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Schistosoma mansoni
cluster # 9730 cluster # 9730       Sequences # 11       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9730#0 length = 875 sequences # 11  

consensusID : consensus_9730#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 11
consensus length = 875
fasta sequence
                              [TACGAGCCAAGATTCGGCACGAGGCGTTCCTCAAATTTCTGATCAATCTGTAATTTCATCAAAGTCTGTTCATAGTTCATTATCGTCGAATAACAATGAAAATATGAAAATTGGTTCTGTTCCCAGTTCTGATTACTATACCAAAAATCACAACTACAAACCAATTACTACTACTACTTATCGTCCGTTACGTCATCTGATTAATAACTGGCCTCCACCTCAACCAATCGATCCAATCCAAGTAACTGAATCTTATTGTACATAAATCTGGGCTATTCTGTCAAATGACTTGC-TTTCCTCTATTTACTCCCCACCTCTTTCCTTCTCTCTCTGTTCTATGCTCCAATTCTGTGGTATTTCGTTTAATAACAATGACGAAATATCATTCTAAGACAAAATGTAGATTATTATTATTGATTGAGGACAGCAACAACATCATACAGAGTAGTTGAAATACGTTTGTTCCTTCTTCTTACAGCCATCACAACACTTGTTATTTAACCAGTGAAATATATACCAGTATTAAGTGTTTTGTACATCCATTAATTTGAAATCAGCACAATAAAATTCCCAATATTTATTTGTGTATGTATGAATCACATGGAAATGAGTAGCTTTATTTCATGATATTTGATTATCCAATGACTTAATATGATAACGTACATATAAATATTTCTATCCTCTCTCACATCAGATTTCATCATAGTCGTTTAGTCTGTTT-GTTTCAGAGAATTATGCTTCTATTTCTTCGTTGACCAGAAATTTCCTTATCTTATGAAACAGTTTATATATGTATGTACACTAACTTACATTCAACCAATTAATAATCAACTGTAGGTTTTATCTCTTGAATTTTGCAACAGTAATACATGAAA]

[+] EMBL CD082647             [TACGAGCCAAGATTCGGCACGAGGCGTTCCTCAAATTTCTGATCAATCTGTAATTTCATCAAAGTCTGTTCATAGTTCATTATCGTCGAATAACAATGAAAATATGAAAATTGGTTCTGTTCCCAGTTCTGATTACTATACCAAAAATCACAACTACAAACCAATTACTACTACTACTTATCGTCCGTTACGTCATCTGATTAATAACTGGCCTCCACCTCAACCAATCGATCCAATCCAAGTAACTGAATCTTATTGTACATAAATCTGGGCTATTCTGTCAAATGACTTGC TTTCCTCTATTTACTCCCCACCTCTTTCCTTCTCTCTCTGTTCTATGCTCCAATTCTGTGGTATTTCGTTTAATAACAATGACGAAATATCATTCTAAGACAAAATGTAGATTATTATTATTGATTGAGGACAGCAACAACATCATACAGAGTAGTTGAAATACGTTTGTTCCTTCTTCTTACAGCCATCACAACACTTGTTATTTAACCAGTGAAATATATACCAGTATTAAGTGTTTTGTACATCCATTAATTTGAAATCAGCACAATAAAATTCCCAATATTTATTTGTGTATGTATGAATCACATGGAAATGAGTAGCTNTATTTCATGATATTTGATTATCCAATGACTTAATATGATAACGTACATATAAATANTTCTATCCTCT                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD076243             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGCTTTTCCTCTATTTACTCCCCACCTCTTTCCTTCTCTCTCTGTTNTATGCTCCAATTCTGTGGTATTTCGTTTAATAACAATGACGAAATATCATTCTAAGACAAAATGTAGATTATTATTATTGATTGAGGACAGCAACAACATCATACAGAGTAGTTGAAATACGTTTGTTCCTTCTTCTTACAGCCATCACAACACTTGTTATTTAACCAGTGAAATATATACCAGTATTAAGTGTTTTGTACATCCATTAATTTGAAATCAGCACAATAAAATTCCCAATATTTATTTGTGTATGTATGAATCACATGGAAATGAGTAGCTTTATTTCATGATATTTGATTATCCAATGACTTAATATGATAACGTACATATAAATATTTCTATCCTCTCTCACATCAGATTTCATCATAGTCGTTTAGTCTGTTT GTTTCAGAGAATTATGCTTCTATTTCTTCGTTGACCAGAAATTTCCTTATCTTATGAAACAGTTTATATATGTATGTACACTAACTTACATTCAACCAATTAATAATCAACTGTAGGTTTTATCTCTTGAATTTTGCAACAGTAATACATGAAA]
[+] EMBL CD140527             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TACGTTTGTTCCTTCTTCTTACAGCCATCACAACACTTGTTATTTAACCAGTGAAATATATGCCAGTATTAAGTGTTTTGTACATCCATTAATTTGAAATCAGCACAATAAAATTCCCAATATTTATTTGTGTATGTATGAATCACATGGAAATGAGTAGCTTTATTTCATGATATTTGATTATCCAATGACTTAATATGATAACGTACATATAAATATTTCTATCCTCTCTCACATCAGATTTCATCATAGTCGTTTAGTCTGTTT GTTTCAGAGAATTATGCTTCTATTTCTTCGTTGACCAGAAATTTCCTTATCTTATGAAACAGTTTATATATGTATGTACACTAACTTACATTCAACCAATTAATAATCAACTG                                         ]
[+] EMBL CD197127             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TACGTTTGTTCCTTCTTCTTACAGCCATCACAACACTTGTTATTTAACCAGTGAAATATATACCAGTATTAAGTGTTTTGTACATCCATTAATTTGAAATCAGCACAATAAAATTCCCAATATTTATTTGTGTATGTATGAATCACATGGAAATGAGTAGCTTTATTTCATGATATTTGATTATCCAATGACTTAATATGATAACGTACATATCAATATTTCTATCCTCTCTCACATCAGATTTCATCATAGTCGTTTAGTCTGTTTCGTTTCAGAGAATTATGCTTCTATTTCTTCGTTGACCAGAAATTTCCTTATCTTATGAAACAGTTTATATATGTATGTACACTAACTTACATTCAACCAATTAATAATCAACTG                                         ]
[+] EMBL CD140531             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TACGTTTGTTCCTTCTTCTTACAGCCATCACGACACTTGTTATTTAACCAGTGAAATATATACCAGTATTAAGTGTTTTGTACATCCATTAATTTGAAATCAGCACAATAAAATTCCCAATATTTATTTGTGTATGTATGAATCACATGGAAATGAGTAGCTTTATTTCATGATATTTGATTATCCAATGACTTAATATGATAACGTACATATAAATATTTCTATCCTCTCTCACATCAGATTTCATCATAGTCGTTTAGTCTGTTT GTTTCAGAGAATTATGCTTCTATTTCTTCGTTGACCAGAAATTTCCTTATCTTATGAAACAGTTTATATATGTATGTACACTAACTTACATTCAACCAATTAATAATCAACTG                                         ]
[+] EMBL CD140699             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TACGTTTGTTCCTTCTTCTTACAGCCATCACAACACTTGTTATTTAACCAGTGAAATATATACCAGTATTAAGTGTTTTGTACATCCATTAATTTGAAATCAGCACAATAAAATTCCCAATATTTATTTGTGTATGTATGAATCACATGGAAATGAGTAGCTTTATTTCATGATATTTGATTATCCAATGACTTAATATGATAACGTACATATAAATATTTCTATCCTCTCTCACATCAGATTTCATCATAGTCGTTTAGTCTGTTT GTTTCAGAGAATTATGCTTCTATTTCTTCGTTGACCAGAAATTTCCTTATCTTATGAAACAGTTTATATATGTATGTACACTAACTTACATTCAACCAATTAATAATCAACTG                                         ]
[+] EMBL CD197147             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TACGTTTGTTCCTTCTTCTTACAGCCATCACAACACTTGTTATTTAACCAGTGAAATATATACCAGTATTAAGTGTTTTGTACATCCATTAA TTGAAATCAGCACAATAAAATTCCCAATATTTATTTGTGTATGTATGAATCACATGGAAATGAGTAGCTTTATTTCATGATATTTGATTATCCAATGACTTAATATGATAACGTACATATAAATATTTCTATCCTCTCTCACATCAGATTTCATCATAGTCGTTTAGTCTGTTT GTTTCAGAGAATTATGCTTCTATTTCTTCGTTGACCAGAAATTTCCTTATCTTATGAAACAGTTTACATATGTATGTACACTAACTTACATTCAACCAATTAATAATCAACTG                                         ]
[-] EMBL CD197216             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ACGTTTGTTCCTTCTTCTTACAGCCATCACAACACTTGTTATTTAACCAGTGAAATATATACCAGTATTAAGTGTTTTGTACATCCATTAA TTGAAATCAGCACAATAAAATTCCCAATATTTATTTGTGTATGTATGAATCACATGGAAATGAGTAGCTTTATTTCATGATATTTGATTATCCAATGACTTAATATGATAACGTACATATAAATATTTCTATCCTCTCTCACATCAGATTTCATCATAGTCGTTTAGTCTGTTT GTTTCAGAGAATTATGCTTCTATTTCTTCGTTGACCAGAAATTTCCTTATCTTATGAAACAGTTTATATATGTATGTACACTAACTTACATTCAACCAATTAATAATCAACTGTAGGTTTTA                                ]
[-] EMBL CD140686             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ACGTTTGTTCCTTCTTCTTACACCCATCACAACACTTGTTATTTAACCAGTGAAATATATACCAGTATTAAGTGTTTTGTACATCCATTAATTTGAAATCAGCACAATAAAATTCCCAATATTTATTTGTGTATGTATGAATCACATGGAAATGAGTAGCCTTATTTCATGATATTTGATTATCCAATGACTTAATATGATAACGTACATATAAATATTTCTATCCTCTCTCACATCAGATTTCATCATAGTCGTTTAGTCTGTTT GTTTCAGAGAATTATGCTTCTATTTCTTCGTTGACCAGAAATTTCCTTATCTTATGAAACAGTTTATATATGTATGTACACTAACTTACATTCAACCAATTAATAATCAACTGT                                        ]
[-] EMBL CD140609             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ACGTTTGTTCATTCTTCTTACACCCATCACAACACTTGTTATTTAACCAGTGAAATATATACCAGTATTAAGTGTTTTGTACATCCATTAATTTGAAATCAGCACAATAAAATTCCCAATATTTATTTGTGTATGTATGAATCACATGGAAATGAGTAGCTTTATTTCATGATATTTGATTATCCAATGACTTAATATGATAACGTACATATAAATATTTCTATCCTCTCTCACATCAGATTTCATCATAGTCGTTTAGTCTGTTT GTTTCAGAGAATTATGCTTCTATTTCTTCGTTGACCAGAAATTTCCTTATCTTATGAAACAGTTTATATATGTATGTACACTAACTTACATTCAACCAATTAATAATCAACTGT                                        ]
[-] EMBL CD196419             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CCATCACAACACTTGTTATTTAACCAGTGAAATATATACCAGTATTAAGTGTTTTGTACATCCATTAATTTGAAATCAGCACAATAAAATTCCCAATATTTATTTGTGTATGTATGAATCACATGGAAATGAGTAGCTTTATTTCATGATATTTGATTATCCAATGACTTAATATGATAACGTACATATAAATATTTCTATCCTCTCTCACATCAGATTTCATCATAGTCGTTTAGTCTGTTT GTTTCAGAGAATTATGCTTCTATTTCTTCGTTGACCAGAAATTTCCTTATCTTATGAAACAGTTTATATATGTATGTACGCTAACTTACATTCAACCAATTAATAATCAACTGT                                        ]


>consensus_9730#0 TACGAGCCAAGATTCGGCACGAGGCGTTCCTCAAATTTCTGATCAATCTGTAATTTCATC AAAGTCTGTTCATAGTTCATTATCGTCGAATAACAATGAAAATATGAAAATTGGTTCTGT TCCCAGTTCTGATTACTATACCAAAAATCACAACTACAAACCAATTACTACTACTACTTA TCGTCCGTTACGTCATCTGATTAATAACTGGCCTCCACCTCAACCAATCGATCCAATCCA AGTAACTGAATCTTATTGTACATAAATCTGGGCTATTCTGTCAAATGACTTGCTTTCCTC TATTTACTCCCCACCTCTTTCCTTCTCTCTCTGTTCTATGCTCCAATTCTGTGGTATTTC GTTTAATAACAATGACGAAATATCATTCTAAGACAAAATGTAGATTATTATTATTGATTG AGGACAGCAACAACATCATACAGAGTAGTTGAAATACGTTTGTTCCTTCTTCTTACAGCC ATCACAACACTTGTTATTTAACCAGTGAAATATATACCAGTATTAAGTGTTTTGTACATC CATTAATTTGAAATCAGCACAATAAAATTCCCAATATTTATTTGTGTATGTATGAATCAC ATGGAAATGAGTAGCTTTATTTCATGATATTTGATTATCCAATGACTTAATATGATAACG TACATATAAATATTTCTATCCTCTCTCACATCAGATTTCATCATAGTCGTTTAGTCTGTT TGTTTCAGAGAATTATGCTTCTATTTCTTCGTTGACCAGAAATTTCCTTATCTTATGAAA CAGTTTATATATGTATGTACACTAACTTACATTCAACCAATTAATAATCAACTGTAGGTT TTATCTCTTGAATTTTGCAACAGTAATACATGAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)