Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 9931 cluster # 9931       Sequences # 12       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9931#0 length = 349 sequences # 12  

consensusID : consensus_9931#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 12
consensus length = 349
fasta sequence
                              [TCGGTAAAGGGGTCGGTAATGACGTCCTCGTCAGTCCCAATTGCCATGCGCACCCCGGCATCCTGCAGGTCCTTGACCCGCGCGATGCCGTCACCCAGATCGGCCTCGGTGGTTGGACACAGTGAGACGACGGTATCCGAAGCCGCGATCATGGCGATGTCGCCGCCGGTCAGATGGGTGGCATGGATGATGGTAGTGCGGTCGGAGAGCACCCCAGCTCGGTCCAGCACTGC-TGTCGGCGTCAGGCCATGTGCAGCCAAGCATTCGGTGTTCTCGCGGNGCTGCTCGGAGACGTGGATGTGAATGGGTACACGTTCCGGTAGTCCACTTACAGCTGTGGCCATCTCGT]

[+] EMBL CD198930             [TCGGTAAAGGGGTCGGTAATGACGTCCTCGTCAGTCCCAATTGCCATGCGCACCCCGGCATCCTGCAGGTCCTTGACCCGCGCGATGCCGTCACCCAGATCGGCCTCGGTGGTTGGACACAGTGAGACGACGGTATCCGAAGCCGCGATCATGGCGATGTCGCCGCCGGTCAGATGGGTGGCATGGATGATGGTAGTGCGGTCGGGGAGCACCCCAGCTCGGTCCAGCACTGC TGTCGGCGTCAGGCCATGTGCAGCCAAGCATTCGGTGTTCTCGCGGGGCTGCTCGGAGACGTGGATGTGAATGGGTACACGTTCCGGTAGTCCACTTACAGCTGTGGCCATCTCGT]
[+] EMBL CD199113             [TCGGTAAAGGGGTCGGTAATGACGTCCTCGTCAGTCCCAATTGCCATGCGCACCCCGGCATCCTGCAGGTCCTTGACCCGCGCGATGCCGTCACCCAGATCGGCCTCGGTGGTTGGACACAGTGAGACGACGGTATCCGAAGCCGCGATCATGGCGATGTCGCCGCCGGTCAGATGGGTGGCATGGATGATGGTAGTGCGGTCGGAGAGCACCCCAGCTCGGTCCAGCACTGC TGTCGGCGTCAGGCCATGTGCAGCCAAGCATTCGGTGTTCTCGCGGGGCTGCTCGGAGACGTGGATGTGAATGGGTACACGTTCCGGTAGTCCACTTACAGCTGTGGCCATCTCG ]
[+] EMBL CD199170             [TCGGTAAAGGGGTCGGTAATGACGTCCTCGTCAGTCCCAATTGCCATGCGCACCCCGGCATCCTGCAGGTCCTTGACCCGCGCGATGCCGTCACCCAGATCGGCCTCGGTGGTTGGACACAGTGAGACGACGGTATCCGAAGCCGCGATCATGGCGATGTCGCCGCCGGTCAGATGGGTGGCATGGATGATGGTAGTGCGGTCGGAGAGCACCCCAGCTCGGTCCAGCACTGC TGTCGGCGTCAGGCCATGTGCAGCCAAGCATTCGGTGTTCTCGCGGGGCTGCTCGGAGACGTGGATGTGAATGGGTACACGTTCCGGTAGTCCACTTACAGC              ]
[+] EMBL CD199123             [TCGGTAAAGGGGTCGGTAATGACGTCCTCGTCAGTCCCAATTGCCATGCGCACCCCGGCATCCTGCAGGTCCTTGACCCGCGCGATGCCGTCACCCAGATCGGCCTCGGTGGTTGGACACAGTGAGACGACGGTATCCGAAGCCGCGATCATGGCGATGTCGCCGCCGGTCAGATGGGTGGCATGGATGATGGTAGTGCGGTCGGAGAGCACCCCAGCTCGGTCCAGCACTGC TGTCGGCGTCAGGCCATGTGCAGCCAAGCATTCGGTGTTCTCGCGNNGCTGCTCGGAGACGTGGATGTGAATGGGTACACGTTCC                               ]
[+] EMBL CD198863             [TCGGTAAAGGGGTCGGTAATGACGTCCTCGTCAGTCCCAATTGCCATGCGCACCCCGGCATCCTGCAGGTCCTTGACCCGCGCGATGCCGTCACCCAGATCGGCCTCGGTGGTTGGACACAGTGAGACGACGGTATCCGAAGCCGCGATCATGGCGATGTCGCCGCCGGTCAGATGGGTGGCATGGATGATGGTAGTGCGGTCGGAGAGCACTCCAGCTCGGTCCAGCACTGC TGTCGGCGTCAGGCCATGTGCAGCCAAGCATTCGGTGTTCTCGCGGGGCTGCTCGGAGACGTGGATGTGAATGNGTACA                                     ]
[+] EMBL CD198885             [TCGGTAAAGGGGTCGGTAATGACGTCCTCGTCAGTCCCAATTGCCATGCGCACCCCGGCATCCTGCAGGTCCTTGACCCGCGCGATGCCGTCACCCAGATCGGCCTCAGTGGTTGGACACAGTGAGACGACGGTATCCGAAGCCGCGATCATGGCGATGTCGCCGCCGGTCAGATGGGTGGCATGGATGATGGTAGTGCGGTCGGAGAGCACCCCAGCTCGGTCCAGCACTGC TGTCGGCGTCAGGCCATGTGCAGCCAAGCATTCGGTGTTCTCGCGNNGCTGCTCGGAGACGTGGATGTGAATGn                                          ]
[+] EMBL CD199145             [TCGGTAAAGGGGTCGGTAATGACGTCCTCGTCAGTCCCAATTGCCATGCGCACCCCGGCATCCTGCAGGTCCTTGACCCGCGCGATGCCGTCACCCAGATCGGCCTCGGCGGTTGGACACAGTGAGACGACGGTATCCGAAGCCGCGATCATGGCGATGTCGCCGCCGGTCAGATGGGTGGCATGGATGATGGTAGTGCGGTCGGAGAGCACCCCAGCTCGGTCCAGCACTGC TGTCGGCGTCAGGCCATGTGCAGCCAAGCATTCGGTGTTCTCGCGNNGCTGCTCGGAGACGTGGATGT                                                ]
[+] EMBL CD199028             [TCGGTAAAGGGGTCGGTAATGACGTCCTCGTCAGTCCCAATTGCCATGCGCACCCCGGCATCCTGCAGGTCCTTGACCCGCGCGATGCCGTCACCCAGATCGGCCTCGGTGGTTGGACACAGTGAGACGACGGTATCCGAAGCCGCGATCATGGCGATGTCGCCGCCGGTCAGATGGGTGGCATGGATGATGGTAGTGCGGTCGGAGAGCACCCCAGCTCGGTCCAGCACTGC TGTCGGCGTCAGGGCATGTGCAGCCAAGCATTCGGTGTTCTCGCGNNGCTGCTCGGAGACGTGGATG                                                 ]
[+] EMBL CD198835             [TCGGTAAAGGGGTCGGTAATGACGTCCTCGTCAGTCCCAATTGCCATGCGCACCCCGGCATCCTGCAGGTCCTTGACCCGCGCGATGCCGTCACCCAGATCGGCCTCGGTGGTTGGACACAGTGAGACGACGGTATCCGAAGCCGCGATCATGGCGATGTCGCCGCCGGTCAGATGGGTGGCATGGATGATGGTAGTGCGGTCGGAGAGCACCCCAGCTCGGTCCAGCACTGC TGTCGGCGTCAGGCCATGTGCAGCCAAGCATTCGGTGTTCTCGCGGTGCTGCTCGGAGACGTGG                                                    ]
[+] EMBL CD199009             [TCGGTAAAGGGGTCGGTAATGACGTCCTCGTCAGTCCCAATTGCCATGCGCACCCCGGCATCCTGCAGGTCCTTGACCCGCGCGATGCCGTCACCCAGATCGGCCTCGGTGGTTGGACACAGTGAGACGACGGTATCCGAAGCCGCGATCATGGCGATGTCGCCGCCGGTCAGATGGGTGGCATGGATGATGGTAGTGCGGTCGGAGAGCACCCCAGCTCGGTCCAGCACTGC TGTCGGCGTCAGGCCATGTGCAGCCAAGCATTCGGTGTTCTCGCGGNGCTGC                                                                ]
[+] EMBL CD199130             [TCGGTAAAGGGGTCGGTAATGACGNCCTCGTCAGTCCCAATTGCCATGCGCACCCCGGCATCCTGCAGGTCCTTGACCCGCGCGATGCCGTCACCCAGATCGGCCTCGGTGGTTGGACACAGTGAGACGACGGTATCCGAAGCCGCGATCATGGCGATGTCGCCGCCGGTCAGATGGGTGGCATGGATGATGGTAGTGCGGTCGGAGAGCACCCCAGCTCGGTCCAGCACTGCTTGTCGGCGTCAGGCCATGTGCA                                                                                              ]
[+] EMBL CD198935             [TCGGTAAAGGGGTCGGTAATGACGTCCTCGTCAGTCCCAATTGCCATGCGCACCCCGGCATCCTGCAGGTCCTTGACCCGCGCGATGCCGTCACCCAGATCGGCCTCGGTGGTTGGACACAGTGAGACGACGGTATCCGAAGCCGCGATCATGGCGATGTCGCCGCCGGTCAGATGGGTGGCATGTATGATGGTAGTGCGGTCGGAGAGCACCCCAGCTCGGTCCAGCACTGC TGTCGGCGTCAGGCCAT                                                                                                   ]


>consensus_9931#0 TCGGTAAAGGGGTCGGTAATGACGTCCTCGTCAGTCCCAATTGCCATGCGCACCCCGGCA TCCTGCAGGTCCTTGACCCGCGCGATGCCGTCACCCAGATCGGCCTCGGTGGTTGGACAC AGTGAGACGACGGTATCCGAAGCCGCGATCATGGCGATGTCGCCGCCGGTCAGATGGGTG GCATGGATGATGGTAGTGCGGTCGGAGAGCACCCCAGCTCGGTCCAGCACTGCTGTCGGC GTCAGGCCATGTGCAGCCAAGCATTCGGTGTTCTCGCGGNGCTGCTCGGAGACGTGGATG TGAATGGGTACACGTTCCGGTAGTCCACTTACAGCTGTGGCCATCTCGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)