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Schistosoma mansoni
cluster # 9685 cluster # 9685       Sequences # 11       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9685#0 length = 1084 sequences # 11  

consensusID : consensus_9685#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 11
consensus length = 1084
fasta sequence
                              [GGTTTTACTCTTGTGATTTGTTGCATGGCTGAATTACCACCTCTTCAGCTTCCTGCGGGTTCATACAATCCAGTCAATAAGCGTGTTATATATGTTGGGGGACTATCAGAGCAAGTTGATGTACCTCTTGTTCGTGCGGCGTTTATCCCTTTTGGAGACATAGTTAGTATTAATATGCCCATGGACTATCAAACT-GAAAAACACAGAGGTTTCGCTTTTGTTGAATTCGAAGAAGTTGAAGATGCTATGAGTGCCATTGATAATATGAATGAAAGTGAAATATTCGGGCGTACCA-TTCGTGTTAATGTGGCAAGACCAGTACGCATACGGGAGGGTTGGAGTCGACCTGTTTGGTCGGACGAGAATTGGCTAAAGAAATATGGCAGTGCTCCACTAGAAGGCAGAAAACTGGATGAACCTGATATCGTCAACCCATCTGATACTTCAGAAAATGTTGAAGACTTGAGTGACGAAGAAATGCGAACCAAAAAACAAAAACGAAATCTTCCTCGGGTATTCTTTGATATTCGTATTGGAAATGGAGATGCTGGTCGTATAGTGATGGAGCTTCGCTCAGATATTGTCCCGAGAACTGCTGAAAACTTCCGTGCCCTGTGTACAGGAGAACGTGGATTCGGTTATCACAATTGTTGTTTCCATCGAGTTATACCACAATTCATGTGTCAAGGAGGCGATT-TTGTAAAAGGAGATGGGACCGGTGGCAAATCAATATATGGACGTAAATTCGATGATGAAAACTTCCAACTCCGACATGAAGGGTTCGGTGTTCTTTCCATGGCGAATTCTGGACCGAATACAAATGGATCTCAATTCTTTATTTGCACAACAAAATGTGATTGGCTTGATGGCAAACATGTTGTTTTTGGTCGAGTAGTGGATGGGCAAAATGTCGTTAAAAAGATGGAGTCCGTTGGATCGAAATCTGGTAAGGTCAAAGAACCCGTTATTATTTCTCGATGCGGAGAGTTAATTTAACATATCTGAATTGTGAAACGAAAGGAGCGATGTACAGTTTTGTTTTTAAATGTTTTTTAACAATATATCATTATTGAAATTAAAAAAA]

[+] EMBL SM30265              [GGTTTTACTCTTGTGATTTGTTGCATGGCTGAATTACCACCTCTTCAGCTTCCTGCGGGTTCATACAATCCAGTCAATAAGCGTGTTATATATGTTGGGGGACTATCAGAGCAAGTTGATGTACCTCTTGTTCGTGCGGCGTTTATCCCTTTTGGAGACATAGTTAGTATTAATATGCCCATGGACTATCAAACT GAAAAACACAGAGGTTTCGCTTTTGTTGAATTCGAAGAAGTTGAAGATGCTATGAGTGCCATTGATAATATGAATGAAAGTGAAATATTCGGGCGTACCA TTCGTGTTAATGTGGCAAGACCAGTACGCATACGGGAGGGTTGGAGTCGACCTGTTTGGTCGGACGAGAATTGGCTAAAGAAATATGGCAGTGCTCCACTAGAAGGCAGAAAACTGGATGAACCTGATATCGTCAACCCATCTGATACTTCAGAAAATGTTGAAGACTTGAGTGACGAAGAAATGCGAACCAAAAAACAAAAACGAAATCTTCCTCGGGTATTCTTTGATATTCGTATTGGAAATGGAGATGCTGGTCGTATAGTGATGGAGCTTCGCTCAGATATTGTCCCGAGAACTGCTGAAAACTTCCGTGCCCTGTGTACAGGAGAACGTGGATTCGGTTATCACAATTGTTGTTTCCATCGAGTTATACCACAATTCATGTGTCAAGGAGGCGATT TTGTWAAAGGAGATGGGACCGGTGGCAAATCAATATATGGACGTAAATTCGATGATGAAAACTTCCAACTCCGACATGAAGGGTTCGGTGTTCTTTCCATGGCGAATTCTGGACCGAATACAAATGGATCTCAATTCTTTATTTGCACAACAAAATGTGATTGGCTTGATGGCAAACATGTTGTTTTTGGTCGAGTAGTGGATGGGCAAAATGTCGTTAAAAAGATGGAGTCCGTTGGATCGAAATCTGGTAAGGTCAAAGAACCCGTTATTATTTCTCGATGCGGAGAGTTAATTTAACATATCTGAATTGTGAAACGAAAGGAGCGATGTACAGTTTTGTTTTTAAATGTTTTTTAACAATATATCATTATTGAAATTAAAAAAA]
[+] EMBL CD090674             [                                                                                                                                                                   TTAGTATTAATATGCCGATGGACTATTAAACT GAAAAACACAGAGGTTTCGCTTTTGTTGAATTCCAAGAAGTTGAAGATGCTATGAGTGCCATTGATAATATGAATGAAAGTGAAATATTCGGGCGTACCA TTCGTGTTAATGTGGCAAGACCAGTACGCATACCGGAGGGTTGGAGTCGACCTGTTTGGTCGGACGACAATTGGCTAAAGAAATATGGCAGTGCTCCACTAGAAGGCATAAAACTGGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD090691             [                                                                                                                                                                   TTAGTATTAATATGCCCATGGACTATCAAACTNGAAAAACACAGAGGTTTCGCTTTTGTTGAATTCGAAGAAGTTGAAGATGCTATGAGTGCCATTGATAATATGAATGAAAGTGAAATATTCGGGCGTACCA TTCGTGTTAATGTGGCAAGACCAGTACGCATACGGGAGGGTTGGAGTCGACCTGTTTGGTCGGACGAGAATTGGCTAAAGAAATATGGCAGTGCTCCACTAGAAGGCAGAAAACTGGATGAACTTGATATCGTCAACCCATCTGATACTTCAGAAAATGTTGAAGACTTGAGTGACGAAGAAATGCGAACCAAAAAACAAAAACGAAATCTTCCTCGGGTATTCTTTGATATTCGTATTGGAAATGGAGATGCTGGTCGTATAGTGATGGAGCTTCGCTCAGATATTGTCCCGAGAACTGCTGAAAACTTCCGTGCCCTGTGTACAGGAGAACGTGGATTCGGTTATCACAATTGTTGTTTCCATCGAGTTATACCACAATTCATGTGTCAAGGAGGCGATT TTGTAAAAGGAGATGGGACC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD090710             [                                                                                                                                                                   TTAGTATTAATATGCCCATGGACTATCAAACT GAAAAACACAGAGGTTTCGCTTTTGTTGAATTCGAAGAAGTTGAAGATGCTATGA TGCCATTGATAATATGAATGAAAGTGAAATATTCGGGCGTACCAGTTCGTGTTAATGTGGCAAGACCAGTACGCATACGGGAGGGTTGGAGTCGACCTGTTTGGTCGGACGAGAATTGGCTAAAGAAATATGGCAGTGCTCCACTAGAAGGCAGAAAACTGGATGAACCTGATATCGTCAACCCATCTGATACTTCAGAAAATGTTGAAGACTTGAGTGACGAAGAAATGCGAACCAAAAAACAAAAACGAAATCTTCCTCGGGTATTCTTTGATATTCGTATTGGAAATGGAGATGCTGGTCGTATAGTGATGGAGCTTCGCTCAGATATTGTCCCGAGAACTGCTGAAAACTTCCGTGCCCTGTGTACAGGAGAACGTGGATTCGGTTATCACAATTGTTGTTTCCATCGAGTTATACCACAATTCATGTGTCAAGGAGGCGATT TTGTAAAAGGAGATGGGACC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD090709             [                                                                                                                                                                   TTAGTATTAATATGCCCATGGACTATCAAACT GAAAAACACAGAGGTTTCGCTTTTGTTGAATTCGAAGAAGTTGAAGATGCTATGAGTGCCATTGATAATATGAATGAAAGTGAAATATTC GGCGTACCA TTCGTGTTAATGTGGCAAGACCAGTACGCATACGGGAGGGTCGGAGTCGACCTGTTTGGTCGGACGAGAATTGGCTAAAGAAATATGGCAGTGCTCCACTAGAAGGCAGAAAACTGGATGAACCTGATACCGTCAACCCATCTGATACTTCAGAAAATGTTGAAGACTTGAGTGACGAAGAAATGCGAACCAAAAAACAAAAACGAAATCTTCCTCGGGTATTCTTTGATATTCGTATTGGAAATGGAGATGCTGGTCGTATAGTGATGGAGCTTCGCTCAGATATTGTCCCGAGAACTGCTGAAAACTTCCGTGCCCAGTGTACAGGAGAACGTGGATTCGGTTATCACAATTGTTGTTTCCATCGAGTTATACCACAATTCATGTGTCAAGGAGGCGATTCTTGT AAAGGAGATGGGACCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD090696             [                                                                                                                                                                   TTAGTATTAATATGCCCATGGACTATCAAACT GAAAAACACAGAGGTTTCGCTTTTGTTGAATTCGAAGAAGTTGAAGATGCTATGAGTGCCATTGATAATATGAATGAAAGTGAAATATTCGGGCGTACCA TTCGTGTTAATGTGGCAAGACCAGTACGCATACGGGAGGGTTGGAGTCGACCTGTTTGGTCGGACGAGAATTGGCTAAAGAAATGTGGCAGTGCTCCACTAGAAGGCAGAAAACTGGATGAACCTGATATCGTCAACCCATCTGATACTTCAGAAAATGTTGAAGACTTGAGTGACGAAGAAATGCGAACCAAAAAACAAAAACGAAATCTCCCTCGGGTATTCTTAGATATTCGTATTGGAAATGGAGATGCTGGTCGTATAGTGATGGAGCTTCGCTCAGATATTGTCCCGAGAACTGCTGAAAACTTCCGTGCCCTGTGTACAGGAGAACGTGGATTCGGNTATCACAATTGTTGTTTCCATCGAGTTATACCACAATTCATGTGTCAAGGAGGCGANC TTGT AAAGGAGATGGGACCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD090677             [                                                                                                                                                                   TTAGTATTAATATGCCCATGGACTATCAAACT GAAAAACACAGAGGTTTCGCTTTTGTTGAATTCGAAGAAGTTGAAGATGCTATGAGTGCCATTGATAATATGAATGAAAGTGAAATATTCGGGCGTACCA TTCGTGTTAATGTGGCAAGACCAGTACGCATACGGGAGGGTTGGAGTCGACCTGTTTGGTCGGACGAGAATTGGCTAAAGAAATATGGCAGTGCTCCACTATAAGGCAGAAAACTGGATGAACCTGATATCGTCAACCCATCTGATACTTCAGAAAATGTTGAAGACTTGAGTGACGAAGAAATGCGAACCAAAAAACAAAAACGAAATCTTCCTCGGGTATTCTTTGATATTCGTATTGGAAATGGAGATGCTGGTCGTATAGTGATGGAGCTTCGCTCAGATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD090675             [                                                                                                                                                                   TTAGTATTAATATGCCCATGGACTATCAAACT GAAAAACACAGAGGTTTCGCTTTTGTTGAATTCGAAGAAGTTGAAGATGCTATGAGTGCCATTGATAATATGAATGAAAGTGAAATATTCGGGCGTACCA TTCGTGTTAATGTGGCAAGACCAGTACGCATACGGGAGGGTTGGAGTCGACCTGTTTGGTCGGACGAGAATTGGCTAAAGAAATATGGCAGTGCTCCACTAGAAGGCAGAAAACTGGATGAACCTGATATCGTCAACCCATCTGATACTTCAAAAAATGTTGAAGACTTGAGTGACGAAGAAATGCGAACCAAAAAACAAAAACGAAATCTTCCTCGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD162806             [                                                                                                                                                                                                                                                                             ATGAAAGTGAAATATTCGGGCGTACCA TTCGTGTTAATGTGGCAAGACCAGTACGCATACGGGAGGGTTGGAGTCGACCTGTTTGGTCGGACGAGAATTGGCTAAAGAAATATGGCAGTGCTCCACTAGAAGGCAGAAAACTGGATGAACCTGATATCGTCAACCCATCTGATACTTCAGAAAATGTTGAAGACTTGAGTGACGAAGAAATGCGAACCAAAAAACAAAAACGAAATCTTCCTCGGGTATTCTTTGATATTCGTATTGGAAATGGAGATGCTGGTCGTATAGTGATGGAGCTTCGCTCAGATATTGTCCCGAGAACTGCTGAAAACTTCCGTGCCCTGTGTACAGGAGAACGTGGATTCGGTTATCACAATTGTTGTTTCCATCGAGTTATACCACAATTCATGTGTCAAGGAGGCGATT TTGTAAAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL SM50388              [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aagctTCGACCTGTTTGGTCGGACGAGAATTGGCTAAAGAAATATGGCAGTGCTCCACTAGAAGGCAGAAAACTGGATGAACCTGATATCGTCAACCCATCTGATACTTCAGAAAATGTCGAAGACTTGAGTGACGAAGAAATGCGAACCAAAAAACAAAAACGAAATCTTCCTCGGGTATTCTTTGATATTCGTATTGGAAATGGAGATGCTGGTCGTATAGTGATGGAGCTTCGCTCAGATATTGTCCCGAGAACTGCTGAAAACTTCCGTGCCCTGTGTACAGGAGAACGTGGATTCGGTTATCACAATTGTTGTTTCCATCGAGTTATACCACAATTCATGTGTCAAGGAGGCGATT TTGTAAAAGGAGATGGGACCGGTGGCAAATCAATATATGGACGTAAATTCGATGATGAAAACATCCAACTCCGACATGAAGGGTTCGGTGTTCTTTCCATGGCGAATTCTGGACCGAATACAAATGGATCTCAATTCTTTATTTGCACAACAAAATGTGATTGGCTTGATGGCAAACATGTTGTTTTTGGTCGAGTAGTGGATGGGCAAAATGTCGTTAAAAAGATGGAGTCCGTTGGATCGAAATCTGGTAAGGTCAAAGAACCCGTTATTATTTCTCGATGCGGAGAGTTAATTTAACATATCTGAATTGTGAAACGAAAGGAGCGATGTACAGTTTTGTTTTTAAATGTTTTTTAACAATATATCATT                ]
[-] EMBL CD162857             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TGATACTTCAGAAAATGTTGAAGACTTGAGTGACGAAGAAATGCGAACCAAAAAACAAAAACGAAATCTTCCTCGGGTATTCTTTGATATTCGTATTGGAAATGGAGATGCTGGTCGTATAGTGATGGAGCTTCGCTCAGATATTGTCCCGAGAACTGCTGAAAACTTCCGTGCCCTGTGTACAGGAGAACGTGGATTCGGTTATCACAATTGTTGTTTCCATCGAGTTATACCACAATTCATGTGTCAAGGAGGCGATT TTGTAAAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]


>consensus_9685#0 GGTTTTACTCTTGTGATTTGTTGCATGGCTGAATTACCACCTCTTCAGCTTCCTGCGGGT TCATACAATCCAGTCAATAAGCGTGTTATATATGTTGGGGGACTATCAGAGCAAGTTGAT GTACCTCTTGTTCGTGCGGCGTTTATCCCTTTTGGAGACATAGTTAGTATTAATATGCCC ATGGACTATCAAACTGAAAAACACAGAGGTTTCGCTTTTGTTGAATTCGAAGAAGTTGAA GATGCTATGAGTGCCATTGATAATATGAATGAAAGTGAAATATTCGGGCGTACCATTCGT GTTAATGTGGCAAGACCAGTACGCATACGGGAGGGTTGGAGTCGACCTGTTTGGTCGGAC GAGAATTGGCTAAAGAAATATGGCAGTGCTCCACTAGAAGGCAGAAAACTGGATGAACCT GATATCGTCAACCCATCTGATACTTCAGAAAATGTTGAAGACTTGAGTGACGAAGAAATG CGAACCAAAAAACAAAAACGAAATCTTCCTCGGGTATTCTTTGATATTCGTATTGGAAAT GGAGATGCTGGTCGTATAGTGATGGAGCTTCGCTCAGATATTGTCCCGAGAACTGCTGAA AACTTCCGTGCCCTGTGTACAGGAGAACGTGGATTCGGTTATCACAATTGTTGTTTCCAT CGAGTTATACCACAATTCATGTGTCAAGGAGGCGATTTTGTAAAAGGAGATGGGACCGGT GGCAAATCAATATATGGACGTAAATTCGATGATGAAAACTTCCAACTCCGACATGAAGGG TTCGGTGTTCTTTCCATGGCGAATTCTGGACCGAATACAAATGGATCTCAATTCTTTATT TGCACAACAAAATGTGATTGGCTTGATGGCAAACATGTTGTTTTTGGTCGAGTAGTGGAT GGGCAAAATGTCGTTAAAAAGATGGAGTCCGTTGGATCGAAATCTGGTAAGGTCAAAGAA CCCGTTATTATTTCTCGATGCGGAGAGTTAATTTAACATATCTGAATTGTGAAACGAAAG GAGCGATGTACAGTTTTGTTTTTAAATGTTTTTTAACAATATATCATTATTGAAATTAAA AAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)