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Schistosoma mansoni
cluster # 9854 cluster # 9854       Sequences # 11       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9854#0 length = 605 sequences # 11  

consensusID : consensus_9854#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 11
consensus length = 605
fasta sequence
                              [AGATCAAGTGTAATATTTAGCGTTTGATCTAATCGGAAATATTTAGTGTTAATTAATGGAGTACCATTAATATAGGATAGATTGTTTTCATTAGTAATGAGTTGTGGTTCCTCAAGGTCAATATTCACGACCGTAGTGGATTAGTTTCTGTTGCTATATGTGCATCCTCAGTGGATTACCTCAATGTAACATTTGGTCGATAGTTATGATATAGTCGATATGAAGCTAGTAATAAAATCCAGAATAAGCATTTCTTCCTGTTTAAGATTTGTCATTAGGATGTACCTGTGTTCCAGAATCGATGTTCATTGGGAGCACATATATTAACATATACTAATAAGCTGTAATCCTGGACATGATGGACGAGAATTTACAAACATTTACTAATA-CGTTCATGATAATTGAATGGTTTAGTGGATATCTGAACTCTGTAGTTCACAGGATAACACAGTAGCGTTTGAACCGAATGGTACAGGATTAAATTCTCAGTGTGATTATCAACTCTAGAAAATAGGTATGCCCACTTGATTGATCCGAGATGGAGTAAAATGTGCATCTTGGTCTTCATTGCTAGCCACATATCAAATTTACTGCAGATTATTTGC]

[+] EMBL CD084668             [AGATCAAGTGTAATATTTAGCGTTTGATCTAATCGGAAATATTTAGTGTTAATTAATGGAGTACCATTAATATAGGATAGATTGTTTTCATTAGTAATGAGTTGTGGTTCCTCAAGGTCAATATTCACGACCGTAGTGGATTAGTTTCTGTTGCTATATGTGCATCCTCAGTGGATTACCTCAATGTAACATTTGGTCGATAGTTATGATATAGTCGATATGAAGCTAGTAATAAAATCCAGAATAAGTATTTCTTCCTGTTTAAGATTTGTCATTAGGATGTACCTGTGTTCCAGAATCGATGTTCATTGGGAGCACATATATTAACATATACTAATAAGCTGTAATCCTGGACATGATGGACGAGAATTTACAAACATTTACTAATA CGTTCATGATAATTGAATGGTTTAGCGGATATCTGAACTCTGTAGTTCACAGGATAACACAGTAGCGTTTGAACCGAATGGTACAGGATTAAATTCTCAGTGTGAT                                                                                                              ]
[+] EMBL CD084674             [AGAACAAGTGTAATATTTAGCGTTTGATCTAATCGGAAATATTTAGTGTTAATTAATGGAGTACCATTAATATAGGATAGATTGTTTTCATTAGTAATGAGTTGTGGTTCCTCAAGGTCAATATTCACGACCGTAGTGGATTAGTTTCTGTTGCTATATGTGCATCCTCAGTGGATTACCTCAATGTAACATTTGGTCGATAGTTATGATATAGTCGATATGAAGCTAGTAATAAAATCCAGAATAAGCATTTCTTCCTGTTTAAGATTTGTCATTAGGATGTACCTGTGTTCCAGAATCGATGTTCATTGGGAGCACATATATTAACATATACTAATAAGCTGCAATCCTGGACATGATGGACGAGAATTTACAAACATTTACTAATA CGTTCATGATAATT                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD084676             [ GAACAAGTGTAATATTTAGCGTTTGATCTAATCGGAAATATTTAGTGTTAATTAATGGAGTACCATTAATATAGGATAGATTGTTTTCATTAGTAATGAGTTGTGGTTCCTCAAGGTCAATATTCACGACCGTAGTGGATTAGTTTCTGTTGCTATATGTGCATCCTCAGTGGATTACCTCAATGTAACATTTGGTCGATAGTTATGATATAGTCGATATGAAGCTAGTAATAAAATCCAGAATAAGCATTTCTTCCTGTTTAAGATTTGTCATTAGGATGTACCTGTGTTCCAGAATCGATGTTCATTGGGAGCACATATATTAACATATACTAATAAGCTGTAATCCTGGACATGATGGACGAGAATTTACAAACATTTACTAATA CGTTCATGATAATTGAATGGTTTAGTGGATATCTGAACTCTGTAGTTCACAGGATAACACAGTAGCGTTTGAACCGAATGGTACAGGATTAAATTCTCAGTGTGATTATCAACTCTAGAAAATAGGTATGCCCACTTGATTGATCCGAGATGGAGTAAAATGTGCATCTTGNTCTTCATTGCTAGCCACATATCAAATTTACTGCAGATTATT   ]
[+] EMBL CD084673             [ GATCAAGTGTAATATTTAGCGTTTGATCTAATCGGAAATATTTAGTGTTAATTAATGGAGTACCATTAATATAGGATAGATTGTTTTCATTAGTAATGAGTTGTGGTTCCTCAAGGTCAATATTCACGACCGTAGTGGATTAGTTTCTGTTGCTATATGTGCATCCTCAGTGGATTACCTCAATGTAACATTTGGTCGATAGTTATGATATAGTCGATATGAAGCTAGTAATAAAATCCAGAATAAGTATTTCTTCCTGTTTAAGATTTGTCATTAGGATGTACCTGTGTTCCAGAATCGATGTTCATTGGGAGCACATATATTAACATATACTAATAAGCTGTAATCCTGGACATGATGGACGAGAATTTACAAACATTTACTAATA CGTTCATGATAATTGAATGGTTTAGTGGATATCTGAACTCTGTAGTTCACAGGATAACACAGTAGCGTTTGAACCGAATGGTACAGGATTAAATTCTCAGTGTGATTATCAACTCTAGAAAATAGGTATGCCCACTTGATTGATCCGAGATGGAGTAAAATGTGCATCTTGGT                                           ]
[+] EMBL CD084651             [ GATCAAGTGTAATATTTAGCGTTTGATCTAATCGGAAATATTTAGTGTTAATTAATGGAGTACCATTAATATAGGATAGATTGTTTTCATTAGTAATGAGTTGTGGTTCCTCAAGGTCAATATTCACGACCGTAGTGGATTAGTTTCTGTTGCTATATGTGCATCCTCAGTGGATTACCTCAATGTAACATTTGGTCGATAGTTATGATATAGTCGATATGAAGCTAGTAATAAAATCCAGAATAAGCATTTCTTCCTGTTTAAGATTTGTCATTAGGATGTACCTGTGTTCCAGAATCGATGTTCATTGGGAGCACATATATTAACATATACTAATAAGCTGTAATCCTGGACATGATGGACGAGAATTTACAAACATTTACTAATA CGTTCATGATAATTGAATGGTTTAGTGGATATCTGAACTCTGTAGTTCACAGGATAACACAGTAGCGTTTGAACCGAATGGTACAGGATTAAATTCTCAGTGTGATTATCAACTCTAGAAATTACGTATGCCCACTTGATTGATCCGAGATGGAGTANAATGTGC                                                   ]
[+] EMBL CD084638             [ GATCAAGTGTAATATTTAGCGTTTGATCTAATCGGAAATATTTAGTGTTAATTAATGGAGGACCATTAATATAGGATAGATTGTTTTCATTAGTAATGAGTTGTGGTTCCTCAAGGTCAATATTCACGACCGTAGTGGATTAGTTTCTGTTGCTATATGTGCATCCTCAGTGGATTACCTCAATGTAACATTTGGTCGATAGTTATGATATAGTCGATATGAAGCTAGTAATAAAATCCAGAATAAGCATTTCTTCCTGTTTAAGATTTGTCATTAGGATGTACCTGTGTTCCAGAATCGATGTTCATTGGGAGCACATATATTAACATATACTAATAAGCTGTAATCCTGGACATGATGGACGAGAATTTACAAACATTTACTAATA CGTTCATGATAATTGAATGGTTTAGTGGATATCTGAACTCTGTAGTTCACAGGATAACACAGTAGCGTTTGAACCGAATGGTACAGGATTAAATTCTCAGTGTGATTATCAACTCTAGAAAATAGGTATGCCCACTTGATTGATCCGAGATGGAGTAAAAT                                                       ]
[+] EMBL CD084641             [ GATCAAGTGTAATATTTAGCGTTTGATCTAATCGGAAATATTTAGTGTTAATTAATGGAGTACCATTAATATAGGATAGATTGTTTTCATTAGTAATGAGTTGTGGTTCCTCAAGGTCAATATTCACGACCGTAGTGGATTAGTTTCTGTTGCTATATGTGCATCCTCAGTGGATTACCTCAATGTAACATTTGGTCGATAGTTATGATATAGTCGATATGAAGCTAGTAATAAAATCCAGAATAAGCATTTCTTCCTGTTTAAGATTTGTCATTAGGATGTACCTGTGTTCCAGAATCGATGTTCATTGGGAGCACATATATTAACATATACTAATAAGCTGTAATCCTGGACATGATGGACGAGAATTTACAAACATTTACTAATA CGTTCATGATAATTGAATGGTTTAGTGGATATCTGAACTCTGTAGCTCAC                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD084648             [ GATCAAGTGTAATATTTAGCGTTTGATCTAATCGGAAATATTTAGTGTTAATTAATGGAGTACCATTAATATAGGATAGATTGTTTTCATTAGTAATGAGTTGTGGTTCCTCAAGGTCAATATTCACGACCGTAGTGGATTAGTTTCTGTTGCTATATGTGCATCCTCAGTGGATTACCTCAATGTAACATTTGGTCGATAGTTATGATATAGTCGATATGAAGCTAGTAATAAAATCCAGAATAAGCATTTCTTCCTGTTTAAGATTTGTCATTAGGATGTACCTGTGTTCCAGAATCGATGTTCATTGGGAGCACATATATTAACATATACTAATAAGCTGTAATCCTGGACATGATGGACGAGAATTTACAAACATTTACTAATACCGTTCATGATAATTGAATGGGTTAGTGGAT                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD084669             [ GATCAAGTGTAATATTTAGCGTTTGATCTAATCGGAAATATTTAGTGTTAATTAATGGAGTACCATTAATATAGGATAGATTGTTTTCATTAGTAATGAGTTGTGGTTCCTCAAGGTCAATATTCACGACCGTAGTGGATTAGTTTCTGTTGCTATATGTGCATCCTCAGTGGATTACCTCAATGTAACATTTGGTCGATAGTTATGATATAGTCGATATGAAGCTAGTAATAAAATCCAGAATAAGCATTTCTTCCTGTTTAAGATTTGTCATTAGGATGTACCTGTGTTCCAGAATCGATGTTCATTGGGAGCACATATATTAACATATACTAATAAGCTGTAATCCTGGACATGATGGACGAGAATTTACAAACATTTACTAATA CGTCCATGATAATTGAATGCCTTACTGc                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD084655             [ GATCAAGTGTAATATTTAGCGTTTGATCTAATCGGAAATATTTAGTGTTAATTAATGGAGTACCATTAATATAGGATAGATTGTTTTCATTAGTAATGAGTTGTGGTTCCTCAAGGTCAATATTCACGACCGTAGTGGATTAGTTTCTGTTGCTATATGTGCATCCTCAGTGGATTACCTCAATGTAACATTTGGTCGATAGTTATGATATAGTCGATATGAAGCTAGTAATAAAATCCAGAATAAGTATTTCTTCCTGTTTAAGATTTGTCATTAGGATGTACCTGTGTTCCAGAATCGATGTTCATTGGGAGCACATATATTAACATATACTAATAAGCTGTAATCCTGGACATGATGGACGAGAATTTACAAACATTTACTAATA CGTTCATGATAATTGAATGGTTTAGTGGATATCTGAACTCTGTAGTTCACAGGATAACACAGTAGCGTTTGAACCGAATGGTACAGGATTAAATTCTCAGTGTGATTATCAACTCTAGAAAATAGGTATGCCCACTTGATTGATCCGAGATGGAGTAAAATGTGCATCTTGGTCTTCATTGCTAGCCACATATCAAATTTACTGCAGATTATTTGC]
[+] EMBL CD084675             [ GATCAAGTGTAATATTTAGCGTTTGATCTAATCGGAAATATTTAGTGTTAATTAATGGAGTACCATTAATATAGGATAGATTGTTTTCATTAGTAATGAGTTGTGGTTCCTCAAGGTCAATATTCACGACCGTAGTGGATTAGTTTCTGTTGCTATATGTGCATCCTCAGTGGATTACCTCAATGTAACATTTGGTCGATAGTTATGATATAGTCGATATGAAGCTAGTAATAAAATCCAGAATAAGCATTTCTTCCTGTTTAAGATTTGTCATTAGGATGTACCTGTGTTCCAGAATCGATGTTCATTGGGAGCACATATATTAACATATACTAATAAGCTGTAATCCTGGACATGATGGACGAGAATTTACAAACATTTACTAATA CGTTCATGATA                                                                                                                                                                                                             ]


>consensus_9854#0 AGATCAAGTGTAATATTTAGCGTTTGATCTAATCGGAAATATTTAGTGTTAATTAATGGA GTACCATTAATATAGGATAGATTGTTTTCATTAGTAATGAGTTGTGGTTCCTCAAGGTCA ATATTCACGACCGTAGTGGATTAGTTTCTGTTGCTATATGTGCATCCTCAGTGGATTACC TCAATGTAACATTTGGTCGATAGTTATGATATAGTCGATATGAAGCTAGTAATAAAATCC AGAATAAGCATTTCTTCCTGTTTAAGATTTGTCATTAGGATGTACCTGTGTTCCAGAATC GATGTTCATTGGGAGCACATATATTAACATATACTAATAAGCTGTAATCCTGGACATGAT GGACGAGAATTTACAAACATTTACTAATACGTTCATGATAATTGAATGGTTTAGTGGATA TCTGAACTCTGTAGTTCACAGGATAACACAGTAGCGTTTGAACCGAATGGTACAGGATTA AATTCTCAGTGTGATTATCAACTCTAGAAAATAGGTATGCCCACTTGATTGATCCGAGAT GGAGTAAAATGTGCATCTTGGTCTTCATTGCTAGCCACATATCAAATTTACTGCAGATTA TTTGC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)