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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9840#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 11 consensus length = 867 fasta sequence
[ACGCAAAAGTTCGGACTGTAACTACTCCATTCGGAAATCCATCAGGTGTTCTTACTGAAGGTTTTGTTAAAGGTGTCCCGTGTGTTGTGCTTCCCAGGCATGGAAAGGAACATTTACTGCTGCCAAGCGAGATCAATTATCGGGCCAACATTTGGGCGTTAAAAGAACTTGGGTG-TACTCACATATTAGCCACTAACGCTTGTGGTAGTCTGCAGAAAGACAAAAAACCTGGTGATTTCGTTGTTCTTAACCAGTTTTACGATAATACTCAAAATCGAGAGCTTACGTTTTATGGAAGTGGGCCTGGCTCACTGAAAGGAGTCTTACATATGCCGATGGCAGACCCATTTTGTGAAGAAACACGTCAGGTTTTAATCAAAGCAGCTAAAAATCTATCACTAACTATTCGTGATAAAACGTGTAGTTCAGATACAATTAGCAATCATCCGTGTGTGCATACTGAAGGTTCTGTAATTACTATTAATGGTCCACGTTTCTCAACTCGTTGCGAATCATTGTTATTTCAAAAATGGGGTTTCGATT-TGATCAATATGACATTAGTTCCTGAGGTTTCATTGGCTCGCGAAGCT-GGTTTAAGTTATGCTTCTATAGCAATTGTTACAGATTTCGATTGTTGGAAAGCAGATGAGGAACATGTCTGTGTTGATATGGGTTTTGGAACAGTTTCGTAAAAGTGTTGGTCAAGTTAGGGAAATCTTATTAGAAGCTGTGAGATTGATTGGTGCTTGTGACTGGACAAAAACTATTGAAGCAAATAAGGCGCTAGTGTTGAGCTCACGTCAAGACTTACTTCATCAAGGAAGTAATGACAAATAAATATGAGGTTAATTGGAATTTATTATCTGT]
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[-] EMBL CD171140 [ TACTGGAGTTTTTGTTAAAGGTGTCCCGTGTGTTGTGCTTCCCAGGCATGGAAAGGAGCATTTACTGCTGCCAAGCGAGATCAATTATCGGGCCAACATTTGGGCGTTAAAAGAACTTGGGTGTTACTCACATATTAGCCACTAACGCTTGTGGTAGTCTGCAGAAAGACAAAAAACCTGGTGATTTCGTTGTTCTTAACCAGTTTTACGATAATACTCAAAATCGAGAGCTTACGTTTTATGGAAGTGGGCCTGGCTCACTGAAAGGAGTCTTACATATGCCGATGGCAGACCCATTTTGTGAAGAAACACGTCAGGTTTTAATCAAAGCAGCTAAAAATCTATCACTAACTATTCGTGATAAAACGTGTAGTTCAGATACAATTAGCAATCATCCGT ]
[-] EMBL CD121555 [ TGAAGGTTTTGTTAAAGGTGTCCCGTGTGTTGTGCTTCCCAGGCATGGAAAGGAACATTTACTGCTGCCAAGCGAGATCAATTATCGGGCCAACATTTGGGCGTTAAAAGAACTTGGGTG TACTCACATATTAGCCACTAACGCTTGTGGTAGTCTGCAGAAAGACAAAAAACCTGGTGATTTCGTTGTTCTTAACCAGTTTTACGATAATACTCAAAATCGAGAGCTTACGTTTTATGGAAGTGGGCCTGGCTCACTGAAAGGAGTCTTACATATGCCGATGGCAGACCCATTTTGTGAAGAAACACGTCAGGTTTTTATCAAAGCAGCTAAAAATCTATCACTAACTATTCGTGATAAAACGTGTAGTTCAGATACAATTAGCAATCATCCGT ]
[-] EMBL CD121566 [ TGAAGGTTTTGTTAAAGGTGTCCCGTGTGTTGTGCTTCCCAGGCATGGAAAGGAACATTTACTGCTGCCAAGCGAGATCAATTATCGGGCCAACATTTGGGCGTTAAAAGAACTTGGGTG TACTCACATATTAGCCACTAACGCTTGTGGTAGTCTGCAGAAAGACAAAAAACCTGGTGATTTCGTTGTTCTTAACCAGTTTTACGATAATACTCAAAATCGAGAGCTTACGTTTTATGGAAGTGGGCCTGGCTCACTGAAAGGAGTCTTACATATGCCGATGGCAGACCCATTTTGTGAAGAAACACGTCAGGTTTTAATCAAAGCAGCTAAAAATCTATCACTAACTACTCGTGATAAAACGTGTAGTTCAGATACAATTAGCAATCATCCGT ]
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[-] EMBL CD171170 [ TGAAGGTTTTGTTAAAGGTGTCCCGTGTGTTGTGCTTCCCAGGCATGGAAAGGAACATTTACTGCTGCCAAGCGAGATCAATTATCGGGCCAACATTTGGGCGTTAAAAGAACTTGGGTG TACTCACATATTAGCCACTAACGCTTGTGGTAGTCTGCAGAAAGACAAAAAACCTGGTGATTTCGTTGTTCTTAACCAGTTTTACGATAATACTCAAAATCGAGAGCTTACGTTTTATGGAAGTGGGCCTGGCTCACTGAAAGGAGTCTTACATATGCCGATGGCAGACCCATTTTGTGAAGAAACACGTCAGGTTTTAATCAAAGCAGCTAAAAATCTATCACTAACTATTCGTGACAAAACGTGTAGTTCAGATACAATTAGCAATCATCCGT ]
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[+] EMBL CD139587 [ GGTGATTTCGTTGTTCTTAACCAGTTTTACGATAATACTCAAAATCGAGAGCTTACGTTTTATGGAAGTGGGCCTGGCTCACTGAAAGGAGTCTTACATATGCCGATGGCAGACCCATTTTGTGAAGAAACACGTCAGGTTTTAATCAAAGCAGCTAAAAATCTATCACTAACTATTCGTGATANAACGTGTAGTTCAGATACAATTAGCAATCATCCGTGTGTGCATACTGAAGGTTCTGTAATTACTATTAATGGTCCACGTTTCTCAACTCGTTGCGAATCATTGTCATTTC AAAATGGGGGTTCGATTNNGATC ATATGACATTAGNTCCTGAGGGTTCATTGGCTCGCGAAGCTGGGTTAAAAGTATGC TCTATAGCAATTGGTACNGA ]
[+] EMBL CD083732 [ gCTT ACCAGTTTTACGATAATACTCAAAATCGAGAGCTTACGTTTTATGGAAGTGGGCCTGGCTCACTGAAAGGAGTCTTACATATGCCGATGGCAGACCCATTTTGTGAAGAAACACGTCAGGTTTTAATCAAAGCAGCTAAAAATCTATCACTAACTATTCGTGATAAAACGTGTAGTTCAGATACAATTAGCAATCATCCGTGTGTGCATACTGAAGGTTCTGTAATTACTATTAATGGTCCACGTTTTTCAACTCGTTGCGAATCATTGTTATTTCAAAAATGGGGTTTCGATT TGATCAATATGACATTAGTTCCTGAGGTTTCATTGGCTCGCGAAGCT GGTTTAAGTTATGCTTCTATAGCAATTGTTACAGATTTCGATTGTTGGAAAGCAGATGAGGAACATGTCTGTGTTGATATGGGTTTTGGAACAGTTTCGTAAAAGTGTTGGTCAAGTTAGGGAAATCTTATTAGAA ]
[+] EMBL CD083892 [ cataggCCGTGTGTGCATACTGAAGGTTCTGTAATTACTATTAATGGTCCACGTTTCTCAACTCGTTGCGAATCATTGTTATTTCAAAAATGGGGTTTCGATT TGATCAATATGACATTAGTTCCTGAGGTTTCATTGGCTCGCGAAGCT GGTTTAAGTTATGCTTCTATAGCAATTGTTACAGATTTCGATTGTTGGAAAGCAGATGAGGAACATGTCTGTGTTGATAT GGTTTTGGAACAGTTTCGTAAAAGTGTTGGTCAAGTTAGGGAAATCTTATTAGAAGCTGTGAGATTGATTGGTGCTTGTGACTGGACAAAAACTATTGAAGCAAATAAGGCGCTAGTGTTGAGCTCACGTCAAGACTTACTTCATCAAGGAAGTAATGACAAATAAATATGAGGTTAATTGGAATTTATTATCTGT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||