These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9977#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 12 consensus length = 479 fasta sequence [GAGTACTCAGCATATCAACTCAACCGTCACAGTATGCGGATGGCTTGAGCATTGTCGACTGTCATCTCGTTTTCTCGTTCTTCGTGATGATCGTGGTTTAATACAAATATATTGTGACAAAAATTCTCTCCAAATTCCGCAATTTAATTCTGAGTCTGTCCTGAGAGTGACAGGTAAAGTCCAAGCACAGGAGTCAGCTCGGTTTGGGAACTCCTAGTTTGACCCTATCTTTCCTAAGTCTTATTCCTAAGGCTTCTGTTTCCAGCTTGCCGGCCTTTGTATATAAATCCCATGCTTGTGGTGAGCTGAGTACTCAGCATATCAACTCAACCGTCACAGTATGCGGATGGCTTGAGCATTGTCGACTGTCATCTCGTTTTCTCGTTCTTCGTGATGATCGTGGTTTAATACAAATATATTGTGACAAAAATTCTCTCCAAATTCCGCAATTTAATTCTGAGTCTGTCCTGAGAGTGACA] [+] EMBL CD121046 [GAGTACTCAGCATATCAACTCAACCGTCACAGTATGCGGATGGCTTGAGCATTGTCGACTGTCATCTCGTTTTCTCGTTCTTCGTGATGATCGTGGTTTAATACAAATATATTGTGACAAAAATTCTCTCCAAATTCCGCAATTTAATTCTGAGTCTGTCCTGAGAGTGACAGGTAAAGTCCAAGCACAGGAGTCAGCTCGGTTTGGGGACTCCTAGTTTGACCCTATCTTTCCTAAGTCTTATTCCTAAGGCTTCTGTTTCCAGCTTGCCGGCCTTTGTATATAAATCCCATGCTTGTGGTGAGCTGAGTACTCAGCATATCAACTCAACCGTCATAGTATGCGGATGGCTTGAGCATTGTCGACTGTCATCTCGTTTTCTCGTTCTTCGTGATGATCGTGGTTTAATACAAATATATTGTGACAAAAATTCTCTCCAAATTCCGCAATTTAATTCTGAGTCTGTCCTGAGAGTGAC ] [+] EMBL CD121734 [GAGTACTCAGCATATCAACTCAACCGTCACAGTATGCGGATGGCTTGAGCATTGTCGACTGTCATCTCGTTTTCTCGTTCTTCGTGATGATCGTGGTTTAATACAAATATATTGTGACAAAAATTCTCTCCAAATTCCGCAATTTAATTCTGAGTCTGTCCTGAGAGTGACAGGTAAAGTCCAAGCACAGGAGTCAGCTCGGTTTGGGAACTCCTAGTTTGACCCTATCTTTCCTAAGTCTTATTCCTAAGGCTTCTGTTTCCAGCTTGCCGGCCTTTGTATATAAATCCCATGCTTGTGGTGAGCTGAGTACTCAGCATATCAACTCAACCGTCACAGTATGCGGATGGCTTGAGCATTGTCGACTGTCATCTCGTTTTCTCGTTCTTCGTGATGATCGTGGTTTAATACAAATATATTGTGACAAAAATTCTCTCCAAATTCCGCAATTTAATTCTGAGTCTGTCCTGAGAGTGAC ] [+] EMBL CD121026 [GAGTACTCAGCATATCAACTCAACCGTCACAGTATGCGGATGGCTTGAGCATTGTCGACTGTCATCTCGTTTTCTCGTTCTTCGTGATGATCGTGGTTTAATACAAATATATTGTGACAAAAATTCTCTCCAAATTCCGCAA TTAATTCTGAGTCTGTCCTGAGAGTGACAGGTAAAGTCCAAGCACAGGAGTCAGCTCGGTTTGGGAACTCCTAGTTTGACCCTATCTTTCCTAAGTCTTATTCCTAAGGCTTCTGTTTCCAGCTTGCCGGCCTTTGTATATAAATCCCATGCTTGTGGTGAGCTGAGTACTCAGCATATCAACTCAACCGTCACAGTATGCGGATGGCTTGAGCATTGTCGACTGTCATCTCGTTTTCTCGTTCTTCGTGATGATCGTGGTTTAATACAAATATATTGTGACAAAAATTCTCTCCAAATTCCGCAATTTAATTCTGAGTCTGTCCTGAGAGTGAC ] [+] EMBL CD121017 [GAGTACTCAGCATATCAACTCAACCGTCACAGTATGCGGATGGCTTGAGCATTGTCGACTGTCATCTCGTTTTCTCGTTCTTCGTGATGGTCGTGGTTTAATACAAATATATTGTGACAAAAATTCTCTCCAAATTCCGCAATTTAATTCTGAGTCTGTCCTGAGAGTGAC ] [-] EMBL CD121049 [ AGTACTCAGCATATCAACTCAACCGTCACAGTATGCGGATGGCTTGAGCATTGTCGACTGTCATCTCGTTTTCTCGTTCTTCGTGATGATCGTGGTTTAATACAAATATATTGTGACAAAAATTCTCTCCAAATTCCGCAATTTAATTCTGAGTCTGTCCTGAGAGTGACA ] [-] EMBL CD159084 [ AGTACTCAGCATATCAACTCAACCGTCACAGTATGCGGATGGCTTGAGCATTGTCGACTGTCATCTCGTTTTCTCGTTCTTCGTGATGATCGTGGTTTAATACAAATATATTGTGACAAAAATTCTCTCCAAATTCCGCAATTTAATTCTGAGTCTGTCCTGAGAGTGACA ] [-] EMBL CD159167 [ AGTACTCAGCATATCAACTCAACCGTCACAGTATGCGGATGGCTTGAGCATTGTCGACTGTCATCTCGTTTTCTCGTTCTTCGTGATGATCGTGGTTTAATACAAATATATTGTGACAAAAATTCTCTCCAAATTCCGCAATTTAATTCTGAGTCTGTCCTGAGAGTGACA ] [-] EMBL CD159424 [ AGTACTCAGCATATCAACTCAACCGTCACAGTATGCGGATGGCTTGAGCATTGTCGACTGTCATCTCGTTTTCTCGTTCTTCGTGATGATCGTGGTTTAATACAAATATATTGTGACAAAAATTCTCTCCAAATTCCGCAATTTAATTCTGAGTCTGTCCTGAGAGTGACA ] [-] EMBL CD120913 [ AGTACTCAGCATATCAACTCAACCGTCACAGTATGCGGATGGCTTGAGCATTGTCGACTGTCATCTCGTTTTCTCGTTCTTCGTGATGATCGTGGTTTAATACAAATATATTGTGACAAAAATCCTCTCCAAATTCCGCAATTTAATTCTGAGTCTGTCCTGAGAGTGACAGGTAAAGTCCAAGCACAGGAGTCAGCTCGGTTTGGGAACTCCTAGTTTGACCCTATCTTTCCTAAGTCTTATTCCTAAGGCTTCTGTTTCCAGCTTGCCGGCCTTTGTATATAAATCCCATGCTTGTGGTGAGCTGAGTACTCAGCATATCAACTCAACCGTCACAGTATGCGGATGGCTTGAGCATTGTCGACTGTCATCTCGTTTTCTCGTTCTTCGTGATGATCGTGGTTTAATACAAATATATTGTGACAAAAATTCTCTCCAAATTCCGCAATTTAATTCTGAGTCTGTCCTGAGAGTGACA] [-] EMBL CD159091 [ AGTACTCAGCATATCAACTCAACCGTCACAGTATGCGGATGGCTTGAGCATTGTCGACTGTCATCTCGTTTTCTCGTTCTTCGTGATGATCGTGGTTTAATACAAATATATTGTGACAAAAATTCTCTCCAAATTCCGCAATTTAATTCTGAGTCTGTCCTGAGAGTGACA ] [-] EMBL CD159410 [ AGTACTCAGCATATCAACTCAACCGTCACAGTATGCGGATGGCTTGAGCATTGTCGACTGTCATCTCGTTTTCTCGTTCTTCGTGATGATCGTGGTTTAATACAAATATATTGTGACGAAAATTCTCTCCAAATTCCGCAATTTAATTCTGAGTCTGTCCTGAGAGTGACA ] [-] EMBL CD120958 [ AGTACTCAGCATATCAACTCAACCGTCACAGTATGCGGATGGCTTGAGCATTGTCGACTGTCATCTCGTTTTCTCGTTCTTCGTGATGATCGTGGTTTAATACAAATATATTGTGACAAAAATTCTCTCCAAATTCCGCAATTTAATTCTGAGTCTGTCCTGAGAGTGACA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||