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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9646#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 10 consensus length = 986 fasta sequence
[AGTTTTTGCGCAACATGGGACTTGTTCGTCCTATTCGTATGATTCTTTGTTTTGTTTGTTTCTTGTTTCTCGTGAACTCTCAAAATGCACAGAAAGAACCCAGTTGCGGCCGTGCAAAAAGTTGTAGTGAATGCATGGGGATACGCCCTGCCTGTTCGTGGTGTAGTGCTGATGAATTTGATGATACGAAAGAAGGTCCAGGGTTTCGTTGTGCTCCATCTTCAGTCTTATTGGCCCGTGGATGTCCACAAAGTAGTATCGAGGATGTGGAGTCTGTGTTATTAGATCATGGAGTTCCTCTTGATCAAGCCAGTTTAACCGAAGATATACAACTTACTCCACGATCACAATCAGTAAAGGTCAGACCCGGAGGGACTATGATGGTCAATTTCACATTCCAGTCTATTTCGGATTACCCCGTTGACCTTTATTTCTTAACAGATCTCAGTTATACAATGATTGATGATTTGGAAACAGTTTCTCGTTTGACTAACGATATTGTATTAACTATGCGTAATGTAACAAAAAAGTTACAAATGGGATTCGGTGCCTTTGTAGACAAACCAGTGTTTCCCTTTGTTGTGCCAACTCCAGAATATCTTCGAAATCCATGTTTAAATGTTGGTACTAAAAATCTCCATTGCGATCCTCCATTCTTGTACAAACACATTTTGTCACTTACCGATAATTTTGAGGAGTTCAGAGAAAAAACCAAAGTAGCACGTCCTTCAGGTAATCTAGATAGTCCAGAGGGTGGTATGGACGCATTACTTCAGGTTGCCCGATGCAGTGAAGCTATTGGATGGCGTGCTGGTG-CCCGTAAAATCGTACTATTTGCTTCTGACGGTGGATTCCATTTGGCTGGTGATGGTCGAATCGCTGGATTAATACTGCCTCCTCCAACTACTTGTCAATTAACATATCAAGCTGATCGATTCAATTCTTCACTTAAGTACCTCGGCTGGCATAATTCTGATCAAACTGAT]
[+] EMBL CD178551 [AGTTTTTGCGCAACATGGGACTTGTTCGTCCTATTCGTATGATTCTTTGTTTTGTTTGTTTCTTGTTTCTCGTGAACTCTCAAAATGCACAGAAAGAACCCAGTTGCGGCCGTGCAAAAAGTTGTAGTGAATGCATGGGGATACGCCCTGCCTGTTCGTGGTGTAGTGCTGATGAATTTGATGATACGAAAGAAGGTCCAGGGTTTCGTTGTGCTCCATCTTCAGTCTTATTGGCCCGTGGATGTCCACAAAGTAGTATCGAGGATGTGGAGTCTGTGTTATTAGATCATGGAGTTCCTCTTGATCAAGCCAGTTTAACCGAAGATATACAACTTACTCCACGATCACAATCAGTAAAGGTCAGACCCGGAGGGACTATGATGGTCAATTTCACATTCCAGTCTATTTCGGATTACCCCGTTGACCTTTATTTCTTAACAGATCTCAGTTATACAATGATTGATGATTTGGAAACAGTTTCTCGTTTGACTAACGATATTGTATTAACTATGCGTAATGTAACAAAAAAGTTACAAATGGGATACGGTGCCTTTGTAGACAAACCAGTGTTTCCCTTTGTTGTGCCAACTTCAGAATATCTTCGAAATCCATGTTTAAATGTTGGTACTAAAAATCT ]
[-] EMBL CD120909 [ TTTTGCGCAACATGGGACTTGTTCGTCCTATTCGTATGATTCTTTGTTTTGTTTGTTTCTTGTTTCTCGTGAACTCTCAAAATGCACAGAAAGAACCCAGTTGCGGCCGTGCAAAAAGTTGTAGTGAATGCATGGGGATACGCCCTGCCTGTTCGTGGTGTAGTGCTGATGAATTTGATGATACGAAAGAAGGTCCAGGGTTTCGTTGTGCTCCATCTTCAGTCTTATTGGCCCGTGGATGTCCACAAAGTAGTATCGAGGATGTGGAGTCTGTGTTATTAGATCATGGAGTT ]
[+] EMBL CD186858 [ ATGCATGGGGATACGCCCTGCCTGTTCGTGGTGTAGTGCTGATGAATTTGATGATACGAAAGAAGGTCCAGGGTTTCGTTGTGCTCCATCTTCAGTCTTATTGGCCCGTGGATGTCCACAAAGTAGTATCGAGGATGTGGAGTCTGTGTTATTAGATCATGGAGTTCCTCTTGATCAAGCCAGTTTAACCGAAGATATACAACTTACTCCACGATCACAATCAGTAAAGGTCAGACCCGGAGGGACTATGATGGCCAATTTCACATTCCAGTCTATTTCGGATTACCCCGTTGACCTTTATTTCTTAACAGATCTCAGTTATACAATGATTGATGATTTGGAAACAGTTTCTCGTTTGACTAACGATATTGTATTAACTATGCGTAATGTAACGAAAAAGTTACAAATGGGATTCGGTGCCTTT ]
[+] EMBL CD164417 [ CGTGG GCACTGCTGATGAATTTGATGATACGAAAGAAGGTCCAGGGTTTCGTTGTGCTCCATCTTCAGTCTTATTGGCCCGTGGATGTCCACAAAGTAGTATCGAGGATGTGGAGTCTGTGTTATTAGATCATGGAGTTCCTCTTGATCAAGCCAGTTTAACCGAAGATATACAACTTACTCCACGATCACAATCAGTAAAGGTCAGACCCGGAGGGACTATGATGGTCAATTTCACATTCCAGTCTATTTCGGATTACCCCGTTGACCTTTATTTCTTAACAGATCTCAGTTATACAATGATTGATGATTTGGAAACAGTTTCTCGTTTGACTAACGATATTGTATTAACTATGCGTAATGTAACAAAAAAGTTACAA ]
[+] EMBL CD164415 [ ATTTGATGGTACGAAAGAAGGTCCAGGGTTTCGTTGTGCTCCATCTTCAGTCTTATTGGCCCGTGGATGTCCACAAAGTAGTATCGAGGATGTGGAGTCTGTGTTATTAGATCATGGAGTTCCTCTTGATCAAGCCAGTTTAACCGAAGATATACAACTTACTCCACGATCACAATCAGTAAAGGTCAGACCCGGAGGGACTATGATGGTCAATTTCACATTCCAGTCTATTTCGGATTACCCCGTTGACCTTTATTTCTTAACAGATCTCAGTTATACAATGTTTGATGATTTGGAAACAGTTTCTCGTTTGACTAACGATATTGTATTAACTATGCGTAATGTAACAAAAAAGTTACAA ]
[+] EMBL CD180983 [ ATGTCCACAAAGTAGTATCGAGGATGTGGAGTCTGTGTTATTAGATCATGGAGTTCCTCTTGATCAAGCCAGTTTAACCGAAGATATACAACTTACTCCACGATCACAATCAGTAAAGGTCAGACCCGGAGGGACTATGATGGTCAATTTCACATTCCAGTCTATTTCGGATTACCCCGTTGACCTTTATTTCTTAACAGATCTCAGTTATACAATGATTGATGATTTGGAAACAGTTTCTCGTTTGACTAACGATATTGTATTAACTATGCGTAATGTAACAAAAAAGTTACAAATGGGATTCGGTGCCTTTGTAGACAAACCAGTGTTTCCCTTTGTTGTGCCAACTCCAGAATATCTTCGAAATCCATGTTTAAATGTTGGTACTACAAATCTCCATTGCGATCCTCCATTCTTGTACAAACACca ]
[-] EMBL CD146541 [ ATACAACTTACTCCACGATCACAATCAGTAAAGGTCAGACCCGGAGGGACTATGATGGTCAATTTCACATTCCAGTCTATTTCGGATTACCCCGTTGACCTTTATTTCTTAACAGATCTCAGTTATACAATGATTGATGATTTGGAAACAGTTTCTCGTTTGACTAACGATATTGTATTAACTATGCGTAATGTAACAAAAAAGTTACAAATGGGATTCGGTGCCTTTGTAGACAAACCAGTGTTTCCCTTTGTTGTGCCAACTCCAGAATATCTTCGAAATCCATGTTTAAATGTTGGTACTAAAAATCTCCATTGCGATCCTCCATTCTTGTACAAACACGTTTTGTCACTTAC ]
[-] EMBL CD182584 [ ATCCATGTTTAAATGTTGGTACTAAAAATCTCCATTGCGATCCTCCATTCTTGTACAAACACATTTTGTCACTTACCGATAATTTTGAGGAGTTCAGAGAAAAAACCAAAGTAGCACGTCCTTCAGGTAATCTAGATAGTCCAGAGGGTGGTATGGACGCACTACTTCAGGTTGCCCGATGCAGTGAAGCTATTGGATGGCGTGCTGGTG CCCGTAAAATCGTACTATTTGCTTCTGACGGTGGATTCCATTTGGCTGGTGATGGTCGAATCGCTGGAT ]
[-] EMBL CD163641 [ GCGATCCTCCATTCTTGTACAAACACATTTTGTCACTTACCGATAATTTTGAGGAGTTCAGAGAAAAAACCAAAGTAGCACGTCCTTCAGGTAATCTAGATAGTCCAGAGGGTGGTATGGACGCATTACTTCAGGTTGCCCGATGCAGTGAAGCTATTGGATGGCGTGCTGGTG CCCGTAAAATCGTACTATTTGCTTCTGACGGTGGATTCCATTTGGCTGGTGATGGTCGAATCGCTGGATTAATACTGCCTCCTCCAACTACTTGTCAATTAACATATCAAGCTGATCGATTCAATTCTTCACTTAAGTACCTCGGCTGGCATAATTCTGATCAAACTGAT]
[+] EMBL CD200334 [ AACCAAAGTAGCACGTCCTTCAGGTAATCTAGATAGTCCAGAGNGTGGTATGGACGCATTACTTCAGGTTGCCCGATGCAGTGAAGCTATTGGATGGCGTGCTGGTGCCCCGT AAATCGTACTATTT ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||