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Schistosoma mansoni
cluster # 9880 cluster # 9880       Sequences # 12       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9880#0 length = 1269 sequences # 12  

consensusID : consensus_9880#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 12
consensus length = 1269
fasta sequence
                              [TATGCGATTGAAACCACATGAATTACGTTGTCGTTTGTTCATTTCATTTACTGGTGAAGAAGGTTTAGACTATGGCGGGTTATCACGAGAGTGGTTTTTCAAACTATCTACAGAATTATTAAATCCAATGTATTGCTTATTTGAATACGCCAGTGGTAATAATTATGCATTACAAATTAATCCTGCATCATCGGTTAATCCGGAACATTTGGAATATTTTCGATTTGTTGGACGATTTATCGCTTTAGCATTATATCATTCTAGATTTATTGATAATGGTTTCACTTTACCATTTTATAAACGTATGTTAAATAAAAATATCACTTTAGCTGATATTGAAACAGTCGATGTGGAATATTACAATTCATTGAAATTTATTCAAGAGAATAATATCGATGAATGCGCATTAGATGTTTACTTTGCTATGGATTATGAAGTGTTGGGTGAACTACGAACGCATGAATTGAAACCAGGCGGTAAAGATATTCTAGTGACTGATGCAAATAAAGCTGAGTATATTGATCTAATGGTTAATTGGAGATTTTCTCGTGGAGTAGAAGATCAGACAAATGCATTCCTCACTGGTTTCGAAGATGTTTTCCCTCTTCAATGGTTACAATATTTCGATGAACGTGAATTAGAAGTTTTATTATGTGGTATGCAACAGATCGATGTAGATGATTGGCAATTGCATACAACTT-ATAAAAAATACGATGCTCGTTCTCC-ACAAGTTTTATGGTTTTGGAAATTTGTTCGAA-GTTT-AACTCAACAAAGACGTATTCGATTACTTCAATTTGTCACTGGCACATGTC-GTGTCCCTGTTGGTGGATTTAAAAATC-TTATGGGTAATAATGGTCCACAACCATTTTGTATTG-AATATATTGGTAAAGATTCATGGCTACCTCGAA-GTCATACATGTTTTAATCGATTAGATCTACCACCATATCGATCATATGAACAATTGGCTGAGAAATTATCTTATGCAATTGATGAAACAGAAGGTTTTGGACAAGAATAGAACCCCTCTTTTCTGACAAAAACAAAGAAACTTACAAATTATGGTGCCTTTTTTCA-TATGTATATCTTGTAGAGAAGAGAATTGAAAAGAGGGATGAAAGAAGAAAAATAGTTGGATGATCATTATTTGATTACATAATTGTTTCACTTAATTGTGTTGTATTTGATACCAAAAAGTTGTTTTTCTTTTTTATCCTCTATGTCGACTTCGACTGTTTTTTTTCCTATCCAGATGATGTAAACTTTGTAAGC]

[+] EMBL CD134565             [TATGCGATTGAAACCACATGAATTACGTTGTCGTTTGTTCATTTCATTTACTGGTGAAGAAGGTTTAGACTATGGCGGGTTATCACGAGAGTGGTTTTTCAAACTATCTACAGAATTATTAAATCCAATGTATTGCTTATTTGAATACGCCAGTGGTAATAATTATGCATTACAAATTAATCCTGCATCATCGGTTAATCCGGAACATTTGGAATATTTTCGATTTGTTGGACGATTTATCGCTTTAGCATTATATCATTCTAGATTTATTGATAATGGTTTCACTTTACCATTTTATAAACGTATGTTAAATAAAAATATCACTTTAGCTGATATTGAAACAGTCGATGTGGAATATTACAATTCATTGAAATTTATTCAAGAGAATAATATCGATGAATGCGCATTAGATGTTTACTTTGCTATGGATTATGAAGTGTTGGGTGAACTACGAACGCATGAATTGAAACCAGGCGGTAAAGATATTCTAGTGACTGATGCAAATAAAGCTGAGTATATTGATCTAATGGTTAATTGGAGATTTTCTCGTGGAGTAGAAGATCAGAACAATGCATTCCTCACTGGTTTCGAAGATGTTTTCCCTCTTTCATGGTTACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD166493             [                                                                                                                 ccctacacAATCCAATGTATTGCTTATTTGAATACGCCAGTGGTAATAATTATGCATTACAAATTAATCCTGCATCATCGGTTAATCCGGAACATTTGGAATATTTTCGATTTGTTGGACGATTTATCGCTTTAGCATTATATCATTCTAGATTTATTGATAATGGTTTCACTTTACCATTTTATAAACGTATGTTAAATAAAAATATCACTTTAGCTGATATTGAAACAGTCGATGTGGAATATTACTATTCATTGTAATTTATTCAAGAG ATAATATCGATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL AI977236             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AGCTGATATTGAAACAGTCGATGTGGAATATTACAATTCATTGAAATTTATTCAAGAGAATAATATCGATGAATGCGCATTAGATGTTTACTTTGCTATGGATTATGAAGTGTTGGGTGAACTACGAACGCATGAATTGAAACCAGGCGGTAAAGATATTCTAGTGACTGATGCAAATAAAGCTGAGTATATTGATCTAATGGTTAATTGGAGATTTTCTCGTGGAGTAGAAGATCAGACAAATGCATTCCTCACTGGTTTCGAAGATGTTTTCCCTCTTCAATGGTTACAATATTTCGATGAACGTGAATTAGAAGTTTTATTATGTGGTATGCAACAGATCGATGTAGATGATTGGCAATTGCATACAACTT ATAAAAAATACGATGCTCGTTCTCC ACAAGTTTTATGGTTTTGGAAATTTGTTCGAA GTTT AACTCAACAAAGACGTATTCGATTACTTCAATTTGTCACTGGCACATGTC GTGTCCCTGTTGGTGGATTTAAAAATC TTATGGGTAATAATGGTCCACAACCATTTTGTATTG AATATATTGGTAAAag                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD194091             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATGGATTATGAAGTGTTGGGTGANCTACGACNGCATGAATTGAAACCAGGCGGTAAAGATATTCTAGTGACTGATGCAAATAAAGCTGAGTATATTGATCTAATGGTTAATTGGAGATTTTCTCGTGGAGTAGAAGATCAGACAAATGCATTCCTCACTGGTTCCGAAGATGTTTTCCCTCTTCAATGGTTACAATATTTCGATGAACGTGAATTAGAAGTTTTATTATGTGGTATGCAACAGATCGATGTAGATGATTGGCAATTGCATACAACTT ATAAAAAATACGATGCTCGTTCTCC ACAAGTTTTATGGTTTTGGAAATTTGTTCGAA GTTT AACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD158101             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gaAAAGCTGAGTATATTGATCTAATGGTTAATTGGAGATTTTCTCGTGGAGTAGAAGATCAGACAAATGCATTCCTCACTGGTTTCGAAGATGTTTTCCCTCTTCAATGGTTACAATATTTCGATGAACGTGAATTAGAAGTTTTATTATGTGGTATGCAACAGATCGATGTAGATGATTGGCAATTGCATACAACTT ATAAAAAATACGATGCTCGTTCTCC ACAAGTTTTATGGTTTTGGAAATTTGTTCGAAGGTTT AACTCAACAAAGACGTATTCGATTACTTCAATTTGTCACTGGCACATGTCGGTGTCCCTGTTGGTGGATTT AAAATC TTATGGGTAATAATGGTCCACAACCATTTTGTATTGAAATATATTGGTAAAGATTCATGGCTACCTCGAAGGTCATACATGTTTTAATCGATTAGATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD158235             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TATATTGATCTAATGGTTAATTGGAGATTTTCTCGTGGAGTAGAAGATCAGACAAATGCATTCCTCACTGGTTTCGAAGATGTTTTCCCTCTTCAATGGTTACAATATTTCGATGAACGTGAATTAGAAGTTTTATTATGTGGTATGCAACAGATCGATGTAGATGATTGGCAATTGCATACAACTT ATAAAAAATACGATGCTCGTTCTCC ACAAGTTTTATGGTTTTGGAAATTTGTTCGAA GTTTAAACTC ACAAAGACGTATTCGATTACTTCAATTTGTCACTGGCACATGTC GTGTCCCTGTTGGTGGATTT AAAATCTTTATGGGT AT ATGGTCCACACCNATTTTGTATTG  ATATATTGGT AAGA TCATGGCTACCTCG A GTCATA ATGTTTT ATCGA TAGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD158096             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TATATTGATCTAATGGTTAATTGGAGATTTTCTCGTGGAGTAGAAGATCAGACAAATGCACTCCTCACTGGTTTCGAAGATGTTTTCCCTCTTCAATGGTTACAATATTTCGATGAACGTGAATTAGAAGTTTTATTATGTGGTATGCAACAGATCGATGTAGATGATTGGCAATTGCATACAACTT ATAAAAAATACGATGCTCGTTCTCC ACAAGTTTTATGGTTTTGGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD158023             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TATATTGATCTAATGGTTAATTGGAGATTTTCTCGTGGAGTAGAAGATCAGACAAATGCATTCCTCACTGGTTTCGAAGATGTTTTCCCTCTTCAATGGTTACAATATTTCGATGAACGTGAATTAGAAGTTTTATTATGTGGTATGCAACAGATCGATGTAGATGATTGGCAATTGCATACAACTTAAAAAAAAATACGATGCTCGTTCTCCAACAAGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD152645             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            T AACTCAACAAAGACGTATTCGATTACTTCAATTTGTCACTGGCACATGTC GTGTCCCTGTTGGTGGATTTAAAAATC TTATGGGTAATAATGGTCCACAACCATTTTGTATTG AATATATTGGTAAAGATTCATGGCTACCTCGAA GTCATACATGTTTTAATCGATTAGATCTACCACCATATCGATCATATGAACAATTGGCTGAGAAATTATCTTATGCAATTGATGAAACAGAAGGTTTTGGACAAGAATAGAACCCCTCTTTTCTGACAAAAACAAAGAAACTTACAAATTATGGTGCCTTTTTTCA TATGTATATCTTGTAGAGAAGAGAATTGAAAAGAGGGATGAAAGAAGAAAAATAGTTGGATGATCATTATTTGATTACATAATTGTTTCACTTAATTGTGTTGTATTTGATACCAAAAAGTTGGTTTTCTTTTTTATCCTCTATGTCGACTTCGACTGTTTTTTTTCCTATCCAGATGATGTAAACTTTGTAAG ]
[-] EMBL CD152921             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GGTGCATTTAAAAATC TTATGGGTAATAATGGTCCACAACCATTTTGTATTG AATATATTGGTAAAGATTCATGGCTACCTCGAA GTCATACATGTTTTAATCGATTAGATCTACCACCATATCGATCGTATGAACAATTGGCTGAGAAATTATCTTATGCAATTGATGAAACAGAAGGTTTTGGACAAGAATAGAACCCCTCTTTTCTGACAAAAACAAATAAACTTACAAATTATGGTGCCTTTTTTCAGTATGTATATCTTGTAGAGAAGAGAATTGAAAAGAGGGATGAAAGAAGAAAAATAGTTGGATGATCATTATTAGATTACATAATTGTTTCACTTAATTGTGTTGTATTTGATGCCAAAAAGTTGTTTTTCTTTTTTATCCTCTATGTCGACTTCGACTGTTTTTTTTCCTATCCAGATGATGTAAACTTTGTAAGC]
[+] EMBL CD077518             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GTGGATTTAAAAATC TTATGGGTAATAATGGTCCACAACCATTTTGTATTG AATATATTGGTAAAGATTCATGGCTACCTCGAA GTCATACATGTTTTAATCGATTAGATCTACCACCATATCGATCATATGAACAATTGGCTGAGAAA TATCTTATGC ATTGATG AACAGAGGGTTTGGGACAg                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD152757             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTTTTTGACAAAAACAAAGAAACTTACAAATTATGGTGCCTTTTTTCA TATGTATATCTTGTAGAGAAGAGAATTGAAAAGAGGGATGAAAGAAGAAAAATAGTTGGATGATCATTATTTGATTACATAATTGTTTCACTTAATTGTGTTGTATTTGATACCAAAAAGTTGTTTTTCTTTTTTATCCTCTATGTCGACTTCGACTGTTTTTTTTCCTATCCAGATGATGTAAACTTTGTAAGC]


>consensus_9880#0 TATGCGATTGAAACCACATGAATTACGTTGTCGTTTGTTCATTTCATTTACTGGTGAAGA AGGTTTAGACTATGGCGGGTTATCACGAGAGTGGTTTTTCAAACTATCTACAGAATTATT AAATCCAATGTATTGCTTATTTGAATACGCCAGTGGTAATAATTATGCATTACAAATTAA TCCTGCATCATCGGTTAATCCGGAACATTTGGAATATTTTCGATTTGTTGGACGATTTAT CGCTTTAGCATTATATCATTCTAGATTTATTGATAATGGTTTCACTTTACCATTTTATAA ACGTATGTTAAATAAAAATATCACTTTAGCTGATATTGAAACAGTCGATGTGGAATATTA CAATTCATTGAAATTTATTCAAGAGAATAATATCGATGAATGCGCATTAGATGTTTACTT TGCTATGGATTATGAAGTGTTGGGTGAACTACGAACGCATGAATTGAAACCAGGCGGTAA AGATATTCTAGTGACTGATGCAAATAAAGCTGAGTATATTGATCTAATGGTTAATTGGAG ATTTTCTCGTGGAGTAGAAGATCAGACAAATGCATTCCTCACTGGTTTCGAAGATGTTTT CCCTCTTCAATGGTTACAATATTTCGATGAACGTGAATTAGAAGTTTTATTATGTGGTAT GCAACAGATCGATGTAGATGATTGGCAATTGCATACAACTTATAAAAAATACGATGCTCG TTCTCCACAAGTTTTATGGTTTTGGAAATTTGTTCGAAGTTTAACTCAACAAAGACGTAT TCGATTACTTCAATTTGTCACTGGCACATGTCGTGTCCCTGTTGGTGGATTTAAAAATCT TATGGGTAATAATGGTCCACAACCATTTTGTATTGAATATATTGGTAAAGATTCATGGCT ACCTCGAAGTCATACATGTTTTAATCGATTAGATCTACCACCATATCGATCATATGAACA ATTGGCTGAGAAATTATCTTATGCAATTGATGAAACAGAAGGTTTTGGACAAGAATAGAA CCCCTCTTTTCTGACAAAAACAAAGAAACTTACAAATTATGGTGCCTTTTTTCATATGTA TATCTTGTAGAGAAGAGAATTGAAAAGAGGGATGAAAGAAGAAAAATAGTTGGATGATCA TTATTTGATTACATAATTGTTTCACTTAATTGTGTTGTATTTGATACCAAAAAGTTGTTT TTCTTTTTTATCCTCTATGTCGACTTCGACTGTTTTTTTTCCTATCCAGATGATGTAAAC TTTGTAAGC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)