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Schistosoma mansoni
cluster # 9612 cluster # 9612       Sequences # 10       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9612#0 length = 1571 sequences # 10  

consensusID : consensus_9612#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 10
consensus length = 1571
fasta sequence
                              [AAACTAAAGAGGAAGCGTATATCGCAAAGTTGGATGCTCGAACAGGTGCTTCATTAAAGCTTACTATACTTAATCCAAATGGTCGTATATGGACAATGAGTGCAGGTGGTGGAGCTTCAGTGATTTATGCTGATACAGTTTGTGAATTAGCTGAAAAAGTCAAAGCAGCCGGTGGTATAAGTCAAGGTGTAAAAGATTTAGCTAATTATGGTGAATATTCTGGAGCACCATCAGAAGAATTAACTTATGAATATTCAAAAACAATTTTAACCTTGATGACTACTGGTGAACCACATCCAGATGGTAAAGTTTTACTGATCGGTGGAGGAATTGCAAATTTCACCAATATTGCTGCTACATTCAAGGGTATTGTACGTGCTTTGACAGAATTCAAAGAACAATTGAAGAGACATAATATACGTATATTTGTCCGTCGTGCTGGTCCCAACTACCAGGAGGGTCTTCGTATAATGCGTGAATTGGGCCGTACTATCGATATTCCAATTTATGTATTTGGACCTGAAACTCATATGACTGCTATCGTGTCAATGGCATTTGGTTTACGTCAAATACCTCCACCTCAAGTAAATCAAATTCAGTCATCTGCAGATAGTTTATCATTGTACAGTTACAATGGTTCTGGCTGTGAACATAAAAATTCAGACAAATCAACACCAATGGTGACCAATCAAACTCTCAAGGTTTCTGAATTCTCTTCTACTATCACTACTACGGCTACTACTGCTACTTCTGATAATAATCATGAAACTATTTATGAAGAACCACTTTTCACAGTGAAAACAAAGTGTTTAATATGGGGTTTACAAGTTAAAGCTGTTCAGTCTATGTTAGATTTCGATTATGCTTCCGGCCGTGATAGTCCAAGTGTAGCAGCTCTGATTTATCCTTTCAGTGATGATCATCAGTTGACATTTTATTGGGGTGCAAAAGAATTATTTCTACCAGTTTATAAGTATATGTTGAATGCAATGCACAAGCATCCAGATGCACGTATATTAGTGAATTTCGCTTCATTGCGAGTTGCTTATGATATATGTATGGAAGCTATGGAAGTGGACTGTATATTGTCATCTAATTATAAAGAGAATGGAATATTGAATGAACACAGTGATACATCTATCAATCATAATGATGGTTTACGGGTAAACGAGGCACAGATCAAATG-TATCGCTATTATAGCTGAAGGTATACCAGAAAATATGACACGTCGTTTAATACAACGATCCAGAGAAAGAAATATTCTATTGATTGGTCCAGCAACCGTAGGTGGCTTGAAATCTGGCTGCTTCAAAATCGGTAATACAGGCGGAATGACAGATAACATACTGGCATCAAAACTTTATCGACCTGGAAGTGTTGCTTATGTATCACGTTCTGGTGGAATGTCCAATGAATTGAATAATATTATTTCAATGAATTCTGATGGTGTGTATGAAGGTGTCGCGATTGGTGGTGATCGTTTTCCTGGTTCAACATTTATTGATCATATTCTACGTTATGAAAATAATCCAGAAATCGGTATGATTGTTGTCTTGGGCGAAGTTGGTGGT]

[+] EMBL CD133009             [AAACTAAAGAGGAAGCGTATATCGCAAAGTTGGATGCTCGAACAGGTGCTTCATTAAAGCTTACTATACTTAATCCAAATGGTCGTATATGGACAATGAGTGCAGGTGGTGGAGCTTCAGTGATTTATGCTGATACAGTTTGTGAATTAGCTGAAAAAGTCAAAGCAGCCGGTGGTATAAGTCAAGGTGTAAAAGATTTAGCTAATTATGGTGAATATTCTGGAGCACCATCAGAAGAATTAACTTATGAATATTCAAAAACAATTTTAACCTTGATGACTACTGGTGAACCACATCCAGATGGTAAAGTTTTACTGATCGGTGGAGGAATTGCAAATTTCACCAATATTGCTGCTACATTCAAGGGTATTGTACGTGCTTTGACAGAATTCAAAGAACAATTGAAGAGACATAATATACGTATATTTGTCCGTCGTGCTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD154122             [        GAGGAAGCGTATATCGCAAAGTTGGATGCTCGAACAGGTGCTTCATTAAAGCTTACTATACTTAATCCAAATGGTCGTATATGGACAATGAGTGCAGGTGGTGGAGCTTTAGTGATTTATGCTGATACAGTTTGTGAATTAGCTGAAAAAGTCAAAGCAGCCGGTGGTATAAGTCAAGGTGTAAAAGATTTAGCTAATTATGGTGAATATTCTGGAGCACCATCAGAAGAATTAACTTATGAATATTCAAAAACAATTTTAACCTTGATGACTACTGGTGAACCACATCCAGATGGTAAAGTTTTACTGATCGGTGGAGGAATTGCAAATTTCACCAATATTGCTGCTACATTCAAGGGTATTGTACGTGCTTTGACAGAATTCAAAGAACAATTGAAGAGACATAATATACGTATATTTGTCCGTCGTGCTGGTCCCAACTACCAGGAGGGTCTTCGTATAATGCGTGAATTGGGCCGTACTATCGATATTCCAATTTATGTATTTGGACCTGAAACTCATATGACTGCTATCGTGTCAATGGCATTTGGTTTACGTCAAATACCTCCACCTCAAGTAAATCAAATTCAGTCATCTGCAGATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD094852             [                          AAGTTGGATGCTCGAACAGGTGCTTCATTAAAGCTTACTATACTTAATCCAAATGGTCGTATATGGACAATGAGTGCAGGTGGTGGAGCTTCAGTGATTTATGCTGATACAGTTTGTGAATTAGCTGAAAAAGTCAAAGCAGCCGGTGGTATAAGTCAAGGTGTAAAAGATTTAGCTAATTATGGTGAATATTCTGGAGCACCATCAGAAGAATTAACTTATGAATATTCAAAAACAATTTTAACCTTGATGACTACTGGTGAACCACATCCAGATGGTAAAGTTTTACTGATCGGTGGAGGAATTGCAAATTTCACCAATATTGCTGCTACATTCAAGGGTATTGTACGTGCTTTGACAGAATTCAAAGAACAATTGAAGAGACATAATATACGTATATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD187194             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GCCGTACTATCGATATTCCAATTTATGTATTTGGACCTGAAACTCATATGACTGCTATCGTGTCAATGGCATTTGGTTTACGTCAAATACCTCCACCCCAAGTAAATCAAATTCAGTCATCTGCAGATAGTTTATCATTGTACAGTTACAATGGTTCTGGCTGTGAACATAAAAATTCAGACAAATCAACACCAATGGTGACCAATCAAACTCTCAAGGTTTCTGAATTCTCTTCTACTATCACTACTACGGCTACTACTGCTACTTCTGATAATAATCATGAAACTATTTATGAAGAACCACTTTTCACAGTGAAAACAAAGTGTTTAATATGGGGTTTACAAGTTAAAGCTGTTCAGTCTATGTTAGATTTCGATTATGCTTCCGGCCGTGATAGTCCAAGTGTAGCAGCTCTGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD117937             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CAAATTCAGTCATCTGCAGATAGTTTATCATTGTACAGTTACAATGGTTCTGGCTGTGAACATAAAAATTCAGACAAATCAACACCAATGGTGACCAATCAAACTCTCAAGGGTTCTGAATTCTCTTCTACTATCACTACTACGGCTACTACTGCTACTTCTGATAATAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD146017             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TAGTTTATCATTGTACAGTTACAATGGTTCTGGCTGTGAACATAAAAATTCAGACAAATCAACACCAATGGTGACCAATCAAACTCTCAAGGTTTCTGAATTCTCTTCTACTATCACTACTACGGCTACTACTGCTACTTCTGATAATAATCATGAAACTATTTATGAAGAACCACTTTTCACAGTGAAAACAAAGTGTTTAATATGGGGTTTACAAGTTAAAGCTGTTCAGTCTATGTTAGATTTCGATTATGCTTCCGGCCGTGATAGTCCAAGTGTAGCAGCTCTGATTTATCCTTTCAGTGATGATCATCAGTTGACATTTTATTGGGGTGCAAAAGAATTATTTCTACCAGTTTATAAGTATATGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD154153             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CTTTTCACAGTGAAAACAAAGTGTTTAATATGGGGTTTACAAGTTAAAGCTGTTCAGTCTATGTTAGATTTCGATTATGCTTCCGGCCGTGATAGTCCAAGTGTAGCAGCTCTGATTTATCCTTTCAGTGATGATCATCAGTTGACATTTTATTGGGGTGCAAAAGAATTATTTCTACCAGTTTATAAGTATATGTTGAATGCAATGCACAAGCATCCAGATGCACGTATATTAGTGAATTTCGCTTCATTGCGAGTTGCTTATGATATATGTATGGAAGCTATGGAAGTGGACTGTATATTGACATCTAATTATAAAGAGAATGGAATATTGAATGAACACAGTGATACATCTATTAATCATAATGATGGTTTACGGGTAAACGAGGCACAGATCAAATG TATCGCTATTATAGCTGAAGGTATACCAGAAAATATGACACGTCGTTTAATACAACGATCCAGAGAAAGAAATATTCTATTGATTGGTCCAGCAACCGTANGTGGCTTGAAATCTGGCTGCTTCAAAATCGGTAATACAGGCGGAATGACAGATAACATACTGGCATCANAACTTTATCGACCTGNAAGTGTTGCTTATGTATCACGTTCTGGTGGGATGTCCAATGAATTG ATAATATTATTTCAATG ATTCTGAT                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD119719             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aGTATATTGTCATCTGATTATAAAAAGAATAGAATATTGAATGAACCCAATGATACATCTATCAGTCATAATGATGGTTTACGGGTAAACGAGGCACAGATC AATGATATCGCTATTATAGCTGAAGGTATACCAGAAAATATGACACGTCGTTTAATACAACGATCCAGAGAAAGAGATATTCTATTGATTGGTCCAGCAGCCGTAGGTGGCTTGAAATCTGGCTGCTTCAAAATCGGTAATACAGGCGGAATGACAGATAACATACTGGCATCAAAACTTTATCGACCTGGAAGTGTTGCTTATGTATCACGTTCTGGTGGAATGTCCAATGAATTGAATAATATTATTTCAATGAATTCTGATGATGT AATGAAGGTGTCGCGATTGGTGGTGATCG TTTCCTGGTTCAACATTAATTGATCATATTCTACGTTATGAAAATAATCCAGAAATCGGTATGATTGTTG                    ]
[-] EMBL CD119716             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GTATATTGTCATCTAATTATAAAGAGAATGGAATATTGAATGAACACAGTGATACATCTATCAATCATAATGATGGTTTACGGGTAAACGAGGCACAGATCAAATG TATCGCTATTATAGCTGAAGGTATACCAGAAAATATGACACGTCGTTTAATACAACGATCCAGAGAAAGAAATATTCTATTGATTGGTCCAGCAACCGTAGGTGGCTTGAAATCTGGCTGCTTCAAAATCGGTAATACAGGCGGAATGACAGATAACATACTGGCATCAAAACTTTATCGACCTGGAAGTGTTGCTTATGTATCACGTTCTGGTGGAATGTCCAATGAATTGAATAATATTATTTCAATGAATTCTGATGGTGTGTATGAAGGTGTCGCGATTGGTGGTGATCGTTTTCCTGGTTCAACATTTATTGATCATATTCTACGTTATGAAAATAATCCAGAAATCGGTATGATTGTTGTCTTGGGCGAAGTTGGTGGT]
[+] EMBL CD114634             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TACTGGCATCAAAACTTTATCGACCTGGAAGTGTTGCTTATGTATCACGTTCTGGTGGAATGTCCAATGAATTGAATAATATTATTTCAATGAATTCTGATGGTGTGTATGAAGGTGTCGCGATTGGTGGTGATCGTTTTCCTGGTTCAACATTTATTGATCATATTCTACGTTATGAAAATAATCCAGAAATCGGTATGATTGTTGTCTTGGGCGAAGTTGGTGGT]


>consensus_9612#0 AAACTAAAGAGGAAGCGTATATCGCAAAGTTGGATGCTCGAACAGGTGCTTCATTAAAGC TTACTATACTTAATCCAAATGGTCGTATATGGACAATGAGTGCAGGTGGTGGAGCTTCAG TGATTTATGCTGATACAGTTTGTGAATTAGCTGAAAAAGTCAAAGCAGCCGGTGGTATAA GTCAAGGTGTAAAAGATTTAGCTAATTATGGTGAATATTCTGGAGCACCATCAGAAGAAT TAACTTATGAATATTCAAAAACAATTTTAACCTTGATGACTACTGGTGAACCACATCCAG ATGGTAAAGTTTTACTGATCGGTGGAGGAATTGCAAATTTCACCAATATTGCTGCTACAT TCAAGGGTATTGTACGTGCTTTGACAGAATTCAAAGAACAATTGAAGAGACATAATATAC GTATATTTGTCCGTCGTGCTGGTCCCAACTACCAGGAGGGTCTTCGTATAATGCGTGAAT TGGGCCGTACTATCGATATTCCAATTTATGTATTTGGACCTGAAACTCATATGACTGCTA TCGTGTCAATGGCATTTGGTTTACGTCAAATACCTCCACCTCAAGTAAATCAAATTCAGT CATCTGCAGATAGTTTATCATTGTACAGTTACAATGGTTCTGGCTGTGAACATAAAAATT CAGACAAATCAACACCAATGGTGACCAATCAAACTCTCAAGGTTTCTGAATTCTCTTCTA CTATCACTACTACGGCTACTACTGCTACTTCTGATAATAATCATGAAACTATTTATGAAG AACCACTTTTCACAGTGAAAACAAAGTGTTTAATATGGGGTTTACAAGTTAAAGCTGTTC AGTCTATGTTAGATTTCGATTATGCTTCCGGCCGTGATAGTCCAAGTGTAGCAGCTCTGA TTTATCCTTTCAGTGATGATCATCAGTTGACATTTTATTGGGGTGCAAAAGAATTATTTC TACCAGTTTATAAGTATATGTTGAATGCAATGCACAAGCATCCAGATGCACGTATATTAG TGAATTTCGCTTCATTGCGAGTTGCTTATGATATATGTATGGAAGCTATGGAAGTGGACT GTATATTGTCATCTAATTATAAAGAGAATGGAATATTGAATGAACACAGTGATACATCTA TCAATCATAATGATGGTTTACGGGTAAACGAGGCACAGATCAAATGTATCGCTATTATAG CTGAAGGTATACCAGAAAATATGACACGTCGTTTAATACAACGATCCAGAGAAAGAAATA TTCTATTGATTGGTCCAGCAACCGTAGGTGGCTTGAAATCTGGCTGCTTCAAAATCGGTA ATACAGGCGGAATGACAGATAACATACTGGCATCAAAACTTTATCGACCTGGAAGTGTTG CTTATGTATCACGTTCTGGTGGAATGTCCAATGAATTGAATAATATTATTTCAATGAATT CTGATGGTGTGTATGAAGGTGTCGCGATTGGTGGTGATCGTTTTCCTGGTTCAACATTTA TTGATCATATTCTACGTTATGAAAATAATCCAGAAATCGGTATGATTGTTGTCTTGGGCG AAGTTGGTGGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)