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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9692#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 11 consensus length = 776 fasta sequence
[ACTAACTAGTTGCGGAGGATCGACCAATGTTAATCGGCCAAGACATTCTGAGACTAGATTTCGTGTACCTTCTTCCGATAAACCAGAACATGCTAATAAAAGGGACCACATTGAATCTAGATGATGTTTCAAAGATTGATTAGGATCCAGACCAGCAAGATTAACAAGAACCTCTCTAAGAGCTTGAATTAAATAATATAATTGATGTTGACTTGTGTTATTTTTACTACCTATGCCAGCACCGCCACTGCCACTACTGCTGCTGCTAGTAAGAGATCCTGAGGTGTTTGTCAGTTGCATATGTTGTTTTACAGCTTGTG-AAATGCTTTCGATTAATGGTGGTAAAAGAATTTCTGGTTTACCAACGACCAATCGACCTAAACTTAACGCTGCTGCTGGTTTGACTTCTTCACTGACCATGAGTCCATTGGATGATATCGTGGAATGAGATAAACCAGTTGAAGTATGCGGTGTTGGTTGCTGATAATGATAAGGTGAATTGTTGGTTGATGACAGGCAAGAAATTAATAGATCGCGAAGATCTGTACGTGAACTCAAATCAACTTTACGACCTAGTTCACCCAAAATAAGCAAATTTAGATATAATTGTGTTGGAGATGTAGAAGGATCCTTGACAGATATTAACAACTGATCAACCACATTGTTTACACTACTCAGTAAACTGTCGGCATGAGGTGATAATAATGACGGTGAATTCGATGAAGTCATTGGTAGTTCAGCTAATAGAGCAGCTATACATTGAGCTAAACTAGGCA]
[+] EMBL CD153338 [ACTAACTAGTTGCGGAGGATCGACCAATGTTAATCGGCCAAGACATTCTGAGACTAGATTTCGTGTACCTTCTTCCGATAAACCAGAACATGCTAATAAAAGGGACCACATTGAATCTAGATGATGTTTCAAAGATTGATTAGGATCCAGACCAGCAAGATTAACAAGAACCTCTCTAAGAGCTTGAATTAAATAATATAATTGATGTTGACTTGTGTTATTTTTACTACCTATGCCAGCACCGCCACTGCCACTACTGCTGCTGCTAGTAAGAGATCCTGAGGTGTTTGTCAGTTGCATATGTTGTTTTACAGCTTGTG AAATGCTTTCGATTAATGGTGGTAAAAGAATTTCTGGTTTACCAACGACCAATCGACCTAAACTTAACGCTGCTGCTGGTTTGACTTCTTCACTGACCATGAGTCCATTGGATGATATCGTGGAATGAGATAAACCAGTTGAAGTATGCGGTGTTGGTTGCTGATAATGATAAGGTGncacagcga ]
[+] EMBL CD069744 [ CAGTTGCATATGTTGTTTTACAGCTTGTG AAATGCTTTCGATTAATGGTGGTAAAAGAATTTCTGGTTTACCAACGACCAATCGACCTAAACTTAACGCTGCTGCTGGTTTGACTTCTTCACTGACCATGAGTCCATTGGATGATATCGTGGAATGAGATAAACCAGTTGAAGTATGCGGTGTTGGTTGCTGATAATGATAAGGTGAATTGTTGGTTGATGACAGGCAAGAAATTAATAGATCGCGAAGATCTGTACGTGAACTCAAATCAACTTTACGACCTAGTTCACCCAAAATAAGCAAATTTAGATATAATTGTGTTGGAGAT ]
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[+] EMBL CD069740 [ CAGTTGCATATGTTGTTTTACAGCTTGTG AGATGCTTTCGATTAATGGTGGTAAAAGAATTTCTGGTTTACCAACGACCAATCGACCTAAACTTAACGCTGCTGCTGGTTTGACTTCTTCACTGACCATGAGTCCATTGGATGATATCGTGGAATGAGATAAACCAGTTGAAGTATGCGGTGTTGGTTGCTGATAATGATAAGGTGAATTGTTGGTTGATGACAGGCAAGAAATTAATAGATCGCGAAGATCTGTACGTGAACTCAAATCAACTTTACGACCTAGTTCACCCAAAATAAGCAAATTTAGATATAATTGTGTTGGAGAT ]
[+] EMBL CD069785 [ CAGTTGCATATGTTGTTTTACAGCTTGTG AAATGCTTTCGATTAATGGTGGTAAAAGAATTTCTGGTTTACCAACGACCAATCGACCTAAACTTAACGCTGCTGCTGGTTTGACTTCTTCACTGAGCATGAGTCCATTGGATGATATCGTGGAATGAGATAAACCAGTTGAAGTATGCGGTGTTGGTTGCTGATAATGATAAGGTGAATTGTTGGTTGATGACAGGCAAGAAATTAATAGATCGCGAAGATCTGTACGTGAACTCAAATCAACTTTACGACCTAGTTCACCCAAAATAAGCAAATTTAGATATAATTGTGTTGGAGAT ]
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[-] EMBL CD069743 [ AGTTGCATATGTTGTTTTACAACTTGTG AAATGCTTTCGATTAATGGTGGTAAAAGAATTTCTGGTTTACCAACGACCAATCGACCTAAACTTAACGCTGCTGCTGGTTTGACTTCTTCACTGACCATGAGTCCATTGGATGATATCGTGGAATGAGATAAACCAGTTGAAGTATGCGGTGTTGGTTGCTGATAATGATAAGGTGAATTGTTGGTTGATGACAGGCAAGAAATTAATAGATCGCGAAGATCTGTACGTGAACTCAAATCAACTTTACGACCTAGTTCACCCAAAATAAGCAAATTTAGATATAATTGTGTTGGAGATG ]
[+] EMBL CD148158 [ TGGAATGAGATAAACCAGTTGAAGTATGCGGTGTTGGTTGCTGATAATGATAAGGTGAATTGTTGGTTGACGACAGGCAAGAAATTAATAGATCGCGAAGATCTGTACGTGAACTCAAATCAACTTTACGACCTAGTTCGCCCAAAATAAGCAAATTTAGATATAATTGTGTTGGAGATGTAGAAGGATCCTTGACAGATATTAACAACTGATCAACCACATTGTTTACACTACTCAGTAAACTGTCGGCATGAGGTGATAATAATGACGGTGAATTCGATGAAGTCATTGGTAGTTCAGCTAATAGAGCAGCTATACATTGAGCTAAACTAGGCA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||