These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9931#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 12 consensus length = 349 fasta sequence [TCGGTAAAGGGGTCGGTAATGACGTCCTCGTCAGTCCCAATTGCCATGCGCACCCCGGCATCCTGCAGGTCCTTGACCCGCGCGATGCCGTCACCCAGATCGGCCTCGGTGGTTGGACACAGTGAGACGACGGTATCCGAAGCCGCGATCATGGCGATGTCGCCGCCGGTCAGATGGGTGGCATGGATGATGGTAGTGCGGTCGGAGAGCACCCCAGCTCGGTCCAGCACTGC-TGTCGGCGTCAGGCCATGTGCAGCCAAGCATTCGGTGTTCTCGCGGNGCTGCTCGGAGACGTGGATGTGAATGGGTACACGTTCCGGTAGTCCACTTACAGCTGTGGCCATCTCGT] [+] EMBL CD198930 [TCGGTAAAGGGGTCGGTAATGACGTCCTCGTCAGTCCCAATTGCCATGCGCACCCCGGCATCCTGCAGGTCCTTGACCCGCGCGATGCCGTCACCCAGATCGGCCTCGGTGGTTGGACACAGTGAGACGACGGTATCCGAAGCCGCGATCATGGCGATGTCGCCGCCGGTCAGATGGGTGGCATGGATGATGGTAGTGCGGTCGGGGAGCACCCCAGCTCGGTCCAGCACTGC TGTCGGCGTCAGGCCATGTGCAGCCAAGCATTCGGTGTTCTCGCGGGGCTGCTCGGAGACGTGGATGTGAATGGGTACACGTTCCGGTAGTCCACTTACAGCTGTGGCCATCTCGT] [+] EMBL CD199113 [TCGGTAAAGGGGTCGGTAATGACGTCCTCGTCAGTCCCAATTGCCATGCGCACCCCGGCATCCTGCAGGTCCTTGACCCGCGCGATGCCGTCACCCAGATCGGCCTCGGTGGTTGGACACAGTGAGACGACGGTATCCGAAGCCGCGATCATGGCGATGTCGCCGCCGGTCAGATGGGTGGCATGGATGATGGTAGTGCGGTCGGAGAGCACCCCAGCTCGGTCCAGCACTGC TGTCGGCGTCAGGCCATGTGCAGCCAAGCATTCGGTGTTCTCGCGGGGCTGCTCGGAGACGTGGATGTGAATGGGTACACGTTCCGGTAGTCCACTTACAGCTGTGGCCATCTCG ] [+] EMBL CD199170 [TCGGTAAAGGGGTCGGTAATGACGTCCTCGTCAGTCCCAATTGCCATGCGCACCCCGGCATCCTGCAGGTCCTTGACCCGCGCGATGCCGTCACCCAGATCGGCCTCGGTGGTTGGACACAGTGAGACGACGGTATCCGAAGCCGCGATCATGGCGATGTCGCCGCCGGTCAGATGGGTGGCATGGATGATGGTAGTGCGGTCGGAGAGCACCCCAGCTCGGTCCAGCACTGC TGTCGGCGTCAGGCCATGTGCAGCCAAGCATTCGGTGTTCTCGCGGGGCTGCTCGGAGACGTGGATGTGAATGGGTACACGTTCCGGTAGTCCACTTACAGC ] [+] EMBL CD199123 [TCGGTAAAGGGGTCGGTAATGACGTCCTCGTCAGTCCCAATTGCCATGCGCACCCCGGCATCCTGCAGGTCCTTGACCCGCGCGATGCCGTCACCCAGATCGGCCTCGGTGGTTGGACACAGTGAGACGACGGTATCCGAAGCCGCGATCATGGCGATGTCGCCGCCGGTCAGATGGGTGGCATGGATGATGGTAGTGCGGTCGGAGAGCACCCCAGCTCGGTCCAGCACTGC TGTCGGCGTCAGGCCATGTGCAGCCAAGCATTCGGTGTTCTCGCGNNGCTGCTCGGAGACGTGGATGTGAATGGGTACACGTTCC ] [+] EMBL CD198863 [TCGGTAAAGGGGTCGGTAATGACGTCCTCGTCAGTCCCAATTGCCATGCGCACCCCGGCATCCTGCAGGTCCTTGACCCGCGCGATGCCGTCACCCAGATCGGCCTCGGTGGTTGGACACAGTGAGACGACGGTATCCGAAGCCGCGATCATGGCGATGTCGCCGCCGGTCAGATGGGTGGCATGGATGATGGTAGTGCGGTCGGAGAGCACTCCAGCTCGGTCCAGCACTGC TGTCGGCGTCAGGCCATGTGCAGCCAAGCATTCGGTGTTCTCGCGGGGCTGCTCGGAGACGTGGATGTGAATGNGTACA ] [+] EMBL CD198885 [TCGGTAAAGGGGTCGGTAATGACGTCCTCGTCAGTCCCAATTGCCATGCGCACCCCGGCATCCTGCAGGTCCTTGACCCGCGCGATGCCGTCACCCAGATCGGCCTCAGTGGTTGGACACAGTGAGACGACGGTATCCGAAGCCGCGATCATGGCGATGTCGCCGCCGGTCAGATGGGTGGCATGGATGATGGTAGTGCGGTCGGAGAGCACCCCAGCTCGGTCCAGCACTGC TGTCGGCGTCAGGCCATGTGCAGCCAAGCATTCGGTGTTCTCGCGNNGCTGCTCGGAGACGTGGATGTGAATGn ] [+] EMBL CD199145 [TCGGTAAAGGGGTCGGTAATGACGTCCTCGTCAGTCCCAATTGCCATGCGCACCCCGGCATCCTGCAGGTCCTTGACCCGCGCGATGCCGTCACCCAGATCGGCCTCGGCGGTTGGACACAGTGAGACGACGGTATCCGAAGCCGCGATCATGGCGATGTCGCCGCCGGTCAGATGGGTGGCATGGATGATGGTAGTGCGGTCGGAGAGCACCCCAGCTCGGTCCAGCACTGC TGTCGGCGTCAGGCCATGTGCAGCCAAGCATTCGGTGTTCTCGCGNNGCTGCTCGGAGACGTGGATGT ] [+] EMBL CD199028 [TCGGTAAAGGGGTCGGTAATGACGTCCTCGTCAGTCCCAATTGCCATGCGCACCCCGGCATCCTGCAGGTCCTTGACCCGCGCGATGCCGTCACCCAGATCGGCCTCGGTGGTTGGACACAGTGAGACGACGGTATCCGAAGCCGCGATCATGGCGATGTCGCCGCCGGTCAGATGGGTGGCATGGATGATGGTAGTGCGGTCGGAGAGCACCCCAGCTCGGTCCAGCACTGC TGTCGGCGTCAGGGCATGTGCAGCCAAGCATTCGGTGTTCTCGCGNNGCTGCTCGGAGACGTGGATG ] [+] EMBL CD198835 [TCGGTAAAGGGGTCGGTAATGACGTCCTCGTCAGTCCCAATTGCCATGCGCACCCCGGCATCCTGCAGGTCCTTGACCCGCGCGATGCCGTCACCCAGATCGGCCTCGGTGGTTGGACACAGTGAGACGACGGTATCCGAAGCCGCGATCATGGCGATGTCGCCGCCGGTCAGATGGGTGGCATGGATGATGGTAGTGCGGTCGGAGAGCACCCCAGCTCGGTCCAGCACTGC TGTCGGCGTCAGGCCATGTGCAGCCAAGCATTCGGTGTTCTCGCGGTGCTGCTCGGAGACGTGG ] [+] EMBL CD199009 [TCGGTAAAGGGGTCGGTAATGACGTCCTCGTCAGTCCCAATTGCCATGCGCACCCCGGCATCCTGCAGGTCCTTGACCCGCGCGATGCCGTCACCCAGATCGGCCTCGGTGGTTGGACACAGTGAGACGACGGTATCCGAAGCCGCGATCATGGCGATGTCGCCGCCGGTCAGATGGGTGGCATGGATGATGGTAGTGCGGTCGGAGAGCACCCCAGCTCGGTCCAGCACTGC TGTCGGCGTCAGGCCATGTGCAGCCAAGCATTCGGTGTTCTCGCGGNGCTGC ] [+] EMBL CD199130 [TCGGTAAAGGGGTCGGTAATGACGNCCTCGTCAGTCCCAATTGCCATGCGCACCCCGGCATCCTGCAGGTCCTTGACCCGCGCGATGCCGTCACCCAGATCGGCCTCGGTGGTTGGACACAGTGAGACGACGGTATCCGAAGCCGCGATCATGGCGATGTCGCCGCCGGTCAGATGGGTGGCATGGATGATGGTAGTGCGGTCGGAGAGCACCCCAGCTCGGTCCAGCACTGCTTGTCGGCGTCAGGCCATGTGCA ] [+] EMBL CD198935 [TCGGTAAAGGGGTCGGTAATGACGTCCTCGTCAGTCCCAATTGCCATGCGCACCCCGGCATCCTGCAGGTCCTTGACCCGCGCGATGCCGTCACCCAGATCGGCCTCGGTGGTTGGACACAGTGAGACGACGGTATCCGAAGCCGCGATCATGGCGATGTCGCCGCCGGTCAGATGGGTGGCATGTATGATGGTAGTGCGGTCGGAGAGCACCCCAGCTCGGTCCAGCACTGC TGTCGGCGTCAGGCCAT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||