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Schistosoma mansoni
cluster # 9628 cluster # 9628       Sequences # 10       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9628#0 length = 1227 sequences # 10  

consensusID : consensus_9628#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 10
consensus length = 1227
fasta sequence
                              [AGGCCANAATTCGGCACGAGGGCGTTGAATTTTTTGAGGCTGCTGGTGTTCCATCCAAACTAAGGGAAACATATGCTGGAATTTTTGTAGAACATCGAATTAACAATTCAGTCCTTGCTGATTTAGATAAGGACCACTTAAAAGATATGGGGATCACAGTTATTGGAGATATTATTTCCATACTAAAGCAATGCAAAAAAATAAGACACGAGCTATCAGTTGCACCAACTCCTGTCGTTACTTCAACTACGTCGAAAGACTGCTCATCTGAAAATAAAAAAGCTGTGTCCAAAAATGTAGCCGTTTTAGTCCCAGTGCGTCGTCGAATGAATCCTGAAGTTGAAGGAAAATACATTGTTAAAATGCCCAAGGGGACGACTTTGAAGACCCAGAAGATTCTTGCATCAATGAAGCAAAAGAACAGTGCAAAGTCTAGTCAACCTGAAGTTGCCAAAGCCGCCAAAACTAATGAACCTCCTGTATCGTCTACCTTTGAAGACAGCGATGCCGATGATTGTGATAATTATCGTGTTATCATCTCTAAATCGAATACACATGGTTCCACATCTAGTGATTCAGTATTCAGTCGTTTAGGT-AATGCTGTAAATAGAGAGGATTCACCTACAAGTGTGCTTATAAAAAAAACGATAGATCCATCTGCTGCNNATGCAACGTTNTATTCGTTGGAATTTAAATGACAACAGTCTTGGATCACCTTTTCGTCCTCCACCATCTGTTACAGAAACCATGATGACCTCATCGGAGGATTCTTTGAATTTTAAAGTTGTTAAACAAGTTAGCAGTCTTACAAAAAACGTTGATCAGCCTATTAAATTAAGAACACCCCTTAAACGTCATGCTTCTGATACGGTATTTAGTCGTTTAAGTACTCCATCAACTACTATACAATC-AATGATCAACTTTCTTACCAAGGAATTTTGAAGAAGTCACGTACGCAACCTCCTAAATTTAACGATGAATCGATGTCTCCATGTTCTCTAAATAGCTTTCTTTCTCCATACACCGAAGGTGTACTTGGACAGAGTCGTATGCAAAAAGTTTCTGTTAAAAACCGCTTAGGCAACAGACAAGGAAAGTCTAACGCCCCAGTTCATTCTAGACTTGGTAGAGCATCTAATCCATTATAAATAATTTGATTGTCATGACTTTCAATGAACTTAGTGTATATATACATAAATATATTCTGCATACCATAAAATATAATTT]

[+] EMBL CD080745             [AGGCCANAATTCGGCACGAGGGCGTTGAATTTTTTGAGGCTGCTGGTGTTCCATCCAAACTAAGGGAAACATATGCTGGAATTTTTGTAGAACATCGAATTAACAATTCAGTCCTTGCTGATTTAGATAAGGACCACTTAAAAGATATGGGGATCACAGTTATTGGAGATATTATTTCCATACTAAAGCAATGCAAAAAAATAAGACACGAGCTATCAGTTGCACCAACTCCTGTCGTTACTTCAACTACGTCGAAAGACTGCTCATCTGAAAATAAAAAAGCTGTGTCCAAAAATGTAGCCGTTTTAGTCCCAGTGCGTCGTCGAATGAATCCTGAAGTTGAAGGAAAATACATTGTTAAAATGCCCAAGGGGACGACTTTGAAGACCCAGAAGATTCTTGCATCAATGAAGCAAAAGAACAGTGCAAAGTCTAGTCAACCTGAAGTTGCCAAAGCCGCCAAAACTAATGAACCTCCTGTATCGTCTACCTTTGAAGACAGCGATGCCGATGATTGTGATAATTATCGTGTTATCATCTCTAAATCGAATACACATGGTTCCACATCTAGTGATTCAGTATTCAGTCGTTTAGGT AATGCTGTAAATAGAGAGGATTCACCTACAAGTGTGCTTATAAAAAAAACGATAGATCCATCTGCTGCNNATGC ACGTTNTATTCGTTGGAATTTAAATGANCACAGTCTTGGATCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD082978             [                                                                                                                                  GGACC CTTAAAAGAT TGGGGATC CAGTTATTGGAGATATTATTTCCATACTAAAGCAATGCAAAAAAATAAGACACGAGCTATCAGTTGCACCAACTCCTGTCGTTACTTCAACTACGTCGAAAGACTGCTCATCTGAAAATAAAAAAGCTGTGTCCAAAAATGTAGCCGTTTTAGTCCCAGTGCGTCGTCGAATGAATCCTGAAGTTGAAGGAAAATACATTGTTAAAATGCCCAAGGGGACGACTTTGAAGACCCAGAAGATTCTTGCATCAATGAAGCAAAAGAACAGTGCAAAGTCTAGTCAACCTGAAGTTGCCAAAGCCGCCAAAACTAATGAACCTCCTGTATCGTCTACCTTTGAAGACAGCGATGCCGATGATTGTGATAATTATCGTGTTATCATCTCTAAATCGAATACACATGGTTCCACATCTAGTGATTCAGTATTCAGTCGTTTAGGT AATGCTGTAAATAGAGAGGATTCACCTACAAGTGTGCTTATAAAAAAAACGATAGAT CTTCTGCTG NCATGCAACGTTNTATTCGTTGGAATTTAAATGANCACAGTCTGGNATCAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL BG931169             [                                                                                                                                             ccagacgcGGGATCACAGTTATTGGAGATATTATTTCCATACTGAAGCAATGCAAAAAAATAAGACACGAGCTATCAGTTGCACCAACTCCTGTCGTTACTTCAACTACGTCGAAAGACTGCTCATCTGAAAATAAAAAAGCTGTGTCCAAAAATGTAGCCGTTTTAGTCCCAGTGCGTCGTCGAATGAATCCTGAAGTTGAAGGAAAATACATTGTTAAAATGCCCAAGGGGACGACTTTGAAGAg                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD180111             [                                                                                                                                                                                                                                        TGTCGTTACTTCAACTACGTCGAAAGACTGCTCATCTGAAAATAAAAAAGCTGTGTCCAAAAATGTAGCCGTTTTAGTCCCAGTGCGTCGTCGAATGAATCCTGAAGTTGAAGGAAAATACATTGTTAAGATGCCCAAGGGGACGACTTTGAAGACCCAGAAGATTCTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD078373             [                                                                                                                                                                                                                                                                                      cgAGGTGTGTCCAAAAATGTAGCCGTTTTAGTCCCAGTGCGTCGTCGAATGAATCCTGAAGTTGAAGGAAAATACATTGTTAAAATGCCCAAGGGGACGACTTTGAAGACCCAGAAGATTCTTGCATCAATGAAGCAAAAGAACAGTGCAAAGTCTAGTCAACCTGAAGTTGCCAAAGCCGCCAAAACTAATGAACCTCCTGTATCGTCTACCTTTGAAGACAGCGATGCCGATGATTGTGATAATTATCGCGTTATCATCTCTAAATCGAATACACATGGTTCCACATCTAGTGATTCAGTATTCAGTCGTTTAGGT AATGCTGTAAATAGAGAGGATTCACCTACAAGTGTGCTTATAAAAAAAACGATAGATCCATCTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD078287             [                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGTGTCCAAAAATGTAGCCGTTTTAGTCCCAGTGCGTCGTCGAATGAATCCTGAAGTTGAAGGAAAATACATTGTTAAAATGCCCAAGGGGACGACTTTGAAGACCCAGAAGATTCTTGCATCAATGAAGCAAAAGAACAGTGCAAAGTCTAGTCAACCTGAAGTTGCCAAAGCCGCCAAAACTAATGAACCTCCTGTATCGTCTACCTTTGAAGACAGCGATGCCGATGATTGTGATAATTATCGTGTTATCATCTCTAAATCGAATACACATGGTTCCACATCTAGTGATTCAGTATTCAGTCGTTTAGGT AATGCTGTAAATAGAGAGGATTCACCTACAAGTGTGCTTATAAAAAAAACGATAGATCCATCTGCTGC AATGCAACGTTTTATTCGTTGGAATTTAAATGACAACAGTCTTGGATCACCTTTTCGTCCTCCACCATCTGTTACAGAAACCATGATGACCTCATCGGAGGATTCTTTGAATTTTANAGTTGTTAAACAAGTTAGCAGTCTTACAAAAAACGTTGATCAGCCTATTAAATTAAGAACACCCCTTANACGTCATGCTTCTGATACGGTATTTAGTCGTTTAAGTACTCCATCAACTACTATAnncat c                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD077996             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gaggTGAATCCTGAAGTTGAAGGAAAATACATTGTTAAAATGCCCAAGGGGACGACTTTGAAGACCCAGAAGATTCTTGCATCAATGAAGCAAAAGAACAGTGCAAAGTCTAGTCAACCTGAAGTTGCCAAAGCCGCCAAAACTAATGAACCTCCTGTATCGTCTACCTTTGAAGACAGCGATGCCGATGATTGTGATAATTATCGTGTTATCATCTCTAAATCGAATACACATGGTTCCACATCTAGTGATTCAGTATTCAGTCGTTTAGGTAAATGCTGT AATAGAGAGGA TCACCTANCAGTGTGCTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD074670             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AACGTTTTATTCGTTGGAATTTAAATGACAACAGTCTTGGATCACCTTTTCGTCCTCCACCATCTGTTACAGAAACCATGATGACCTCATCGGAGGATTCTTTGAATTTTAAAGTTGTTAAACAAGTTAGCAGTCTTACAAAAAACGTTGATCAGCCTATTAAATTAAGAACACCCCTTAAACGTCATGCTTCTGATACGGTATTTAGTCGTTTAAGTACTCCATCAACTACTATACAATCAAATGATCAACTTTCTTACCAAGGAATTTTGAAGAAGTCACGTACGCAACCTCCTAAATTTAACGATGAATCGATGTCTCCATGTTCTCTAAATAGCTTTCTTTCTCCATACACCGAAGGTGTACTTGGACAGAGTCGTATGCAAAAAGTTTCTGTTAAAAACCGCTTAGGCAACAGACAAGGAAAGTCTAACGCCCCAGTTCATTCTAGACTTGGTAGAGCATCTAATCCATTATAAATAATTTGATTGTCATGACTTTCAATGAACTTAGTGTATATATACATAAATATATTCTGCATACCATAAAATATAATTT]
[-] EMBL CD076561             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AAATGACAACAGTCTTGGATCACCTTTTCGTCCTCCACCATCTGTTACAGAAACCATGATGACCTCATCGGAGGATTCTTTGAATTTTAAAGTTGTTAAACAAGTTAGCAGTCTTACAAAAAACGTTGATCAGCCTATTAAATTAAGAACACCCCTTAAACGTCATGCTTCTGATACGGTATTTAGTCGTTTAAGTACTCCATCAACTACTATACAATCAAATGATCAACTTTCTTACCAAGGAATTTTGAAGAAGTCACGTACGCAACCTCCTAAATTTAACGATGAATCGATGTCTCCATGTTCTCTAAATAGCTTTCTTTCTCCATACACCGAAGGTGTACTTGGACAGAGTCGTATGCAAAAAGTTTCTGTTAAAAACCGCTTAGGCAACAGACAAGGAAAGTCTAACGCCCCAGTTCATTCTAGACTTGGTAGAGCATCTAATCCATTATAAATAATTTGATTGTCATGACTTTCAATGAACTTAGTGTATATATACATAAATATATTCTGCATACCATAAAATATAATTT]
[-] EMBL CD072933             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ACTCCATCAACTGCTATGCAATCAAATGATCAACTTTCTTACCAAGGAATTTTGAAGAAGTCACGTACGCAACCTCCTAAATTTAACGATGAATCGATGTCTCCATGTTCTCTAAATAGCTTTCTTTCTCCATACGCCAAAGGTGTACTTGGGCAGAGTGGTATGCAAAAAGTTTCTGTTAAAAACCGCTTAGGCAACAGACAAGGAAAGTCTAACGCCCCAGTTCATTCTAGACTTGGTAGAGCATCTAATCCATTATAAATAATTTGATTGTCATGACTTTCAATGAACTTAGTGTATATATACATAAATATATTCTGCATACCATAAAATATAATTT]


>consensus_9628#0 AGGCCANAATTCGGCACGAGGGCGTTGAATTTTTTGAGGCTGCTGGTGTTCCATCCAAAC TAAGGGAAACATATGCTGGAATTTTTGTAGAACATCGAATTAACAATTCAGTCCTTGCTG ATTTAGATAAGGACCACTTAAAAGATATGGGGATCACAGTTATTGGAGATATTATTTCCA TACTAAAGCAATGCAAAAAAATAAGACACGAGCTATCAGTTGCACCAACTCCTGTCGTTA CTTCAACTACGTCGAAAGACTGCTCATCTGAAAATAAAAAAGCTGTGTCCAAAAATGTAG CCGTTTTAGTCCCAGTGCGTCGTCGAATGAATCCTGAAGTTGAAGGAAAATACATTGTTA AAATGCCCAAGGGGACGACTTTGAAGACCCAGAAGATTCTTGCATCAATGAAGCAAAAGA ACAGTGCAAAGTCTAGTCAACCTGAAGTTGCCAAAGCCGCCAAAACTAATGAACCTCCTG TATCGTCTACCTTTGAAGACAGCGATGCCGATGATTGTGATAATTATCGTGTTATCATCT CTAAATCGAATACACATGGTTCCACATCTAGTGATTCAGTATTCAGTCGTTTAGGTAATG CTGTAAATAGAGAGGATTCACCTACAAGTGTGCTTATAAAAAAAACGATAGATCCATCTG CTGCNNATGCAACGTTNTATTCGTTGGAATTTAAATGACAACAGTCTTGGATCACCTTTT CGTCCTCCACCATCTGTTACAGAAACCATGATGACCTCATCGGAGGATTCTTTGAATTTT AAAGTTGTTAAACAAGTTAGCAGTCTTACAAAAAACGTTGATCAGCCTATTAAATTAAGA ACACCCCTTAAACGTCATGCTTCTGATACGGTATTTAGTCGTTTAAGTACTCCATCAACT ACTATACAATCAATGATCAACTTTCTTACCAAGGAATTTTGAAGAAGTCACGTACGCAAC CTCCTAAATTTAACGATGAATCGATGTCTCCATGTTCTCTAAATAGCTTTCTTTCTCCAT ACACCGAAGGTGTACTTGGACAGAGTCGTATGCAAAAAGTTTCTGTTAAAAACCGCTTAG GCAACAGACAAGGAAAGTCTAACGCCCCAGTTCATTCTAGACTTGGTAGAGCATCTAATC CATTATAAATAATTTGATTGTCATGACTTTCAATGAACTTAGTGTATATATACATAAATA TATTCTGCATACCATAAAATATAATTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)