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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9803#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 11 consensus length = 905 fasta sequence
[TCAGCCGTTCACGTTCATCCTGTGGTGTTAGCATCAATTGTCGATGCATACGAAAGACGCGCGGAAGGATCAGAGAGAGTTATTGGCACTCTCCTTGGTATGATAACGTTGTTTTCATGATTACCACAGGGACGTGGGGAAAAAGGATAACCGAAGTTACTCATTGCTACAGTGTTGTGCACCAAGAATCTGCGGT-CGATGTGTCCAT-GGACA-TAGAGTTCAAAAACAATATGACAGTTCTTGAGCGCAAAGTGAATCCCTCTCATAACATTGTTGGGTGGTATGCAACGGGGAATGAAATTCCAGAGACCCTCAAACTTATCCATCAAGATGTTTACATGCAGAAGTCAAAAAATGCAATCTTTTTAATGGTTGACACAAATATGACTATCGGGGACAAAATGGCCATAAAAGCTTACCTATGTAGAAAGATGGGTATTCCTGGGGGAACACAGGGCTTTATTTTTGTACCGGTGGAGGTAGAAGTCGAGTGTTACGGTGCAGAACGTTGTGCCGTTGAAATGATGGTGTCTTCTATTGATCCAAGGAGTAAATTAGAGCCTGAACTTGGAGATGACATGGTCTATCTGTATCAACTTTCACAACATCTGCTAACTATGTTGGATCAGGTCATTCGTTATGTTGAAAATGTTATCGATAACAAATGTCCAGCTGACCCCAAAATTGGGAGGTCCATAGCACAGTTAATTTTCTCAATCCCCAAATTAGACCCTGATCATTTGGAGCAACTGATCAACTCGAGCTATAAAGATTTGCTGATGATCACTTACCTCACTAATCTTATCCGGACGCATCTAAAGATTTTAAATCTGGCCCAGTGAACATTCCCATTTCAAGTAAATTTTCTCAATGTTGAACAGAGTATCCAGCTGTAAACGCTTACA]
[-] EMBL BG930584 [TCAGCCGTTCACGTTCATCCTGTGGTGTTAGCATCAATTGTCGATGCATACGAAAGACGCGCGGAAGGATCAGAGAGAGTTATTGGCACTCTCCTTGGTATGATAACGTTGTTTTCATGATTACCACAGGGACGTGGGGAAAAAGGATAACCGAAGTTACTCATTGCTACAGTGTTGTGCACCAAGAATCTGCGGT CGATGTGTCCAT GGACA TAGAGTTCAAAAACAATATGACAGTTCTTGAGCGCAAAGTGAATCCCTCTCATAACATTGTTGGGTGGTATGCAACGGGGAATGAAATTCCAGAGAt ]
[+] EMBL CD077750 [ gcacgaggGGTCCGATGTGTCCATGGGACATTAGAGTTCAAAAACAATATGACAGTTCTTGAGCGCAAAGTGAATCCCTCTCATAACATTGTTGGGTGGTATGCAACGGGGAATGAAATTCCAGAGACCCTCAAACTTATCCATCAAGATGTTTACATGCAGAAGTCAAAAAATGCAATCTTTTTAATGGTTGACACAAATATGACTATCGGGGACAAAATGGCCATAAAAGCTTACCTATGTAGAAAGATGGGTATTCCTGGNGGAACACAGGGCTTTATTTTTGTACCGGTGGAGGTAGA ]
[+] EMBL CD116001 [ GTTCAAAAACAATGTGACAGTTCTTGAGCGCAAAGTGAATCCCTCTCATAACATTGTTGGGTGGTATGCAACGGGGAATGAAATTCCAGAGACCCTCAAACTTATCCATCAAGATGTTTACATGCAGAAGTCAAAAAATGCAATCTTTTTAATGGTTGACACAAATATGACTATCGGGGACAAAATGGCCATAAAAGCTTACCTATGTAGAAAGATGGGTATTCCTGGGGGAACACAGGGCTTTATTTTTGTACCGGTGGAGGTAGAAGTCGAGTGTTACGGTGCAGAACGTTGTGCCGTTGAAATGATGGTGTCTTCTATTGATCCAAGGAGTAAATTAGAGCCTGAACTTGGAGATGACATGGTCTATCTGTATCAACTTTCACAACATCTGCTAACTATGTTGGATCAGGTCATTCGTTATGTTGAAAATGTTATCGATAACAA ]
[+] EMBL CD116025 [ GTTCAAAAACAATGTGACAGTTCTTGAGCGCAAAGTGAATCCCTCTCATAACATTGTTGGGTGGTATGCAACGGGGAATGAAATTCCAGAGACCCTCAAACTTATCCATCAAGATGTTTACATGCAGAAGTCAAAAAATGCAATCTTTTTAATGGTTGACACAAATATGACTATCGGGGACAAAATGGCCATAAAAGCTTACCTATGTAGAAAGATGGGTATTCCTGGGGGAACACAGGGCTTTATTTTTGTACCGGTGGAGGTAGAAGTCGAGTGTTACGGTGCAGAACGTTGTGCCGTTGAAATGATGGTGTCTTCTATTGATCCAAGGAGTAAATTAGAGCCTGAACTTGGAGATGACATGGTCTATCTGTATCAACTTTCACAACATCTGCTAACTATGTTGGATCAGGTCATTCGTTATGTTGAAAATGTTATCGATAACAA ]
[-] EMBL CD134295 [ TGAACTTGGAGATGACATGGTCTATCTGTATCAACTTTCACAACATCTGCTAACTATGTTGGATCAGGTCATTCGTTATGTTGAAAATGTTATCGATAACAAATGTCCAGCTGACCCCANAATTGGGAGGTCCATAGCACAGTTAATTTTCTCAATCCCCAAATTAGACCCTGATCATTTGGAGCAACTGATCAACTCGAGCTATAAAGATTTGCTGATGATCACTTACCTCACTAATCTTATCCGGACGCATCTAAAGATTTTAAATCTGGCCCAGTGAACATTCCCATTTCAAGTAAATTTTCTCAATGTTGAACAGAGTATCCAGCTGTAAA ]
[+] EMBL CD195444 [ TGACATGGTCTATCTGTATCAACTTTCACAACATCTGCTAACTATGTTGGATCAGGTCATTCGTTATGTTGAAAATGTTATCGATAACAAATGTCCAGCTGACCCCAAAATTGGGAGGTCCATAGCACAGTTAATTTTCTCAATCCCCAAATTAGACCCTGATC ]
[+] EMBL CD161349 [ ATGGTCTATCTGTACCAACTTTCACAACATCTGCTAACTATGTTGGATCAGGTCATTCGTTATGTTGAAAATGTTATCGATAACAAATGTCCAGCTGACCCCAAAATTGGGAGGTCCATAGCACAGTTAATTTTCTCAATCCCCAAATTAGACCCTGATCATTTGG ]
[-] EMBL CD120948 [ GGTCTATCTGTATCAACTTTCACAACATCTGCTAACTATGTTGGATCAGGTCATTCGTTATGTTGAAAATGTTATCGATAACAAATGTCCAGCTGACCCCAAAATTGGGAGGTCCATAGCACAGTTAATTTTCTCAATCCCCAAATTAGACCCTGATCATTTGGAGCAACTGATCAACTCGAGCTATAAAGATTTGCTGATGATCACTTACCTCACTAATCTTATCCGGACGCATCTAAAGATTTTAAATCTGGCCCAGTGAACATTCCCACTTCAAGTAAATTTTCTCAATGTTGAACAGAGTATCCAGCTGTAAACGCTTACA]
[+] EMBL CD147979 [ GGTCTATCTGTATCAACTTTCACAACATCTGCTAACTATGTTGGATCAGGTCATTCGTTATGTTGAAAATGTTATCGATAACAAATGTCCAGCTGACCCCAAAATTGGGAGGTCCATAGCACAGTTAATTTTCTCAATCCCCAAATTAGACCCTGATCATTTGGAGCAACTGATCAACTCGAGCTATAAAGATTTGCTGATGATCACTTACCTCACTAATCTTATCCGGACGCATCTAAAGATTTTAAATCTGGCCAAGgt ]
[+] EMBL SMRAP125 [ TCACAACATCTGNTANCTATGTTGGATCAGGTCATTCGTTATGTTGAAAATGTTATCGATAACAAATGTCCAGCTGACCCCAANATTGGGAGGTCCATAGCACAGTTANTTTTCTCAATCCCCAAATTAGACCCTGATCA ]
[+] EMBL SMRAP095 [ CACAACATCTGNTAACTATGTTGGGTCAGGTCATTCGTTATGTTGAAAATGTTATCGATAACAAATGTCCAGCTGACCCCAAAATTGGGAGGTCCATAGCACAGTTANTTTTCTCAANCCCCAAATTAGACCCTGATCA ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||