cluster # 9825

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Schistosoma mansoni
cluster # 9825 cluster # 9825 Sequences # 11 consensus # 3

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consensus_9825#0 length = 879 sequences # 4

consensus_9825#1 length = 878 sequences # 5
consensus_9825#2 length = 787 sequences # 2

consensusID : consensus_9825#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 879
fasta sequence

                              [CCCCGGAGCCATATTCGGCACGAGGATTTGACCGATTTTGGAAATATCTATGGATTGTCGTGGCGATGTACCAATCGTTTTACGACTGTTTGACCTTTAAGTGCTCAGTAACCTACATCAATGAATGAAGCCACTGGGTCGTTGCCGAAGTCATCTGATCGTGAGTCTAGGCTAAAAGCCATTAAGTCAGCTGTCGGGATTATACCAGATTTCCCAAAACAGGGCATTATTTTCTGGGACTTTTTTGGCGTTTTCAGAGACCCTGTTTTAACTCAATATCTATTGGATGAGTTATATTATGTGGCTACATCCGAGATAGAGCGTAAATTTACAAAAATCAACGTTGTTGTGGGTCTTGAGTCACGTGGTTTTTTACTTGGACCAGCACTTGCCCTTCGTCTGAACTGCCCTTTCGTCCCTATTCGGAAAGCAGGAAAACTCCCAGGTCCTTGTTTCTCTTATAAATACGAATTGGAATATGGAAGTAGCATTGTAGAAATTCAAAAGGATGTTCTCAAACCTGATGATAATGTAGTTCTTTTTGATGATGTTTTGGCCACTGGTGGAAGCCTTGAAGCTGGTGTAAAATTAATAAACTTATCTGGAGCTAGAATCCTATCCAGTTTGTTGTTTGTGGAACTGAAAGGTTTGGGTGGACGTAAAAGGATAGAAGATCTTGACGTACCTGTTCACACACTCTTTCAAGCTTAAACACTACTTCTGTANAAAGTATCCTTTCTTAATTCCTNCCTTTCTACTATTAAATGTAGTTTATTTTTCCGACTGACCTTAAGTACTGAAATATCGTCCTATTAAATAATAGACTGTAGCTAGTTATGAAATGTCATACTTCGAAATACCTAGTTAATAAAGTTCAGT]

[+] EMBL CD081607             [CCCCGGAGCCATATTCGGCACGAGGATTTGACCGATTTTGGAAATATCTATGGATTGTCGTGGCGATGTACCAATCGTTTTACGACTGTTTGACCTTTAAGTGCTCAGTAACCTACATCAATGAATGAAGCCACTGGGTCGTTGCCGAAGTCATCTGATCGTGAGTCTAGGCTAAAAGCCATTAAGTCAGCTGTCGGGATTATACCAGATTTCCCAAAACAGGGCATTATTTTCTGGGACTTTTTTGGCGTTTTCAGAGACCCTGTTTTAACTCAATATCTATTGGATGAGTTATATTATGTGGCTACATCCGAGATAGAGCGTAAATTTACAAAAATCAACGTTGTTGTGGGTCTTGAGTCACGTGGTTTTTTACTTGGACCAGCACTTGCCCTTCGTCTGAACTGCCCTTTCGTCCCTATTCGGAAAGCAGGAAAACTCCCAGGTCCTTGTTTCTCTTATAAATACGAATTGGAATATGGAAGTAGCATTGTAGAAATTCAAAAGGATGTTCTCAAACCTGATGATAATGTAGTTCTTTTTGATGATGTTTTGGCCACTGGTGGAAGCCTTGAAGCTGGTGTAAAATTAATAAACTTATCTGGAGCTAGAATCCTATCCAGTTTGTTGTTTGTGGAACTGAAAGGTTTGGGTGGACGTAAAAGGATAGAAGATCTTGACGTACCTGTTCACACACTCTTTCAAGCTTAAACACTACTTCTGTANAAAGTATCCTTTCTTAATTCCTNCCTTTCTACTATTAAATGTAGTTTATTTTTCCGACTGACCTTAAGTACTGAAATATCGTCCTATTAAATAATAGACTGTAGCTAGTTATGAAATGTCATACTTCGAAATACCTAGTTAATAAAGTTCAG ]
[+] EMBL CD154999             [                                 GATTTTGGAAATATCTATGGATTGTCGTGGCGATGTACCAATCGTTTTACGACTGTTTGACCTTTAAGTGCTCAGTAACCTACATCAATGAATGAAGCCACTGGGTCGTTGCCGAAGTCATCTGATCGTGAGTCTAGGCTAAAAGCCATTAAGTCAGCTGTCGGGATTATACCAGATTTCCCAAAACAGGGCATTATTTTCTGGGACTTTTTTGGCGTTTTCAGAGACCCTGTTTTAACTCAATATCTATTGGATGAGTTATATTATGTGGCTACATCCGAGATAGAGCGTAAATTTACAAAAATCAACGTTGTTGTGGGTCTTGAGTCACG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL AI977246             [                                                                                                                                                            GATCGTGAGTCTAGGCTAAAAGCCATTAAGTCAGCTGTCGGGATTATACCAGATTTCCCAAAACAGGGCATTATTTTCTGGGACTTTTTTGGCGTTTTCAGAGACCCTGTTTTAACTCAATATCTATTGGATGAGTTATATTATGTGGCTACATCCGAGATAGAGCGTAAATTTACAAAAATCAACGTTGTTGTGGGTCTTGAGTCACGTGGTTTTTTACTTGGACCAGCACTTGCCCTTCGTCTGAACTGCCCTGTCGTCCCTATTCGGAAAGCAGGAAAACTCCCAGGTCCTTGTTTCTCTTATAAATACGAATTGGAATATGGAAGTAGCATTGTAGAAATTCAAAAGGATGTTCTCAAACCTGATGATAATGTAGTTCTTTTTGATGATGTTTTGGCCACTGGTGGAAGCCTTGAAGCTGGTGTAAAATTAATAAACTTATCTGGAGCTAGAATCCTATCCAGT                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD075430             [                                                                                                                                                                                                                                                                    CCCTGTTTTAACTCAATATCTATTGGATGAGTTATATTATGTGGCTACATCCGAGATAGAGCGTAAATTTACAAAAATCAACGTTGTTGTGGGTCTTGAGTCACGTGGTTTTTTACTTGGACCAGCACTTGCCCTTCGTCTGAACTGCCCTTTCGTCCCTATTCGGAAAGCAGGAAAACTCCCAGGTCCTTGTTTCTCTTATAAATACGAATTGGAATATGGAAGTAGCATTGTAGAAATTCAAAAGGATGTTCTCAAACCTGATGATAATGTAGTTCTTTTTGATGATGTTTTGGCCACTGGTGGAAGCCTTGAAGCTGGTGTAAAATTAATAAACTTATCTGGAGCTAGAATCCTATCCAGTTTGTTGTTTGTGGAACTGAAAGGTTTGGGTGGACGTAAAAGGATAGAAGATCTTGACGTACCTGTTCACACACTCTTTCAAGCTTAAACACTACTTCTGTAAAAAGTATCCTTTCTTAATTCCTCCCTTTCTACTATTAAATGTAGTTTATTTTTCCGACTGACCTTAAGTACTGAAATATCGTCCTATTAAATAATAGACTGTAGCTAGTTATGAAATGTCATACTTCGAAATACCTAGTTAATAAAGTTCAGT]




>consensus_9825#0
CCCCGGAGCCATATTCGGCACGAGGATTTGACCGATTTTGGAAATATCTATGGATTGTCG
TGGCGATGTACCAATCGTTTTACGACTGTTTGACCTTTAAGTGCTCAGTAACCTACATCA
ATGAATGAAGCCACTGGGTCGTTGCCGAAGTCATCTGATCGTGAGTCTAGGCTAAAAGCC
ATTAAGTCAGCTGTCGGGATTATACCAGATTTCCCAAAACAGGGCATTATTTTCTGGGAC
TTTTTTGGCGTTTTCAGAGACCCTGTTTTAACTCAATATCTATTGGATGAGTTATATTAT
GTGGCTACATCCGAGATAGAGCGTAAATTTACAAAAATCAACGTTGTTGTGGGTCTTGAG
TCACGTGGTTTTTTACTTGGACCAGCACTTGCCCTTCGTCTGAACTGCCCTTTCGTCCCT
ATTCGGAAAGCAGGAAAACTCCCAGGTCCTTGTTTCTCTTATAAATACGAATTGGAATAT
GGAAGTAGCATTGTAGAAATTCAAAAGGATGTTCTCAAACCTGATGATAATGTAGTTCTT
TTTGATGATGTTTTGGCCACTGGTGGAAGCCTTGAAGCTGGTGTAAAATTAATAAACTTA
TCTGGAGCTAGAATCCTATCCAGTTTGTTGTTTGTGGAACTGAAAGGTTTGGGTGGACGT
AAAAGGATAGAAGATCTTGACGTACCTGTTCACACACTCTTTCAAGCTTAAACACTACTT
CTGTANAAAGTATCCTTTCTTAATTCCTNCCTTTCTACTATTAAATGTAGTTTATTTTTC
CGACTGACCTTAAGTACTGAAATATCGTCCTATTAAATAATAGACTGTAGCTAGTTATGA
AATGTCATACTTCGAAATACCTAGTTAATAAAGTTCAGT

consensusID : consensus_9825#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 878
fasta sequence

                              [TCGCAGCCACGATTCGGCACGAGGATTTTTTGAAATGTCTGATCGCGAGTCTAGACTTAGAG-CT-TCGAGTCAGCCATCAGGGTTGTGCCGAATTTTCCACAGAAAGGCATTCTTTTCCGTGACTTCTTTGGAGTTCTCATGAATCCTGTCTTAACTCAATACCTATTGGATGAATTATATTATGTGGCTACATCCGAGGCAGCTCGTAAATGTAAAAAAATAGACGTTGTTGTGGGCCTCGAGTCGCGCGGCTTTCTTCTTGGACCAGCTCTTGCCCTTCGTCTGAACTGCGCCTTCGTCCCTATTCGGAAAGCAGGAAAACTTCCAGGTCCTTGTTTCTCTCATCGATATACATTGGAATATGGAACTGATACTGTAGATATGCCAAAGGATGTTATCAATGCTGGCGATAATATATTATTATTGGACGATGTTTTAGCTACTGGTGGAAGTCTTGAAGCTTGTGTTAATCTGGTAAACCTATCTGGAGCTAAGGTTTTATTCAGCTTGGTGTATATGGAACTAAATAATCTGTCTGGACGTAAAAGGCTAGAAGATCTTAACGTTCCTGTTTATTCACTTTTCAACATTTGAACATGATGCCTTGTGTAGAAATGCCTTATCCTTTCATAATTCGTGCCCTTTTTATTACTTGACACCAGTTATTTTTTCCTGCATATCTGAAATACTGAAATACTTTTTATCTAATAAAGCATAACATGTTGTTGGTTGTGGAGTGTATCTCTTAAGTAATTGGGTTCACTTCTGTATGTAGATGCTGATTTTAGCTGACTAACTTTCCCATCATTTTGATTTCAACTGTTTGGAGACTTTGCTTGTATTATCAATGAACGTTATTTTAAAAAAAGAATGGAGTC]

[+] EMBL CD077619             [TCGCAGCCACGATTCGGCACGAGGATTTTTTGAAATGTCTGATCGCGAGTCTAGACTTAGAG CTATCGAGTCAGCCATCAGGGTTGTGCCGAATTTTCCACAGAAAGGCATTCTTTTCCGTGACTTCTTTGGAGTTCTCATGAATCCTGTCTTAACTCAATACCTATTGGATGAATTATATTATGTGGCTACATCCGAGGCAGCTCGTAAATGTAAAAAAATAGACGTTGTTGTGGGCCTCGAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD127260             [                                          tagtagGTCTAGACTTANAGTCT TCGAGTCAGCCATCAGGGTTGCGCCCAATTTTCCACAGAAAGGCATTCTTTTCCGTGACTTCTTTGGAGTTCTCATGAATCCTGTCTTAACTCAATACCTATTGGATGAATTATATTATGTGGCTACATCCGAGGCAGCTCGTAAATGTAAAAAAATAGACGTTGTTGTGGGCCTCGAGTCGCGCGGCTTTCTTCTTGGACCAGCTCTTGCCCTTCGTCTGAACTGCGCCTTCGTCCCTATTCGGAAAGCAGGAAAACTTCCAGGTCCTTGTTTCTCTCATCGATATACATTGGAATATGGAACTGATACTGTAGATATGCCAAAGGATGTTATCAATGCTGGCGATAATATATTATTATTGGACGATGTTTTAGCTACTGGTGGAAGTCTTGAAGCTTGTGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD127288             [                                                            AG CTATCGAGTCAGCCATCAGGGTTGTGCCGAATTTTCCACAGAAAGGCATTCTTTTCCGTGACTTCTTTGGAGTTCTCATGAATCCTGTCTTAACTCAATACCTATTGGATGAATTATATTATGTGGCTACATCCGAGGCAGCTCGTAAATGTAAAAAAATAGACGTTGTTGTGGGCCTCGAGTCGCGCGGCTTTCTTCTTGGACCAGCTCTTGCCCTTCGTCTGAACTGCGCCTTCGTCCCTATTCGGAAAGCAGGAAAACTTCCAGGTCCTTGTTTCTCTCATCGATATACATTGGAATATGGAACTGATACTGTAGATATGCCAAAGGATGTTATCAATGCTGGCGATAATATATTATTATTGGACGATGTTTGAGCTACTGGTGGAAGTCTTGAAGCTAATGTTAATCTGGTAAACC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD084186             [                                                                                    acgaggCGAATTTTCCACAGAAAGGCATTCTTTTCCGTGACTTCTTTGGAGTTCTCATGAATCCTGTCTTAACTCAATACCTATTGGATGAATTATATTATGTGGCTACATCCGAGGCAGCTCGTAAATGTAAAAAAATAGACGTTGTTGTGGGCCTCGAGTCGCGCGGCTTTCTTCTTGGACCAGCTCTTGCCCTTCGTCTGAACTGCGCCTTCGTCCCTATTCGGAAAGCAGGAAAACTTCCAGGTCCTTGTTTCTCTCATCGATATACATTGGAATATGGAACTGATACTGTAGATATGCCAAAGGATGTTATCAATGCTGGCGATAATATATTATTATTGGACGATGTTTTAGCTACTGGTGGAAGTCTTGAAGCTTGTGTTAATCTGGTAAACCTATCTGGAGCTAAGGTTTTATTCAGCTTGGTGTATATGGAACTAAATAATCTGTCTGGACGTAAAAGGCTAGAAGATCTTAACGTTCCTGTTTATTCACTTTTCAACATTTGAACATGATGCCTTGTGTAGAAATGCCTTATCCTT                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL AW017168             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CATTGGAATATGGAACTGATACTGTAGATATGCCAAAGGATGTTATCAATGCTGGCGATAATATATTATTATTGGACGATGTTTTAGCTACTGGTGGAAGTCTTGAAGCTTGTGTTAATCTGGTAAACCTATCTGGAGCTAAGGTTTTATTCAGCTTGGTGTATATGGAACTAAATAATCTGTCTGGACGTAAAAGGCTAGAAGATCTTAACGTTCCTGTTTATTCACTTTTCAACATTTGAACATGATGCCTTGTGTAGAAATGCCTTATCCTTTCATAATTCGTGCCCTTTTTATTACTTGACACCAGTTATTTTTTCCTGCATATCTGAAATACTGAAATACTTTTTATCTAATAAAGCATAACATGTTGTTGGTTGTGGAGTGTATCTCTTAAGTAATTGGGTTCACTTCTGTATGTAGATGCTGATTTTAGCTGACTAACTTTCCCATCATTTTGATTTCAACTGTTTGGAGACTTTGCTTGTATTATCAATGAACGTTATTTTAAAAAAAGAATGGAGTC]




>consensus_9825#1
TCGCAGCCACGATTCGGCACGAGGATTTTTTGAAATGTCTGATCGCGAGTCTAGACTTAG
AGCTTCGAGTCAGCCATCAGGGTTGTGCCGAATTTTCCACAGAAAGGCATTCTTTTCCGT
GACTTCTTTGGAGTTCTCATGAATCCTGTCTTAACTCAATACCTATTGGATGAATTATAT
TATGTGGCTACATCCGAGGCAGCTCGTAAATGTAAAAAAATAGACGTTGTTGTGGGCCTC
GAGTCGCGCGGCTTTCTTCTTGGACCAGCTCTTGCCCTTCGTCTGAACTGCGCCTTCGTC
CCTATTCGGAAAGCAGGAAAACTTCCAGGTCCTTGTTTCTCTCATCGATATACATTGGAA
TATGGAACTGATACTGTAGATATGCCAAAGGATGTTATCAATGCTGGCGATAATATATTA
TTATTGGACGATGTTTTAGCTACTGGTGGAAGTCTTGAAGCTTGTGTTAATCTGGTAAAC
CTATCTGGAGCTAAGGTTTTATTCAGCTTGGTGTATATGGAACTAAATAATCTGTCTGGA
CGTAAAAGGCTAGAAGATCTTAACGTTCCTGTTTATTCACTTTTCAACATTTGAACATGA
TGCCTTGTGTAGAAATGCCTTATCCTTTCATAATTCGTGCCCTTTTTATTACTTGACACC
AGTTATTTTTTCCTGCATATCTGAAATACTGAAATACTTTTTATCTAATAAAGCATAACA
TGTTGTTGGTTGTGGAGTGTATCTCTTAAGTAATTGGGTTCACTTCTGTATGTAGATGCT
GATTTTAGCTGACTAACTTTCCCATCATTTTGATTTCAACTGTTTGGAGACTTTGCTTGT
ATTATCAATGAACGTTATTTTAAAAAAAGAATGGAGTC

consensusID : consensus_9825#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 787
fasta sequence

                              [CTTGGTACGAAGCCTTGCCGAAGTCATCTGATCGTGAGTCTAGGTTAAAAGCCATTAAGTCAGCTGTCGGGATTATACCAGATTTCCCAAAACAGGGCATTATTTTCTGGGACTTTTTTGGCGTTTTCAGAGACCCTGTTTTAACTCAATATCTATTGGATGAGTTATATTATGTGGCTACATCCGAGATAGAGCGTAAATTTACAGTAAGCTACGTTGCACTCGATC-TATTGTACGTTAGAAAATCAACGTTGTTGTGGGTCTTGAGTCACGTGGTTTTTTACTTGGACCAGCACTTGCCCTTCGTCTGAACTGCCCTTTCGTCCCTATTCGGAAAGCAGGAAAACTCCCAGGTCCTTGTTTCTCTTATAAATACGAATTGGAATATGGAAGTAGCATTGTAGAAATTCAAAAGGATGTTCTCAAACCTGATGATAATGTAGTTCTTTTTGATGATGTTTTGGCCACTGGTGGAAGCCTTGAAGCTGGTGTAAAATTAATAAACTTATCTGGAGCTAGAATCCTATCCAGTTTGTTGTTTGTGGAACTGAAAGGTTTGGGTGGACGTAAAAGGATAGAAGATCTTGACGTACCTGTTCACACACTCTTTCAAGCTTAAACACTACTTCTGTAAAAAGTATCCTTTCTTAATTCCTNCCTTTCTACTATTAAATGTAGTTTATTTTTCCGACTGACCTTAAGTACTGAAATATCGTCCTATTAAATAATAGACTGTAGCTAGTTATGAAATGTCATACTTCGAAATACCTAGTTAATAAAGTTCAGT]

[+] EMBL CD082240             [CTTGGTACGAAGCCTTGCCGAAGTCATCTGATCGTGAGTCTAGGTTAAAAGCCATTAAGTCAGCTGTCGGGATTATACCAGATTTCCCAAAACAGGGCATTATTTTCTGGGACTTTTTTGGCGTTTTCAGAGACCCTGTTTTAACTCAATATCTATTGGATGAGTTATATTATGTGGCTACATCCGAGATAGAGCGTAAATTTACAGTAAGCTACGTTGCACTCGATC TATTGTACGTTAGAAAATCAACGTTGTTGTGGGTCTTGAGTCACGTGGTTTTTTACTTGGACCAGCACTTGCCCTTCGTCTGAACTGCCCTTTCGTCCCTATTCGGAAAGCAGGAAAACTCCCAGGTCCTTGTTTCTCTTATAAATACGAATTGGAATATGGAAGTAGCATTGTAGAAATTCAAAAGGATGTTCTCAAACCTGATGATAATGTAGTTCTTTTTGATGATGTTTTGGCCACTGGTGGAAGCCTTGAAGCTGGTGTAAAATTAATAAACTTATCTGGAGCTAGAATCCTATCCAGTTTGTTGTTTGTGGAACTGAAAGGTTTGGGTGGACGTAAAAGGATAGAAGATCTTGACGTACCTGTTCACACACTCTTTCAAGCTTAAACACTACTTCTGTAAAAAGTATCCTTTCTTAATTCCTNCCTTTCTACTATTAAATGTAGTTTATTTTTCCGACTGACCTTAAGTACTGAAATATCG                                                                        ]
[-] EMBL CD075849             [                                                                                                                                                                      ATATTATGTGGCTACATCCGAGATAGAGCGTAAATTTACAGTAAGCTACGTTGCACTCGATCNTATTGTACGTTAGAAAATCAACGTTGTTGTGGGTCTTGAGTCACGTGGTTTTTTACTTGGACCAGCACTTGCCCTTCGTCTGAACTGCCCTTTCGTCCCTATTCGGAAAGCAGGAAAACTCCCAGGTCCTTGTTTCTCTTATAAATACGAATTGGAATATGGAAGTAGCATTGTAGAAATTCAAAAGGATGTTCTCAAACCTGATGATAATGTAGTTCTTTTTGATGATGTTTTGGCCACTGGTGGAAGCCTTGAAGCTGGTGTAAAATTAATAAACTTATCTGGAGCTAGAATCCTATCCAGTTTGTTGTTTGTGGAACTGAAAGGTTTGGGTGGACGTAAAAGGATAGAAGATCTTGACGTACCTGTTCACACACTCTTTCAAGCTTAAACACTACTTCTGTAAAAAGTATCCTTTCTTAATTCCTCCCTTTCTACTATTAAATGTAGTTTATTTTTCCGACTGACCTTAAGTACTGAAATATCGTCCTATTAAATAATAGACTGTAGCTAGTTATGAAATGTCATACTTCGAAATACCTAGTTAATAAAGTTCAGT]




>consensus_9825#2
CTTGGTACGAAGCCTTGCCGAAGTCATCTGATCGTGAGTCTAGGTTAAAAGCCATTAAGT
CAGCTGTCGGGATTATACCAGATTTCCCAAAACAGGGCATTATTTTCTGGGACTTTTTTG
GCGTTTTCAGAGACCCTGTTTTAACTCAATATCTATTGGATGAGTTATATTATGTGGCTA
CATCCGAGATAGAGCGTAAATTTACAGTAAGCTACGTTGCACTCGATCTATTGTACGTTA
GAAAATCAACGTTGTTGTGGGTCTTGAGTCACGTGGTTTTTTACTTGGACCAGCACTTGC
CCTTCGTCTGAACTGCCCTTTCGTCCCTATTCGGAAAGCAGGAAAACTCCCAGGTCCTTG
TTTCTCTTATAAATACGAATTGGAATATGGAAGTAGCATTGTAGAAATTCAAAAGGATGT
TCTCAAACCTGATGATAATGTAGTTCTTTTTGATGATGTTTTGGCCACTGGTGGAAGCCT
TGAAGCTGGTGTAAAATTAATAAACTTATCTGGAGCTAGAATCCTATCCAGTTTGTTGTT
TGTGGAACTGAAAGGTTTGGGTGGACGTAAAAGGATAGAAGATCTTGACGTACCTGTTCA
CACACTCTTTCAAGCTTAAACACTACTTCTGTAAAAAGTATCCTTTCTTAATTCCTNCCT
TTCTACTATTAAATGTAGTTTATTTTTCCGACTGACCTTAAGTACTGAAATATCGTCCTA
TTAAATAATAGACTGTAGCTAGTTATGAAATGTCATACTTCGAAATACCTAGTTAATAAA
GTTCAGT

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_9825#0      CCCCGGAGCCATATTCGGCACGAGGATTTGACCGATTTTGGAAATATCTATGGATTGTCG 60
consensus_9825#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9825#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9825#0      TGGCGATGTACCAATCGTTTTACGACTGTTTGACCTTTAAGTGCTCAGTAACCTACATCA 120
consensus_9825#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9825#1      ----------------------------------------------------TCGCAGCC 8
                                                                                  

consensus_9825#0      ATGAATGAAGCCACTGGGTCGTTGCCGAAGTCATCTGATCGTGAGTCTAGGCTAAAAGCC 180
consensus_9825#2      ------CTTGGTACGAAGCC-TTGCCGAAGTCATCTGATCGTGAGTCTAGGTTAAAAGCC 53
consensus_9825#1      ACGATTC--GGCACGAGGAT-TTTTTGAAAT-GTCTGATCGCGAGTCTAGACTTAGAGCT 64
                               *  **   *   **   *** *  ******** ********  * * *** 

consensus_9825#0      ATTAAGTCAGCTGTCGGGATTATACCAGATTTCCCAAAACAGGGCATTATTTTCTGGGAC 240
consensus_9825#2      ATTAAGTCAGCTGTCGGGATTATACCAGATTTCCCAAAACAGGGCATTATTTTCTGGGAC 113
consensus_9825#1      -TCGAGTCAGCCATCAGGGTTGTGCCGAATTTTCCACAGAAAGGCATTCTTTTCCGTGAC 123
                       *  *******  ** ** ** * **  **** *** *  * ****** ***** * ***

consensus_9825#0      TTTTTTGGCGTTTTCAGAGACCCTGTTTTAACTCAATATCTATTGGATGAGTTATATTAT 300
consensus_9825#2      TTTTTTGGCGTTTTCAGAGACCCTGTTTTAACTCAATATCTATTGGATGAGTTATATTAT 173
consensus_9825#1      TTCTTTGGAGTTCTCATGAATCCTGTCTTAACTCAATACCTATTGGATGAATTATATTAT 183
                      ** ***** *** ***   * ***** *********** *********** *********

consensus_9825#0      GTGGCTACATCCGAGATAGAGCGTAAATTTACA--------------------------- 333
consensus_9825#2      GTGGCTACATCCGAGATAGAGCGTAAATTTACAGTAAGCTACGTTGCACTCGATCTATTG 233
consensus_9825#1      GTGGCTACATCCGAGGCAGCTCGTAAATGTAAA--------------------------- 216
                      ***************  **  ******* ** *                           

consensus_9825#0      --------AAAATCAACGTTGTTGTGGGTCTTGAGTCACGTGGTTTTTTACTTGGACCAG 385
consensus_9825#2      TACGTTAGAAAATCAACGTTGTTGTGGGTCTTGAGTCACGTGGTTTTTTACTTGGACCAG 293
consensus_9825#1      --------AAAATAGACGTTGTTGTGGGCCTCGAGTCGCGCGGCTTTCTTCTTGGACCAG 268
                              *****  ************* ** ***** ** ** *** * **********

consensus_9825#0      CACTTGCCCTTCGTCTGAACTGCCCTTTCGTCCCTATTCGGAAAGCAGGAAAACTCCCAG 445
consensus_9825#2      CACTTGCCCTTCGTCTGAACTGCCCTTTCGTCCCTATTCGGAAAGCAGGAAAACTCCCAG 353
consensus_9825#1      CTCTTGCCCTTCGTCTGAACTGCGCCTTCGTCCCTATTCGGAAAGCAGGAAAACTTCCAG 328
                      * ********************* * ***************************** ****

consensus_9825#0      GTCCTTGTTTCTCTTATAAATACGAATTGGAATATGGAAGTAGCATTGTAGAAATTCAAA 505
consensus_9825#2      GTCCTTGTTTCTCTTATAAATACGAATTGGAATATGGAAGTAGCATTGTAGAAATTCAAA 413
consensus_9825#1      GTCCTTGTTTCTCTCATCGATATACATTGGAATATGGAACTGATACTGTAGATATGCCAA 388
                      ************** **  ***   ************** *   * ****** ** * **

consensus_9825#0      AGGATGTTCTCAAACCTGATGATAATGTAGTTCTTTTTGATGATGTTTTGGCCACTGGTG 565
consensus_9825#2      AGGATGTTCTCAAACCTGATGATAATGTAGTTCTTTTTGATGATGTTTTGGCCACTGGTG 473
consensus_9825#1      AGGATGTTATCAATGCTGGCGATAATATATTATTATTGGACGATGTTTTAGCTACTGGTG 448
                      ******** ****  ***  ****** ** *  * ** ** ******** ** *******

consensus_9825#0      GAAGCCTTGAAGCTGGTGTAAAATTAATAAACTTATCTGGAGCTAGAATCCTATCCAGTT 625
consensus_9825#2      GAAGCCTTGAAGCTGGTGTAAAATTAATAAACTTATCTGGAGCTAGAATCCTATCCAGTT 533
consensus_9825#1      GAAGTCTTGAAGCTTGTGTTAATCTGGTAAACCTATCTGGAGCTAAGGTTTTATTCAGCT 508
                      **** ********* **** **  *  ***** ************   *  *** *** *

consensus_9825#0      TGTTGTTTGTGGAACTGAAAGGTTTGGGTGGACGTAAAAGGATAGAAGATCTTGACGTAC 685
consensus_9825#2      TGTTGTTTGTGGAACTGAAAGGTTTGGGTGGACGTAAAAGGATAGAAGATCTTGACGTAC 593
consensus_9825#1      TGGTGTATATGGAACTAAATAATCTGTCTGGACGTAAAAGGCTAGAAGATCTTAACGTTC 568
                      ** *** * ******* **   * **  ************* *********** **** *

consensus_9825#0      CTGTTCACACACTCTTTCAAGCTTAAACACTA---CTTCTGTANAAAG----TATCCTTT 738
consensus_9825#2      CTGTTCACACACTCTTTCAAGCTTAAACACTA---CTTCTGTAAAAAG----TATCCTTT 646
consensus_9825#1      CTGTTTATTCACTTTTCAACATTTGAACATGATGCCTTGTGTAGAAATGCCTTATCCTTT 628
                      ***** *  **** **  *   ** ****  *   *** **** ***     ********

consensus_9825#0      CTTAATTCCTNCC-TTTCTACTATTAAATGT-AGTTTATTTTTCCGACTGACCTTAAGTA 796
consensus_9825#2      CTTAATTCCTNCC-TTTCTACTATTAAATGT-AGTTTATTTTTCCGACTGACCTTAAGTA 704
consensus_9825#1      CATAATTCGTGCCCTTTTTATTACTTGACACCAGTTATTTTTTCCTGCATATCTGAAATA 688
                      * ****** * ** *** ** ** *  *    ****  *******  *  * ** ** **

consensus_9825#0      CTGAAATATCGTC---CTATTAAATAATAGACTGTAGCTAGTTATGAAATGTCATACTTC 853
consensus_9825#2      CTGAAATATCGTC---CTATTAAATAATAGACTGTAGCTAGTTATGAAATGTCATACTTC 761
consensus_9825#1      CTGAAATACTTTTTATCTAATAAAGCATAACATGTTGTTGGTTGTGGAGTGT-ATCTCTT 747
                      ********   *    *** ****  ***   *** * * *** ** * *** **   * 

consensus_9825#0      GAAATACCTAGTTAATAAAGTTCAGT---------------------------------- 879
consensus_9825#2      GAAATACCTAGTTAATAAAGTTCAGT---------------------------------- 787
consensus_9825#1      AAGTAATTGGGTTCACTTCTGTATGTAGATGCTGATTTTAGCTGACTAACTTTCCCATCA 807
                       *   *    *** *      *  **                                  

consensus_9825#0      ------------------------------------------------------------
consensus_9825#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9825#1      TTTTGATTTCAACTGTTTGGAGACTTTGCTTGTATTATCAATGAACGTTATTTTAAAAAA 867
                                                                                  

consensus_9825#0      -----------
consensus_9825#2      -----------
consensus_9825#1      AGAATGGAGTC 878