cluster # 9899

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Schistosoma mansoni
cluster # 9899 cluster # 9899 Sequences # 12 consensus # 3

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consensus_9899#0 length = 910 sequences # 9

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consensus_9899#2 length = 481 sequences # 1

consensusID : consensus_9899#0
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NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
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fasta sequence

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[+] EMBL CD145337             [GGGAAAGCCCCACAAATGGATATTATACAAAGTCTAGTTTTAAATCTTGACAATGAAGGTCGTTATCTCTTACTTAATTGTATGGCAAATCAATTACGTTATCCTAATTCGCATACATATTATTTCAGTTATACAATATTATATTTATTCTCTGAACAATCTAAAGAACAAGTTAAAGAACAAATAAGTCGTGTACTAATGGAAAGACTAATTGTAAATCGTCCACATCCATGGGGTTTATTAATGACTAGTGCAGAATTATTACGTAATCCAGCTTATCGATTTTGGGAACATGAATTTGCACGATGTAATCCAGAAATTGAAGCAATTGTAACTATTGTTGCTCGTAGTTGTATACCAAATTTTCAAATTCCCAATGTAAATTCTTCTGATATTTGTACAACTTCTAGTGTGGTTTCATCAAATCTACGTTATGCTTTATTATCATCGGGAACCGCTCAAGGTTCAGTTTAATTAATCATCATTAGAATGATGATAACACAC    TATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTGTATTTGGGTGAATAAATTATCATTNTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
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[+] EMBL CD145343             [                  GATATTATACAAAGTCTAGTTTTAAATCTTGACAATGAAGGTCGTTATCTCTTACTTAATTGTATGGCAAATCAATTACGTTATCCTAATTCGCATACATATTATTTCAGTTATACAATATTATATTTATTCTCTGAACAATCTAAAGAACAAGTTAAAGAACAAATAAGTCGTGTACTAATGGAAAGACTAATTGTAAATCGTCCACATCCATGGGGTTTATTAATGACTAGTGCAGAATTATTACGTAATCCAGCTTATCGATTTTGGGAACATGAATTTGCACGATGTAATCCAGAAATTGAAGCAATTGTAACTATTGTTGCTCGTAGTTGTATACCAAATTTTCAAATTCCCAATGTAAATTCTTCTGATATTTGTACAACTTCTAGTGTGGTTTCATCAAATCTACGTTATGCTTTATTATCATCGGGAACCGCTCAAGGTTCAGTTTAATTAATCATCATTAGAATGATGATAACACACTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTGTATTTGTGTGAATAAATTATCATTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD075799             [                                                  cttatcAGGTCGTTATCTCTTACTTAATTGTATGGCAAATCAATTACGTTATCCTAATTCGCATACATATTATTTCAGTTATACAATATTATATTTATTCTCTGAACAATCTAAAGAACAAGTTAAAGAACAAATAAGTCGTGTACTAATGGAAAGACTAATTGTAAATCGTCCACATCCATGGGGTTTATTAATGACTAGTGCAGAATTATTACGTAATCCAGCTTATCGATTTTGGGAACATGAATTTGCACGATGTAATCCAGAAATTGAAGCAATTGTAACTATTGTTGCTCGTAGTTGTATACCAAATTTTCAAATTCCCAATGTAAATTCTTCTGATATTTGTACAACTTCTAGTGTGGTTTCATCAAATCTACGTTATGCTTTATTATCATCGGGAACCGCTCAAGGTTCAGTTTAATTAATCATCATTAGAATGATGATAACACACTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD083602             [                                                            gGTTATCTCTTACTTAATTGTATGGC AATCAATTACGTTATCCTAATTCGCATACATATTATTTCAGTTATACAATATTATATTTATTCTCTGAACAATCTAAAGAACAAGTTAAAGAACAAATAAGTCGTGTACTAATGGAAAGACTAATTGTAAATCGTCCACATCCATGGGGTTTATTAATGACTAGTGCAGAATTATTACGTAATCCAGCTTATCGATTTTGGGAACATGAATTTGCACGATGTAATCCAGAAATTGAAGCAATTGTAACTATTGTTGCTCGTAGTTGTATACCAAATTTTCAAATTCCCAATGTAAATTCTTCTGATATTTGTACAACTTCTAGTGTGGTTTCATCAAATCTACGTTATGCTTTATTATCATCGGGAACCGCTCAAGGTTCAGTTTAATTAATCATCATTAGAATGATGATAACACACTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTGTATTTGTGTGAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
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>consensus_9899#0
GGGAAAGCCCCACAAATGGATATTATACAAAGTCTAGTTTTAAATCTTGACAATGAAGGT
CGTTATCTCTTACTTAATTGTATGGCAAATCAATTACGTTATCCTAATTCGCATACATAT
TATTTCAGTTATACAATATTATATTTATTCTCTGAACAATCTAAAGAACAAGTTAAAGAA
CAAATAAGTCGTGTACTAATGGAAAGACTAATTGTAAATCGTCCACATCCATGGGGTTTA
TTAATGACTAGTGCAGAATTATTACGTAATCCAGCTTATCGATTTTGGGAACATGAATTT
GCACGATGTAATCCAGAAATTGAAGCAATTGTAACTATTGTTGCTCGTAGTTGTATACCA
AATTTTCAAATTCCCAATGTAAATTCTTCTGATATTTGTACAACTTCTAGTGTGGTTTCA
TCAAATCTACGTTATGCTTTATTATCATCGGGAACCGCTCAAGGTTCAGTTTAATTAATC
ATCATTAGAATGATGATAACACACTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTGTA
TTTGTGTGAATAAATTATCATTTTATCTGTACTTTCTGTACTTTCTTCTTTTTCTTCTTC
TTCTCCTTCTTGTTCTTCTTGTTCTTCGTCTTTTATCCACCATTGGAACTGTTTGTTCAA
ATCAATTAACATGTGTATCTAATCATTAGTTAATTATCTATCCTTTCACATTCAATATCA
TTGATTGTGTAATTTCATTCTTGTTAACATGATGTTTACCTTCATTTTTTGTACTTTTGA
TTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCGGTTTGTGTTTGTGTTTGTGATAGAGATGATGATGAT
CATGATGATGATATTGTGTTTATACATATATTGTTTTCTTTCGATTTCGGATTTTAAAGT
ACTTCCCCTC

consensusID : consensus_9899#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 663
fasta sequence

                              [AGCCAANAATTTGGCACGAGGCAAATTTTCAAATTCCCAATGTAAATTCTTCTGATATTTGTACAACTTCTAGTGTGGTTTCATCAAATCTACGTTATGCTTTATTATCATCGGGAACCGCTCAAGGTTCAGTTTAATTAATCATCATTAGAATGATGATAACACACTATGTATGTATGTATGTATGTATGTGTATTTGTGTGAATAAATTATCATTTTATCTGTACTTTCTTCTTTTTCTTCTTCTTCTCCTTCTTGTTCTTCTTGTTCTTCGTCTTTTATCCACCATTGGAACTGTTTGTTCAAATCAATTAACATGTGTATCTAATCATTAGTTAATTATCTATCCTTTCACATTCAATATCATTGATTGTGTAATTTCATTCTTGTTAACATGATGTTTACCTTCATTTTTTGTACTTTTGATTTTCTTCTTCTTCGGTTTGTGTTTGTGTTTGTGATAGAGATGATGATGATCATGATGATGATATTGTGTTTATACATATATTGTTTTCTTTCGATTTCGGATTTTAAAGTACTTCCCCTCCCCCCCTCATCTCCACCCCGCCCGGAAACAAAATACTATCTATTTGATACCCACTCCTCTTTGTAAAATTTAATTATTGACCTCATTCATATAAATAAATATATATATAATTNTGT]

[+] EMBL CD080817             [AGCCAANAATTTGGCACGAGGCAAATTTTCAAATTCCCAATGTAAATTCTTCTGATATTTGTACAACTTCTAGTGTGGTTTCATCAAATCTACGTTATGCTTTATTATCATCGGGAACCGCTCAAGGTTCAGTTTAATTAATCATCATTAGAATGATGATAACACACTATGTATGTATGTATGTATGTATGTGTATTTGTGTGAATAAATTATCATTTTATCTGTACTTTCTTCTTTTTCTTCTTCTTCTCCTTCTTGTTCTTCTTGTTCTTCGTCTTTTATCCACCATTGGAACTGTTTGTTCAAATCAATTAACATGTGTATCTAATCATTAGTTAATTATCTATCCTTTCACATTCAATATCATTGATTGTGTAATTTCATTCTTGTTAACATGATGTTTACCTTCATTTTTTGTACTTTTGATTTTCTTCTTCTTCGGTTTGTGTTTGTGTTTGTGATAGAGATGATGATGATCATGATGATGATATTGTGTTTATACATATATTGTTTTCTTTCGATTTCGGATTTTAAAGTACTTCCCCTCCCCCCCTCATCTCCACCCCGCCCGGAAACAAAATACTATCTATTTGATACCCACTCCTCTTTGTAAAATTTAATTATTGACCTCATTCATATAAATAAATATATATATAATTNTGT]
[-] EMBL CD082184             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gGTTTGGGTTTGTGATAGAGATGATGATGATCATGATGATGATATTGTGTTTATACATATATTGTTTTCTTTCGATTTGGGATTTTAAAGTATTTCCCCTCCCCCCCTCATTTCCACCCCGCCCGGAAACAAAATACTATTTATTTGATACCCACTCCTCTTTGTAAAATTTAATTATTGCCCT                                 ]




>consensus_9899#1
AGCCAANAATTTGGCACGAGGCAAATTTTCAAATTCCCAATGTAAATTCTTCTGATATTT
GTACAACTTCTAGTGTGGTTTCATCAAATCTACGTTATGCTTTATTATCATCGGGAACCG
CTCAAGGTTCAGTTTAATTAATCATCATTAGAATGATGATAACACACTATGTATGTATGT
ATGTATGTATGTGTATTTGTGTGAATAAATTATCATTTTATCTGTACTTTCTTCTTTTTC
TTCTTCTTCTCCTTCTTGTTCTTCTTGTTCTTCGTCTTTTATCCACCATTGGAACTGTTT
GTTCAAATCAATTAACATGTGTATCTAATCATTAGTTAATTATCTATCCTTTCACATTCA
ATATCATTGATTGTGTAATTTCATTCTTGTTAACATGATGTTTACCTTCATTTTTTGTAC
TTTTGATTTTCTTCTTCTTCGGTTTGTGTTTGTGTTTGTGATAGAGATGATGATGATCAT
GATGATGATATTGTGTTTATACATATATTGTTTTCTTTCGATTTCGGATTTTAAAGTACT
TCCCCTCCCCCCCTCATCTCCACCCCGCCCGGAAACAAAATACTATCTATTTGATACCCA
CTCCTCTTTGTAAAATTTAATTATTGACCTCATTCATATAAATAAATATATATATAATTN
TGT

consensusID : consensus_9899#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 481
fasta sequence

                              [GCGAANTTCNTTTGATTCCCAAGCCCGTACGGAGGTTCAGTTTAATTAATCATCATTAGAATGATGATAACACACTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTGTATTTGTGTGAATAAATTATCATTTTATCTGTACTTTCTGTACTTTCTTCTTTTTTTTCTTCTTCTCCTTCTTGTTCTTCTTGTTCTTCGTCTTTTATCCACCATTGGAACTGTTTGTTCAAATCAATTAACATGTGTATCTGATCATTAGTTAATTATCTATCCTCTCACATTCAATATCATTGATTGTGTAATTTCATTCTTGTTAACATGATGTTTACCTTCATTTTTTGTACTTTTGATTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCGGTTTGTGTTTGTGTTTGTGATAAAGATGATGATGATCATGATGATGATATTGTGTTTATACATATATTGTTTTCTTTCGATTTCGGATTTTAAAGTACCTCCCCTC]

[+] EMBL CD093754             [GCGAANTTCNTTTGATTCCCAAGCCCGTACGGAGGTTCAGTTTAATTAATCATCATTAGAATGATGATAACACACTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTGTATTTGTGTGAATAAATTATCATTTTATCTGTACTTTCTGTACTTTCTTCTTTTTTTTCTTCTTCTCCTTCTTGTTCTTCTTGTTCTTCGTCTTTTATCCACCATTGGAACTGTTTGTTCAAATCAATTAACATGTGTATCTGATCATTAGTTAATTATCTATCCTCTCACATTCAATATCATTGATTGTGTAATTTCATTCTTGTTAACATGATGTTTACCTTCATTTTTTGTACTTTTGATTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCGGTTTGTGTTTGTGTTTGTGATAAAGATGATGATGATCATGATGATGATATTGTGTTTATACATATATTGTTTTCTTTCGATTTCGGATTTTAAAGTACCTCCCCTC]




>consensus_9899#2
GCGAANTTCNTTTGATTCCCAAGCCCGTACGGAGGTTCAGTTTAATTAATCATCATTAGA
ATGATGATAACACACTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTGTATTTGTGTGA
ATAAATTATCATTTTATCTGTACTTTCTGTACTTTCTTCTTTTTTTTCTTCTTCTCCTTC
TTGTTCTTCTTGTTCTTCGTCTTTTATCCACCATTGGAACTGTTTGTTCAAATCAATTAA
CATGTGTATCTGATCATTAGTTAATTATCTATCCTCTCACATTCAATATCATTGATTGTG
TAATTTCATTCTTGTTAACATGATGTTTACCTTCATTTTTTGTACTTTTGATTTTCTTCT
TCTTCTTCTTCTTCGGTTTGTGTTTGTGTTTGTGATAAAGATGATGATGATCATGATGAT
GATATTGTGTTTATACATATATTGTTTTCTTTCGATTTCGGATTTTAAAGTACCTCCCCT
C

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_9899#0      GGGAAAGCCCCACAAATGGATATTATACAAAGTCTAGTTTTAAATCTTGACAATGAAGGT 60
consensus_9899#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9899#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9899#0      CGTTATCTCTTACTTAATTGTATGGCAAATCAATTACGTTATCCTAATTCGCATACATAT 120
consensus_9899#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9899#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9899#0      TATTTCAGTTATACAATATTATATTTATTCTCTGAACAATCTAAAGAACAAGTTAAAGAA 180
consensus_9899#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9899#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9899#0      CAAATAAGTCGTGTACTAATGGAAAGACTAATTGTAAATCGTCCACATCCATGGGGTTTA 240
consensus_9899#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9899#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9899#0      TTAATGACTAGTGCAGAATTATTACGTAATCCAGCTTATCGATTTTGGGAACATGAATTT 300
consensus_9899#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9899#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9899#0      GCACGATGTAATCCAGAAATTGAAGCAATTGTAACTATTGTTGCTCGTAGTTGTATACCA 360
consensus_9899#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9899#1      --------------------------------AGCCAANAAT-----TTGGCACGAGGCA 23
                                                                                  

consensus_9899#0      AATTTTCAAATTCCCAATGTAAATTCTTCTGATATTTGTACAACTTCTAGTGTGGTTTCA 420
consensus_9899#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9899#1      AATTTTCAAATTCCCAATGTAAATTCTTCTGATATTTGTACAACTTCTAGTGTGGTTTCA 83
                                                                                  

consensus_9899#0      TCAAATCTACGTTATGCTTTATTATCATCGGGAACCGCTCA-AGGTTCAGTTTAATTAAT 479
consensus_9899#2      ----------GCGAANTTCNTTTGATTCCCAAGCCCGTACGGAGGTTCAGTTTAATTAAT 50
consensus_9899#1      TCAAATCTACGTTATGCTTTATTATCATCGGGAACCGCTCA-AGGTTCAGTTTAATTAAT 142
                                *  *   *   **     *     ***  *  ******************

consensus_9899#0      CATCATTAGAATGATGATAACACACTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTGT 539
consensus_9899#2      CATCATTAGAATGATGATAACACACTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTGT 110
consensus_9899#1      CATCATTAGAATGATGATAACACACTATGTATGTATGTATGTATGTATGT--------GT 194
                      **************************************************        **

consensus_9899#0      ATTTGTGTGAATAAATTATCATTTTATCTGTACTTTCTGTACTTTCTTCTTTTTCTTCTT 599
consensus_9899#2      ATTTGTGTGAATAAATTATCATTTTATCTGTACTTTCTGTACTTTCTTCTTTTTTTTCTT 170
consensus_9899#1      ATTTGTGTGAATAAATTATCATTTTATCTGTACT---------TTCTTCTTTTTCTTCTT 245
                      **********************************         *********** *****

consensus_9899#0      CTTCTCCTTCTTGTTCTTCTTGTTCTTCGTCTTTTATCCACCATTGGAACTGTTTGTTCA 659
consensus_9899#2      CTTCTCCTTCTTGTTCTTCTTGTTCTTCGTCTTTTATCCACCATTGGAACTGTTTGTTCA 230
consensus_9899#1      CTTCTCCTTCTTGTTCTTCTTGTTCTTCGTCTTTTATCCACCATTGGAACTGTTTGTTCA 305
                      ************************************************************

consensus_9899#0      AATCAATTAACATGTGTATCTAATCATTAGTTAATTATCTATCCTTTCACATTCAATATC 719
consensus_9899#2      AATCAATTAACATGTGTATCTGATCATTAGTTAATTATCTATCCTCTCACATTCAATATC 290
consensus_9899#1      AATCAATTAACATGTGTATCTAATCATTAGTTAATTATCTATCCTTTCACATTCAATATC 365
                      ********************* *********************** **************

consensus_9899#0      ATTGATTGTGTAATTTCATTCTTGTTAACATGATGTTTACCTTCATTTTTTGTACTTTTG 779
consensus_9899#2      ATTGATTGTGTAATTTCATTCTTGTTAACATGATGTTTACCTTCATTTTTTGTACTTTTG 350
consensus_9899#1      ATTGATTGTGTAATTTCATTCTTGTTAACATGATGTTTACCTTCATTTTTTGTACTTTTG 425
                      ************************************************************

consensus_9899#0      ATTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCGGTTTGTGTTTGTGTTTGTGATAGAGATGATGATGA 839
consensus_9899#2      ATTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCGGTTTGTGTTTGTGTTTGTGATAAAGATGATGATGA 410
consensus_9899#1      ATTTTCTT---------CTTCTTCGGTTTGTGTTTGTGTTTGTGATAGAGATGATGATGA 476
                      ********         ****************************** ************

consensus_9899#0      TCATGATGATGATATTGTGTTTATACATATATTGTTTTCTTTCGATTTCGGATTTTAAAG 899
consensus_9899#2      TCATGATGATGATATTGTGTTTATACATATATTGTTTTCTTTCGATTTCGGATTTTAAAG 470
consensus_9899#1      TCATGATGATGATATTGTGTTTATACATATATTGTTTTCTTTCGATTTCGGATTTTAAAG 536
                      ************************************************************

consensus_9899#0      TACTTCCCCTC------------------------------------------------- 910
consensus_9899#2      TACCTCCCCTC------------------------------------------------- 481
consensus_9899#1      TACTTCCCCTCCCCCCCTCATCTCCACCCCGCCCGGAAACAAAATACTATCTATTTGATA 596
                      *** *******                                                 

consensus_9899#0      ------------------------------------------------------------
consensus_9899#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9899#1      CCCACTCCTCTTTGTAAAATTTAATTATTGACCTCATTCATATAAATAAATATATATATA 656
                                                                                  

consensus_9899#0      -------
consensus_9899#2      -------
consensus_9899#1      ATTNTGT 663