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Takifugu rubripes
cluster # 1478 cluster # 1478       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1478#0 length = 974 sequences # 3  

consensusID : consensus_1478#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 974
fasta sequence
                              [TTCGTTAGAGGACATCTCCGGGGCGTTTGTCAGTCAGGCTCTCGTTTCTGATTTTGATATATTTACATACAGAATATTTAACCTGTTCAATGCCACAGCTCTCGCTGTCAGATAAACGTGCTTTCGTGCAGCACGTTGAACGCAGCATGAATTCGATGACGCCCTGTCAAAGGTTTGGCATCTTAAAATTAATCTTATACTTTGTAAAAGAAGTGAGGTAGCTTCAGTGAAGCAATGAAAGGAGCAGATATAGAAGAGAAAAGTCAGGCAGACATTTTCAGACTGTAATATATTAAAAAAACAAAACATTGGAAAGGTTAAATGTTTACATAATACTTTATTTAATGTATCTGGCTTTTCTCCTTTTATTATCAAGCATTTAATATCGTCGATTTGAACTCTTAAATATGTAAATATACATTATGAACCTATATTTTTTCTTTTTTTTTGCTTCCACTGCATATTGTTTTATCTTACAATAGATACTGCTTAAAAAATGTATGGATCTGTAGCCGGTAGCAAGTAGGTTAAAAATAGTACGTGATGGTGAGAGATTAAACTAAATACCTGTGCCTAAACTTTGAGCTCATCATATCAGAACAGATTAAATGACCTGTCAGTAGCACAAAATAATCCTCCTAATTTTTCCACTTGTACTTTTTCCTTGTGCATGTTTTACGTACCAGGTGTTGTCATTCACAAAGACGTTCATAATTTATTCTGTGTACTGTATGTTGGGAAGTATTTACACTTAAGATACAGATACATTTTTGGCTTCTGCTTCACTTCTGATTTCTCCTTTTCTGGTTTGCTTGTATTAAGTGTGACGAGAATTGGAGCTGACACTCAAGATTTCAGCTCAAGTGAATGACAACATTTCTGGTGTTCACATTGTATAAATTTATTCAGTATGTACTCTTTACCCTCCATTTTCTTTTCACTCCAGTCGAATGAAATACTAATAAAAACAAAGT]

[+] EMBL CA589077             [TTCGTTAGAGGACATCTCCGGGGCGTTTGTCAGTCAGGCTCTCGTTTCTGATTTTGATATATTTACATACAGAATATTTAACCTGTTCAATGCCACAGCTCTCGCTGTCAGATAAACGTGCTTTCGTGCAGCACGTTGAACGCAGCATGAATTCGATGACGCCCTGTCAAAGGTTTGGCATCTTAAAATTAATCTTATACTTTGTAAAAGAAGTGAGGTAGCTTCAGTGAAGCAATGAAAGGAGCAGATATAGAAGAGAAAAGTCAGGCAGACATTTTCAGACTGTAATATATTAAAAAAACAAAACATTGGAAAGGTTAAATGTTTACATAATACTTTATTTAATGTATCTGGCTTTTCTCCTTTTATTATCAAGCATTTAATATCGTCGATTTGAACTCTTAAATATGTAAATATACATTATGAACCTATATTTTTTCTTTTTTTTTGCTTCCACTGCATATTGTTTTATCTTACAATAGATACTGCTTAAAAAATGTATGGATCTGTAGCCGGTAGCAAGTAGGTTAAAAATAGTACGTGATGGTGAGAGATTAAACTAAATACCTGTGCCTAAACTTTGAGCTCATCATATCAGAACAGATTAAATGACC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CA332320             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTATCAAGCATTTAATATCGTCGATTTGAACTCTTAAATATGTAAATATACATTATGAACCTATATTTTTTCTTTTTTTTTGCTTCCACTGCATATTGTTTTATCTTACAATAGATACTGCTTAAAAAATGTATGGATCTGTAGCCGGTAGCAAGTAGGTTAAAAATAGTACGTGATGGTGAGAGATTAAACTAAATACCTGTGCCTAAACTTTGAGCTCATCATATCAGAACAGATTAAATGACCTGTCAGTAGCACAAAATAATCCTCCTAATTTTTCCACTTGTACTTTTTCCTTGTGCATGTTTTACGTACCAGGTGTTGTCATTCACAAAGACGTTCATAATTTATTCTGTGTACTGTATGTTGGGAAGTATTTACACTTAAGATACAGATACATTTTTGGCTTCTGCTTCACTTCTGATTTCTCCTTTTCTGGTTTGCTTGTATTAAGTGTGACGAGAATTGGAGCTGACACTCAAGATTTCAGCTCAAGTGAATGACAACATTTCTGGTGTTCACATTGTATAAATTTATTCAGTATGTACTCTTTACCCTCCATTTTCTTTTCACTCCAGTCGAATGAAATTCT              ]
[-] EMBL CA332246             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTATGAACCTATATTTTTTCTTTTTTTTTGCTTCCACTGCATATTGTTTTATCTTACAATAGATACTGCTTAAAAAATGTATGGATCTGTAGCCGGTAGCAAGTAGGTTAAAAATAGTACGTGATGGTGAGAGATTAAACTAAATACCTGTGCCTAAACTTTGAGCTCATCATATCAGAACAGATTAAATGACCTGTCAGTAGCACAAAATAATCCTCCTAATTTTTCCACTTGTACTTTTTCCTTGTGCATGTTTTACGTACCAGGTGTTGTCATTCACAAAGACGTTCATAATTTATTCTGTGTACTGTATGTTGGGAAGTATTTACACTTAAGATACAGATACATTTTTGGCTTCTGCTTCACTTCTGATTTCTCCTTTTCTGGTTTGCTTGTATTAAGTGTGACGAGAATTGGAGCTGACACTCAAGATTTCAGCTCAAGTGAATGACAACATTTCTGGTGTTCACATTGTATAAATTTATTCAGTATGTACTCTTTACCCTCCATTTTCTTTTCACTCCAGTCGAATGAAATACTAATAAAAACAAAGT]


>consensus_1478#0 TTCGTTAGAGGACATCTCCGGGGCGTTTGTCAGTCAGGCTCTCGTTTCTGATTTTGATAT ATTTACATACAGAATATTTAACCTGTTCAATGCCACAGCTCTCGCTGTCAGATAAACGTG CTTTCGTGCAGCACGTTGAACGCAGCATGAATTCGATGACGCCCTGTCAAAGGTTTGGCA TCTTAAAATTAATCTTATACTTTGTAAAAGAAGTGAGGTAGCTTCAGTGAAGCAATGAAA GGAGCAGATATAGAAGAGAAAAGTCAGGCAGACATTTTCAGACTGTAATATATTAAAAAA ACAAAACATTGGAAAGGTTAAATGTTTACATAATACTTTATTTAATGTATCTGGCTTTTC TCCTTTTATTATCAAGCATTTAATATCGTCGATTTGAACTCTTAAATATGTAAATATACA TTATGAACCTATATTTTTTCTTTTTTTTTGCTTCCACTGCATATTGTTTTATCTTACAAT AGATACTGCTTAAAAAATGTATGGATCTGTAGCCGGTAGCAAGTAGGTTAAAAATAGTAC GTGATGGTGAGAGATTAAACTAAATACCTGTGCCTAAACTTTGAGCTCATCATATCAGAA CAGATTAAATGACCTGTCAGTAGCACAAAATAATCCTCCTAATTTTTCCACTTGTACTTT TTCCTTGTGCATGTTTTACGTACCAGGTGTTGTCATTCACAAAGACGTTCATAATTTATT CTGTGTACTGTATGTTGGGAAGTATTTACACTTAAGATACAGATACATTTTTGGCTTCTG CTTCACTTCTGATTTCTCCTTTTCTGGTTTGCTTGTATTAAGTGTGACGAGAATTGGAGC TGACACTCAAGATTTCAGCTCAAGTGAATGACAACATTTCTGGTGTTCACATTGTATAAA TTTATTCAGTATGTACTCTTTACCCTCCATTTTCTTTTCACTCCAGTCGAATGAAATACT AATAAAAACAAAGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Sat Aug 9 00:50:02 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)