These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9723#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 11 consensus length = 818 fasta sequence [AGCTTATTACATCAGACATGATTGAAGAAGTGATGACTAGCATTGCACAACAAGCTGTTGAAAAAATCGATCGGACACGAGGTGTAGCTGGTCAAGTGTTCGCTCATTTACTCCATCATGACCCTCCTATCGAACACATTTCACATTTTGAAGAACTGAAACAAATTTTCCCAAAATCTGATTGTGATGATATGATATGGAATTCGGCCAACTCAACATTTCATCGTTTTACGAAACTGCTGGATTTTCCAGAATATCGTTATCGTTTAATTTTAGGCTTAATTGTCAGTGTCGGTGGTCTGACAGAATTAACAATTCGATGTAGTACTTCAGCT-TTAAGTGCATATTTTCTTGATCATGAATCAGACCAGCTGTTTATCGTAGAAGTATTAAAGATTGTTGGACAGATTTTGCAATCGTTTCGACAAGAAGAGAGGATTGTTGTTCCTCTTTTTAAATTTCTGGATTTTTTACTGAATGATCCGA--TTGTCAACTCAACAATTGATCCAAACAGTTCAATTCTTTTACAACTAACGGAAAGTGTATGGAATG-AAACTAAACT--AACTAAAGATGTACAACGTATTAAAGCTGCTATCGATGTATTTGGTGGGATGTTACAATTTACTGGGTCTGTTCGAAAACGATCCCTATCATTAATGATGATCATATTGGGATCTCGTTACCCAATTATTCGTAAAGCAACCGCAACAGAATTGTATGAAGGTTTACTGGTTTATGAGTTATGTCCATCTGAGTTATTAGATCAAGTATCATCTATACTTACTGAAACCATCTGGGAAGGTGATATCGAAGCAGTC] [-] EMBL CD156503 [AGCTTATTACATCAGACATGATTGAAGAAGTGATGACTAGCATTGCACAACAAGCTGTTGAAAAAATCGATCGGACACGAGGTGTAGCTGGTCAAGTGTTCGCTCATTTACTCCATCATGACCCTCCTATCGAACACATTTCACATTTTGAAGAACTGAAACAAATTTTCCCAAAATCTGATTGTGATGATATGATATGGAATTCGGCCAACTCAACATTTCATCGTTTTACGAAACTGCTGGATTTTCCAGAATATCGTTATCGTTTAATTTTAGGCTTAATTGTCAGTGTCGGTGGTCTGACAGAATTAACAATTCGATGTAGTACTTCAGCT TTAAGTGCATATTTTCTTGATCATGAATCAGTCCAG ] [-] EMBL CD156462 [AGCTTATTACATCAGACATGATTGAAGAAGTGATGACTAGCATTGCACAACAAGCTGTTGAAAAAATCGATCGGACACGAGGTGTAGCTGGTCAAGTGTTCGCTCATTTACTCCATCATGACCCTCCTATCGAACACATTTCACATTTTGAAGAACTGAAACATATTTTCCCAAAATCTGATTGTGATGATATGATATGGAATTCGGCCAACTCAACATTTCATCGTTTTACGAAACTGCTGGATTTTCCAGAATATCGTTATCGTTTAATTTTAGGCTTAATTGTCAGTGTCGGTGGTCTGACAGAATTAACAATTCGATGTAGTACTTCAGCT TTAAGTGCATATTTTCTTGATCATGAATCAGACCAG ] [-] EMBL CD156456 [ TGATTGTGATGATATGATATGGAATTCGGCCAACTCAACATTTCATCGTTTTACGAAACTGCTGGATTTTCCAGAATATCGTTATCGTTTAATTTTAGGCTTAATTGTCAGTGTCGGTGGTCTGACAGAATTAACAATTCGATGTAGTACTTCAGCT TTAAGTGCATATTTTCTTGATCATGAATCAGACCAG ] [+] EMBL CD139862 [ GAAACTGCTGGATTTTCCAGAATATCGTTATCGTTTAATTTTAGGCTTAATTGTCAGTGTCGGTGGTCTGACAGAATTAACAATTCGATGTAGTACTTCAGCT TTAAGTGCATATTTTCTTGATCATGAATCAGACCAGCTGTTTATCGTAGAAGTATTAAAGATTGTTGGACAGATTTTGCAATCGTTTCGACAAGAAGAGAGGATTGTTGTTCCTCTTTTTAAATTTCTGGATTTTTTACTGAATGATCCGA TTGTCAACTCAACAATTGATCCAAACAGTTCAATTCTTTTACNACTAACGGNAAGTGTATGGAATGAAAACT AACTAAAACTAA ] [+] EMBL CD139989 [ GAAACTGCTGGATTTTCCAGAATATCGTTATCGTTTAATTTTAGGCTTAATTGTCAGTGTCGGTGGTCTGACAGAATTAACAATTCGATGTAGTACTTCAGCT TTAAGTGCGTATTTTCTTGATCATGAATCAGACCAGCTGTTTATCGTAGAAGTATTAAAGATTGTTGGACAGATTTTGCAATCGTTTCGACAAGAAGAGAGGATTGTTGTTCCTCTTTTTAAATTTCTGGATTTTTTACTGAATGATCCGA TTGTCAGCTCAACAATTGATCCAAACAGTTCAATTCTTTTACAACTAACGG AAGTGTATGGAAT ] [+] EMBL CD139943 [ GAAACTGCTGGATTTTCCAGAATATCGTTATCGTTTAATTTTAGGCTTAATTGTCAGTGTCGGTGGTCTGACAGAATTAACAATTCGATGTAGTACTTCAGCT TTAAGTGCATATTTTCTTGATCATGAATCAGACCAGCTGTTTATCGTAGAAGTATTAAAGATTGTTGGACAGATTTTGCAATCGTTTCGACAAGAAGAGAGGATTGTTGTTCCTCTTTTT AATTTCTGGATTTTTTACTGAATGATCCGA TTGTCCACTCAACAATTGATCCAAACAGTTCAATTCT ] [+] EMBL CD139916 [ GAAACTGCTGGATTTTCCAGAATATCGTTATCGTTTAATTTTAGGCTTAATTGTCAGTGTCGGTGGTCTGACAGAATTAACAATTCGATGTAGTACTTCAGCT TTAAGTGCATATTTTCTTGATCATGAATCAGACCAGCTGTTTATCGTAGAAGTATTAAAGATTGTTGGACAGATTTTGCAATCGTTTCGACAAGAAGAGAGGATTGTTGTTCCTCTTTTT AATTTCTGGATTTTTTACTGAATGATCCGATTTTGTC ACTC ACAATTGATCC ] [+] EMBL CD139929 [ GAAACTGCTGGATTTTCCAGAATATCGTTATCGTTTAGTTTTAGGCTTAATTGTCAGTGTCGGTGGTCTGACAGAATTAACAATTCGATGTAGTACTTCAGCT TTAAGTGCATATTTTCTTGATCATGAATCAGACCAGCTGTTTATCGTAGAAGTATTAAAGATTGTTGGACAGATTTTGCAATCGTTTCGACAAGAAGAGAGGATTGTTGTTCCTCTTTTTAAATTTCTGGATTTTTTACTGAATGATCCGA TTGTCAACTCAACAATT ] [+] EMBL CD139883 [ GAAACTGCTGGATTTTCCAGAATATCGTTATCGTTTAATTTTAGGCTTAATTGTCAGTGTCGGTGGTCTGACAGAATTAACAATTCGATGTAGTACTTCAGCT TTAAGTGCATATTTTCTTGATCATGAATCAGACCAGCTGTTTATCGTAGAAGTATTAAAGATTGTTGGACAGATTTTGCAATCGTTTCGACAAGAAGAGAGGATTGTTGTTCCTCTTTTTAAATTTCTGGATTTTTTACTGAATG ] [+] EMBL CD069166 [ TTCAGCTCTTGTGTGCATATTTTCTTGATCATGAATCAGACCAGCTGTTTATCGTAGAAGTATTAAAGATTGTTGGACAGATTTTGCAATCGTTTCGACAAGAAGAGAGGATTGTTGTTCCTCTTTTTAAATTTCTGGATTTTTTACTGAATGATCCGA TTGTCAACTCAACAATTGATCCAAACAGTTCAATTCTTTTACGACTAACGGAAAGTGTATGGAATG AAACTAAACT AACTAAAGATGTACAACGTATTAAAGCTGCTATCGATGTATTTGGTGGGATGTTACAATTTACTGGGTCTGTTCGAAAACGATCCCTATCATTAATGATGATCATATTGGGATCTCGTTACCCAATTATTCGTAAAGCAACCGCAACAGAATTGTATGAAGGTTTACTGGTTTATGAGTTATGTCCATCTGAGTTATTAGATCAAGTATCATCTATACTTACTG ] [-] EMBL CD193939 [ TTGATNCAAACAGTTCAATTCTTTTACAACTAACGGAAAGTGTATGGAATG AAACTAAACT AACTAAAGATGTACAACGTATTAAAGCTGCTATCGATGTATTTGGTGGGATGTTACAATTTACTGGGTCTGTTCGAAAACGATCTCTATCATTAATGATGATCATATTGGGATCTCGTTACCCAATTATTCGTAAAGCAACCGCAACAGAATTGTATGAAGGTTTGCTGGTTTATGAGTTATGTCCATCTGAGTTATTAGATCAAGTATCATCTATACTTACTGAAACCATCTGGGAAGGTGATATCGAAGCAGTC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||