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Takifugu rubripes
cluster # 1799 cluster # 1799       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1799#0 length = 1077 sequences # 3  

consensusID : consensus_1799#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1077
fasta sequence
                              [TGTGCATGTGGGGGATCGGTCACCCCGGAGTCTAATCAGGAAGCTAGTTAGAGAGCTCTTCACAGCATGCGTAAAATGGTCGCAGGACGATAAAAACGTGTAGTGGTGTATAAAAAGCTAAACACACGCCTTTAAAGCGTGCCGACTGTTGTTTGTTCAGAACAACTATTAGGTTGTGAAGTGACGTATCTCTATCAGCTAGACTAGTTAACAAAACTAAAGTGGAGAGACAGGAGTATGTTTGCAACAGTTAAGATTCCTTTTCTCACTCTCCTTTAGAGCTCTCTGCTGCTTGCCTGACCACAAACGTTCTGGTCTGATGGAATCCTCCGGCAGTCGACAGCAGCAACGGTGTGTTTGCTGGAGTCCCTCGAGTGCAGTATCTCTCTCTGCTTGACAGTGCTTAAGAAATCAACACATATCGGTCTAGTATAAAGTAGAAGGCAATTAAAACCATCACAAAGTTGATAGTAAAACATAAATCAAAACGGATATATCTCTCTATGCTTATTGTACAAACACAGAAAAATAATATAGAAATAAAAGAAACTTAAAAAAAAAAAACAACAACTCCAGTGTTGACTTAGTGTATGTTTGTTTACAACAGGAAGTTAGTAGATATATGGCTGCAAAATTAAGTCCATGTAACTCAGTTTAGTGTAAAAAGAATCTTCCCTCAGTAGTAAGGTCTGGGTGTAGCGAGACGTGAGTCTGGGATCTGTCCGTGAGAGAAGCCTTGGTAGCCAGAAATCCAGCTTTGAAACTGTCAGGGAGTTGTAAATGTTGTTCTGTCGCTTAAATTGGTCAATAAACCCACAGTTCCTTCAAAGCACCCGATGTGCAAAACCCCGACACACACATGAATATCCAGGCAAGGTCCACACGGAGAGGAACGACCAGCCATAGTCCTTCAACCTTCCAGCTCAGTCCCCTTAATAAAATTATAAGGTGAAATACGCCTGCCTGATGAGCAAGCTGCTGCTTTTTCTGGTCTTCTCTCTCCAAGAAAGTGTTGGCATCAGACCTCCACACACACTCATACACACACACACACACACACACACACACACACGCGCA]

[-] EMBL FR0062831            [TGTGCATGTGGGGGATCGGTCACCCCGGAGTCTAATCAGGAAGCTAGTTAGAGAGCTCTTCACAGCATGCGTAAAATGGTCGCAGGACGATAAAAACGTGTAGTGGTGTATAAAAAGCTAAACACACGCCTTTAAAGCGTGCCGACTGTTGTTTGTTCAGAACAACTATTAGGTTGTGAAGTGACGTATCTCTATCAGCTAGACTAGTTAACAAAACTAAAGTGGAGAGACAGGAGTATGTTTGCAACAGTTAAGATTCCTTTTCTCACTCTCCTTTAGAGCTCTCTGCTGCTTGCCTGACCACAAACGTTCTGGTCTGATGGAATCCTCCGGCAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL BU806500             [                                                                                                                                          GTGCCGACTGTTGTTTGTTCAGAACAACTATTAGGTTGTGAAGTGACGTATCTCTATCAGCTAGACTAGTTAACAAAACTAAAGTGGAGAGACAGGAGTATGTTTGCAACAGTTAAGATTCCTTTTCTCACTCTCCTTTAGAGCTCTCTCCTGCTTGCCTGACCACAAACGTTCTGGTCTGATGGAATCCTCCGGCAGTCGACAGCAGCAACGGTGTGTTTGCTGGAGTCCCTCGAGTGCAGTATCTCTCTCTGCTTGACAGTGCTTAAGAAATCAACACATATCGGTCTAGTATAAAGTAGAAGGCAATTAAAACCATCACAAAGTTGATAGTAAAACATAAATCAAAACGGATATATCTCTCTATGCTTATTGTACAAACACAGAAAAATAATATAGAAATAAAAGAAACTTAAAAAAAAAAAACAACAACTCCAGTGTTGACTTAGTGTATGTTTGTTTACAACAGGAAGTTAGTAGATATATGGCTGCAAAATTAAGTCCATGTAACTCAGTTTAGTGTAAAAAGAATCTTCCCTCAGTAGTAAGGTCTGGGTGTAGCGAGACGTGAGTCTGGGATCTGTCCGTGAGAGAAGCCTTGGTAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CA329451             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TAGTGTATGTTTGTTTACAACAGGAAGTTAGTAGATATATGGCTGCAAAATTAAGTCCATGTAACTCAGTTTAGTGTAAAAAGAATCTTCCCTCAGTAGTAAGGTCTGGGTGTAGCGAGACGTGAGTCTGGGATCTGTCCGTGAGAGAAGCCTTGGTAGCCAGAAATCCAGCTTTGAAACTGTCAGGGAGTTGTAAATGTTGTTCTGTCGCTTAAATTGGTCAATAAACCCACAGTTCCTTCAAAGCACCCGATGTGCAAAACCCCGACACACACATGAATATCCAGGCAAGGTCCACACGGAGAGGAACGACCAGCCATAGTCCTTCAACCTTCCAGCTCAGTCCCCTTAATAAAATTATAAGGTGAAATACGCCTGCCTGATGAGCAAGCTGCTGCTTTTTCTGGTCTTCTCTCTCCAAGAAAGTGTTGGCATCAGACCTCCACACACACTCATACACACACACACACACACACACACACACACACGCGCA]


>consensus_1799#0 TGTGCATGTGGGGGATCGGTCACCCCGGAGTCTAATCAGGAAGCTAGTTAGAGAGCTCTT CACAGCATGCGTAAAATGGTCGCAGGACGATAAAAACGTGTAGTGGTGTATAAAAAGCTA AACACACGCCTTTAAAGCGTGCCGACTGTTGTTTGTTCAGAACAACTATTAGGTTGTGAA GTGACGTATCTCTATCAGCTAGACTAGTTAACAAAACTAAAGTGGAGAGACAGGAGTATG TTTGCAACAGTTAAGATTCCTTTTCTCACTCTCCTTTAGAGCTCTCTGCTGCTTGCCTGA CCACAAACGTTCTGGTCTGATGGAATCCTCCGGCAGTCGACAGCAGCAACGGTGTGTTTG CTGGAGTCCCTCGAGTGCAGTATCTCTCTCTGCTTGACAGTGCTTAAGAAATCAACACAT ATCGGTCTAGTATAAAGTAGAAGGCAATTAAAACCATCACAAAGTTGATAGTAAAACATA AATCAAAACGGATATATCTCTCTATGCTTATTGTACAAACACAGAAAAATAATATAGAAA TAAAAGAAACTTAAAAAAAAAAAACAACAACTCCAGTGTTGACTTAGTGTATGTTTGTTT ACAACAGGAAGTTAGTAGATATATGGCTGCAAAATTAAGTCCATGTAACTCAGTTTAGTG TAAAAAGAATCTTCCCTCAGTAGTAAGGTCTGGGTGTAGCGAGACGTGAGTCTGGGATCT GTCCGTGAGAGAAGCCTTGGTAGCCAGAAATCCAGCTTTGAAACTGTCAGGGAGTTGTAA ATGTTGTTCTGTCGCTTAAATTGGTCAATAAACCCACAGTTCCTTCAAAGCACCCGATGT GCAAAACCCCGACACACACATGAATATCCAGGCAAGGTCCACACGGAGAGGAACGACCAG CCATAGTCCTTCAACCTTCCAGCTCAGTCCCCTTAATAAAATTATAAGGTGAAATACGCC TGCCTGATGAGCAAGCTGCTGCTTTTTCTGGTCTTCTCTCTCCAAGAAAGTGTTGGCATC AGACCTCCACACACACTCATACACACACACACACACACACACACACACACACGCGCA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Sat Aug 9 00:50:02 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)