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Schistosoma mansoni
cluster # 9891 cluster # 9891       Sequences # 12       consensus # 3


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9891#0 length = 1055 sequences # 6  
consensus_9891#1 length = 874 sequences # 2  
consensus_9891#2 length = 474 sequences # 4  

consensusID : consensus_9891#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1055
fasta sequence
                              [GTGCACAGCATCTTCGGCTGTGGTATATGCTGTTGGATTTTCACCGTGACCACATCTCCTGGTGCCAGTGTAAACACATAGCTTTTTGTGGATTTAATTACGACAAAAATGGGTCTGCCTGTTGTGCTATTCGTAATGTATGGATATAAGATGACTTTATTCCTTGCTGTATTTGTGTTTTTGTGGTGCATGTATATTTGGGAAACATACTTGAGTATTCGTCAAAGAAGAAAAATTGTTGACACAAGAACAGTGCCTATTGAACTAGCAAGTGTTATGGATAATGATAAGTTTCAAAAGTCGCGTCTTTATGCGATTGATCGATCAAGCTTTGGTCTGGTCAGTGGGTTTTATCATATGATAGAGCTATCAGTGACCTTGTACTTTTCATTGATACCATGGTTGTGGTATACAGTTGTTAACCACAGCACTATCTTGAATGCCTATGTGGTAGACAAATTTGGTGTCGATATGGGCTTTGATAAAGATAGTGAGATAAAGTGTTCCGTCATTTTTTTCCTGTATGTAGCTGTATTTGTATTTTTCGACTCACTCCCTTGGACGATTTACAGCACATTCGTAATAGAAGCGCGCCATGGGTTTAACAAGCAAACTTTTGGTTTTTTCATTAAAGACCAAATCAAGTCGCTTTTGATTTCGATGATTATTGGCATTCCAATAATGTC-TTGTTTAGTTTGGATAATCAAAGTTGGTGGACATTATTTCTATTTGTATGCTTTTTTATTCACAGTCGTGGTCACTGTGTTTCTGATGTTTGTGTATCCAGAGTTCATCGCTCCATTGTTTGATCGTTATGAACCATTACCTGATGGACCTTTAAAAACGAAAATTGAAACATTAGCTGCGTCTATCAAGTTTCCTTTGAAAAAGCTCTTAGTTGTTGAAGGATCAAGACGTTCCGCTCATAGCAATGCATATTTGTAGCGCTTTGGTAATAACAAAAGGATTGTAATTTTTGACACACTTATTCGTGGTTTCAAATTTCCAAATAAAAACGAAGATCTACCGAATCAGGGAAGTAAAAATGACTCAGA]

[+] EMBL CD075563             [GTGCACAGCATCTTCGGCTGTGGTATATGCTGTTGGATTTTCACCGTGACCACATCTCCTGGTGCCAGTGTAAACACATAGCTTTTTGTGGATTTAATTACGACAAAAATGGGTCTGCCTGTTGTGCTATTCGTAATGTATGGATATAAGATGACTTTATTCCTTGCTGTATTTGTGTTTTTGTGGGGCATGTATATTTGGGAAACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL BF936394             [                                    ATTTTCACCGTGACCACATCTCCTGGTGCCAGTGTAAACACATAGCTTTTTGTGGATTTAATTACGACAAAAATGGGTCTGCCTGTTGTGCTATTCGTAATGTATGGATATAAGATGACTTTATTCCTTGCTGTATTTGTGTTTTTGTGGTGCATGTATATTTGGGAAACATACTTGAGTATTCGTCAAAGAAGAAAAATTGTTGACACAAGAACAGTGCCTATTGAACTAGCAAGTGTTATGGATAATGATAAGTTTCAAAAGTCGCGTCTTTATGCGATTGATCGATCAAGCTTTGGTCTGGTCAGTGGGTTTTATCATATGATAGAGCTATCAGTGACCTTGTACTTTTCATTGATACCATGGTTGTGGTATACAGTTGTTAACCACAGCACTATCTTGAATGCCTATGTGGTAGACAAATTTGGTGTCGATATGGGCTTTGATAAAGATAGTGAGATAAAGTGTTCCGTCATTTTTTTCCTGTATGTAGCTGTATTTGTATTTTTCGACTCACTCCCTTGGACGATTTACAGCACATTCGTAATAGAAGCGCGCCATGGGTTTAACAAGCAAACTTTTGGTTTTTTCATTAAAGACCAAATCAAGTCGCTTTTGATTTCGATGATTATTGGCATTCCAATAATGTCTTTGTTTAGTTTGGATAATCAAAGTTGGTGGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD118626             [                                           CCGTGACCACATCTCCTGGTGCCAGTGTAAACACATAGCTTTTTGTGGATTTAATTACGACAAAAATGGGTCTGCCTGTTGTGCTATTCGTAATGTATGGATATAAGATGACTTTATTCCTTGCTGTATTTGTGTTTTTGTGGTGCATGTATATTTGGGAAACATACTTGAGTATTCGTCAAAGAAGAAAAATTGTTGACACAAGAACAGTGCCTATTGAACTAGCAAGTGTTATGGATAATGATAAGTTTCAAAAGTCGCGTCTTTATGCGATTGATCGATCAAGCTTTGGTCTGGTCAGTGGGTTTTATCATATGATAGAGCTATCAGTGACCTTGTACTTTTCATTGATACCATGGTTGTGGTATACAGTTGTTAACCACAGCACTATCTTGAATGCCTATGTGGTAGACAAATTTGGTGTCGATATGGGCTTTGATAAAGATAGTGAGATAAAGTGTTCCGTCATTTTTTTCCTGTATGTAGCTGTATTTGTATTTTTCGACTCACTCCCTTGGACGATTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD167779             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TATCATATGATAGAGCTATCAGTGACCTTGTACTTTTCATTGATACCATGGTTGTGGTATACAGTTGTTAACCACAGCACTATCTTGAATGCCTATGTGGTAGACAAATTTGGTGTCGATATGGGCTTTGATAAAGATAGTGAGATAAAGTGTTCCGTCATTTTTTTCCTGTATGTAGCTGTATTTGTATTTTTCGACTCACTCCCTTGGACGATTTACAGCACATTCGTAATAGAAGCGCGCCATGGGTTTAACAAGCAAACTTTTGGTTTTTTCATTAAAGACCAAATCAAGTCGCTTTTGATTTCGATGATTATTGGCATTCCAATAATGTC TTGTTTAGTTTGGATAATCAAAGTTGGTGGACATTATTTCTATTTGTATGCTTTTTTATTCACAGTCGTGGTCACTGTGTTTCTGATGTTTGTGTATCCAGAGT                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD180827             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GATAGTGAGATAAAGTGTTCCGTCATTTTTTTCCTGTATGTAGCTGTATTTGTATTTTTCGACTCACTCCCTTGGACGATTTACAGCACATTCGTAATAGAAGCGCGCCATGGGTTTAACAAGCAAACTTTTGGTTTTTTCATTAAAGACCAAATCAAGTCGCTTTTGATTTCGATGATTATTGGCATTCCAATAATGTC TTGTTTAGTTTGGATAATCAAAGTTGGTGGACATTATTTCTATTTGTATGCTTTTTTATTCACAGTCGTGGTCACTGTGTTTCTGATGTTTGTGTATCCAGAGTTCATCGCTCCATTGTTTGATCGTTATG                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD113416             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTGTATTCTTCGACTCACTCCCTTGGACGATTTACAGCACATTCGTAATAGAAGCGCGCCATGGGTTCAACAAGCAAACTTTTGGGTTTTTCATTAAAGACCAAATCAAGTCGCTTTTGATTTCGATGATTATTGGCATTCCAATAATGTC TTGTTTAGTTTGGATAATCAAAGTTGGTGGACATTATTTCTATTTGTACGCTTTTTTATTCACAGTCGTGGTCACAGTGTTTCTGATGTTTGTGTATCCAGAGTTCATCGCTCCATTGTTTGATCGTTATGAACCATTACCTGATGGACCTTTAAAAACGAAAATTGAAACATTAGCTGCGTCTATCAAGTTTCCTTTGAAAAAGCTCTTAGTTGTTGAAGGATCAAGACGTTCCGCTCATAGCAATGCATATTTGTAGCGCTTTGGTAATAACAAAAGGATTGTAATTTTTGACACACTTATTCGTGGTTTCAAATTTCCAAATAAAAACGAAGATCTACCGAATCAGGGAAGTAAAAATGACTCAGA]


>consensus_9891#0 GTGCACAGCATCTTCGGCTGTGGTATATGCTGTTGGATTTTCACCGTGACCACATCTCCT GGTGCCAGTGTAAACACATAGCTTTTTGTGGATTTAATTACGACAAAAATGGGTCTGCCT GTTGTGCTATTCGTAATGTATGGATATAAGATGACTTTATTCCTTGCTGTATTTGTGTTT TTGTGGTGCATGTATATTTGGGAAACATACTTGAGTATTCGTCAAAGAAGAAAAATTGTT GACACAAGAACAGTGCCTATTGAACTAGCAAGTGTTATGGATAATGATAAGTTTCAAAAG TCGCGTCTTTATGCGATTGATCGATCAAGCTTTGGTCTGGTCAGTGGGTTTTATCATATG ATAGAGCTATCAGTGACCTTGTACTTTTCATTGATACCATGGTTGTGGTATACAGTTGTT AACCACAGCACTATCTTGAATGCCTATGTGGTAGACAAATTTGGTGTCGATATGGGCTTT GATAAAGATAGTGAGATAAAGTGTTCCGTCATTTTTTTCCTGTATGTAGCTGTATTTGTA TTTTTCGACTCACTCCCTTGGACGATTTACAGCACATTCGTAATAGAAGCGCGCCATGGG TTTAACAAGCAAACTTTTGGTTTTTTCATTAAAGACCAAATCAAGTCGCTTTTGATTTCG ATGATTATTGGCATTCCAATAATGTCTTGTTTAGTTTGGATAATCAAAGTTGGTGGACAT TATTTCTATTTGTATGCTTTTTTATTCACAGTCGTGGTCACTGTGTTTCTGATGTTTGTG TATCCAGAGTTCATCGCTCCATTGTTTGATCGTTATGAACCATTACCTGATGGACCTTTA AAAACGAAAATTGAAACATTAGCTGCGTCTATCAAGTTTCCTTTGAAAAAGCTCTTAGTT GTTGAAGGATCAAGACGTTCCGCTCATAGCAATGCATATTTGTAGCGCTTTGGTAATAAC AAAAGGATTGTAATTTTTGACACACTTATTCGTGGTTTCAAATTTCCAAATAAAAACGAA GATCTACCGAATCAGGGAAGTAAAAATGACTCAGA



consensusID : consensus_9891#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 874
fasta sequence
                              [ACANGCCAGAATTTGGCACGAGGGTCATGAACCATTACCTGATGGACCTTTAAAAACGAAAATTGAAACATTAGCTGCGTCTATCAAGTTTCCTTTGAAAAAGCTCTTAGTTGTTGAAGGATCAAGACGTTCCGCTCATAGCAATGCATATTTCTATGGCTTTGGTAATAACAAAAGGATTGTAATTTTTGATACACTTATTCGTGGTTTCAAATTTCCAAATAAAAACGAAGATCTAACGAAGCAGGAAACTAAAAATGACTCAGAACAACGAGGCTGTGCAGTTGATGAAGAAATCTTGTCAGTGATCGCTCATGAGTTAGGACATTGGAAACTAGGGCATACAGTTTACAATCTTTTCATCGGGAAGGCAAATCTCTTGATGTTGTTTGTAATATTTGGCCTTCTGATGGATGTGGATGATTTGTTCATTTCTTTTGGTTTTAAAAGTAATGATACACCAGTAATACTGAGACTGTTTATTATCTTTCAGTACATTTTCTCTCCGTATAATACGGTTATTGACTTTCTAATGACAGTTTTGTCTAGGAAATTTGAATTCCAGGCAGATGCCTTTGCTGCTAAATTGGGTTATAAACATTATTTAAAATCTGCCTTGGTAATTCTATTAAAAGACAATTTATCATTTCCTGTCTGTGATTGGTTGTATTCAATGTTTAACCATTCTCATCCACCACTTCTTGAGCGTTTGAGTGCAATTGACAAAGTGT-AATCTGACTAANNATATGTTGNATTTTCATTCACATTTGTNTTATTC-GCCTCTATTGG-TGAA-ATATGNNT-GCA-TCACCATNNTG-TG-T-AC-TTTGC-AAG-TTTCTCA-TG-TTCTNAAGTAGATG-TTTTTC-CTA-ATAANTTTACACTA]

[+] EMBL CD080823             [ACANGCCAGAATTTGGCACGAGGGTCATGAACCATTACCTGATGGACCTTTAAAAACGAAAATTGAAACATTAGCTGCGTCTATCAAGTTTCCTTTGAAAAAGCTCTTAGTTGTTGAAGGATCAAGACGTTCCGCTCATAGCAATGCATATTTCTATGGCTTTGGTAATAACAAAAGGATTGTAATTTTTGATACACTTATTCGTGGTTTCAAATTTCCAAATAAAAACGAAGATCTAACGAAGCAGGAAACTAAAAATGACTCAGAACAACGAGGCTGTGCAGTTGATGAAGAAATCTTGTCAGTGATCGCTCATGAGTTAGGACATTGGAAACTAGGGCATACAGTTTACAATCTTTTCATCGGGAAGGCAAATCTCTTGATGTTGTTTGTAATATTTGGCCTTCTGATGGATGTGGATGATTTGTTCATTTCTTTTGGTTTTAAAAGTAATGATACACCAGTAATACTGAGACTGTTTATTATCTTTCAGTACATTTTCTCTCCGTATAATACGGTTATTGACTTTCTAATGACAGTTTTGTCTAGGAAATTTGAATTCCAGGCAGATGCCTTTGCTGCTAAATTGGGTTATAAACATTATTTAAAATCTGCCTTGGTAATTCTATTAAAAGACAATTTATCATTTCCTGTCTGTGATTGGTTGTATTCAATGTTTAACCATTCTCATCCACCACTTCTTGAGCGTTTGAGTGCAATTGACAAAGTGT AATCTGACTAANNATATGTTGNATTTTCATTCACATTTGTNTTATTC GCCTCTATTGG TGAA ATATGNNT GCA TCACCATNNTG TG T AC TTTGC AAG TTTCTCA TG TTCTNAAGTAGATG TTTTTC CTA ATAANTT       ]
[+] EMBL CD078549             [                                                                                                                                                                                                                                                                       CAGAACAACGAGGCTGTGCAGTTGATGAAGAAATCTTGTCAGTGATCGCTCATGAGTTAGGACATTGGAAACTAGGGCATACAGTTTACAATCTTTTCATCGGGAAGGCAAATCTCTTGATGTTGTTTGTAATATTTGGCCTTCTGATGGATGTGGATGATTTGTTCATTTCTTTTGGTTTTAAAAGTAATGATACACCAGTAATACTGAGACTGTTTATTATCTTTCAGTACATTTTCTCTCCGTATAATACGGTTATTGACTTTCTAATGACAGTTTTGTCTAGGAAATTTGAATTCCAGGCAGATGCCTTTGCTGCTAAATTGGGTTATAAACATTATTTAAAATCTGCCTTGGTAATTCTATTAAAAGACAATTTATCATTTCCTGTCTGTGATTGGTTGTATTCAATGTTTAACCATTCTCATCCACCACTTCTTGAGCGTTTGAGTGCAATTGAC AAGTGTAAATCTGACTAA ATTATGTTGTATTTTCATTCACATTTGTTTTATTCGGCCTCTATTGGCTGAATAT TGCTTGGCATTCACCAT TTGTTGNTCACTTTTGCAAAGTTTTCTCAGTGTTTCT AACAACATGTTTTTTCACTATATAAATNTACACTA]


>consensus_9891#1 ACANGCCAGAATTTGGCACGAGGGTCATGAACCATTACCTGATGGACCTTTAAAAACGAA AATTGAAACATTAGCTGCGTCTATCAAGTTTCCTTTGAAAAAGCTCTTAGTTGTTGAAGG ATCAAGACGTTCCGCTCATAGCAATGCATATTTCTATGGCTTTGGTAATAACAAAAGGAT TGTAATTTTTGATACACTTATTCGTGGTTTCAAATTTCCAAATAAAAACGAAGATCTAAC GAAGCAGGAAACTAAAAATGACTCAGAACAACGAGGCTGTGCAGTTGATGAAGAAATCTT GTCAGTGATCGCTCATGAGTTAGGACATTGGAAACTAGGGCATACAGTTTACAATCTTTT CATCGGGAAGGCAAATCTCTTGATGTTGTTTGTAATATTTGGCCTTCTGATGGATGTGGA TGATTTGTTCATTTCTTTTGGTTTTAAAAGTAATGATACACCAGTAATACTGAGACTGTT TATTATCTTTCAGTACATTTTCTCTCCGTATAATACGGTTATTGACTTTCTAATGACAGT TTTGTCTAGGAAATTTGAATTCCAGGCAGATGCCTTTGCTGCTAAATTGGGTTATAAACA TTATTTAAAATCTGCCTTGGTAATTCTATTAAAAGACAATTTATCATTTCCTGTCTGTGA TTGGTTGTATTCAATGTTTAACCATTCTCATCCACCACTTCTTGAGCGTTTGAGTGCAAT TGACAAAGTGTAATCTGACTAANNATATGTTGNATTTTCATTCACATTTGTNTTATTCGC CTCTATTGGTGAAATATGNNTGCATCACCATNNTGTGTACTTTGCAAGTTTCTCATGTTC TNAAGTAGATGTTTTTCCTAATAANTTTACACTA



consensusID : consensus_9891#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 474
fasta sequence
                              [TGAATGTGGATGATTTGTTCATTTCTTTTGGTTTTAAAAGTAATGATACACCAGTAATACTGAGACTGTTTATTATCTTTCAGTACATTTTCTCTCCGTATAATACGGTTATTGACTTTCTAATGACAGTTTTGTTTAGGAAATTTGAATTCCAGGCAGATGCCTTTGCTGCTAAATTGGGTTATAAACATTATTTAAAATCTGCCTTGGTAATTCTATTAAAAGACAATTTATCATTTCCTGTCTGTGATTGGTTGTATTCAATGTTTAACCATTTTCATCCACCACTTCTTGAGCGTTTGAGTGCAATTGACAAGTGTAAATCTGACTAAATTATGTTGTATTTTCATTCACATTTGTTTTATTCGGCCTCTATTGGTTGAATATTGTTTGGCATTCACCATTTGTTGTTCACTTTTGCAAAGTTTTCTCAGTGTTTCTAAGTAAGATGTTTTTTCACTATATAAATTTACA]

[-] EMBL CD073016             [TGAATGTGGATGATTTGTTCATTTCTTTTGGTTTTAAAAGTAATGATACACCAGTAATACTGAGACTGTTTATTATCTTTCAGTACATTTTCTCTCCGTATAATACGGTTATTGACTTTCTAATGACAGTTTTGTTTAGGAAATTTGAATTCCAGGCAGATGCCTTTGCTGCTAAATTGGGTTATAAACATTATTTAAAATCTGCCTTGGTAATTCTATTAAAAGACAATTTATCATTTCCTGTCTGTGATTGGTTGTATTCAATGTTTAACCATTTTCATCCACCACTTCTTGAGCGTTTGAGTGCAATTGACAAGTGTAAATCTGACTAAATTATGTTGTATTTTCATTCACATTTGTTTTATTCGGCCTCTATTGGTTGAATATTGTTTGGCATTCACCATTTGTTGTTCACTTTTGCAAAGTTTTCTCAGTGTTTCTAAGTAAGATGTTTTTTCACTATATAAATTTACA]
[-] EMBL CD081847             [                                                                                                        ACGGTTATTGACTTTTTAATGACAGTTTTGTTTAGGAAATTTGAATTCCAGGCAAATGCCTTTGCTGTTAAATTGGGTTATAAACATTATTTAAAATCTGCCTTGGTAATTTTATTAAAAGACAATTTATCATTTCCTGTCTGTGATTGGTTGTATTCAATGTTTAACCATTTTCATCCCCCACTTTTTAAGCGTTTGAGTGCAATTGACAAGTGTAAATCTGATTAAATTATGTGGTATTTTCATTCACATTTGTTTTATTCGGCCTCTATTGGTTGAATATTGTTTGGCATTCCCCATTTGTTGTTCACTTTTGCAAAGTTTTCTCAGTGTTTTTAAGTAAGATGTTTTTTCACTATATAAATTTCCA]
[-] EMBL SMW760               [                                                                                                                  ACTTTCTAATGACAGTTTTGTCTAGGAAATTTGAATTCCAGGCAGATGCCTTTGCTGCTAAATTGGGTTATAAACATTATTTAAAATCTGCCTTGGTAATTCTATTAAAAGACAATTTATCATTTCCTGTCTGTGATTGGTTGTATTCAATGTTTAACCATTCTCATCCACCACTTCTTGAGCGTTTGAGTGCAATTGACAAGTGTAAATCTGACTAAATTATGTTGTATTTTCATTCACATTTGTTTTATTCGGCCTCTATTGGTTGAATATTGTTTGGCATTCACCATTTGTTGTTCACTTTTGCAAAGTTTTCTCAGTGTTTCTAAGTAAGATGTTTTTTCACTATATAAATTTACA]
[-] EMBL SMT14623             [                                                                                                                                                                                                                                              TCCTNTCTGTGATTGGTTGTATTCAATGTTTAACCATTCTCATCCACCACTTCTTGANCGTTTGAGTGCAATTGACAAGTGTAAATCTGACTAAATTATGTTGTATTTTCATTCACATTTGTTTTATTCGGCCTCTATTGGTTGAATATTGTTTGGCATTCNCCATTTGTTGTTCAC  TTG  AAGNTTTCNCAGTGTTTCTAAGTAAGATGTTTTTTCNCTATATAAATTTACA]


>consensus_9891#2 TGAATGTGGATGATTTGTTCATTTCTTTTGGTTTTAAAAGTAATGATACACCAGTAATAC TGAGACTGTTTATTATCTTTCAGTACATTTTCTCTCCGTATAATACGGTTATTGACTTTC TAATGACAGTTTTGTTTAGGAAATTTGAATTCCAGGCAGATGCCTTTGCTGCTAAATTGG GTTATAAACATTATTTAAAATCTGCCTTGGTAATTCTATTAAAAGACAATTTATCATTTC CTGTCTGTGATTGGTTGTATTCAATGTTTAACCATTTTCATCCACCACTTCTTGAGCGTT TGAGTGCAATTGACAAGTGTAAATCTGACTAAATTATGTTGTATTTTCATTCACATTTGT TTTATTCGGCCTCTATTGGTTGAATATTGTTTGGCATTCACCATTTGTTGTTCACTTTTG CAAAGTTTTCTCAGTGTTTCTAAGTAAGATGTTTTTTCACTATATAAATTTACA



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_9891#1      ------------------------------------------------------------
consensus_9891#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9891#0      GTGCACAGCATCTTCGGCTGTGGTATATGCTGTTGGATTTTCACCGTGACCACATCTCCT 60
                                                                                  

consensus_9891#1      -------------------------------------ACANGCCAGAATTTGGCACGAGG 23
consensus_9891#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9891#0      GGTGCCAGTGTAAACACATAGCTTTTTGTGGATTTAATTACGACAAAAATGGGTCTGCCT 120
                                                                                  

consensus_9891#1      GTCATGA-ACCATTACCTGATGGACCTTTAAAAACGAAAATTGAAACATTAGCTGCGTCT 82
consensus_9891#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9891#0      GTTGTGCTATTCGTAATGTATGGATATAAGATGACTTTATTCCTTGCTGTATTTGTGTTT 180
                                                                                  

consensus_9891#1      AT------CAAGTTTCCTTTGAAAAAGCTCTTAGTTGTTGAAGGATCAAGACGTTCCGCT 136
consensus_9891#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9891#0      TTGTGGTGCATGTATATTTGGGAAACATACTTGAGTATTCGTCAAAGAAGAAAAATTGTT 240
                                                                                  

consensus_9891#1      CATA-----GCAATGCATATTTCTATGGCTTTGGTAATAACAAAAGGATTGTAATTTTTG 191
consensus_9891#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9891#0      GACACAAGAACAGTGCCTATTGAACTAGCAAGTGTTATGGATAATGATAAGTTTCAAAAG 300
                                                                                  

consensus_9891#1      ATACACTTATTCGTGGTT------TCAAATTTCCAAATAAAAACGAAGATCTAACGAAGC 245
consensus_9891#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9891#0      TCGCGTCTTTATGCGATTGATCGATCAAGCTTTGGTCTGGTCAGTGGGTTTTATCATATG 360
                                                                                  

consensus_9891#1      AGGAAACTAAAAATGACTCAGAACAACGAGGCTGTGCAGTTGATGAAGAAATC--TTGTC 303
consensus_9891#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9891#0      ATAGAGCTATCAGTGACCTTGTACTTTTCATTGATACCATGGTTGTGGTATACAGTTGTT 420
                                                                                  

consensus_9891#1      AGTGATCGCTCATGAGTTAGGACATTGGAAACTAGGGCATACAGTTTACAATCTTTTCAT 363
consensus_9891#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9891#0      AACCACAGCAC-TATCTTGAATGCCTATGTGGTAGACAAATTTGGTGTCGATATGGGCTT 479
                                                                                  

consensus_9891#1      CGGGAAGGCAAATCTCTTGATGTTGTTTGTAATATTTGGCCTTCTGATGGATGTGGATGA 423
consensus_9891#2      -----------------------------------------------TGAATGTGGATGA 13
consensus_9891#0      TGATAAAGATAGTGAGATAAAGTGTTCCGTCATTTTTTTCCTGTATGTAGCTGTATTTGT 539
                                                                     *   ***   ** 

consensus_9891#1      TTTGTTCATTTCTTTTGGTTTTAAAAGTAATGATACACCAGTAATACTGAGACTGTTTAT 483
consensus_9891#2      TTTGTTCATTTCTTTTGGTTTTAAAAGTAATGATACACCAGTAATACTGAGACTGTTTAT 73
consensus_9891#0      ATTTTTCGACTCACTCCCTTGGACGATTTACAGCACATTCGTAATAGAAGCGCGCCATGG 599
                       ** ***   **  *   **  *  * * *    ***   ******      *    *  

consensus_9891#1      TATCTTTCAGTACATTTTCTCTCCGTATAATACGGTT---ATTGACTTTCTAATGACAGT 540
consensus_9891#2      TATCTTTCAGTACATTTTCTCTCCGTATAATACGGTT---ATTGACTTTCTAATGACAGT 130
consensus_9891#0      GTTTAACAAGCAAACTTTTGGTTTTTTCATTAAAGACCAAATCAAGTCGCTTTTGATTTC 659
                        *     ** * * ***   *   *  * **  *     **  * *  **  ***    

consensus_9891#1      TTTGTCTAG-GAAATTTGAATTCCAGGCAGATGCCTTTGCTGCTAAATTGGGTTA-TAAA 598
consensus_9891#2      TTTGTTTAG-GAAATTTGAATTCCAGGCAGATGCCTTTGCTGCTAAATTGGGTTA-TAAA 188
consensus_9891#0      GATGATTATTGGCATTCCAATAATGTCTTGTTTAGTTTG--GATAATCAAAGTTGGTGGA 717
                        **  **  *  ***  ***        * *   ****  * ***     ***  *  *

consensus_9891#1      CATTATTTAAAATC---TGCCTTGGTAATTCTATTAAAAGACA----ATTTATCATTTCC 651
consensus_9891#2      CATTATTTAAAATC---TGCCTTGGTAATTCTATTAAAAGACA----ATTTATCATTTCC 241
consensus_9891#0      CATTATTTCTATTTGTATGCTTTTTTATTCACAGTCGTGGTCACTGTGTTTCTGATGTTT 777
                      ********  * *    *** **  ** *   * *    * **     *** * ** *  

consensus_9891#1      ---TGTCTGTGATTGGTTGTATTCAATGTTTAACCATTCTCATCCACCACTTCTTGAGCG 708
consensus_9891#2      ---TGTCTGTGATTGGTTGTATTCAATGTTTAACCATTTTCATCCACCACTTCTTGAGCG 298
consensus_9891#0      GTGTATCCAGAGTTCATCGC-TCCATTGTTTGATCGTTATGAACCATTACCTGATGGACC 836
                         * **     **  * *  * ** ***** * * ** * * ***  ** *  **  * 

consensus_9891#1      TTTGAGTGCAATTGACAAAGTGTAATCTGACTAANNATATGTTGNATTTTCATTCACATT 768
consensus_9891#2      TTTGAGTGCAATTGACAAGTGTAAATCTGACTAAAT-TATGTTGTATTTTCATTCACATT 357
consensus_9891#0      TTTAAAAACGAAAATTGAAACATTAGCTGCGTCTAT-CAAGTTTCCTTTGAAAAAGCTCT 895
                      *** *   * *      *      * ***  *      * ***   ***  *    *  *

consensus_9891#1      TGTNTTATTCG-CCTCTATTGGTGAA----ATATGNNT--GCAT-CACCATNNTGTGTAC 820
consensus_9891#2      TGTTTTATTCGGCCTCTATTGGTTGA----ATATTGTTTGGCATTCACCATTTGTTGTTC 413
consensus_9891#0      TAGTTGTTGAAGGATCAAGACGTTCCGCTCATAGCAATGCATATTTGTAGCGCTTTGGTA 955
                      *   *  *      ** *   **       ***    *    **           **   

consensus_9891#1      ---TTTGCAAG--T----TTCTCA-TGTTCTNAAGTA-GATGTTTTTC--CTA-ATAANT 866
consensus_9891#2      ACTTTTGCAAAGTT----TTCTCAGTGTTTCTAAGTAAGATGTTTTTTCACTATATAAAT 469
consensus_9891#0      ATAACAAAAGGATTGTAATTTTTGACACACTTATTCGTGGTTTCAAATTTCCAAATAAAA 1015
                              *    *    ** *          *     * * *       * * ****  

consensus_9891#1      TTACACTA-------------------------------- 874
consensus_9891#2      TTACA----------------------------------- 474
consensus_9891#0      ACGAAGATCTACCGAATCAGGGAAGTAAAAATGACTCAGA 1055
                          *                                   




Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)