These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9803#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 11 consensus length = 905 fasta sequence [TCAGCCGTTCACGTTCATCCTGTGGTGTTAGCATCAATTGTCGATGCATACGAAAGACGCGCGGAAGGATCAGAGAGAGTTATTGGCACTCTCCTTGGTATGATAACGTTGTTTTCATGATTACCACAGGGACGTGGGGAAAAAGGATAACCGAAGTTACTCATTGCTACAGTGTTGTGCACCAAGAATCTGCGGT-CGATGTGTCCAT-GGACA-TAGAGTTCAAAAACAATATGACAGTTCTTGAGCGCAAAGTGAATCCCTCTCATAACATTGTTGGGTGGTATGCAACGGGGAATGAAATTCCAGAGACCCTCAAACTTATCCATCAAGATGTTTACATGCAGAAGTCAAAAAATGCAATCTTTTTAATGGTTGACACAAATATGACTATCGGGGACAAAATGGCCATAAAAGCTTACCTATGTAGAAAGATGGGTATTCCTGGGGGAACACAGGGCTTTATTTTTGTACCGGTGGAGGTAGAAGTCGAGTGTTACGGTGCAGAACGTTGTGCCGTTGAAATGATGGTGTCTTCTATTGATCCAAGGAGTAAATTAGAGCCTGAACTTGGAGATGACATGGTCTATCTGTATCAACTTTCACAACATCTGCTAACTATGTTGGATCAGGTCATTCGTTATGTTGAAAATGTTATCGATAACAAATGTCCAGCTGACCCCAAAATTGGGAGGTCCATAGCACAGTTAATTTTCTCAATCCCCAAATTAGACCCTGATCATTTGGAGCAACTGATCAACTCGAGCTATAAAGATTTGCTGATGATCACTTACCTCACTAATCTTATCCGGACGCATCTAAAGATTTTAAATCTGGCCCAGTGAACATTCCCATTTCAAGTAAATTTTCTCAATGTTGAACAGAGTATCCAGCTGTAAACGCTTACA] [-] EMBL BG930584 [TCAGCCGTTCACGTTCATCCTGTGGTGTTAGCATCAATTGTCGATGCATACGAAAGACGCGCGGAAGGATCAGAGAGAGTTATTGGCACTCTCCTTGGTATGATAACGTTGTTTTCATGATTACCACAGGGACGTGGGGAAAAAGGATAACCGAAGTTACTCATTGCTACAGTGTTGTGCACCAAGAATCTGCGGT CGATGTGTCCAT GGACA TAGAGTTCAAAAACAATATGACAGTTCTTGAGCGCAAAGTGAATCCCTCTCATAACATTGTTGGGTGGTATGCAACGGGGAATGAAATTCCAGAGAt ] [+] EMBL CD077750 [ gcacgaggGGTCCGATGTGTCCATGGGACATTAGAGTTCAAAAACAATATGACAGTTCTTGAGCGCAAAGTGAATCCCTCTCATAACATTGTTGGGTGGTATGCAACGGGGAATGAAATTCCAGAGACCCTCAAACTTATCCATCAAGATGTTTACATGCAGAAGTCAAAAAATGCAATCTTTTTAATGGTTGACACAAATATGACTATCGGGGACAAAATGGCCATAAAAGCTTACCTATGTAGAAAGATGGGTATTCCTGGNGGAACACAGGGCTTTATTTTTGTACCGGTGGAGGTAGA ] [+] EMBL CD116001 [ GTTCAAAAACAATGTGACAGTTCTTGAGCGCAAAGTGAATCCCTCTCATAACATTGTTGGGTGGTATGCAACGGGGAATGAAATTCCAGAGACCCTCAAACTTATCCATCAAGATGTTTACATGCAGAAGTCAAAAAATGCAATCTTTTTAATGGTTGACACAAATATGACTATCGGGGACAAAATGGCCATAAAAGCTTACCTATGTAGAAAGATGGGTATTCCTGGGGGAACACAGGGCTTTATTTTTGTACCGGTGGAGGTAGAAGTCGAGTGTTACGGTGCAGAACGTTGTGCCGTTGAAATGATGGTGTCTTCTATTGATCCAAGGAGTAAATTAGAGCCTGAACTTGGAGATGACATGGTCTATCTGTATCAACTTTCACAACATCTGCTAACTATGTTGGATCAGGTCATTCGTTATGTTGAAAATGTTATCGATAACAA ] [+] EMBL CD116025 [ GTTCAAAAACAATGTGACAGTTCTTGAGCGCAAAGTGAATCCCTCTCATAACATTGTTGGGTGGTATGCAACGGGGAATGAAATTCCAGAGACCCTCAAACTTATCCATCAAGATGTTTACATGCAGAAGTCAAAAAATGCAATCTTTTTAATGGTTGACACAAATATGACTATCGGGGACAAAATGGCCATAAAAGCTTACCTATGTAGAAAGATGGGTATTCCTGGGGGAACACAGGGCTTTATTTTTGTACCGGTGGAGGTAGAAGTCGAGTGTTACGGTGCAGAACGTTGTGCCGTTGAAATGATGGTGTCTTCTATTGATCCAAGGAGTAAATTAGAGCCTGAACTTGGAGATGACATGGTCTATCTGTATCAACTTTCACAACATCTGCTAACTATGTTGGATCAGGTCATTCGTTATGTTGAAAATGTTATCGATAACAA ] [-] EMBL CD134295 [ TGAACTTGGAGATGACATGGTCTATCTGTATCAACTTTCACAACATCTGCTAACTATGTTGGATCAGGTCATTCGTTATGTTGAAAATGTTATCGATAACAAATGTCCAGCTGACCCCANAATTGGGAGGTCCATAGCACAGTTAATTTTCTCAATCCCCAAATTAGACCCTGATCATTTGGAGCAACTGATCAACTCGAGCTATAAAGATTTGCTGATGATCACTTACCTCACTAATCTTATCCGGACGCATCTAAAGATTTTAAATCTGGCCCAGTGAACATTCCCATTTCAAGTAAATTTTCTCAATGTTGAACAGAGTATCCAGCTGTAAA ] [+] EMBL CD195444 [ TGACATGGTCTATCTGTATCAACTTTCACAACATCTGCTAACTATGTTGGATCAGGTCATTCGTTATGTTGAAAATGTTATCGATAACAAATGTCCAGCTGACCCCAAAATTGGGAGGTCCATAGCACAGTTAATTTTCTCAATCCCCAAATTAGACCCTGATC ] [+] EMBL CD161349 [ ATGGTCTATCTGTACCAACTTTCACAACATCTGCTAACTATGTTGGATCAGGTCATTCGTTATGTTGAAAATGTTATCGATAACAAATGTCCAGCTGACCCCAAAATTGGGAGGTCCATAGCACAGTTAATTTTCTCAATCCCCAAATTAGACCCTGATCATTTGG ] [-] EMBL CD120948 [ GGTCTATCTGTATCAACTTTCACAACATCTGCTAACTATGTTGGATCAGGTCATTCGTTATGTTGAAAATGTTATCGATAACAAATGTCCAGCTGACCCCAAAATTGGGAGGTCCATAGCACAGTTAATTTTCTCAATCCCCAAATTAGACCCTGATCATTTGGAGCAACTGATCAACTCGAGCTATAAAGATTTGCTGATGATCACTTACCTCACTAATCTTATCCGGACGCATCTAAAGATTTTAAATCTGGCCCAGTGAACATTCCCACTTCAAGTAAATTTTCTCAATGTTGAACAGAGTATCCAGCTGTAAACGCTTACA] [+] EMBL CD147979 [ GGTCTATCTGTATCAACTTTCACAACATCTGCTAACTATGTTGGATCAGGTCATTCGTTATGTTGAAAATGTTATCGATAACAAATGTCCAGCTGACCCCAAAATTGGGAGGTCCATAGCACAGTTAATTTTCTCAATCCCCAAATTAGACCCTGATCATTTGGAGCAACTGATCAACTCGAGCTATAAAGATTTGCTGATGATCACTTACCTCACTAATCTTATCCGGACGCATCTAAAGATTTTAAATCTGGCCAAGgt ] [+] EMBL SMRAP125 [ TCACAACATCTGNTANCTATGTTGGATCAGGTCATTCGTTATGTTGAAAATGTTATCGATAACAAATGTCCAGCTGACCCCAANATTGGGAGGTCCATAGCACAGTTANTTTTCTCAATCCCCAAATTAGACCCTGATCA ] [+] EMBL SMRAP095 [ CACAACATCTGNTAACTATGTTGGGTCAGGTCATTCGTTATGTTGAAAATGTTATCGATAACAAATGTCCAGCTGACCCCAAAATTGGGAGGTCCATAGCACAGTTANTTTTCTCAANCCCCAAATTAGACCCTGATCA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||