These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9972#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 10 consensus length = 879 fasta sequence [GAAGAATTGATCATAAAATACACTATATAAAACAAATTGAAGGGTGTTTTTCCAAGAGAAAAAAGAGTGAAGCAAATGAACTTAGTAAAGCTTAAATAATATTAACTATTATAGCATTGTATTATATCATTCCAATTACTTAATATGACTAGAAGGATGATTCAAGGAATAAGTGGAAGAATTTTTGTAATGACAATTTGATTGAAAGAAAGAAGAATCTAATAAAATGGTGAATTGAAGATTACAAATTTGTATAAGGACTATGTATATACGTAAAGTTGTGCTTAGTATATGTGAGTGAGTGTATGTGTATTTATGCCTCTATTCATTATTATTGCTATTATTATCAGTGACAGTTTTAATCTACCATTATTTCAAAATTCAGTTCATCTTTATTAGCATTTAGCACATTTGAAATTGTACATTTAACCAAAATAGTGACACTCTTTTTAGGTGATTTAAATTCCACAGCAACTATTGGGCCAAGGTAACCCGCTTGTCCAAGATATGGATAATAAGCACTACTGAATACCCCATATTGCTTTCCACTAAAATTTTTAGAAGGATAATAAGCCAATGAACCAATATTTTCCTCGTCTGCAGAGTTTTGTCCAGAACAACTAACCAAGATATCATTTGATTGAGACGGTCTTTCAATAGACGGCATCCATCCAAACACTTTATTTACTTTAAGGAGAACACAA-GGTGTTCCCTTACCGTAACCATAATTATTTGCAGTATTACAAGGTCCTAAAACTTCAAGAGGGAATTTGCAGACTTTATCCACATCTTTTGTTTCTCCTTCCTTGCCTTTACAATTGGCGAATTGACTGTCAGGTTTCGCGTTAACCTGATTATATGTATCTAAATCCGCGTCCA] [-] EMBL SMAA18512 [GAAGAATTGATCATAAAACACACTATATAAAACAAATTGAAGGGTG TTTTCCAAGAG AAAAAGAGTGAAGCAAATGAACTTAGTAAAGCTTAAATAATATTAACTATTATAGCATTGTATTATATCATTCCAATTACTTAATATGACTAGAAGGATGATTCAAGGAATAAGTGGAAGAATTTTTGTAATGACAATTTGATTGAAAGAAAGAAGAATCTAATAAAATGGTGAATTGAAGATTACAAATTTGTATAAGGACTATGTATATACGTAAAGTTGTGCTTAGTATAT ] [+] EMBL CD197289 [ AGAATTGATCATAAAATACACTATATAAAACAAATTGAAGGGTGTTTTTCCAAGAGAAAAAAGAGTGAAGCAAATGAACTTAGTAAAGCTTAAATAATATTAACTATTATAGCATTGTATTATATCATTCCAATTACTTAATATGACTAGAAGGATGATTCAAGGAATAAGTGGAAGAATTTTTGTAATGACAATTTGATTGAAAGAAAGAAGAATCTAATAAAATGGTGAATTGAAGATTACAAATTTGTATAAGGACTATGTATATACGTAAAGTTGTGCTTAGTATATGTGAGTGAGTGTAT ] [-] EMBL CD140892 [ GAATTGATCATAAAATACACTATATAAAACAAATTGAAGGGTGTTTTTCCAAGAGAAAAAAGAGTGAAGCAAATGAACTTAGTAAAGCTTAAATAATATTAACTATTATAGCATTGTATTATATCATTCCAATTACTTAATATGACTAGAAGGATGATTCAAGGAATAAGTGGAAGAATTTTTGTAATGACAATTTGATTGAAAGAAAGAAGAATCTAATAAAATGGTGAATTGAAGATTACAAATTTGTATAAGGACTATGTATATACGTAAAGTTGTGCTTAGTATATGTGAGTGAGTGTA ] [+] EMBL CD195659 [ GAGTGAAGCAAATGAACTTAGTAAAGCTTAAATAATATTAACTATTATAGCATTGTATTATATCATTCCAATTACTTAATATGACTAGAAGGATGATTCAAGGAATAAGTGGAAGAATTTTTGTAATGACAATTTGATTGAAAGAAAGAAGAATCTAATAAAATGGTGAATTGAAGATTACAAATTTGTATAAGGACTATGTATATACGTAAAGTTGTGCTTAGTATATGTGAGTGAGTGTATGTGTATTTATGCCTCTATTCATTn ] [+] EMBL CD169770 [ ATGAACTTAGTAAAGCTTAAATAATATTAACTATTATAGCATTGTATTATATCATTCCAATTACTTAATATGACTAGAAGGATGATTCAAGGAATAAGTGGAAGAATTTTTGTAATGACAATTTGATTGAAAGAAAGAAGAATCTAATAAAATGGGGAATTGAAGATTACAAATTTGTATAAGGACTATGTATATACGTAAAGTTGTGCTTAGTATATGTGAGTGAGTGTATGTGTATTTATGCCTCTATTCATTATTATTGCTATTATTATCAGTGACAGTTTTAATCTACCATTATTTCAAAATTCAGTTCATCTTTATTAGCATTTAGCACATTTGAAATTGTACATTTAACCAAAATAGTGACACTCTTTTTAGGTGATTTAAATTCCACAGCAACTATTGGGCCAAGGTAACCCGCTTGTCCAAGATATGGATAATAAGCACTACTGAATACCCCATATTGCTTTCCACTAAAATTTTTAGATGGATA ] [+] EMBL CD195163 [ GAACTTAGTAAAGCTTAAATAATATTAACTATTATAGCATTGTATTATATCATTCCAATTACTTAATATGACTAGAAGGATGATTCAAGGAATAAGTGGAAGAATTTTTGTAATGACAATTTGATTGAAAGAAAGAAGAATCTAATAAAATGGTGAATTGAAGATTACAAATTTGTATAAGGACTATGTATATACGTAAAGTTGTGCTTAGTATATGTGAGTGAGTGTATGTGTATTTATGCCTCTATTCATTATTATTGCTATTATTATCAGTGACAGTTTTAATCTACCATTATTTCAAAATTCAGTTCATCTTTATTAGCATTTAGCACATTTGAAATTGTACATTTAACCAAAAT ] [+] EMBL CD195389 [ GAACTTAGTAAAGCTTAAATAATATTAACTATTATAGCATTGTATTATATCATTCCAATTACTTAATATGACTAGAAGGATGATTCAAGGAATAAGTGGAAGAATTTTTGTAATGACAATTTGATTGAAAGAAAGAAGAATCTAATAAAATGGTGAATTGAAGATTACAAATTTGTATAAGGACTATGTATATACGTAAAGTTGTGCTTAGTATATGTGAGTGAGTGTATGTGTATTTATGCCTCTATTCATTATTATTGCTATTATTATCAGTGACAGTTTTAATCTACCATTATTTCAAAATTCAGTTCATCTTTATTAGCATTTANCACATTTGAAATTGTACATTTAACCAAAAT ] [+] EMBL CD144085 [ GCCAAGGTAACCCGCTTGTCCAAGATATGGATAATAAGCACTACTGAATACCCCATATTGTTTTCCACTAAAATTTTTAGAAGGATAATAAGCCAATGAACCAATATTTTCCTCGTCTGCAGAGTTTTGTCCAGAACAACTAACCAAGATATCATTTGATTGAGACGGTCTTTCAATAGACGGCATCCATCCAAACACTTTATTTACTTTAAGGAGAACACAA GGTGTTCCCTTACCGTAACCATAATTATTTGCAGTAT ] [-] EMBL CD120117 [ CTAAAATTTTTAGAAGGATAATAAGCCAATGAACCAATATTTTCCTCGTCTGCAGAGTTTCGTCCAGAACAACTAACCAAGATATCATTTGGTTGAGATGGTCTTTCAATAGACGGCATCCATCCAAACACTTTATTTACTTTAAGGAGAACACAA GGAGTTCCCTTACAGTAACCATAATTATTTGCAGTATTACAAGGTCCTAAAACTTCAAGAGGGAATTTGCAGACTTTATCCACATCTTTTGTTTCTCCTTCCTTGCCTTTACAATTGGCGAATTGACTGTCAGGTTTCGCGTTAACCTGATTATATGTATCTAAATCCGCGTCCA] [+] EMBL CD065599 [ GCAT CATC AACACTTTATTTACTTTAAGGAGAACACAAGGGTGTTCCCTTACCGTAACCATAATTATTTGCAGTATTACAAGGTCCTAAAACTTCAAGAGGGAATTTGCAGACTTTATCCACATCTTTTGTTTCTCCT ] consensusID : consensus_9972#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! 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Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||