Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 9953 cluster # 9953       Sequences # 12       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9953#0 length = 1322 sequences # 12  

consensusID : consensus_9953#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 12
consensus length = 1322
fasta sequence
                              [AATTGCCAAAATGCACCTTTACCAGGTTCCGATTGAGAACGTGGTACACGGATAAAATAACGATTTAATGATAAATTATGACGTATTGAATTCTGCCAACCTTTTTCATGTGGTTTATAATATGGAAATGTTTTTGAAATATGAGCGTAGATATCAGCTAAAGTTAGACGTTGATTAGGCGCCGATGCGATAGCTTGAATAATTAATTGAGCATAAGAATAAGGCGGTTTACGGAACGTTGAGCCTCGATCAATTGCGGTTGTTGAAGCTAAATTTGCAGCTAACTTATTAATAGTTGATTCGTTTTCTTGAGTACTACAAGTATTATTATTATTACCATCGTCATTACGATGATCATTACAATATGTTGTGATATCCTGGTGTACTGCGACTACACTTGAATCGACAGTGTCATCTAAATCGTCCACCGTCAAGGTGTTTTGTTCAATGATATCGGA-TTTTTTAAATTGAGATTCTGGAGAGTTAGATGATAATACGAAGGGGTTCTTCATTAAATCTGATAAGCCATGGTCGAACGTAGAACAATTGTGTTCAGTTGATCTGGAGTCATATAGTTGATGAGAAGGAAAATTCACTAAGTTAGATAATG-TTAGAGTACTAC-TTTTGTGTGCATTCAACTGGGATAGCTGTGCAAGTGAATTAAAAGCAAACAATCTTGCGATATGATTCATTTTAGTTGTAACATCTGAATTTTCACTTTGAAACA-GTGATTC-ACCAT-CGATATTTAAGGATTTAGGTTGATTATCATTTTGAATAAGATTCTGAAGGACTGTTGTAGTTGCTGTGATGGCTGGAATATTAAAATGTTGATCTGTTTGTACAAATAATGGTTCAACTGGTAATAAAGCACAGTTTGAGGTGGCTGAACCCTGAAGACTATTAAGGGATAGATCCGAAATAGTATTCTGATTATCAATTTTTAAGTTGTTACATGAAACATCATGTCTTTCTTCGGGAGTATTTCGACAATTTTCTGACTCAAAGCAAAATGAAGAATGGGAATTTTCTTCAAATCCTTTGGATTTTAGAATTGGTGAAATGACTGGATCTGTCATATTTCTATTGTTTTGATCAGTACTCAATGTAGGCTCGCCACGATTGGTGTGATCGAGTGAAGATCTCCAAGATGCCCGCTTTTTAGGATGGCAAAATGGTTCCAGCTCGACTACTTCTACGATGATCACGATGTTGGTACTCGGAAACCTTAGTTTACACCCATCAGCTAAAAGAACAAAATCCGGCTTCCCAACGTGAAAGGATCCGTCTATGAAAATTCCATTTTTACTAAGACATCTAAGATA]

[+] EMBL CD151656             [AATTGCCAAAATGCACCTTTACCAGGTTCCGATTGAGAACGTGGTACACGGATAAAATAACGATTTAATGATAAATTATGACGTATTGAATTCTGCCAACCTTTTTCATGTGGTTTATAATATGGAAATGTTTTTGATATATGAGCGTAGATATCAGCTAAAGTTAGACGTTGATTAGGCGCCGATGCGATAGCTTGAATAATTAATTGAGCATAAGAATAAGGCGGTTTACGGAACGTTGAGCCTCGATCAATTGCGGTTGTTGAAGCTAAATTTGCAGCTAACTTATTAATAGTTGATTCGTTTTCTTGAGTACTACAAGTATTATTATTATTACCATCGTCATTACGATGATCATTACAATATGTTGTGATATCCTGGTGTACTGCGACTACACTTGAATCGACAGTGTCATCTAAATCGTCCACCGTCAAGGTGTTTTGTTCAATGATATCGGATTTTTTTAAATTGAGATTCTGGAGAGTTAGATGATAATACGAAGGGGTTCTTCATTAAATCTGATAAGCCATGGTCGAACGTAGAACAATTGTGTTCAGTTGATCTGGAGTCATATAGTTGATGAGAAAGAAAATTCACTAAGTTAGATAATG TTAGAGTACTAC TTTTGTGTGCATTCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD113469             [AATTGCCAAAATGCACCTTTACCAGGTTCCGATTGAGAACGTGGTACACGGATAAAATAACGATTTAATGATAAATTATGACGTATTGAATTCTGCCAACCTTTTTCATGTGGTTTATAATATGGAAATGTTTTTGAAATATGAGCGTAGATATCAGCTAAAGTTAGACGTTGATTAGGCGCCGATGCGATAGCTTGAATAATTAATTGAGCATAAGAATAAGGCGGTTTACGGAACGTTGAGCCTCGATCAATTGCGGTTGTTGAAGCTAAATTTGCAGCTAACTTATTAATAGTTGATTCGTTTTCTTGAGTACTACAAGTATTATTATTATTACCATCGTCATTACGATGATCATTACAATATGTTGTGATATCCTGGTGTACTGCGACTACACTTGAATCGACAGTGTCATCTAAATCGTCCACCGTCAAGGTGTTTTGTTCAATGATATCGGA TTTTTTAAATTGAGATTCTGGAGAGTTAGATGATAATACGAAGGGGTTCTTCATTAAATCTGATAAGCCATGGTCGAACGTAGAACAATTGTGTTCAGTTGATCTGGAGTCATATAGTTGACGAGAAGGAAAATTCACTAAGTTAGATAATGTTTAGAG ACTACTTTTTGTGTGCATTCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD113409             [AATTGCCAAAATGCACCTTTACCACGTTCCGATTGAGAACGTGGTACACGGATAAAATAACCATTCAATGATAAATTATGACGTATTGAATTCTGCCAACCTTTTTCATGTGGTTTATAATATGGAAATGTTTTTGAAATATGATCGTAAATATCAGCTAAAGTTAAACGTTGATTATGCGCCGATGCGATAACTGGAATAATTAATTGAGCATAAGAATAAGGCGGTTTACGGAACGTCGATCCTCGATCAATAGCCGTTGCTGAATCTAAATTAGCAGCTAACTTATTAATAGTTGATTCGGTTTCTTGAGTACTACAACTATTATTATTATTACCATCGTCATTACGATGATCATTACGATATGTTGCGATATCCTGGAGTACTGCGACTACACTTGAATCGACAGTGACATCTAAATCGTCCACCGTCAAGGTGTTAAGCTCAATGATATCGGA TTTTTTAAATCGACATTCTGGACAGTTACATGATAATACGAACGGGTTCTTCATTAAATCTGATAAGCCATGGTCGAACGTCTAACAATAGTGTTCAGTAGATCTGGATTCATATAGTTGATGAGAAGGAAAATTCACTAAGTTAGATAATG ATAGAGTACTAC TTTAGTGTGCATTCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD090064             [                                                                                                                                     TTGAAATATGAGCGTAGATATCAGCTAAAGTTAGACGTTGATTAGGCGCCGATGCGATAGCTTGAATAATTAATTGAGCATAAGAATAAGGCGGTTTACGGAACGTTGAGCCTCGATCAATTGCGGTTGTTGAAGCTAAATTTGCAGCTAACTTATTAATAGTTGATTCGTTTTCTTGAGTACTACAAGTATTATTATTATTACCATCGTCATTACGATGATCATTACAATATGTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD065734             [                                                                                                                                                                                                                                    tcACGGAAC TTGAGCCTCGATCA  TGCGGTTGTTGAAGCTAAATTTGCAGCT ACTTATTAATAGTTGATTCGTTTTCTTGAGTACTACAAGTATTATTATTATTACCATCGTCATTACGATGATCATTACAATATGTTGTGATATCCTGGTGTACTGCGACTACACTTGAATCGACAGTGTCATCTAAATCGTCCACCGTCAAGGTGTTTTGTTCAATGATATCGGA TTTTTTAAATTGAGATTCTGGAGAGTTAGATGATAATACGAAGGGGTTCTTCATTAAATCTGATAAGCCATGGTCGAACGTAGAACAATTGTGTTCAGTTGATCTGGAGTCATATAGTTGATGAGAAGGAAAATTCACTAAGTTAGATAATG TTAGAGTACTAC TTTTGTGTGCATTCAACTGGGATAGCTGTGCAAGTGAATTAAAAGCAAACAATCTTGCGATATGATTCATTTTAGTTGTAACATCTGAATTTTCACTTTGAAACA GTGATTC ACCAT CGATATTTAAGGATTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD065708             [                                                                                                                                                                                                                                                            ATTGCGGT  TTGAAGCTAAATTTGCAGCTAACTTATTAATAGTTGATTCGTTTTCTTGAGTACTACAAGTATTATTATTATTACCATCGTCATTACGATGATCATTACAATATGTTGTGATATCCTGGTGTACTGCGGCTACACTTGAATCGACAGTGTCATCTAAATCGTCCACCGTCAAGGTGTTTTGTTCAATGATATCGGA TTTTTTAAATTGAGATTCTGGAGAGTTAGATGATAATACGAAGGGGTTCTTCATTAAATCTGATAAGCCATGGTCGAACGTAGAACAATTGTGTTCAGTTGATCTGGAGTCATATAGTTGATGAGAAGGAAAATTCACTAAGTTAGATAATG TTAGAGTACTAC TTTTGTGTGCATTCAACTGGGATAGCTGTGCAAGTGAATTAAAAGCAAACAATCTTGCGATATGATTCATTTTAGTTGTAACATCTGAATTTTCACTTTGAAACA GTGATTC ACCAT CGATATTTACGGATTTAGGTTGATTATCCATTTGAATAAGATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD123149             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CAAGGTGTTTTGTTCAATGATATCGGA TTTTTTAAATTGAGATTCTGGAGAGTTAGATGATAATACGAAGGGGTTCTTCATTAAATCTGATAAGCCATGGTCGAACGTAGTACAATTGTGTTCAGTTGATATGGAGTCATATAGTTGATGAGAAGGAAAATTCAATAAGTTAGATAATG TTAGAGTAATAC TTTTGTGTGCATTCAGGTGGGATAGCTGTGCAAGTGAATTAAAAGCTAACAATCTTGCGATATGATTCATTTTAGTTGTAACATGTGAATTTTCTCTTTGAAACAGGTTATTCGACCATCCGATATTTAAGGATTTAGGTTGATTATCATTTTGAATAAGATTCTGAAGGACTGTTGTAGTTGCTGTGATGGCTGGAATATTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD186645             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATGATAATACGAAGGGGTTCTTCATTAAATCTGATAAGCCATGGTCGAACGTAGAACAATTGTGTTCAGTTGATCTGGAGTCATATAGTTGATGAGAAGGAAAATTCACTAAGTTAGATAATG TTAGAGTACTAC TTTTGTGTGCATTCAACTGGGATAGCTGTGCAAGTGAATTAAAAGCAAACAATCTTGCGATATGATTCATTTTAGTTGTAACATCTGAATTTTCACTTTGAAACA GTGATTC ACCAT CGATATTTAAGGATTTAGGTTGATTATCATTTTGAATAAGATTCTGAAGGACTGTTGTAGCTGCTCTGATGGCTGGAATATTAAAATGTTGATCTGTTTGTACAAATAATGGTTCAACTGGTAATAAAGCACAGTTTGAGGTGGCTGAAACCTGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD111669             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTAAAATGTTGATCTG TTGTACAAATAATGGTTCAACTGGTAATAAAGCACAGTTTGAGGTGGCTGAACCCTGAAGACTATTAAGGGATAGATCCGAAATAGTATTCTGATTATCAATTTTTAAGTTGTTACATGAAACATCATGTCTTTCCTCGGGAGTATTTCGACAATTTTCTGACTCAAAGCAAAATGAAGAATGGGAATTTTCTTCAAATCCTTTGGATTTTAGAATTGGTGAAATGACTGGATCTGTCATATTTCTATTGTTTTGATCAGTACTCAATGTAGGCTCGCCACGATTGGTGTGATCGAGTGAAGATCTCCAAGATGCCCGCTTTTTAGGATGGCAAAATGGTTCCAGCTCGACTACTTCTACGATGATCACGATGTTGGTACTCGGAAACCTTAGTTTACACCCATCAGCTAAAAGAACAAAATCCGGCTTCCCAACGTGAAAGGATCCGTCTATGAAAATTCCATTTTTACTAAGACATCTAAGATA]
[+] EMBL CD158495             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AAATGTTGATCTGTTTGTACAAATAATGGTTCAACTGGTAATAAAGCACAGTTTGAGGTGGCTGAACCCTGAAGACTATTAAGGGATAGATCCGAAATAGTATTCTGATTATCAATTTTTAAGTTGTTACATGAAACATCATGTCTTTCTTCGGGAGTATTTCGACAATTTTCTGACTCAAAGCAAAATGAAGAATGGGAATTTTCTTCAAATCCTTTGGATTTTAGAATTGGTGAAATGACTGGATCTGTCATATTTCTATTGTTTTGATCAGTACTCAATGTAGGCTCGCCACGATTGGTGTGATCGAGTGAAGATCTCCAAGATGCCCGCTTTTTAGGATGGCAAAATGGTTCCAGCTCGACTACTTCTACGAT                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD158630             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AATGTTGATCTGTTTGTACAAATAATGGTTCAACTGGTAATAAAGCACAGTTTGAGGTGGCTGAACCCTGAAGACTATTAAGGGATAGATCCGAAATAGTATTCTGATTATCAATTTTTAAGTTGTTACATGAAACATCATGTCTTTCTTCGGGAGTATTTCGACAATTTTCTGACTCAAAGCAAAATGAAGAATGGGAATTTTCTTCAAATCCTTTGGATTTTAGAATTGGTGAAATGACTGGATCTGTCATATTTCTATTGTTTTGATCAGTACTCAATGTAGGCTCGCCACGATTGGTGTGATCGAGTGAAGATCTCCAAGATGCCCGCTTTTTAGGATGGCAAAATGGTTCCAGCTCGACTACTTCTACGATG                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD158898             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GGTGTGATCGAGTGAAGATCTCCAAGATGCCCGCTTTTTAGGATGGCAAAATGGTTCCAGCTCGACTACTTCTACGATGATCACGATGTTGGTACTCGGAAACCTTAGTTTACACCCATCAGCTAAAAGAACAAAATCCGGCTTCCCAACGTGAAAGGA                                          ]


>consensus_9953#0 AATTGCCAAAATGCACCTTTACCAGGTTCCGATTGAGAACGTGGTACACGGATAAAATAA CGATTTAATGATAAATTATGACGTATTGAATTCTGCCAACCTTTTTCATGTGGTTTATAA TATGGAAATGTTTTTGAAATATGAGCGTAGATATCAGCTAAAGTTAGACGTTGATTAGGC GCCGATGCGATAGCTTGAATAATTAATTGAGCATAAGAATAAGGCGGTTTACGGAACGTT GAGCCTCGATCAATTGCGGTTGTTGAAGCTAAATTTGCAGCTAACTTATTAATAGTTGAT TCGTTTTCTTGAGTACTACAAGTATTATTATTATTACCATCGTCATTACGATGATCATTA CAATATGTTGTGATATCCTGGTGTACTGCGACTACACTTGAATCGACAGTGTCATCTAAA TCGTCCACCGTCAAGGTGTTTTGTTCAATGATATCGGATTTTTTAAATTGAGATTCTGGA GAGTTAGATGATAATACGAAGGGGTTCTTCATTAAATCTGATAAGCCATGGTCGAACGTA GAACAATTGTGTTCAGTTGATCTGGAGTCATATAGTTGATGAGAAGGAAAATTCACTAAG TTAGATAATGTTAGAGTACTACTTTTGTGTGCATTCAACTGGGATAGCTGTGCAAGTGAA TTAAAAGCAAACAATCTTGCGATATGATTCATTTTAGTTGTAACATCTGAATTTTCACTT TGAAACAGTGATTCACCATCGATATTTAAGGATTTAGGTTGATTATCATTTTGAATAAGA TTCTGAAGGACTGTTGTAGTTGCTGTGATGGCTGGAATATTAAAATGTTGATCTGTTTGT ACAAATAATGGTTCAACTGGTAATAAAGCACAGTTTGAGGTGGCTGAACCCTGAAGACTA TTAAGGGATAGATCCGAAATAGTATTCTGATTATCAATTTTTAAGTTGTTACATGAAACA TCATGTCTTTCTTCGGGAGTATTTCGACAATTTTCTGACTCAAAGCAAAATGAAGAATGG GAATTTTCTTCAAATCCTTTGGATTTTAGAATTGGTGAAATGACTGGATCTGTCATATTT CTATTGTTTTGATCAGTACTCAATGTAGGCTCGCCACGATTGGTGTGATCGAGTGAAGAT CTCCAAGATGCCCGCTTTTTAGGATGGCAAAATGGTTCCAGCTCGACTACTTCTACGATG ATCACGATGTTGGTACTCGGAAACCTTAGTTTACACCCATCAGCTAAAAGAACAAAATCC GGCTTCCCAACGTGAAAGGATCCGTCTATGAAAATTCCATTTTTACTAAGACATCTAAGA TA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)