cluster # 9858

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 9858 cluster # 9858 Sequences # 11 consensus # 5

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_9858#0 length = 977 sequences # 4
consensus_9858#1 length = 667 sequences # 1

consensus_9858#2 length = 591 sequences # 4
consensus_9858#3 length = 488 sequences # 1
consensus_9858#4 length = 274 sequences # 1

consensusID : consensus_9858#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 977
fasta sequence

                              [CCTCCGAGGCCANAATTCGGCACGAGGAATAATCATGAAGTAGTTGGATTTTTAACTTGGCATAGATATTATATGTTATTTTGGGAAAGACATCTACGTAAAATTGCAATTCGACTGTATGGTTGGACAGATTTCACAATACCTTATTGGGATTGGGTTGATTCTACAAGGTGTGATGTTTGTGTTAATAGTTTATTAGGTGGTTATGGACAATGGGTTGGGCAAACTCGTTTAATAGACCCTAGAAGTCCATTTTACATGTGGCCGGAATACTGTTCTCCCCCAACTACGGGAAGTAATTGTTATAGTTGTCATGCTGGTTGGCCAAACTTTCGAGTATTGACAAGATATTTCGAAAGTACAGCATTCCCAACAACTCATAACCTTTTGTTCACTCTTTCAAAGGATACGTTTTATTTGCCTCAAGTGAAGGAGGATTTTGATAAATGTCGTGGTTTTCATCAAGCTCTTGAAGGATTTTGTTCTTTTCCCGGTGACAATTCAACTTATTCATTTATGCATAATAAAGTACATAATGTAGTGAGTGGTACATTTTGTTGTGCAGCTACTTCACCCAATGATCCTCTATTCTTAGTACATCATACACAAATTGATAGAATTTTCCAATTATGGTTTATGTATAATCGTCCACGTCCAACGGATTATCCAAATCATGGAGTTGCACTTGGAAATTGTCGTGAATGTAATATGGTTGGTTTCATTCCTACAATTAAACACGTACAAATGTTTGTAAATACAAAACTAATAGGTTATACATATGATAATTTTAATTTTGGTAAACGTGGCTTCAAGGGAGAAAAATACTTGAAATGTGGTCCTAAATATCGTGTCTAATTTATTATTTACTTGAGATCATACCAATACAAAGCATAGAAGCTGAAATTGAATACTTTTGATCAACTTTAAATGAATAAATATTATTCCAAAAATAAAAAAAAATAAAAAAAAANCATCGN]

[+] EMBL CD079681             [CCTCCGAGGCCANAATTCGGCACGAGGAATAATCATGAAGTAGTTGGATTTTTAACTTGGCATAGATATTATATGTTATTTTGGGAAAGACATCTACGTAAAATTGCAATTCGACTGTATGGTTGGACAGATTTCACAATACCTTATTGGGATTGGGTTGATTCTACAAGGTGTGATGTTTGTGTTAATAGTTTATTAGGTGGTTATGGACAATGGGTTGGGCAAACTCGTTTAATAGACCCTAGAAGTCCATTTTACATGTGGCCGGAATACTGTTCTCCCCCAACTACGGGAAGTAATTGTTATAGTTGTCATGCTGGTTGGCCAAACTTTCGAGTATTGACAAGATATTTCGAAAGTACAGCATTCCCAACAACTCATAACCTTTTGTTCACTCTTTCAAAGGATACGTTTTATTTGCCTCAAGTGAAGGAGGATTTTGATAAATGTCGTGGTTTTCATCAAGCTCTTGAAGGATTTTGTTCTTTTCCCGGTGACAATTCAACTTATTCATTTATGCATAATAAAGTACATAATGTAGTGAGTGGTACATTTTGTTGTGCAGCTACTTCACCCAATGATCCTCTATTCTTAGTACATCATACACAAATTGATAGAATTTTCCAATTATGGTTTATGTATAATCGTCCACGTCCAACGGATTATCCAAATCATGGAGTTGCACTTGGAAATTGTCGTGAATGTAATATGGGTTGTTTCATT                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD073941             [                                                                                                                                                                                                                                                                                         CCCAACTACGGGAAGTAATTGTTATAGTTGTCATGCTGGTTGGCCAAACTTTCGAGTATTGACAAGATATTTCGAAAGTACAGCATTCCCAACAACTCATAACCTTTTGTTCACTCTTTCAAAGGATACGTTTTATTTGCCTCAAGTGAAGGAGGATTTTGATAAATGTCGTGGTTTTCATCAAGCTCTTGAAGGATTTTGTTCTTTTCCCGGTGACAATTCAACTTATTCATTTATGCATAATAAAGTACATAATGTAGTGAGTGGTACATTTTGTTGTGCAGCTACTTCACCCAATGATCCTCTATTCTTAGTACATCATACACAAATTGATAGAATTTTCCAATTATGGTTTATGTATAATCGTCCACGTCCAACGGATTATCCAAATCATGGAGTTGCACTTGGAAATTGTCGTGAATGTAATATGGTTGGTTTCATTCCTACAATTAAACACGTACAAATGTTTGTAAATACAAAACTAATAGGTTATACATATGATAATTTTAATTTTGGTAAACGTGGCTTCAAGGGAGAAAAATACTTGAAATGTGGTCCTAAATATCGTGTCTAATTTATTATTTACTTGAGATCATAACAATACAAAGCATAGAAGCTGAAATTGAAGACTTTTGATCAACTTTAAATGAATAAATATTATTCCAAAAATAAAAAAAAATAAAAAAAAANCATCGN]
[-] EMBL CD074654             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ACAGCATTCCCAACAACTCATAACCTTTTGTTCACTCTTTCAAAGGATACGTTTTATTTGCCTCAAGTGAAGGAGGATTTTGATAAATGTCGTGGTTTTCATCAAGCTCTTGAAGGATTTTGTTCTTTTCCCGGTGACAATTCAACTTATTCATTTATGCATAATAAAGTACATAATGTAGTGAGTGGTACATTTTGTTGTGCAGCTACTTCACCCAATGATCCTCTATTCTTAGTACATCATACACAAATTGATAGAATTTTCCAATTATGGTTTATGTATAATCGTCCACGTCCAACGGATTATCCAAATCATGGAGTTGCACTTGGAAATTGTCGTGAATGTAATATGGTTGGTTTCATTCCTACAATTAAACACGTACAAATGTTTGTAAATACAAAACTAATAGGTTATACATATGATAATTTTAATTTTGGTAAACGTGGCTTCAAGGGAGAAAAATACTTGAAATGTGGTCCTAAATATCGTGTCTAATTTATTATTTACTTGAGATCATACCAATACAAAGCATAGAAGCTGAAATTGAATACTTTTGATCAACTTTAAATGAATAAA                                         ]
[-] EMBL AI975789             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CATCATACACAAATTGATAGAATTTTCCAAGTATGGTTTATGTATAATGGTCCGGGTGCAACGGATTATCCAAATCATGGAGTTGCACTTGGAAATTGTGGTGAATGTAAAATGGTTGGTTTCATTCCTACAATTAAACAGGTACAAATGTTTGTAAATCCACAACTAATAGGTTATACATATGATAATTTTAATTTTGGTAAACGTGGTTTCAAGGGAGAAAAATACTTGAAATGTGGTCCTAAATATGGGGTCTAATTAATTATTTACTTGAGATCATACCAACACAAAGGATTGAAGCTGAAATTGAATACTTTTGATCAACTTTAAATGAATAAA                                         ]




>consensus_9858#0
CCTCCGAGGCCANAATTCGGCACGAGGAATAATCATGAAGTAGTTGGATTTTTAACTTGG
CATAGATATTATATGTTATTTTGGGAAAGACATCTACGTAAAATTGCAATTCGACTGTAT
GGTTGGACAGATTTCACAATACCTTATTGGGATTGGGTTGATTCTACAAGGTGTGATGTT
TGTGTTAATAGTTTATTAGGTGGTTATGGACAATGGGTTGGGCAAACTCGTTTAATAGAC
CCTAGAAGTCCATTTTACATGTGGCCGGAATACTGTTCTCCCCCAACTACGGGAAGTAAT
TGTTATAGTTGTCATGCTGGTTGGCCAAACTTTCGAGTATTGACAAGATATTTCGAAAGT
ACAGCATTCCCAACAACTCATAACCTTTTGTTCACTCTTTCAAAGGATACGTTTTATTTG
CCTCAAGTGAAGGAGGATTTTGATAAATGTCGTGGTTTTCATCAAGCTCTTGAAGGATTT
TGTTCTTTTCCCGGTGACAATTCAACTTATTCATTTATGCATAATAAAGTACATAATGTA
GTGAGTGGTACATTTTGTTGTGCAGCTACTTCACCCAATGATCCTCTATTCTTAGTACAT
CATACACAAATTGATAGAATTTTCCAATTATGGTTTATGTATAATCGTCCACGTCCAACG
GATTATCCAAATCATGGAGTTGCACTTGGAAATTGTCGTGAATGTAATATGGTTGGTTTC
ATTCCTACAATTAAACACGTACAAATGTTTGTAAATACAAAACTAATAGGTTATACATAT
GATAATTTTAATTTTGGTAAACGTGGCTTCAAGGGAGAAAAATACTTGAAATGTGGTCCT
AAATATCGTGTCTAATTTATTATTTACTTGAGATCATACCAATACAAAGCATAGAAGCTG
AAATTGAATACTTTTGATCAACTTTAAATGAATAAATATTATTCCAAAAATAAAAAAAAA
TAAAAAAAAANCATCGN

consensusID : consensus_9858#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 667
fasta sequence

                              [CCAATNATTCGGCACGAGGACTATTTCATGATAATATAGATTGTATAATACGTAGACATTTGGATAATAATCATGAAGTAGTTGGATTTTTAACTTGGCATAGATATTATATGTTATTTTGGGAAAGACATCTACGTAAAATTGCAATTCGACTGTATGGTTGGACAGATTTCACAATACCTTATTGGGATTGGGTTGATTCTACAAGGTGTGATGTTTGTGTTAATAGTTTATTAGGTGGTTATGGACAATGGGTTGGGCAAACTCGTTTAATAGACCCTAGAAGTCCATTTTACATGTGGCCGGAATACTGTTCTCCCCCAACTACGGGAAGTAATTGTTATAGTTGTCATGCTGGTTGGCCAAACTTTCGAGTATTGACAAGATATTTCGAAAGTACAGCATTCCCAACAACTCATAACCTTTTGTTCACTCTTTCAAAGGATACGTTTTATTTGCCTCAAGTGAAGGAGGATTTTGATAAATGTCGTGGTTTTCATCAAGCTCTTGAAGGATTTTGTTCTTTTCCCGGTGACAATTCAACTTATTCATTTATGCATAATAAAGTACATAATGTAGTGAGTGGTACATTTTGTTGTGCAGCTACTTCACCCAATGATCCTCTATTCTTAGTACATCATACACAAATTGATAGAATTTTCCATTA]

[+] EMBL CD080730             [CCAATNATTCGGCACGAGGACTATTTCATGATAATATAGATTGTATAATACGTAGACATTTGGATAATAATCATGAAGTAGTTGGATTTTTAACTTGGCATAGATATTATATGTTATTTTGGGAAAGACATCTACGTAAAATTGCAATTCGACTGTATGGTTGGACAGATTTCACAATACCTTATTGGGATTGGGTTGATTCTACAAGGTGTGATGTTTGTGTTAATAGTTTATTAGGTGGTTATGGACAATGGGTTGGGCAAACTCGTTTAATAGACCCTAGAAGTCCATTTTACATGTGGCCGGAATACTGTTCTCCCCCAACTACGGGAAGTAATTGTTATAGTTGTCATGCTGGTTGGCCAAACTTTCGAGTATTGACAAGATATTTCGAAAGTACAGCATTCCCAACAACTCATAACCTTTTGTTCACTCTTTCAAAGGATACGTTTTATTTGCCTCAAGTGAAGGAGGATTTTGATAAATGTCGTGGTTTTCATCAAGCTCTTGAAGGATTTTGTTCTTTTCCCGGTGACAATTCAACTTATTCATTTATGCATAATAAAGTACATAATGTAGTGAGTGGTACATTTTGTTGTGCAGCTACTTCACCCAATGATCCTCTATTCTTAGTACATCATACACAAATTGATAGAATTTTCCATTA]




>consensus_9858#1
CCAATNATTCGGCACGAGGACTATTTCATGATAATATAGATTGTATAATACGTAGACATT
TGGATAATAATCATGAAGTAGTTGGATTTTTAACTTGGCATAGATATTATATGTTATTTT
GGGAAAGACATCTACGTAAAATTGCAATTCGACTGTATGGTTGGACAGATTTCACAATAC
CTTATTGGGATTGGGTTGATTCTACAAGGTGTGATGTTTGTGTTAATAGTTTATTAGGTG
GTTATGGACAATGGGTTGGGCAAACTCGTTTAATAGACCCTAGAAGTCCATTTTACATGT
GGCCGGAATACTGTTCTCCCCCAACTACGGGAAGTAATTGTTATAGTTGTCATGCTGGTT
GGCCAAACTTTCGAGTATTGACAAGATATTTCGAAAGTACAGCATTCCCAACAACTCATA
ACCTTTTGTTCACTCTTTCAAAGGATACGTTTTATTTGCCTCAAGTGAAGGAGGATTTTG
ATAAATGTCGTGGTTTTCATCAAGCTCTTGAAGGATTTTGTTCTTTTCCCGGTGACAATT
CAACTTATTCATTTATGCATAATAAAGTACATAATGTAGTGAGTGGTACATTTTGTTGTG
CAGCTACTTCACCCAATGATCCTCTATTCTTAGTACATCATACACAAATTGATAGAATTT
TCCATTA

consensusID : consensus_9858#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 591
fasta sequence

                              [TCTATATATATATATATCTCATTGAATCGGTTGATTTGATTACATTTATTTCAATTATTAATAAATTATATCACCATAGAGTAAATTCCTACAAAATTCCCCACCCCCTTTTCTTTTTATGGACATATTTCATGTGAATAATATTCATTGAAAATTAATTAAATTATTCATTATAATTAATTATTATAATAAATTAAATCAATATTATTATTATTATGCAACATATATGGTTTATTATTATTCTAACATTCTATTTAATAATAATAAATGTTCAATGTCTTATACCAAAATTATGTGTAAATAATATTACAGCAATTGGTGGTAGTGGTATTTGTTGTCCAATACCTAATGGTTCCAAATATCCATGTGGTGGTCCAGGTCAAGGTACATGTCAAAAAGAATATACACAAATTGATCGTATACCATTTTATTTAATTATGGATGATAGAATGAATTGGCCATCAAGATTTTTTAATCATTT-TTGTAAATGTGAAAATCATTATTTT-GGTATTTCATGTAATG-AATGTTGGTATGGTTGGGAAGGAAAATTTTGGT-ATAAACGTAAAGAATATATTCGATATAATATATTAT]

[+] EMBL BF936773             [TCTATATATATATATATCTCATTGAATCGGTTGATTTGATTACATTTATTTCAATTATTAATAAATTATATCACCATAGAGTAAATTCCTACAAAATTCCCCACCCCCTTTTCTTTTTATGGACATATTTCATGTGAATAATATTCATTGAAAATTAATTAAATTATTCATTATAATTAATTATTATAATAAATTAAATCAATATTATTATTATTATGCAACATATATGGTTTATTATTATTCTAACATTCTATTTAATAATAATAAATGTTCAATGTCTTATACCAAAATTATGTGTAAATAATATTACAGCAATTGGTGGTAGTGGTATTTGTTGTCCAATACCTAATGGTTCCAAATATCCATGTGGTGGTCCAGGTCAAGGTACATGTCAAAAAGAATATACACAAATTGATCGTATACCATTTTATTTAATTATGGATGATAGAATGAATTGGCCATCAAGATTTTTTAATCATTT TTGTAAATGTGAAAATCATTATTTT GGTATTTCATGTAATG AATGTTGGTATGGTTGGGAAGGAAAATTTTGGT ATAAACGTAAAGAATATATTCGATATAATATATTAT]
[+] EMBL SMAA25598            [         ATATATATCTCATTGAATCGGTTGATTTGATTACATTTATTTCAATTATTAATAAATTATATCACCATAGAGTAAATTCCTACAAAATTCCCCACCCCCTTTTCTTTTTATGGACATATTTCATGTGAATAATATTCATTGAAAATTAATTAAATTATTCATTATAATTAATTATTATAATAAATTAAATC ATATTATTATTATTATGC ACATATATGGTTTATTATTATTCTAACATTCTATTTAATAATAATAAATGTTC ATGTCTTATACCAAAATTATGTGTAAATAATATTACAGCAATTGGTGGTAGTGGTATTTGTTGTCCAA A CTAATGGTTCC AATATCCATGTGGTGGTCCAGGTCAAG                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL AA756923             [                             GTTGATTTGATTACATTTATTTCAATTATTAATAAATTATATCACCATAGAGTAAATTCCTACAAAATTCCCCACCCCCTTTTCTTTTTATGGACATATTTCATGTGAATAATATTCATTGAAAATTAATTAAATTATTCATTATAATTAATTATTATAATAAATTAAATCAATATTATTATTATTATGCAACATATATGG TTATTATTATTCTAACATTCTATTTAATAATAATAAATGTTCAATGTCTTATACCAAAATTATGTGTAAATNATATTA                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL SM781                [                                                                                                                                                                                                                                                                    ATAATAAATGTTCAATGTCTTATACCAAAATTATGTGTAAATAATATTACAGCAATTGGTGGTAGTGGTATTTGTTGTCCAATACCTAATGGTTCCAAATATCCATGTGGTGGTCCAGGTCAAGGTACATGTCAAAAAGAATATACACAAATTGATCGTATACCATTTTATTTAATTATGGATGATAGAATGAATTGGCCATCAAGATTTTTTAATCATTTNTGGTAAATGTGAAAATCATTATTTTGGGTATTTCATGTAATGNAATGTTGGTATGGTTGGGAAGGAAAA TTTGGTAATAAACGTAAAGAATATATTCGATATAATATATTAT]




>consensus_9858#2
TCTATATATATATATATCTCATTGAATCGGTTGATTTGATTACATTTATTTCAATTATTA
ATAAATTATATCACCATAGAGTAAATTCCTACAAAATTCCCCACCCCCTTTTCTTTTTAT
GGACATATTTCATGTGAATAATATTCATTGAAAATTAATTAAATTATTCATTATAATTAA
TTATTATAATAAATTAAATCAATATTATTATTATTATGCAACATATATGGTTTATTATTA
TTCTAACATTCTATTTAATAATAATAAATGTTCAATGTCTTATACCAAAATTATGTGTAA
ATAATATTACAGCAATTGGTGGTAGTGGTATTTGTTGTCCAATACCTAATGGTTCCAAAT
ATCCATGTGGTGGTCCAGGTCAAGGTACATGTCAAAAAGAATATACACAAATTGATCGTA
TACCATTTTATTTAATTATGGATGATAGAATGAATTGGCCATCAAGATTTTTTAATCATT
TTTGTAAATGTGAAAATCATTATTTTGGTATTTCATGTAATGAATGTTGGTATGGTTGGG
AAGGAAAATTTTGGTATAAACGTAAAGAATATATTCGATATAATATATTAT

consensusID : consensus_9858#3
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 488
fasta sequence

                              [ATATATATCTCANTGAATCGGTTGATTTGATTACATTTATTTCAATTATTAATAAATTATATCACCATAGAGTAAATTCCTACAAAATTCCCCACCCCCTTTTCTTTTTATGGACATATTTCATGTGAATAATATTCATTGAAAATTAATTAATTATTCATTATAATTAATTATTATAATAAATTAAATCATATTATTATTATTATGCACATATATGGTTTATTAATATTCTAACATTCTATTTATAATAATAAATGTTCAATGTCTTATACCAAAATTATGTGTAAATAATATCACGGCAATTGGTGGTAGTGGTATTGTTGTCCAATACCTAATGGTTCCAATATCCATGTGGTGTCGTCAGTCTGTCAAGATTCCATGTGATACATTATTATAGATGAGATGATGGCATCAGATTTTACATTTGTATGGAATCATATTGGATCAGATGATGTGGATGTTGAGGAATTGANACGTAGATATCGTAA]

[+] EMBL SMAA25595            [ATATATATCTCANTGAATCGGTTGATTTGATTACATTTATTTCAATTATTAATAAATTATATCACCATAGAGTAAATTCCTACAAAATTCCCCACCCCCTTTTCTTTTTATGGACATATTTCATGTGAATAATATTCATTGAAAATTAATTAATTATTCATTATAATTAATTATTATAATAAATTAAATCATATTATTATTATTATGCACATATATGGTTTATTAATATTCTAACATTCTATTTATAATAATAAATGTTCAATGTCTTATACCAAAATTATGTGTAAATAATATCACGGCAATTGGTGGTAGTGGTATTGTTGTCCAATACCTAATGGTTCCAATATCCATGTGGTGTCGTCAGTCTGTCAAGATTCCATGTGATACATTATTATAGATGAGATGATGGCATCAGATTTTACATTTGTATGGAATCATATTGGATCAGATGATGTGGATGTTGAGGAATTGANACGTAGATATCGTAA]




>consensus_9858#3
ATATATATCTCANTGAATCGGTTGATTTGATTACATTTATTTCAATTATTAATAAATTAT
ATCACCATAGAGTAAATTCCTACAAAATTCCCCACCCCCTTTTCTTTTTATGGACATATT
TCATGTGAATAATATTCATTGAAAATTAATTAATTATTCATTATAATTAATTATTATAAT
AAATTAAATCATATTATTATTATTATGCACATATATGGTTTATTAATATTCTAACATTCT
ATTTATAATAATAAATGTTCAATGTCTTATACCAAAATTATGTGTAAATAATATCACGGC
AATTGGTGGTAGTGGTATTGTTGTCCAATACCTAATGGTTCCAATATCCATGTGGTGTCG
TCAGTCTGTCAAGATTCCATGTGATACATTATTATAGATGAGATGATGGCATCAGATTTT
ACATTTGTATGGAATCATATTGGATCAGATGATGTGGATGTTGAGGAATTGANACGTAGA
TATCGTAA

consensusID : consensus_9858#4
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 274
fasta sequence

                              [TGGTAGTGGTATTTGTTGTCCAATCACCTAATGGTTCCAAATATCCATGTGGTGGTCCAGGTCAAGGTTTTATTTGCCTCAAGTGAAGGAGGATTTTGATAAATGTCGTGGTTTTCATCAAGCTCTTGAAGGATTTTGTTCTTTTCCCGGTGACAATTCAACTTATTCATTTATGCATAATAAAGTACATAATGTAGTGAGTGGTACATTTTGTTGTGCAGCTACTTCACCCAATGATCCTCTATTCTTAGTACATCATACACAAATTGGATAG]

[+] EMBL SM878                [TGGTAGTGGTATTTGTTGTCCAATCACCTAATGGTTCCAAATATCCATGTGGTGGTCCAGGTCAAGGTTTTATTTGCCTCAAGTGAAGGAGGATTTTGATAAATGTCGTGGTTTTCATCAAGCTCTTGAAGGATTTTGTTCTTTTCCCGGTGACAATTCAACTTATTCATTTATGCATAATAAAGTACATAATGTAGTGAGTGGTACATTTTGTTGTGCAGCTACTTCACCCAATGATCCTCTATTCTTAGTACATCATACACAAATTGGATAG]




>consensus_9858#4
TGGTAGTGGTATTTGTTGTCCAATCACCTAATGGTTCCAAATATCCATGTGGTGGTCCAG
GTCAAGGTTTTATTTGCCTCAAGTGAAGGAGGATTTTGATAAATGTCGTGGTTTTCATCA
AGCTCTTGAAGGATTTTGTTCTTTTCCCGGTGACAATTCAACTTATTCATTTATGCATAA
TAAAGTACATAATGTAGTGAGTGGTACATTTTGTTGTGCAGCTACTTCACCCAATGATCC
TCTATTCTTAGTACATCATACACAAATTGGATAG

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_9858#0      ---------------------------------CCTCCGAGGCCANAATTCG-----GCA 22
consensus_9858#1      CCAATNATTCGGCACGAGGACTATTTCATGATAATATAGATTGTATAATACGTAGACATT 60
consensus_9858#4      ------------------------------------------------------------
consensus_9858#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9858#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9858#0      CGAGGAATAATCATGAAGTAGTTGGATTTTTAACTTGGCATAGATATTATATGTTATTTT 82
consensus_9858#1      TGGATAATAATCATGAAGTAGTTGGATTTTTAACTTGGCATAGATATTATATGTTATTTT 120
consensus_9858#4      ------------------------------------------------------------
consensus_9858#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9858#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9858#0      GGGAAAGACATCTACGTAAAATTGCAATTCGACTGTATGGTTGGACAGATTTCACAATAC 142
consensus_9858#1      GGGAAAGACATCTACGTAAAATTGCAATTCGACTGTATGGTTGGACAGATTTCACAATAC 180
consensus_9858#4      ------------------------------------------------------------
consensus_9858#2      -------------------------------------------TCTATATATATATATAT 17
consensus_9858#3      ----------------------------------------------------ATATATAT 8
                                                                                  

consensus_9858#0      CTTATTGGGATTGGGTTGATTCTACAAGGTGTGATGTTTGTGTTAATAGTTTATTAGGTG 202
consensus_9858#1      CTTATTGGGATTGGGTTGATTCTACAAGGTGTGATGTTTGTGTTAATAGTTTATTAGGTG 240
consensus_9858#4      ------------------------------------------------------------
consensus_9858#2      CTCATT--GAATCGGTTGATTTGATTACATTTATTTCAATTATTAATAAATTATATCACC 75
consensus_9858#3      CTCANT--GAATCGGTTGATTTGATTACATTTATTTCAATTATTAATAAATTATATCACC 66
                                                                                  

consensus_9858#0      GTTATGGACAATGGGTTGGGCAAACTCGTTTAATAGACCCTAGAAGTCCATTTTACATGT 262
consensus_9858#1      GTTATGGACAATGGGTTGGGCAAACTCGTTTAATAGACCCTAGAAGTCCATTTTACATGT 300
consensus_9858#4      ------------------------------------------------------------
consensus_9858#2      ATAGAGTAAATTCCTACAAAATTCCCCACCCCCTTTTCTTTTTATGGACATATTTCATGT 135
consensus_9858#3      ATAGAGTAAATTCCTACAAAATTCCCCACCCCCTTTTCTTTTTATGGACATATTTCATGT 126
                                                                                  

consensus_9858#0      GGCCGGAATACTGTTCTCCCCCAACTACGGGAAGTAATTGTTATAGTTG-TCATGCTGGT 321
consensus_9858#1      GGCCGGAATACTGTTCTCCCCCAACTACGGGAAGTAATTGTTATAGTTG-TCATGCTGGT 359
consensus_9858#4      ------------------------------------------------------------
consensus_9858#2      G-----AATAATATTCATTGAAAATTAATTAAATTATTCATTATAATTAATTATTATAAT 190
consensus_9858#3      G-----AATAATATTCATTGAAAATTAATTAA-TTATTCATTATAATTAATTATTATAAT 180
                                                                                  

consensus_9858#0      TGGCCAAACT--TTCGAGTATTGACA-A-GATATTTCGAAAGTACAGCATTCCCAACAAC 377
consensus_9858#1      TGGCCAAACT--TTCGAGTATTGACA-A-GATATTTCGAAAGTACAGCATTCCCAACAAC 415
consensus_9858#4      ---------------------TGGTA-GTGGTATTT--GTTGTCCAAT-CACCTAATGGT 35
consensus_9858#2      AAATTAAATCAATATTATTATTATTATGCAACATATATGGTTTATTATTATTCTAACATT 250
consensus_9858#3      AAATTAAATCA-TATTATTATTATTATGCA-CATATATGGTTTATTAATATTCTAACATT 238
                                           *   *      ** *      *         * **    

consensus_9858#0      TCATAACCTTTTGTTCACTCTTTCAAAGGATACGTTTTATTTGCCT-CAAGTGAAG--GA 434
consensus_9858#1      TCATAACCTTTTGTTCACTCTTTCAAAGGATACGTTTTATTTGCCT-CAAGTGAAG--GA 472
consensus_9858#4      TC-CAAATATCCATGTGGTGGTCCAGGTCA-AGGTTTTATTTGCCT-CAAGTGAAG--GA 90
consensus_9858#2      CTATTTAATAATAATAAATGTTCAATGTCTTATACCAAAATTATGTGTAAATAATATTAC 310
consensus_9858#3      CTATTTA-TAATAATAAATGTTCAATGTCTTATACCAAAATTATGTGTAAATAATATCAC 297
                                        *  *  *      *      * **   *  ** * *      

consensus_9858#0      GGATTTTGATAAATGTCGTGGTTTTCATCAAGCTCTTGAAGGATTTTGTTCTTTTCCCGG 494
consensus_9858#1      GGATTTTGATAAATGTCGTGGTTTTCATCAAGCTCTTGAAGGATTTTGTTCTTTTCCCGG 532
consensus_9858#4      GGATTTTGATAAATGTCGTGGTTTTCATCAAGCTCTTGAAGGATTTTGTTCTTTTCCCGG 150
consensus_9858#2      AGCAATTGGTGGTAGTGGTATTTGTTGTCCAATACCTAATGGTTCCAAATATCCATGTGG 370
consensus_9858#3      GGCAATTGGTGGTAGTGGTATT-GTTGTCCAATACCTAATGGTTCCAA-TATCCATGTGG 355
                       *   *** *    ** **  *  *  ** *   * * * ** *     * *      **

consensus_9858#0      TGACAATTCAACTTATTCATTTAT-GCATAATAAAGTAC-ATAATGTAGTGAGTGGTAC- 551
consensus_9858#1      TGACAATTCAACTTATTCATTTAT-GCATAATAAAGTAC-ATAATGTAGTGAGTGGTAC- 589
consensus_9858#4      TGACAATTCAACTTATTCATTTAT-GCATAATAAAGTAC-ATAATGTAGTGAGTGGTAC- 207
consensus_9858#2      TGGT---CCAG---GTCAAGGTAC-ATGTCAAAAAGAAT-ATACACAAATTGATCGTATA 422
consensus_9858#3      TGTCG--TCAGTCTGTCAAGATTCCATGTGATACATTATTATAGATGAGATGATGGCATC 413
                      **      **     *  *  *      * * * *  *  ***    *     * * *  

consensus_9858#0      --ATTTTGTT---GTGCAGCTACTTCACCCAATGATCCTCTATTCTTAGTACATCATACA 606
consensus_9858#1      --ATTTTGTT---GTGCAGCTACTTCACCCAATGATCCTCTATTCTTAGTACATCATACA 644
consensus_9858#4      --ATTTTGTT---GTGCAGCTACTTCACCCAATGATCCTCTATTCTTAGTACATCATACA 262
consensus_9858#2      CCATTTTATTTAATTATGGATGATAGAATGAATTGGCCATCAAGATTTTTTAATCATTTT 482
consensus_9858#3      AGATTTTACATTTGTATGGA-ATCATATTGGATCAGATGATGTGGATGTTGAGGAATT-- 470
                        *****       *   *       *    **             *  *     **   

consensus_9858#0      CAAATTG-ATAGAATTTTCCAATTATGGTTTATGTATAATCGTCCACGTCCAACGGATTA 665
consensus_9858#1      CAAATTG-ATAGAATTTTCCA-TTA----------------------------------- 667
consensus_9858#4      CAAATTGGATAG------------------------------------------------ 274
consensus_9858#2      TGTAAAT-GTGAAAATCATTATTTTGGTATTTCATGTAATGAATGTTGGTATGGTTGGGA 541
consensus_9858#3      --GANAC-GTAGATATCGTAA--------------------------------------- 488
                         *     *                                                  

consensus_9858#0      TCCAAATCATGGAGTTGCACTTGGAAATTGTCGTGAATGTAATATGGTTGGTTTCATTCC 725
consensus_9858#1      ------------------------------------------------------------
consensus_9858#4      ------------------------------------------------------------
consensus_9858#2      AGGAAAATTTTGGTATAAACGTAAAGAATATATTCGATATAATATATTAT---------- 591
consensus_9858#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9858#0      TACAATTAAACACGTACAAATGTTTGTAAATACAAAACTAATAGGTTATACATATGATAA 785
consensus_9858#1      ------------------------------------------------------------
consensus_9858#4      ------------------------------------------------------------
consensus_9858#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9858#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9858#0      TTTTAATTTTGGTAAACGTGGCTTCAAGGGAGAAAAATACTTGAAATGTGGTCCTAAATA 845
consensus_9858#1      ------------------------------------------------------------
consensus_9858#4      ------------------------------------------------------------
consensus_9858#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9858#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9858#0      TCGTGTCTAATTTATTATTTACTTGAGATCATACCAATACAAAGCATAGAAGCTGAAATT 905
consensus_9858#1      ------------------------------------------------------------
consensus_9858#4      ------------------------------------------------------------
consensus_9858#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9858#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9858#0      GAATACTTTTGATCAACTTTAAATGAATAAATATTATTCCAAAAATAAAAAAAAATAAAA 965
consensus_9858#1      ------------------------------------------------------------
consensus_9858#4      ------------------------------------------------------------
consensus_9858#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9858#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9858#0      AAAAANCATCGN 977
consensus_9858#1      ------------
consensus_9858#4      ------------
consensus_9858#2      ------------
consensus_9858#3      ------------