAAATTATGTTGCAATAGGT TGGGATAAAAATCTTACACCAACATTAGAGGGCTTAGACCCGATGATGGTTTGTAAAGAA CGAGGTATTCTTCGTAGAATCGATAGTGGATCTAATGTTACAACTTCACTTGTTATATCC CGTATTATGAAAAATAGACTTCTTTACGAAGAACGGAATCGGAAAAAAGTGAGTAAAGAA ATGCAGTTGGCGAGTAAATTCTTGACAAATAATTAATCAGATTGTTTTTTTTATTGTCAA ACTAACAACACAACAATTACTTACTGACTTATCTTCTTTGTTTTCTGTCACACTATTTAT TCGTTTGTTTCCGTCACTTTTTTTTGTCTTCATTTGCTTTGAATTGTTTTAATTTGATCC ANANNAATGANAAGAATGTGTCTTCTCTCATCTCTCATCCTGTCATCTCACTTTTACGTG AGAAANNAGACAGTGAACATGAGTATAATGGAATCTTACTGNATGAANTNATCTATGTAT CGTACACATTCTCAANTCGTTTTATTANTAGAATTCAGTGATGTGAAAATGCATGACATG CTAANTATCAATAAANTGTGAATANNTATGACCTCCTCGANAAACGA



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_9578#0      TTAATTCTTAACTTTACCATTACTTTATTAGAAGAAATCACTAAACATAAGGGACCACCA 60
consensus_9578#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9578#0      GTTTTTCATGAAAAAGAACGTTATCGGCTAATCAGAGCTATGAAATGGGTCGATGAAGTA 120
consensus_9578#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9578#0      GTAGAAGACGCACCATACTTTACCTATGTGAAAACGTTAGAAAAATATTCTTGTGATTTC 180
consensus_9578#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9578#0      TGTGTACATGGAGATGATTTGGTGGTATCCAACGATGGTTCGGATCCCTATGCAGAAGTT 240
consensus_9578#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9578#0      AAAGCAAATAATCGATACAAAGAAGTTAAACGAACTGAGGGTATATCTACTACAGCTTTA 300
consensus_9578#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9578#0      GTTTCAAGAATGTTAAAACGTATACAACAATTGCAAGATCAAGGTACCTATGCATCGCAG 360
consensus_9578#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9578#0      TTTAGTTCAAGTACAGAGTATTCGATTCGCCGAACACAATCGTTAGATTCTATATTAAAA 420
consensus_9578#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9578#0      AGTAAAGATAAATTTATGCATCCTTGTAAGACAAATGAAACATTATCACCCATATATCCC 480
consensus_9578#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9578#0      GGTCTAAATTCAAATTGTTCTAAAGATAATGATGTGGCAGATTCAATTAATGTTTCAATT 540
consensus_9578#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9578#0      TGGTCTACTGGTGGCATGACATATATGCCGAATATTTTACGTATAAGTCAATTTTGTTCT 600
consensus_9578#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9578#0      GGACAATTTCGTGAACCTAATAGTAATGACATTGTGGTATATGTACCGGGTACATTTGAC 660
consensus_9578#1      -------CCTCCGGGCCAANAATTCGGCACGA-GGGGTATATGTACCGGGTACATTTGAC 52
                                  *  ** *  * *    **   * *************************

consensus_9578#0      CTATTCCACATTGGTCATTTATCATTCCCTGAGCAATGCTTAAAACTTGGGAATTATCTG 720
consensus_9578#1      CTATTCC-CATTGGTCATTTATCATTCCTTGAGCAATGCTTAAAACTTGGGAATTATCTG 111
                      ******* ******************** *******************************

consensus_9578#0      GTGGTTGGATTATACTCGGATAAAACATCGTCGTTTGAAAGTGGTAGAATGGGCTCAATC 780
consensus_9578#1      GTGGTTGGATTATACTCGGATAAAACATCGTCATTTGAAAGTGGTCGAATGGGCTCAATC 171
                      ******************************** ************ **************

consensus_9578#0      CTCACACTTCAAGAACGGCTGTTATCTGTACTGGCCTGTCGATACGTGAGCAATGTAATC 840
consensus_9578#1      CTCACACTTCAAGAACGGCTGTTATCTGTACTGGCCTGTCGATACGTGAGCAATGTAATC 231
                      ************************************************************

consensus_9578#0      ATTGATGCACCGTATGTAATGCCTCACAGTCTTTTGGATCATTTCAATGTAAATTATGTT 900
consensus_9578#1      ATTGATGCACCGTATGTAATACCTCCCAGTCTTTTGGATCATTTCAATGTAAATTATGTT 291
                      ******************** **** **********************************

consensus_9578#0      GCAATAGGTTGGGATAAAAATGTTACGCCAACATTAGAGGGCTTAGACCCGATGATGGTT 960
consensus_9578#1      GCAATAGGTTGGGATAAAAATCTTACACCAACATTAGAGGGCTTAGACCCGATGATGGTT 351
                      ********************* **** *********************************

consensus_9578#0      TGTAAAGAACGAGGTATTCTTCGTAGAATCGATAGTGGATCTAATGTTACAACTTCACTT 1020
consensus_9578#1      TGTAAAGAACGAGGTATTCTTCGTAGAATCGATAGTGGATCTAATGTTACAACTTCACTT 411
                      ************************************************************

consensus_9578#0      GTTATATCCCGTATTATGAAAAATAGACTTCTTTACGAAGAACGGAATCGGAAAAAAGTG 1080
consensus_9578#1      GTTATATCCCGTATTATGAAAAATAGACTTCTTTACGAAGAACGGAATCGGAAAAAAGTG 471
                      ************************************************************

consensus_9578#0      AGTAAAGAAATGCAGTTGGCGAGTAAATTCTTGACAAATAATTAATCAGATTGTTTTTTT 1140
consensus_9578#1      AGTAAAGAAATGCAGTTGGCGAGTAAATTCTTGACAAATAATTAATCAGATTGTTTTTTT 531
                      ************************************************************

consensus_9578#0      TATTGTCAAACTAACAACACAACAATTACTTACTGACTTATCTTCTTTGTTTTCTGTCAA 1200
consensus_9578#1      TATTGTCAAACTAACAACACAACAATTACTTACTGACTTATCTTCTTTGTTTTCTGTCA- 590
                      *********************************************************** 

consensus_9578#0      CACTATTTATTCGTTTGTTTCCGTCACTTTTTTTTGTCTTCATTTGCTTTGAATTGTTTT 1260
consensus_9578#1      CACTATTTATTCGTTTGTTTCCGTCACTTTTTTTTGTCTTCATTTGCTTTGAATTGTTTT 650
                      ************************************************************

consensus_9578#0      AATTTGATCCAAAAAAAATGAAAAGAATGTGTCTTCTCTCCATCTCTCATCCTGTCATCT 1320
consensus_9578#1      AATTTGATCCANANNAA-TGANAAGAATGTGTCTTCTCTC-ATCTCTCATCCTGTCATCT 708
                      *********** *  ** *** ****************** *******************

consensus_9578#0      CACTTTTACGTGAGAAAAAAAGACAGTGAACATGAGTATAATGGAAATCTTACTGATTGT 1380
consensus_9578#1      CACTTTTACGTGAGAAANNA-GACAGTGAACATGAGTATAATGGAA-TCTTACTGN--AT 764
                      *****************  * ************************* ********    *

consensus_9578#0      AAATTAATCTATGTATCGGTACAACATTCTCAATTCGTTTTTTATTAATTAGAATTTCAG 1440
consensus_9578#1      GAANTNATCTATGTATCG-TACA-CATTCTCAANTCGTTTT--ATTANT-AGAATT-CAG 818
                       ** * ************ **** ********* *******  **** * ****** ***

consensus_9578#0      TAGATGTGAAAATGCAATTGACATTGCTAAATTAATCATATTAAATTGCTGATATAATTA 1500
consensus_9578#1      T-GATGTGAAAATGCA--TGACAT-GCTAANT--ATCA--ATAAANTGTGAATAN---NT 867
                      * **************  ****** ***** *  ****   **** **   ***      

consensus_9578#0      ATGATCATACTCGAAATAAACGAAAGGA 1528
consensus_9578#1      ATGACC-TCCTCGANA--AACGA----- 887
                      **** * * ***** *  *****     




Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)