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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9685#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 11 consensus length = 1084 fasta sequence
[GGTTTTACTCTTGTGATTTGTTGCATGGCTGAATTACCACCTCTTCAGCTTCCTGCGGGTTCATACAATCCAGTCAATAAGCGTGTTATATATGTTGGGGGACTATCAGAGCAAGTTGATGTACCTCTTGTTCGTGCGGCGTTTATCCCTTTTGGAGACATAGTTAGTATTAATATGCCCATGGACTATCAAACT-GAAAAACACAGAGGTTTCGCTTTTGTTGAATTCGAAGAAGTTGAAGATGCTATGAGTGCCATTGATAATATGAATGAAAGTGAAATATTCGGGCGTACCA-TTCGTGTTAATGTGGCAAGACCAGTACGCATACGGGAGGGTTGGAGTCGACCTGTTTGGTCGGACGAGAATTGGCTAAAGAAATATGGCAGTGCTCCACTAGAAGGCAGAAAACTGGATGAACCTGATATCGTCAACCCATCTGATACTTCAGAAAATGTTGAAGACTTGAGTGACGAAGAAATGCGAACCAAAAAACAAAAACGAAATCTTCCTCGGGTATTCTTTGATATTCGTATTGGAAATGGAGATGCTGGTCGTATAGTGATGGAGCTTCGCTCAGATATTGTCCCGAGAACTGCTGAAAACTTCCGTGCCCTGTGTACAGGAGAACGTGGATTCGGTTATCACAATTGTTGTTTCCATCGAGTTATACCACAATTCATGTGTCAAGGAGGCGATT-TTGTAAAAGGAGATGGGACCGGTGGCAAATCAATATATGGACGTAAATTCGATGATGAAAACTTCCAACTCCGACATGAAGGGTTCGGTGTTCTTTCCATGGCGAATTCTGGACCGAATACAAATGGATCTCAATTCTTTATTTGCACAACAAAATGTGATTGGCTTGATGGCAAACATGTTGTTTTTGGTCGAGTAGTGGATGGGCAAAATGTCGTTAAAAAGATGGAGTCCGTTGGATCGAAATCTGGTAAGGTCAAAGAACCCGTTATTATTTCTCGATGCGGAGAGTTAATTTAACATATCTGAATTGTGAAACGAAAGGAGCGATGTACAGTTTTGTTTTTAAATGTTTTTTAACAATATATCATTATTGAAATTAAAAAAA]
[+] EMBL SM30265 [GGTTTTACTCTTGTGATTTGTTGCATGGCTGAATTACCACCTCTTCAGCTTCCTGCGGGTTCATACAATCCAGTCAATAAGCGTGTTATATATGTTGGGGGACTATCAGAGCAAGTTGATGTACCTCTTGTTCGTGCGGCGTTTATCCCTTTTGGAGACATAGTTAGTATTAATATGCCCATGGACTATCAAACT GAAAAACACAGAGGTTTCGCTTTTGTTGAATTCGAAGAAGTTGAAGATGCTATGAGTGCCATTGATAATATGAATGAAAGTGAAATATTCGGGCGTACCA TTCGTGTTAATGTGGCAAGACCAGTACGCATACGGGAGGGTTGGAGTCGACCTGTTTGGTCGGACGAGAATTGGCTAAAGAAATATGGCAGTGCTCCACTAGAAGGCAGAAAACTGGATGAACCTGATATCGTCAACCCATCTGATACTTCAGAAAATGTTGAAGACTTGAGTGACGAAGAAATGCGAACCAAAAAACAAAAACGAAATCTTCCTCGGGTATTCTTTGATATTCGTATTGGAAATGGAGATGCTGGTCGTATAGTGATGGAGCTTCGCTCAGATATTGTCCCGAGAACTGCTGAAAACTTCCGTGCCCTGTGTACAGGAGAACGTGGATTCGGTTATCACAATTGTTGTTTCCATCGAGTTATACCACAATTCATGTGTCAAGGAGGCGATT TTGTWAAAGGAGATGGGACCGGTGGCAAATCAATATATGGACGTAAATTCGATGATGAAAACTTCCAACTCCGACATGAAGGGTTCGGTGTTCTTTCCATGGCGAATTCTGGACCGAATACAAATGGATCTCAATTCTTTATTTGCACAACAAAATGTGATTGGCTTGATGGCAAACATGTTGTTTTTGGTCGAGTAGTGGATGGGCAAAATGTCGTTAAAAAGATGGAGTCCGTTGGATCGAAATCTGGTAAGGTCAAAGAACCCGTTATTATTTCTCGATGCGGAGAGTTAATTTAACATATCTGAATTGTGAAACGAAAGGAGCGATGTACAGTTTTGTTTTTAAATGTTTTTTAACAATATATCATTATTGAAATTAAAAAAA]
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[+] EMBL CD090677 [ TTAGTATTAATATGCCCATGGACTATCAAACT GAAAAACACAGAGGTTTCGCTTTTGTTGAATTCGAAGAAGTTGAAGATGCTATGAGTGCCATTGATAATATGAATGAAAGTGAAATATTCGGGCGTACCA TTCGTGTTAATGTGGCAAGACCAGTACGCATACGGGAGGGTTGGAGTCGACCTGTTTGGTCGGACGAGAATTGGCTAAAGAAATATGGCAGTGCTCCACTATAAGGCAGAAAACTGGATGAACCTGATATCGTCAACCCATCTGATACTTCAGAAAATGTTGAAGACTTGAGTGACGAAGAAATGCGAACCAAAAAACAAAAACGAAATCTTCCTCGGGTATTCTTTGATATTCGTATTGGAAATGGAGATGCTGGTCGTATAGTGATGGAGCTTCGCTCAGATA ]
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[-] EMBL CD162806 [ ATGAAAGTGAAATATTCGGGCGTACCA TTCGTGTTAATGTGGCAAGACCAGTACGCATACGGGAGGGTTGGAGTCGACCTGTTTGGTCGGACGAGAATTGGCTAAAGAAATATGGCAGTGCTCCACTAGAAGGCAGAAAACTGGATGAACCTGATATCGTCAACCCATCTGATACTTCAGAAAATGTTGAAGACTTGAGTGACGAAGAAATGCGAACCAAAAAACAAAAACGAAATCTTCCTCGGGTATTCTTTGATATTCGTATTGGAAATGGAGATGCTGGTCGTATAGTGATGGAGCTTCGCTCAGATATTGTCCCGAGAACTGCTGAAAACTTCCGTGCCCTGTGTACAGGAGAACGTGGATTCGGTTATCACAATTGTTGTTTCCATCGAGTTATACCACAATTCATGTGTCAAGGAGGCGATT TTGTAAAAG ]
[+] EMBL SM50388 [ aagctTCGACCTGTTTGGTCGGACGAGAATTGGCTAAAGAAATATGGCAGTGCTCCACTAGAAGGCAGAAAACTGGATGAACCTGATATCGTCAACCCATCTGATACTTCAGAAAATGTCGAAGACTTGAGTGACGAAGAAATGCGAACCAAAAAACAAAAACGAAATCTTCCTCGGGTATTCTTTGATATTCGTATTGGAAATGGAGATGCTGGTCGTATAGTGATGGAGCTTCGCTCAGATATTGTCCCGAGAACTGCTGAAAACTTCCGTGCCCTGTGTACAGGAGAACGTGGATTCGGTTATCACAATTGTTGTTTCCATCGAGTTATACCACAATTCATGTGTCAAGGAGGCGATT TTGTAAAAGGAGATGGGACCGGTGGCAAATCAATATATGGACGTAAATTCGATGATGAAAACATCCAACTCCGACATGAAGGGTTCGGTGTTCTTTCCATGGCGAATTCTGGACCGAATACAAATGGATCTCAATTCTTTATTTGCACAACAAAATGTGATTGGCTTGATGGCAAACATGTTGTTTTTGGTCGAGTAGTGGATGGGCAAAATGTCGTTAAAAAGATGGAGTCCGTTGGATCGAAATCTGGTAAGGTCAAAGAACCCGTTATTATTTCTCGATGCGGAGAGTTAATTTAACATATCTGAATTGTGAAACGAAAGGAGCGATGTACAGTTTTGTTTTTAAATGTTTTTTAACAATATATCATT ]
[-] EMBL CD162857 [ TGATACTTCAGAAAATGTTGAAGACTTGAGTGACGAAGAAATGCGAACCAAAAAACAAAAACGAAATCTTCCTCGGGTATTCTTTGATATTCGTATTGGAAATGGAGATGCTGGTCGTATAGTGATGGAGCTTCGCTCAGATATTGTCCCGAGAACTGCTGAAAACTTCCGTGCCCTGTGTACAGGAGAACGTGGATTCGGTTATCACAATTGTTGTTTCCATCGAGTTATACCACAATTCATGTGTCAAGGAGGCGATT TTGTAAAAG ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||