|
These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9910#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 12 consensus length = 1290 fasta sequence
[ACCAATGCTGCCACAACGACCTATTCATCATCACAGTTCAACTTTATCTACTGTTTATCCTGTCCAAATAAATAATTGTCAATCATCTGATTTTAAATCCTCCACATCATCGTCATCATCTCCTAGAAATTGGCGACAGTATGATGAGAACACTG-AACATAT-TCATC-AATCTTCATCACATTATTGCTTATCTAATCGACAAAATGAATGTGATGATATTGAATTAACAAGTCAAAGAAATGATTGGCCAACAATGGCTAGTCAAGATTTAGATCACAGTTATCAATCAGTTAGTAGTGGAGGATTTAATTTAAATAGACGTATACGAACTTCACTTACTGACGAACAGCGTTATCGATTACAGGAGGCATACGAATTAAATATTCGTCCATCAAAAAGTATACGTGAAGCCTTAGCCTCCGAGTTAGGTGTACCTATGCGTGTTGTTCAGGTGTGGTTTCAAAATCAACGTGCACGTGATAAACGAGCCTCTACCTTTGGTCATCTAAATCCTAACACT-GACAAATCATCAGTTTCACATATGAATACTATTAACCCTCATCAATTTGATGGTCATCAATTGCATTTGCAGGAG-CAACAACGAAATCATTGTAACAAACAGCAATCTTCAGATTTACGCCCGTTTACTCCATCTCCACACACCTCTGTTGAAAGTGGTCCTTTTCCTGAATTCGGTGGATTTTCC-TCTGAC-ATCTAGTACGCTATGTTCCCGATGTTAATATGCACAATGATTCTGCTGATAT-GC-ATCTTGGAGATCTGTATCCAATGCTGTATGGCTTGTAGAAAATGGAAATGAAAATTCAACTATCAGATGATACTGTCTTCGTTGTCGTATTTCTCCAACTGAATATTATTTAATGAATGAAAACACTATGTGGGTAAACGTATATCAAGTGTAAATGAAACAGTTTAACCTTTGTACATATTTGTATCACACATATATTTGTCCAAACAATGAATTTTAAAAAAAACCAATTGGATAATTATGAATAAAAGCACAAAACGTGATCATGTTTCATATTTGTTGCTATTGTTAACCTCTCTCTTCATTCTATGTCTTTATAGTGTATATTTTATGATAAATCGATTTGAATAACATTCGGCATCTGTTCTCTCCATTGTTAATCTTACCTTATAGTACGGTTGCTTCTGTTTGTTTTATGCTATTATTTTCGTTTTTAGTTGTTTATTTTATGCGCCTTTTGTACATGACAAATAAACATATATATACCTATTTATTGCGAAAAAAAAAGTAAAAAAAANCATCTG]
[+] EMBL CD201738 [ACCAATGCTGCCACAACGACCTATTCATCATCACAGTTCAACTTTATCTACTGTTTATCCTGTCCAAATAAATAATTGTCAATCATCTGATTTTAAATCCTCCACATCATCGTCATCATCTCCTAGAAATTGGCGACAGTATGATGAGAACACTG AACATAT TCATC AATCTTCATCACATTATTGCTTATCTAATCGACAAAATGAATGTGATGATATTGAATTAACAAGTCAAAGAAATGATTGGCCAACAATGGCTAGTCAAGATTTAGATCACAGTTATCAATCAGTTAGTAGTGGAGGATTTAATTTAAATAGACGTATACGAACTTCACTTACTGACGAACAGCGTTATCGATTACAGGAGGCATACGAATTAAATATTCGTCCATCAAAAAGTATACGTGAAGCCTTAGCCTCCGAGTTAGGTGTACCTATGCGTGTTGTTCAGGTGTGGTTTCAAAATCAACGTGCACGTGATAAACGAGCCTCTACCTTTGGTCATCTAAATCCTAACACTNGAC AATCATCAGTTTCACATATGAATACTATTAACCCTCATCAATNTGATGGTCATCAATTGCATTTGCAGGAGCCCAC ACG AATCATTGNTACANACAGNCATCTTCAGATTTACGCCCGTTTACTNCAT ]
[+] EMBL CD115045 [ACCAATGCTGCCACAACGACCTATTCATCATCACAGTTCAACTTTATCTACTGTTTATCCTGTCCAAATAAATAATTGTCAATCATCTGATTTTAAATCCTCCACATCATCGTCATCATCTCCTAGAAATTGGCGACAGTATGATGAGAACACTG AACATAT TCATC AATCTTCATCACATTATTGCTTATCTAATCGACAAAATGAATGTGATGATATTGAATTAACAAGTCAAAGAAATGATTGGCCAACAATGGCTAGTCAGGATTTAGATCACAGTTATCAATCAGTTAGTAGTGGAGGATTTAGTTTAAATAGACGTATACGAACTTCACTTACTGACGAACAGCGTTATCGATTACAGGAGGCATACGAATTAAATATTCGTCCATCAAAAAGTATACGTGAAGCCTTAGCCTCCGAGTTAGGTGTACCTATGCGTGTTGTTCAGGTGTGGTTTCAAAATCAACGTGCACGTGATAAACGAGCCTCTACCTTTGGTCATCTAAATCCTAACACT GACAAATCATCAGTTTCACATATGAATACTATTAACCCTCATCAATTTGATGGTCATCAATTGCATTTGCAGGAG CAACAACGAAATCATTGTAACANACAGNCATCTTCAGATTTACGCCCGTTT ]
[+] EMBL CD114929 [ACCAATGCTGCCACAACGACCTATTCATCATCACAGTTCAACTTTATCTACTGTTTATCCTGTCCAAATAAATAATTGTCAATCATCTGATTTTAAATCCTCCACATCATCGTCATCATCTCCTAGAAATTGGCGACAGTATGATGAGAACACTG AACATCT TCATC AATCTTCATCACATTATTGCTTATCTAATCGACAAAATGAATGTGATGATATTGAATTAACAAGTCAAAGAAATGATTGGCCAACAATGGCTAGTCAAGATTTAGATCACAGTTATCAATCAGTTTGTAGTGGAGGATTTAATTTAAATAGACGTATACGAACTTCACTTACTGACGAACAGCGTTATCGATTACAGGAGGCATACGAATTAAATATTCGTCCATCAAAAAGTATACGTGAAGCCTTAGCCTCCGAGTTAGGTGTACCTATGCGTGTTGTTCAGGTGTGGTTTCAAAATCAACGTGCACGTGATAAACGAGCCTCTACCTTTGGTCATCTAAATCCTAACACT GAC ]
[+] EMBL CD114928 [ACCAATGCTGCCACAACGACCTATTCATCATCACAGTTCAACTTTATCTACTGTTTATCCTGTCCAAATAAATAATTGTCAATCATCTGATTTTAAATCCTCCACATCATCGTCATCATCTCCTAGAAATTGGTGACAGTATGATGAGAACACTG AACATCT TCATC AATCTTCATCACATTATTGCTTATCTAATCGACAAAATGAATGTGATGATATTGAATTAACGAGTCAAAGAAATGATTGGCCAACAATGGCTAGTCAAGATTTAGATCACAGTTATCAATCAGTTTGTAGTGGAGGATTTAATTTAAATAGACGTATACGAACTTCACTTACTGACGAACAGCGTTATCGATCACAGGAGGCATACGAATTAAATATTTGTCCATCAAAAAGTATACGTGAAGCCTTAGCCTCCGAGTTAGGTGTACCTATGCGTGTTGTTCAGGTGTGGTTTCAAAATCAACGTGCACGTGATAAACGAGCCTCTACCTTTGGTCATCTAAATCCTAACACT GACAAATCTTCAGTTT ]
[-] EMBL CD152934 [ CCAATGCTGCCACAACGACCTATTCATCATCACAGTTCAACTTTATCTACTGTTTATCCTGTCCAAATAAATAATTGTCAATCATCTGATTTTAAATCCTCCACATCATCGTCATCATCTCCTAGAAATTGGCGACAGTATGATGAGAACACTG AACATAT TCATC AATCTTCATCACATTATTGCTTATCTAATCGACAAAATGAATGTGATGATATTGAATTAACAAGTCAAAGAAATGATTGG ]
[-] EMBL CD152603 [ CCAATGCTGCCACAACAACCTATTCATCATCACAGTTCAACTTTATCTACTGTTTATCCTGTCCAAATAAATAATTGTCAATCATCTGATTTTAAATCCTCCACATCATCGTCATCATCTCCTAGAAATTGGCGACAGTATGATGAGAACACTG AACATAT TCAT ]
[+] EMBL CD078897 [ CATCTCCTAGAAATTGGCGACAGTATGATGAGAACACTG AACATAT TCATC AATCTTCATCACATTATTGCTTATCTAATCGACAAAATGAATGTGATGATATTGAATTAACAAGTCAAAGAAATGATTGGCCAACAATGGCTAGTCAAGATTTAGATCACAGTTATCAATCAGTTAGTAGTGGAGGATTTAATTTAAATAGACGTATACGAACTTCACTTACTGACGAACAGCGTTATCGATTACAGGAGGCATACGAATTAAATATTCGTCCATCAAAAAGTATACGTGAAGCCTTAGCCTCCGAGTTAGGTGTACCTATGCGTGTTGTTCAGGTGTGGTTTCAAAATCAACGTGCACGTGATAAACGAGCCTCTACCTTTGGTCATCTAAATCCTAACACT GACAAATCATCAGTTTCACATATGAATACTATTAACCCTCATCAATTTGATGGTCATCAATTGCATTTGCAGGAG CAACAACGAAATCATTGTAACAAACAGCAATCTTCAGATTTACGCCCGTTTACTCCATCTCCACACACCTCTGTTGAAAGTGGTCCTTTTCCTGAATTCGGTGGATTTTCCTTCTGAC ATCTAGTACG ]
[+] EMBL CD079627 [ CTGCAACATATATCATCTAATCTTCATCACATTATTGCTTATCTAATCGACAAAATGAATGTGATGATATTGAATTAACAAGTCAAAGAAATGATTGGCCAACAATGGCTAGTCAAGATTTAGATCACAGTTATCAATCAGTTAGTAGTGGAGGATTTAATTTAAATAGACGTATACGAACTTCACTTACTGACGAACAGCGTTATCGATTACAGGAGGCATACGAATTAAATATTCGTCCATCAAAAAGTATACGTGAAGCCTTAGCCTCCGAGTTAGGTGTACCTATGCGTGTTGTTCAGGTGTGGTTTCAAAATCAACGTGCACGTGATAAACGAGCCTCTACCTTTGGTCATCTAAATCCTAACACT GACAAATAATCAGTTTCACATATGAATACTATTAACCCTCATCAATTTGATGGTCATCAATTGCATTTGCAGGAG CAACAACGAAATCATTGTAACAAACAGCAATCTTCAGATTTACGCCCGTTTACTCCATCTTCACACACCTGTGTTGAAAGTGGTACTTTTCCTGAATTCGGTGGATTTTCC TCTGACAATCTAGTACGCTATGTTCCCGATGTTAATATGCACAATGATTCTGCTGATATAGC ATCTTGGAGATCTGTATCCAAT ]
[-] EMBL CD114931 [ GATATTGAATTAACAAGTCAAAGAAATGATTGGCCAACAATGGCTAGTCAAGATTTAGATCACAGTTATCAATCAGTTAGTAGTGGAGGATTTAATTTAAATAGACGTATACGAACTTCACTTACTGACGAACAGCGTTATCGATTACAGGAGGCATACGAATTAAATATTCGTCCGTCAAAAAGTATACGTGAAGCCTTAGCCTCCGAGTTAGGTGTACCTATGCGTGTTGTTCAGGTGTGGTTTCAAAATCAACGTGCACGTGATAAACGAGCCTCTACCTTTGGTCATCTAAATCCTAACACT GACTAATCATCAGTTTCACATATGAATACTATTAACCCTCATCAATTTGATGGTCATCAATTGCATTTGCAGGAG CAACAACGAAATCATTGTAACAAACAGCAATCTTCAGATTTACGCCCGTTTACTCCATC ]
[+] EMBL CD139912 [ ACTATTAACCCTCATCAATTTGATGGTCATCAATTGCATTTGCAGGAG CAACAACGAAATCATTGTAACAAACAGCAATCTTCAGATTTACGCCCGTTTACTCCATCTCCACACACCTCTGTTGAAAGTGGTCCTTTTCCTGAATTCGGTGGATTTTCC TCTGACAATCTAGTACGCTATGTTCCCGATGTTAATATGCACAATGATTCTGCTGATAT GCAATCTTGGAGATCTGTATCCAATGCTGTATGGCTTGTAGAAAATGGAAATGAAAATTCAACTATCAGATGATACTGTCTTCGTTGTCGTATTTCTCCAACTGAA ]
[-] EMBL CD073891 [ CCACACACCTCTGTTGAAAGTGGTCCTTTTCCTGAATTCGGTGGATTTTCC TCTGACAATTTAGTACGCTATGTTCCCGATGTTAATATGCACAATGATTCTGCTGATAT GCAATCTTGGAGATCTGTATCCAATGCTGTATGGCTTGTAGAAAATGGAAATGAAAATTCAACTATCAGATGATACTGTGTTCGTTGTCGTATTTCTCCAACTGAATATTATTTAATGAATGAAAACACTATGTGGGTAAACGTATATCAAGTGTAAATGAAACAGTTTAACCTTTGTACATATTTGTATCACACATATATTTGTCCAAACAATGAATTTTAAAAAAAACCAATTGGATAATTATGAATAAAAGCACAAAACGTGATCATGTTTCATATTTGTTGCTATTGTTAACCTCTCTCTTCATTCTATGTCTTTATAGTGTATATTTTATGATAAATCGATTTGAATAACATTCGGCATCTGTTCTCTCCATTGTTAATCTTACCTTATAGTACGGTTGCTTCTGTTTGTTTTATGCTATTATTTTCGTTTTTAGTTGTTTATTTTATGCGCCTTTTGTACATGACAAATAAACATATATATACCTATTTATTGCGAAAAAAAAAGTAAAAAAAANCATCTG]
[-] EMBL CD073356 [ TAGTACGCTATGTTCCCGATGTTAATATGCACAATGATTCTGCTGATAT GCAATCTTGGAGATCTGTATCCAATGCTGTATGGCTTGTAGAAAATGGAAATGAAAATTCAACTATCAGATGATACTGTCTTCGTTGTCGTATTTCTCCAACTGAATATTATTTAATGAATGAAAACACTATGTGGGTAAACGTATATCAAGTGTAAATGAAACAGTTTAACCTTTGTACATATTTGTATCACACATATATTTGTCCAAACAATGAATTTTAAAAAAAACCAATTGGATAATTATGAATAAAAGCACAAAACGTGATCATGTTTCATATTTGTTGCTATTGTTAACCTCTCTCTTCATTCTATGTCTTTATAGTGTATATTTTATGATAAATCGATTTGAATAACATTCGGCATCTGTTCTCTCCATTGTTAATCTTACCTTCTAGTACGGTTGCTTCTGTTTGTTTTATGCTATTATTTTCGTTTTTAGTTGTTTATTTTATGCGCCTTTTGTACATGACAAATATACATATATATACTTA ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||