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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9730#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 11 consensus length = 875 fasta sequence
[TACGAGCCAAGATTCGGCACGAGGCGTTCCTCAAATTTCTGATCAATCTGTAATTTCATCAAAGTCTGTTCATAGTTCATTATCGTCGAATAACAATGAAAATATGAAAATTGGTTCTGTTCCCAGTTCTGATTACTATACCAAAAATCACAACTACAAACCAATTACTACTACTACTTATCGTCCGTTACGTCATCTGATTAATAACTGGCCTCCACCTCAACCAATCGATCCAATCCAAGTAACTGAATCTTATTGTACATAAATCTGGGCTATTCTGTCAAATGACTTGC-TTTCCTCTATTTACTCCCCACCTCTTTCCTTCTCTCTCTGTTCTATGCTCCAATTCTGTGGTATTTCGTTTAATAACAATGACGAAATATCATTCTAAGACAAAATGTAGATTATTATTATTGATTGAGGACAGCAACAACATCATACAGAGTAGTTGAAATACGTTTGTTCCTTCTTCTTACAGCCATCACAACACTTGTTATTTAACCAGTGAAATATATACCAGTATTAAGTGTTTTGTACATCCATTAATTTGAAATCAGCACAATAAAATTCCCAATATTTATTTGTGTATGTATGAATCACATGGAAATGAGTAGCTTTATTTCATGATATTTGATTATCCAATGACTTAATATGATAACGTACATATAAATATTTCTATCCTCTCTCACATCAGATTTCATCATAGTCGTTTAGTCTGTTT-GTTTCAGAGAATTATGCTTCTATTTCTTCGTTGACCAGAAATTTCCTTATCTTATGAAACAGTTTATATATGTATGTACACTAACTTACATTCAACCAATTAATAATCAACTGTAGGTTTTATCTCTTGAATTTTGCAACAGTAATACATGAAA]
[+] EMBL CD082647 [TACGAGCCAAGATTCGGCACGAGGCGTTCCTCAAATTTCTGATCAATCTGTAATTTCATCAAAGTCTGTTCATAGTTCATTATCGTCGAATAACAATGAAAATATGAAAATTGGTTCTGTTCCCAGTTCTGATTACTATACCAAAAATCACAACTACAAACCAATTACTACTACTACTTATCGTCCGTTACGTCATCTGATTAATAACTGGCCTCCACCTCAACCAATCGATCCAATCCAAGTAACTGAATCTTATTGTACATAAATCTGGGCTATTCTGTCAAATGACTTGC TTTCCTCTATTTACTCCCCACCTCTTTCCTTCTCTCTCTGTTCTATGCTCCAATTCTGTGGTATTTCGTTTAATAACAATGACGAAATATCATTCTAAGACAAAATGTAGATTATTATTATTGATTGAGGACAGCAACAACATCATACAGAGTAGTTGAAATACGTTTGTTCCTTCTTCTTACAGCCATCACAACACTTGTTATTTAACCAGTGAAATATATACCAGTATTAAGTGTTTTGTACATCCATTAATTTGAAATCAGCACAATAAAATTCCCAATATTTATTTGTGTATGTATGAATCACATGGAAATGAGTAGCTNTATTTCATGATATTTGATTATCCAATGACTTAATATGATAACGTACATATAAATANTTCTATCCTCT ]
[-] EMBL CD076243 [ TGCTTTTCCTCTATTTACTCCCCACCTCTTTCCTTCTCTCTCTGTTNTATGCTCCAATTCTGTGGTATTTCGTTTAATAACAATGACGAAATATCATTCTAAGACAAAATGTAGATTATTATTATTGATTGAGGACAGCAACAACATCATACAGAGTAGTTGAAATACGTTTGTTCCTTCTTCTTACAGCCATCACAACACTTGTTATTTAACCAGTGAAATATATACCAGTATTAAGTGTTTTGTACATCCATTAATTTGAAATCAGCACAATAAAATTCCCAATATTTATTTGTGTATGTATGAATCACATGGAAATGAGTAGCTTTATTTCATGATATTTGATTATCCAATGACTTAATATGATAACGTACATATAAATATTTCTATCCTCTCTCACATCAGATTTCATCATAGTCGTTTAGTCTGTTT GTTTCAGAGAATTATGCTTCTATTTCTTCGTTGACCAGAAATTTCCTTATCTTATGAAACAGTTTATATATGTATGTACACTAACTTACATTCAACCAATTAATAATCAACTGTAGGTTTTATCTCTTGAATTTTGCAACAGTAATACATGAAA]
[+] EMBL CD140527 [ TACGTTTGTTCCTTCTTCTTACAGCCATCACAACACTTGTTATTTAACCAGTGAAATATATGCCAGTATTAAGTGTTTTGTACATCCATTAATTTGAAATCAGCACAATAAAATTCCCAATATTTATTTGTGTATGTATGAATCACATGGAAATGAGTAGCTTTATTTCATGATATTTGATTATCCAATGACTTAATATGATAACGTACATATAAATATTTCTATCCTCTCTCACATCAGATTTCATCATAGTCGTTTAGTCTGTTT GTTTCAGAGAATTATGCTTCTATTTCTTCGTTGACCAGAAATTTCCTTATCTTATGAAACAGTTTATATATGTATGTACACTAACTTACATTCAACCAATTAATAATCAACTG ]
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[+] EMBL CD140699 [ TACGTTTGTTCCTTCTTCTTACAGCCATCACAACACTTGTTATTTAACCAGTGAAATATATACCAGTATTAAGTGTTTTGTACATCCATTAATTTGAAATCAGCACAATAAAATTCCCAATATTTATTTGTGTATGTATGAATCACATGGAAATGAGTAGCTTTATTTCATGATATTTGATTATCCAATGACTTAATATGATAACGTACATATAAATATTTCTATCCTCTCTCACATCAGATTTCATCATAGTCGTTTAGTCTGTTT GTTTCAGAGAATTATGCTTCTATTTCTTCGTTGACCAGAAATTTCCTTATCTTATGAAACAGTTTATATATGTATGTACACTAACTTACATTCAACCAATTAATAATCAACTG ]
[+] EMBL CD197147 [ TACGTTTGTTCCTTCTTCTTACAGCCATCACAACACTTGTTATTTAACCAGTGAAATATATACCAGTATTAAGTGTTTTGTACATCCATTAA TTGAAATCAGCACAATAAAATTCCCAATATTTATTTGTGTATGTATGAATCACATGGAAATGAGTAGCTTTATTTCATGATATTTGATTATCCAATGACTTAATATGATAACGTACATATAAATATTTCTATCCTCTCTCACATCAGATTTCATCATAGTCGTTTAGTCTGTTT GTTTCAGAGAATTATGCTTCTATTTCTTCGTTGACCAGAAATTTCCTTATCTTATGAAACAGTTTACATATGTATGTACACTAACTTACATTCAACCAATTAATAATCAACTG ]
[-] EMBL CD197216 [ ACGTTTGTTCCTTCTTCTTACAGCCATCACAACACTTGTTATTTAACCAGTGAAATATATACCAGTATTAAGTGTTTTGTACATCCATTAA TTGAAATCAGCACAATAAAATTCCCAATATTTATTTGTGTATGTATGAATCACATGGAAATGAGTAGCTTTATTTCATGATATTTGATTATCCAATGACTTAATATGATAACGTACATATAAATATTTCTATCCTCTCTCACATCAGATTTCATCATAGTCGTTTAGTCTGTTT GTTTCAGAGAATTATGCTTCTATTTCTTCGTTGACCAGAAATTTCCTTATCTTATGAAACAGTTTATATATGTATGTACACTAACTTACATTCAACCAATTAATAATCAACTGTAGGTTTTA ]
[-] EMBL CD140686 [ ACGTTTGTTCCTTCTTCTTACACCCATCACAACACTTGTTATTTAACCAGTGAAATATATACCAGTATTAAGTGTTTTGTACATCCATTAATTTGAAATCAGCACAATAAAATTCCCAATATTTATTTGTGTATGTATGAATCACATGGAAATGAGTAGCCTTATTTCATGATATTTGATTATCCAATGACTTAATATGATAACGTACATATAAATATTTCTATCCTCTCTCACATCAGATTTCATCATAGTCGTTTAGTCTGTTT GTTTCAGAGAATTATGCTTCTATTTCTTCGTTGACCAGAAATTTCCTTATCTTATGAAACAGTTTATATATGTATGTACACTAACTTACATTCAACCAATTAATAATCAACTGT ]
[-] EMBL CD140609 [ ACGTTTGTTCATTCTTCTTACACCCATCACAACACTTGTTATTTAACCAGTGAAATATATACCAGTATTAAGTGTTTTGTACATCCATTAATTTGAAATCAGCACAATAAAATTCCCAATATTTATTTGTGTATGTATGAATCACATGGAAATGAGTAGCTTTATTTCATGATATTTGATTATCCAATGACTTAATATGATAACGTACATATAAATATTTCTATCCTCTCTCACATCAGATTTCATCATAGTCGTTTAGTCTGTTT GTTTCAGAGAATTATGCTTCTATTTCTTCGTTGACCAGAAATTTCCTTATCTTATGAAACAGTTTATATATGTATGTACACTAACTTACATTCAACCAATTAATAATCAACTGT ]
[-] EMBL CD196419 [ CCATCACAACACTTGTTATTTAACCAGTGAAATATATACCAGTATTAAGTGTTTTGTACATCCATTAATTTGAAATCAGCACAATAAAATTCCCAATATTTATTTGTGTATGTATGAATCACATGGAAATGAGTAGCTTTATTTCATGATATTTGATTATCCAATGACTTAATATGATAACGTACATATAAATATTTCTATCCTCTCTCACATCAGATTTCATCATAGTCGTTTAGTCTGTTT GTTTCAGAGAATTATGCTTCTATTTCTTCGTTGACCAGAAATTTCCTTATCTTATGAAACAGTTTATATATGTATGTACGCTAACTTACATTCAACCAATTAATAATCAACTGT ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||