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Schistosoma mansoni
cluster # 9591 cluster # 9591       Sequences # 10       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9591#0 length = 1425 sequences # 10  

consensusID : consensus_9591#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 10
consensus length = 1425
fasta sequence
                              [AGGGCCAGAATTCGGCACGAGGTTTTCCCTCAAGAACGCGATGAAGATGCTTCAATAATTGACAAGGAAGCAGTTTATGAAGTTTGTCAAGCGTGCAATGCAACAGAACGTGAAGTTTTCGCTGCCTTACTAAACAACGATCCTAGTGATCAATTATCAGTTGCTTATCATCTTATCATAGACAATAAACGTTTTGGATCAGTTTTAAATCCAGAAGAAGTGAATAATTTTTATGTTGCTACTGGGATTGATTCATCAACCTCATCAGCAGCAGGAACAACAACAAATACATCAAATAGTCCACCTATTAGTGGTGGTACACTGACTCATTCTCAGCCTGGTGGTGGTCGAAGTCAATCATTAAGTCCAAATTATGGTAATAATACTGGCATGATTGGATTAAAAGGAAGAGGTCTCTCCCCAACACGACCTCATCCAGAAAGAATGCCTGATGGACCACCGTTATCAAGAACATTAGATCCAATGGGGGATTCATTGGCATCTGGGTCAATTGTTACAGGTGATTTGAACTGTCCAAGTCAAATTTCTTCTCAAGCACAATCAGCTATTACATCGGGAGCTGCAGCAGCTAGTGGAATGAAACGTTTTAGATGGCATTTAGGTATACGTTCTCAATCTAGACCATGGGATATTATGCATGAAGTATTTAAAGCAATGAATTCACTTGGTTATGAATGGAAAGTTGTTAATCCTTTTAATGTACGTGTAAGAAAGTGGAATCCAATACTACAGCATTATTCTCGACTTGTATTACAACTTTATCAGATCGATGCAAGATCATATCTCCTCGATTTTAAGTGTATCGATGAAAGTCAATTAGAATCGGAAACAGCGATGGGTAGATTACGTTCAAACAATATGTCAGTATGCCTTGATTCTTGTGGTGGAACTCCTCCAGCTGCTATGGGTACTTCAACA-TATAGTAGAGATGGTAGTTTTTCTGGTAGCACTGGATCTGCTAGTCCAACCAATTGCTCCGATGGTCCAAATACAACTGAATTTCCTCGATCGTTTTCAGCTAATTGTCAAGAAGTACCGATTAACCGAAGA-ACTAAACGACATCAAACAATGGAATTTTTTGAAATGTGTACTGAGC-TTA-TTACCACATTGGCTCGATGATCTACTGTAATAGTGTTTAAGCGCAGATTCCGCAAGATTCAAAAACTAATCTCTGTACACAAGGACGATAAATACTACTGTCGCCA-CTGTACACAGTGATTAGTTCAAAAAAATCTCTATTTGTAGTATTTATCGTTCCTTTTTATTTCGATTCCTGATTTAATTACTAATTAGCATTACTTTCAACCAGAAAAGTTTTGACCTTATTCCCGTCGCCCTTATCTCTTACAGACGATGTAATGTTTTAATTCGATTTCCATTTACACATATACATATATTTATTCA]

[+] EMBL CD081884             [AGGGCCAGAATTCGGCACGAGGTTTTCCCTCAAGAACGCGATGAAGATGCTTCAATAATTGACAAGGAAGCAGTTTATGAAGTTTGTCAAGCGTGCAATGCAACAGAACGTGAAGTTTTCGCTGCCTTACTAAACAACGATCCTAGTGATCAATTATCAGTTGCTTATCATCTTATCATAGACAATAAACGTTTTGGATCAGTTTTAAATCCAGAAGAAGTGAATAATTTTTATGTTGCTACTGGGATTGATTCATCAACCTCATCAGCAGCAGGAACAACAACAAATACATCAAATAGTCCACCTATTAGTGGTGGTACACTGACTCATTCTCAGCCTGGTGGTGGTCGAAGTCAATCATTAAGTCCAAATTATGGTAATAATACTGGCATAATTGGATTAAAAGGAAGAGGTCTCTCCCCAACACGACCTCATCCAGAAAGAATGCCTGATGGACCACCGTTATCAAGAACATTAGATCCAATGGGGGATTCATTGGCATCTGGGTCAATTGTTACAGGTGATTTGAACTGTCCAAGTCAAATTTCTTCTCAAGCACAATCAGCTATTACATCGGGAGCTGCAGCAGCTAGTGGAATGAAACGTTTTANATGGCATTTAGGTATACGTTCTCAATCTAGACCATGGGATATTATGCATGAAGTATTTAAAGCAATGAATTCACTTGGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD131223             [                                   ACGCGATGAAGATGCTTCAATAATCGACAAGGAAGCAGTTTATGAAGTTTGTCAAGCGTGCAATGCAACAGAACGTGAAGTTTTCGCTGCCTTACTAAACAACGATCCTAGTGATCAATTATCAGTTGCTTATCATCTTATCATAGACAATAAACGTTTTGGATCAGTTTTAAATCCAGAAGAAGTGAATAATTTTTATGTTGCTACTGGGATTGATTCATCAACCTCATCAGCAGCAGGAACAACAACAAATACATCAAATAGTCCACCTATTAGTGGTGGTACAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD156156             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ATACTGGCATGATTGGATTAAAAGGAAGAGGTCTCTCCCCAACACGACCTCATCCAGAAAGAATGCCTGATGGACCACCGTTATCAAGAACATTAGGTCCAATGGGGGATTCATTGGCATCTGGGTCAATTGTTACAGGTGATTTGAACTGTCCAAGTCAAATTTCTTCTCAAGCACAATCAGCTATTACATCGGGAGCTGCAGCAGCTAGTGGAATGAAACGTTTTAGATGGCATTCAGGTATACGTTCTCAATCTAGACCATGGGATATTATGCATGAAGTATTTAAAGCAATGAATTCACTTGGTTATGAATGGAAAGTTGTTAATCCTTTTAATGTACGTGTAAGAAAGTGGAATCCAATACTACAGCATTATTCTCGACTTGTATTACAACTTTATCAGATCGATGCAAGATCATATCTCCTCGATTTTAAGTGTATCGATGAAAGTCAATTAGAATCGGAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD156384             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ATACTGGCATGATTGGATTAAAAGGAAGAGGTCTCTCCCCAACACGACCTCATCCAGAAAGAATGCCTGATGGACCACCGTTATCAAGAACATTAGGTCCAATGGGGGATTCATTGGCATCTGGGTCAATTGTTACAGGTGATTTGAACTGTCCAAGTCAAATTTCTTCTCAAGCACAATCAGCTATTACATCGGGAGCTGCAGCAGCTAGTGGAATGAAACGTTTTAGATGGCATTCAGGTATACGTTCTCAATCTAGACCATGGGATATTATGCATGAAGTATTTAAAGCAATGAATTCACTTGGTTATGAATGGAAAGTTGTTAATCCTTTTAATGTACGTGTAAGAAAGTGGAATCCAATACTACAGCATTATTCTCGACTTGTATTACAACTTTATCAGATCGATGCAAGATCATATCTCCTCGATTTTAAGTGTATCGATGAAAGTCAATTAGAATCGGAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD077921             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tcggtacGAGGGGTTCTCTCCCCAACACGACCTCATCCAGAAAGAATGCCTGATGGACCACCGTTATCAAGAACATTAGATCCAATGGGGGATTCATTGGCATCTGGGTCAATTGTTACAGGTGATTTGAACTGTCCAAGTCAAATTTCTTCTCAAGCACAATCAGCTATTACATCGGGAGCTGCAGCAGCTAGTGGAATGAAACGTTTTAAATGGCATTTAGGTATACGTTCTCAATCTAGACCATGGGATATTATGCATGAAGTATTTAAAGCAATGAATTCACTTTGTTATGAATGGAAAAGTGTTAATCC TTTAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD167714             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AACG  TTAAATGGCATTTAGGTATACGTTCTC ATCTAGACCATGGGATATTATGCATGAAGTATTTAAAGCAATGAATTCACTTGGTTATGAATGGAAAGTTGTTAATCCTTTTAATGTACGTGTAAGAAAATGGAATCCAATACTACAGCATTATTCTCGACTTGTATTACAACTTTATCAGGTCGATGCAAGATCATATCTCCTCGATTTTAAGTGTATCGATGAAAGTCAATTAGAATCGGAAACAGCGATGGGTAGATTACGTTCAAACAATATGTCAGTATGCCTTGATTCTTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD075591             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GTGTATCGATGANAGTCAATTAGAATCGGAAACAGCGATGGGTAGATTACGTTCAAACAATATGTCAGTATGCCTTGATTCTTGTGGTGGAACTCCTCCAGCTGCTATGGGTACTTCAACANTATAGTAGAGATGGTAGTTTTTCTGGTAGCACTGGATCTGCTAGTCCAACCAATTGCTCCGATGGTCCAAATACAACTGAATTTCCTCGATCGTTTTCAGCTAATTGTCAAGAAGTACCGATTAACCGAAGA ACTAAACGACATCAAACAATGGAATTTTTTGAAATGTGTACTGAGC TTA TTACCACATTGGCTCGATGATCTACTGTAATAGTGTTTAAGCGCAGATTCCGCAAGATTCAAAAACTAATCTCTGTACACAAGGACGATAAATACTACTGTCGCCA CTGTACACAGTGATTAGTTCAAAAAAATCTCTATTTGTAGTATTTATCGTTCCTTTTTATTTCGATTCCTGATTTAATTACTAATTAGCATTACTTTCAACCAGAAAAGTTTTGACCTTATTCCCGTCGCCCTTATCTCTTACAGACGATGTAATGTTTTAATTCGATTTCCATTTACACATATACATATATTTATTCA]
[+] EMBL CD095125             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AAACAATATGTCAGTATGCCTTGATTCTTGTGGTGGAACTCCTCCAGCTGCTATGGGTACTTCAACA TATAGTAGAGATGGTAGTTTTTCTGGTAGCACTGGATCTGCTAGTCCAACCAATTGCTCCGATGGTCCAAATACAACTGAATTTCCTCGATCGTTTTCAGCTAATTGTCAAGAAGTACCGATTAACCGAAGA ACTAAACGACATCAAACAATGGAATTTTTTGAAATGTGTACTGAGC TTA TTACCACATTGGCTCGATGATCTACTGTAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD128368             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGGAACTCCTCCAGCTGCTATGGGTACTTCAACA TATAGTAGAGATGGTAGTTTTTCTGGTAGCACTGGATCTGCTAGTCCAACCAATTGCTCCGATGGTCCAAATACAACTGAATTTCCTCGATCGTTTTCAGCTAATTGTCAAGAAGTACCGATTAACCGAAGA ACTAAACGACATCAAACAATGGAATTTTTTGAAATGTGTACTGAGC TTA TTACCACATTGGCTCGATGATCTACTGTAATAGTGTTTAAGCGCAGATTCCGCAAGATTCAAAAACTAATCTCTGTACACAAGGACGATAAATACTACTGTCGCCACCTGTACACAGTGATTAGTTCAAAAAAATCTCTATTTGTAGTATTTATCGTTCCTTTTTATTTCGATTCCTGATTTAATTACTAATTAGCA TACTTTCAACCAGAAAAGTTccgtgagcc                                                                               ]
[+] EMBL AI390070             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGAATTTCCTCGATCGTTTTCAGCTAATTGTCAAGAAGTACCGATTAACCGAAGATACTAAACGACATCAAACAATGGAATTTTTTG AATGTGTACTGAGCTTTATTTACCACATTGGCTCGATGATCTACTGTAATAGTGTTTAAGCGCAGATTCC                                                                                                                                                                                                                                                               ]


>consensus_9591#0 AGGGCCAGAATTCGGCACGAGGTTTTCCCTCAAGAACGCGATGAAGATGCTTCAATAATT GACAAGGAAGCAGTTTATGAAGTTTGTCAAGCGTGCAATGCAACAGAACGTGAAGTTTTC GCTGCCTTACTAAACAACGATCCTAGTGATCAATTATCAGTTGCTTATCATCTTATCATA GACAATAAACGTTTTGGATCAGTTTTAAATCCAGAAGAAGTGAATAATTTTTATGTTGCT ACTGGGATTGATTCATCAACCTCATCAGCAGCAGGAACAACAACAAATACATCAAATAGT CCACCTATTAGTGGTGGTACACTGACTCATTCTCAGCCTGGTGGTGGTCGAAGTCAATCA TTAAGTCCAAATTATGGTAATAATACTGGCATGATTGGATTAAAAGGAAGAGGTCTCTCC CCAACACGACCTCATCCAGAAAGAATGCCTGATGGACCACCGTTATCAAGAACATTAGAT CCAATGGGGGATTCATTGGCATCTGGGTCAATTGTTACAGGTGATTTGAACTGTCCAAGT CAAATTTCTTCTCAAGCACAATCAGCTATTACATCGGGAGCTGCAGCAGCTAGTGGAATG AAACGTTTTAGATGGCATTTAGGTATACGTTCTCAATCTAGACCATGGGATATTATGCAT GAAGTATTTAAAGCAATGAATTCACTTGGTTATGAATGGAAAGTTGTTAATCCTTTTAAT GTACGTGTAAGAAAGTGGAATCCAATACTACAGCATTATTCTCGACTTGTATTACAACTT TATCAGATCGATGCAAGATCATATCTCCTCGATTTTAAGTGTATCGATGAAAGTCAATTA GAATCGGAAACAGCGATGGGTAGATTACGTTCAAACAATATGTCAGTATGCCTTGATTCT TGTGGTGGAACTCCTCCAGCTGCTATGGGTACTTCAACATATAGTAGAGATGGTAGTTTT TCTGGTAGCACTGGATCTGCTAGTCCAACCAATTGCTCCGATGGTCCAAATACAACTGAA TTTCCTCGATCGTTTTCAGCTAATTGTCAAGAAGTACCGATTAACCGAAGAACTAAACGA CATCAAACAATGGAATTTTTTGAAATGTGTACTGAGCTTATTACCACATTGGCTCGATGA TCTACTGTAATAGTGTTTAAGCGCAGATTCCGCAAGATTCAAAAACTAATCTCTGTACAC AAGGACGATAAATACTACTGTCGCCACTGTACACAGTGATTAGTTCAAAAAAATCTCTAT TTGTAGTATTTATCGTTCCTTTTTATTTCGATTCCTGATTTAATTACTAATTAGCATTAC TTTCAACCAGAAAAGTTTTGACCTTATTCCCGTCGCCCTTATCTCTTACAGACGATGTAA TGTTTTAATTCGATTTCCATTTACACATATACATATATTTATTCA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)