cluster # 1653

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Takifugu rubripes
cluster # 1653 cluster # 1653 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_1653#0 length = 656 sequences # 3

consensusID : consensus_1653#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 656
fasta sequence

                              [TTCCNCCTTATTTTTAAGGGGGTAGGAGATAAGATGGAGGGATTTTTACACTGCACCCTTCCTTATTCCGTTGTCCCTGTAATATCCTCCTCTAGAGGTGACACTTCAAGCAGTAATCATGTGCAAATCAAAGGGCACTCTGTGTTTTATACAATAAAGCGTAAAGTTGGAATTGTTGCAGGCTGTGTACAATAAAGCTTAAAAATACACATGGCCTTTTTTGGTCTTCTGTTGGGTTCTCTGAAAGGACTTTTTACCCATGACTCCTGCCCTATCTCTCTTACTCCCATCTCAACGTTCCTCAGTTAACGCCATCGTACACAAACATGCACGCACAAATGTAACCCCATGTTTCCCCCACTATTATCATTTCAGTTTCTTTATTTTCGAATTGGAGGTTCTGGACCAGATATTTAAGCAACTTATTTTTCTTAGTTTAACCTGTGTTTTTATTTTTTATTCTTTAGTTTGCTCTCCCCTCTTTCTTTCCCCCCTTTTGCTATTGTTAAATTAGAGGCTAACATCTTAAATGGCTATGGGACTGGCTTGGGCTCTGGGTGCGAGGAGAACCCACTCTTCTCGCACAAATCCTCTGTATATTGAATTACCTGAGAGGCTCATTGAGCTTTGTGTGTTGATTAAACTGTGTAATAAAA]

[+] EMBL CA847135             [TTCCNCCTTATTTTTAAGGGGGTAGGAGATAAGATGGAGGGATTTTTACACTGCACCCTTCCTTATTCCGTTGTCCCTGTAATATCCTCCTCTAGAGGTGACACTTCAAGCAGTAATCATGTGCAAATCAAAGGGCACTCTGTGTTTTATACAATAAAGCGTAAAGTTGGAATTGTTGCAGGCTGTGTACAATAAAGCTTAAAAATACACATGGCCTTTTTTGGTCTTCTGTTTGGTTCTCTGAAAGGACTTTTTACCCATGACTCCTGCCCTATCTCTCTTACTCCCATCTCAACGTTCCTCAGTTAACGCCATCGTACACAAACATGCACGCACAAATGTAACCCCATGTTTCCCCCACTATTATCATTTCAGTTTCTTTATTTTCGAATTGGAGGTTCTGGACCAGATATTTAAGCAACTTATTTTTCTTAGTTTAACCTGTGTTTTTATTTTTTATTCTTTAGTTTGCTCTCCCCTCTTTCTTTCCCCCCTTTTGCTATTGTTAAATTAGAGGCTAACATCTTAAATGGCTATGGGACT                                                                                                                 ]
[-] EMBL CA329629             [                                                                                                                                                                                                                             TGGTCTTCTGTTGGGTTCTCTGAAAGGACTTTTTACCCATGACTCCTGCCCTATCTCTCTTACTCCCATCTCAACGTTCCTCAGTTAACGCCATCGTACACACACATGCACGCACAAATGTAACCCCATGTTTCCCCCACTATTATCATTTCAGTTTCTTTATTTTCGAATTGGAGGTTCTGGACCAGATATTTAAGCAACTTATTTTTCTTAGTTTAACCGGTGTTTTTATTTTTTATTCTTTAGTTTGCTCTCCCCTCTTTCTTTCCCCCCTTTTGCTATTGTTAAATTAGAGGCTAACATCTTAAATGGCTATGGGACTGGCTTGGGCTCTGGGTGCGAGGAGAACCCACTCTTCTCGCACAAATCCTCTGTATATTGAATTACCTGAGAGGCTCATTGAGCTTTGTGTGTTGATTAACCTGTGTAATAAAA]
[+] EMBL CA329910             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GTAACCCCATGTTTCCCCCACTATTATCATTTCAGTTTCTTTATTTTCGAATTGGAGGTTCTGGACCAGATATTTAAGCAACTTATTTTTCTTAGTTTAACCTGTGTTTTTATTTTTTATTCTTTAGTTTGCTCTCCCCTCTTTCTTTCCCCCCTTTTGCTATTGTTAAATTAGAGGCTAACATCTTAAATGGCTATGGGACTGGCTTGGGCTCTGGGTGCGAGGAGAACCCACTCTTCTTGCACAAATCCTCTGTATATTGAATTACCTGAGAGGCTCATTGAGCTTTGTGTGTTGATTAAACTGTGT       ]




>consensus_1653#0
TTCCNCCTTATTTTTAAGGGGGTAGGAGATAAGATGGAGGGATTTTTACACTGCACCCTT
CCTTATTCCGTTGTCCCTGTAATATCCTCCTCTAGAGGTGACACTTCAAGCAGTAATCAT
GTGCAAATCAAAGGGCACTCTGTGTTTTATACAATAAAGCGTAAAGTTGGAATTGTTGCA
GGCTGTGTACAATAAAGCTTAAAAATACACATGGCCTTTTTTGGTCTTCTGTTGGGTTCT
CTGAAAGGACTTTTTACCCATGACTCCTGCCCTATCTCTCTTACTCCCATCTCAACGTTC
CTCAGTTAACGCCATCGTACACAAACATGCACGCACAAATGTAACCCCATGTTTCCCCCA
CTATTATCATTTCAGTTTCTTTATTTTCGAATTGGAGGTTCTGGACCAGATATTTAAGCA
ACTTATTTTTCTTAGTTTAACCTGTGTTTTTATTTTTTATTCTTTAGTTTGCTCTCCCCT
CTTTCTTTCCCCCCTTTTGCTATTGTTAAATTAGAGGCTAACATCTTAAATGGCTATGGG
ACTGGCTTGGGCTCTGGGTGCGAGGAGAACCCACTCTTCTCGCACAAATCCTCTGTATAT
TGAATTACCTGAGAGGCTCATTGAGCTTTGTGTGTTGATTAAACTGTGTAATAAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case

Data build on Sat Aug 9 00:50:02 CEST 2003 by Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr)