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Schistosoma mansoni
cluster # 9910 cluster # 9910       Sequences # 12       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9910#0 length = 1290 sequences # 12  

consensusID : consensus_9910#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 12
consensus length = 1290
fasta sequence
                              [ACCAATGCTGCCACAACGACCTATTCATCATCACAGTTCAACTTTATCTACTGTTTATCCTGTCCAAATAAATAATTGTCAATCATCTGATTTTAAATCCTCCACATCATCGTCATCATCTCCTAGAAATTGGCGACAGTATGATGAGAACACTG-AACATAT-TCATC-AATCTTCATCACATTATTGCTTATCTAATCGACAAAATGAATGTGATGATATTGAATTAACAAGTCAAAGAAATGATTGGCCAACAATGGCTAGTCAAGATTTAGATCACAGTTATCAATCAGTTAGTAGTGGAGGATTTAATTTAAATAGACGTATACGAACTTCACTTACTGACGAACAGCGTTATCGATTACAGGAGGCATACGAATTAAATATTCGTCCATCAAAAAGTATACGTGAAGCCTTAGCCTCCGAGTTAGGTGTACCTATGCGTGTTGTTCAGGTGTGGTTTCAAAATCAACGTGCACGTGATAAACGAGCCTCTACCTTTGGTCATCTAAATCCTAACACT-GACAAATCATCAGTTTCACATATGAATACTATTAACCCTCATCAATTTGATGGTCATCAATTGCATTTGCAGGAG-CAACAACGAAATCATTGTAACAAACAGCAATCTTCAGATTTACGCCCGTTTACTCCATCTCCACACACCTCTGTTGAAAGTGGTCCTTTTCCTGAATTCGGTGGATTTTCC-TCTGAC-ATCTAGTACGCTATGTTCCCGATGTTAATATGCACAATGATTCTGCTGATAT-GC-ATCTTGGAGATCTGTATCCAATGCTGTATGGCTTGTAGAAAATGGAAATGAAAATTCAACTATCAGATGATACTGTCTTCGTTGTCGTATTTCTCCAACTGAATATTATTTAATGAATGAAAACACTATGTGGGTAAACGTATATCAAGTGTAAATGAAACAGTTTAACCTTTGTACATATTTGTATCACACATATATTTGTCCAAACAATGAATTTTAAAAAAAACCAATTGGATAATTATGAATAAAAGCACAAAACGTGATCATGTTTCATATTTGTTGCTATTGTTAACCTCTCTCTTCATTCTATGTCTTTATAGTGTATATTTTATGATAAATCGATTTGAATAACATTCGGCATCTGTTCTCTCCATTGTTAATCTTACCTTATAGTACGGTTGCTTCTGTTTGTTTTATGCTATTATTTTCGTTTTTAGTTGTTTATTTTATGCGCCTTTTGTACATGACAAATAAACATATATATACCTATTTATTGCGAAAAAAAAAGTAAAAAAAANCATCTG]

[+] EMBL CD201738             [ACCAATGCTGCCACAACGACCTATTCATCATCACAGTTCAACTTTATCTACTGTTTATCCTGTCCAAATAAATAATTGTCAATCATCTGATTTTAAATCCTCCACATCATCGTCATCATCTCCTAGAAATTGGCGACAGTATGATGAGAACACTG AACATAT TCATC AATCTTCATCACATTATTGCTTATCTAATCGACAAAATGAATGTGATGATATTGAATTAACAAGTCAAAGAAATGATTGGCCAACAATGGCTAGTCAAGATTTAGATCACAGTTATCAATCAGTTAGTAGTGGAGGATTTAATTTAAATAGACGTATACGAACTTCACTTACTGACGAACAGCGTTATCGATTACAGGAGGCATACGAATTAAATATTCGTCCATCAAAAAGTATACGTGAAGCCTTAGCCTCCGAGTTAGGTGTACCTATGCGTGTTGTTCAGGTGTGGTTTCAAAATCAACGTGCACGTGATAAACGAGCCTCTACCTTTGGTCATCTAAATCCTAACACTNGAC AATCATCAGTTTCACATATGAATACTATTAACCCTCATCAATNTGATGGTCATCAATTGCATTTGCAGGAGCCCAC ACG AATCATTGNTACANACAGNCATCTTCAGATTTACGCCCGTTTACTNCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD115045             [ACCAATGCTGCCACAACGACCTATTCATCATCACAGTTCAACTTTATCTACTGTTTATCCTGTCCAAATAAATAATTGTCAATCATCTGATTTTAAATCCTCCACATCATCGTCATCATCTCCTAGAAATTGGCGACAGTATGATGAGAACACTG AACATAT TCATC AATCTTCATCACATTATTGCTTATCTAATCGACAAAATGAATGTGATGATATTGAATTAACAAGTCAAAGAAATGATTGGCCAACAATGGCTAGTCAGGATTTAGATCACAGTTATCAATCAGTTAGTAGTGGAGGATTTAGTTTAAATAGACGTATACGAACTTCACTTACTGACGAACAGCGTTATCGATTACAGGAGGCATACGAATTAAATATTCGTCCATCAAAAAGTATACGTGAAGCCTTAGCCTCCGAGTTAGGTGTACCTATGCGTGTTGTTCAGGTGTGGTTTCAAAATCAACGTGCACGTGATAAACGAGCCTCTACCTTTGGTCATCTAAATCCTAACACT GACAAATCATCAGTTTCACATATGAATACTATTAACCCTCATCAATTTGATGGTCATCAATTGCATTTGCAGGAG CAACAACGAAATCATTGTAACANACAGNCATCTTCAGATTTACGCCCGTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD114929             [ACCAATGCTGCCACAACGACCTATTCATCATCACAGTTCAACTTTATCTACTGTTTATCCTGTCCAAATAAATAATTGTCAATCATCTGATTTTAAATCCTCCACATCATCGTCATCATCTCCTAGAAATTGGCGACAGTATGATGAGAACACTG AACATCT TCATC AATCTTCATCACATTATTGCTTATCTAATCGACAAAATGAATGTGATGATATTGAATTAACAAGTCAAAGAAATGATTGGCCAACAATGGCTAGTCAAGATTTAGATCACAGTTATCAATCAGTTTGTAGTGGAGGATTTAATTTAAATAGACGTATACGAACTTCACTTACTGACGAACAGCGTTATCGATTACAGGAGGCATACGAATTAAATATTCGTCCATCAAAAAGTATACGTGAAGCCTTAGCCTCCGAGTTAGGTGTACCTATGCGTGTTGTTCAGGTGTGGTTTCAAAATCAACGTGCACGTGATAAACGAGCCTCTACCTTTGGTCATCTAAATCCTAACACT GAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD114928             [ACCAATGCTGCCACAACGACCTATTCATCATCACAGTTCAACTTTATCTACTGTTTATCCTGTCCAAATAAATAATTGTCAATCATCTGATTTTAAATCCTCCACATCATCGTCATCATCTCCTAGAAATTGGTGACAGTATGATGAGAACACTG AACATCT TCATC AATCTTCATCACATTATTGCTTATCTAATCGACAAAATGAATGTGATGATATTGAATTAACGAGTCAAAGAAATGATTGGCCAACAATGGCTAGTCAAGATTTAGATCACAGTTATCAATCAGTTTGTAGTGGAGGATTTAATTTAAATAGACGTATACGAACTTCACTTACTGACGAACAGCGTTATCGATCACAGGAGGCATACGAATTAAATATTTGTCCATCAAAAAGTATACGTGAAGCCTTAGCCTCCGAGTTAGGTGTACCTATGCGTGTTGTTCAGGTGTGGTTTCAAAATCAACGTGCACGTGATAAACGAGCCTCTACCTTTGGTCATCTAAATCCTAACACT GACAAATCTTCAGTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD152934             [ CCAATGCTGCCACAACGACCTATTCATCATCACAGTTCAACTTTATCTACTGTTTATCCTGTCCAAATAAATAATTGTCAATCATCTGATTTTAAATCCTCCACATCATCGTCATCATCTCCTAGAAATTGGCGACAGTATGATGAGAACACTG AACATAT TCATC AATCTTCATCACATTATTGCTTATCTAATCGACAAAATGAATGTGATGATATTGAATTAACAAGTCAAAGAAATGATTGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD152603             [ CCAATGCTGCCACAACAACCTATTCATCATCACAGTTCAACTTTATCTACTGTTTATCCTGTCCAAATAAATAATTGTCAATCATCTGATTTTAAATCCTCCACATCATCGTCATCATCTCCTAGAAATTGGCGACAGTATGATGAGAACACTG AACATAT TCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD078897             [                                                                                                                    CATCTCCTAGAAATTGGCGACAGTATGATGAGAACACTG AACATAT TCATC AATCTTCATCACATTATTGCTTATCTAATCGACAAAATGAATGTGATGATATTGAATTAACAAGTCAAAGAAATGATTGGCCAACAATGGCTAGTCAAGATTTAGATCACAGTTATCAATCAGTTAGTAGTGGAGGATTTAATTTAAATAGACGTATACGAACTTCACTTACTGACGAACAGCGTTATCGATTACAGGAGGCATACGAATTAAATATTCGTCCATCAAAAAGTATACGTGAAGCCTTAGCCTCCGAGTTAGGTGTACCTATGCGTGTTGTTCAGGTGTGGTTTCAAAATCAACGTGCACGTGATAAACGAGCCTCTACCTTTGGTCATCTAAATCCTAACACT GACAAATCATCAGTTTCACATATGAATACTATTAACCCTCATCAATTTGATGGTCATCAATTGCATTTGCAGGAG CAACAACGAAATCATTGTAACAAACAGCAATCTTCAGATTTACGCCCGTTTACTCCATCTCCACACACCTCTGTTGAAAGTGGTCCTTTTCCTGAATTCGGTGGATTTTCCTTCTGAC ATCTAGTACG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD079627             [                                                                                                                                                        CTGCAACATATATCATCTAATCTTCATCACATTATTGCTTATCTAATCGACAAAATGAATGTGATGATATTGAATTAACAAGTCAAAGAAATGATTGGCCAACAATGGCTAGTCAAGATTTAGATCACAGTTATCAATCAGTTAGTAGTGGAGGATTTAATTTAAATAGACGTATACGAACTTCACTTACTGACGAACAGCGTTATCGATTACAGGAGGCATACGAATTAAATATTCGTCCATCAAAAAGTATACGTGAAGCCTTAGCCTCCGAGTTAGGTGTACCTATGCGTGTTGTTCAGGTGTGGTTTCAAAATCAACGTGCACGTGATAAACGAGCCTCTACCTTTGGTCATCTAAATCCTAACACT GACAAATAATCAGTTTCACATATGAATACTATTAACCCTCATCAATTTGATGGTCATCAATTGCATTTGCAGGAG CAACAACGAAATCATTGTAACAAACAGCAATCTTCAGATTTACGCCCGTTTACTCCATCTTCACACACCTGTGTTGAAAGTGGTACTTTTCCTGAATTCGGTGGATTTTCC TCTGACAATCTAGTACGCTATGTTCCCGATGTTAATATGCACAATGATTCTGCTGATATAGC ATCTTGGAGATCTGTATCCAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD114931             [                                                                                                                                                                                                                         GATATTGAATTAACAAGTCAAAGAAATGATTGGCCAACAATGGCTAGTCAAGATTTAGATCACAGTTATCAATCAGTTAGTAGTGGAGGATTTAATTTAAATAGACGTATACGAACTTCACTTACTGACGAACAGCGTTATCGATTACAGGAGGCATACGAATTAAATATTCGTCCGTCAAAAAGTATACGTGAAGCCTTAGCCTCCGAGTTAGGTGTACCTATGCGTGTTGTTCAGGTGTGGTTTCAAAATCAACGTGCACGTGATAAACGAGCCTCTACCTTTGGTCATCTAAATCCTAACACT GACTAATCATCAGTTTCACATATGAATACTATTAACCCTCATCAATTTGATGGTCATCAATTGCATTTGCAGGAG CAACAACGAAATCATTGTAACAAACAGCAATCTTCAGATTTACGCCCGTTTACTCCATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD139912             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ACTATTAACCCTCATCAATTTGATGGTCATCAATTGCATTTGCAGGAG CAACAACGAAATCATTGTAACAAACAGCAATCTTCAGATTTACGCCCGTTTACTCCATCTCCACACACCTCTGTTGAAAGTGGTCCTTTTCCTGAATTCGGTGGATTTTCC TCTGACAATCTAGTACGCTATGTTCCCGATGTTAATATGCACAATGATTCTGCTGATAT GCAATCTTGGAGATCTGTATCCAATGCTGTATGGCTTGTAGAAAATGGAAATGAAAATTCAACTATCAGATGATACTGTCTTCGTTGTCGTATTTCTCCAACTGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD073891             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CCACACACCTCTGTTGAAAGTGGTCCTTTTCCTGAATTCGGTGGATTTTCC TCTGACAATTTAGTACGCTATGTTCCCGATGTTAATATGCACAATGATTCTGCTGATAT GCAATCTTGGAGATCTGTATCCAATGCTGTATGGCTTGTAGAAAATGGAAATGAAAATTCAACTATCAGATGATACTGTGTTCGTTGTCGTATTTCTCCAACTGAATATTATTTAATGAATGAAAACACTATGTGGGTAAACGTATATCAAGTGTAAATGAAACAGTTTAACCTTTGTACATATTTGTATCACACATATATTTGTCCAAACAATGAATTTTAAAAAAAACCAATTGGATAATTATGAATAAAAGCACAAAACGTGATCATGTTTCATATTTGTTGCTATTGTTAACCTCTCTCTTCATTCTATGTCTTTATAGTGTATATTTTATGATAAATCGATTTGAATAACATTCGGCATCTGTTCTCTCCATTGTTAATCTTACCTTATAGTACGGTTGCTTCTGTTTGTTTTATGCTATTATTTTCGTTTTTAGTTGTTTATTTTATGCGCCTTTTGTACATGACAAATAAACATATATATACCTATTTATTGCGAAAAAAAAAGTAAAAAAAANCATCTG]
[-] EMBL CD073356             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TAGTACGCTATGTTCCCGATGTTAATATGCACAATGATTCTGCTGATAT GCAATCTTGGAGATCTGTATCCAATGCTGTATGGCTTGTAGAAAATGGAAATGAAAATTCAACTATCAGATGATACTGTCTTCGTTGTCGTATTTCTCCAACTGAATATTATTTAATGAATGAAAACACTATGTGGGTAAACGTATATCAAGTGTAAATGAAACAGTTTAACCTTTGTACATATTTGTATCACACATATATTTGTCCAAACAATGAATTTTAAAAAAAACCAATTGGATAATTATGAATAAAAGCACAAAACGTGATCATGTTTCATATTTGTTGCTATTGTTAACCTCTCTCTTCATTCTATGTCTTTATAGTGTATATTTTATGATAAATCGATTTGAATAACATTCGGCATCTGTTCTCTCCATTGTTAATCTTACCTTCTAGTACGGTTGCTTCTGTTTGTTTTATGCTATTATTTTCGTTTTTAGTTGTTTATTTTATGCGCCTTTTGTACATGACAAATATACATATATATACTTA                                   ]


>consensus_9910#0 ACCAATGCTGCCACAACGACCTATTCATCATCACAGTTCAACTTTATCTACTGTTTATCC TGTCCAAATAAATAATTGTCAATCATCTGATTTTAAATCCTCCACATCATCGTCATCATC TCCTAGAAATTGGCGACAGTATGATGAGAACACTGAACATATTCATCAATCTTCATCACA TTATTGCTTATCTAATCGACAAAATGAATGTGATGATATTGAATTAACAAGTCAAAGAAA TGATTGGCCAACAATGGCTAGTCAAGATTTAGATCACAGTTATCAATCAGTTAGTAGTGG AGGATTTAATTTAAATAGACGTATACGAACTTCACTTACTGACGAACAGCGTTATCGATT ACAGGAGGCATACGAATTAAATATTCGTCCATCAAAAAGTATACGTGAAGCCTTAGCCTC CGAGTTAGGTGTACCTATGCGTGTTGTTCAGGTGTGGTTTCAAAATCAACGTGCACGTGA TAAACGAGCCTCTACCTTTGGTCATCTAAATCCTAACACTGACAAATCATCAGTTTCACA TATGAATACTATTAACCCTCATCAATTTGATGGTCATCAATTGCATTTGCAGGAGCAACA ACGAAATCATTGTAACAAACAGCAATCTTCAGATTTACGCCCGTTTACTCCATCTCCACA CACCTCTGTTGAAAGTGGTCCTTTTCCTGAATTCGGTGGATTTTCCTCTGACATCTAGTA CGCTATGTTCCCGATGTTAATATGCACAATGATTCTGCTGATATGCATCTTGGAGATCTG TATCCAATGCTGTATGGCTTGTAGAAAATGGAAATGAAAATTCAACTATCAGATGATACT GTCTTCGTTGTCGTATTTCTCCAACTGAATATTATTTAATGAATGAAAACACTATGTGGG TAAACGTATATCAAGTGTAAATGAAACAGTTTAACCTTTGTACATATTTGTATCACACAT ATATTTGTCCAAACAATGAATTTTAAAAAAAACCAATTGGATAATTATGAATAAAAGCAC AAAACGTGATCATGTTTCATATTTGTTGCTATTGTTAACCTCTCTCTTCATTCTATGTCT TTATAGTGTATATTTTATGATAAATCGATTTGAATAACATTCGGCATCTGTTCTCTCCAT TGTTAATCTTACCTTATAGTACGGTTGCTTCTGTTTGTTTTATGCTATTATTTTCGTTTT TAGTTGTTTATTTTATGCGCCTTTTGTACATGACAAATAAACATATATATACCTATTTAT TGCGAAAAAAAAAGTAAAAAAAANCATCTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)