These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Takifugu rubripes see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_2002#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 610 fasta sequence [TCAATTAAATCCCAATTTATGGGCATAGTTATTAGCTTTAACAATAATCAGATACTGATTTATTGATGTTAATAGACAAATTGGGTTCTATTGTGTTGGAAAAACATTTTACATAATAATATATGGCTTTCTTTTGTATAATGAAACAAATGCTTTGAAAACAAACTTTTAAAAAGGATAATGCTTTTGTTGCACAAGTGAATTACTTAGAAATAAGCGCCTGCTTTTTATTTTTGACTGTGCAGTCCTACTGCTGCCATCGGAAGCTGTGCTTAAATACAGTAGGCCAGGAGTTACTTAATCTGATTAAAGTTCCAAAAGACCCTTA--------TGTGTGTGTGTGTGTGTTGTGATTGTTTATGTGCTGCAGAGTCTTTCAACTGGGTGCAAAACATTGGATCAGAGTGTTCCATTCAAGGTTTGGTTTGTATTCATGAATGCTCGACTGAGAGTTCTATTCCAATGTCCTGACTTCTTTTGTTGAGGTTCCTCTCTTCGAAAAACACACTTTTCAAGCAGGAAGTTGAAACTCTGCAATTTGCATGATTGTCCACTGACCACATATTCATTTAAATCACTGTAAGATGCTAAAATAAACTCCCACTTCAAATGT] [-] EMBL CA331721 [TCAATTAAATCCCAATTTATGGGCATAGTTATTAGCTTTAACAATAATCAGATACTGATTTATTGATGTTAATAGACAAATTGGGTTCTATTGTGTTGGAAAAACATTTTACATAATAATATATGGCTTTCTTTTGTATAATGAAACAAATGCTTTGAAAACAAACTTTTAAAAAGGATAATGCTTTTGTTGCACAAGTGAATTACTTAGAAATAAGCGCCTGCTTTTTATTTTTGACTGTGCAGTCCTACTGCTGCCATCGGAAGCTGTGCTTAAATACAGTAGGCCAGGAGTTACTTAATCTGATTAAAGTTCCAAAAGACCCTTA TGTGTGTGTGTGTGTGTTGTGATTGTTTATGTGCTGCAGAGTCTTTCAACTGGGTGCAAAACATTGGATCAGAGTGTTCCATTCAAGGTTTGGTTTGTATTCATGAATGCTCGACTGAGAGTTCTATTCCAATGTCCTGACTTCTTTTGTTGAGGTTCCTCTCTTCGAAAAACACACTTTTCAAGCAGGAAGTTGAAACTCTGCAATTTGCATGATTGTCCACTGACCACATATTCATTTAAATCACTGTAAGATGCTAAAATAAACTCCCACTT ] [-] EMBL CA333009 [ GATTTATTGATGTTAATAGACAAATTGGGTTCTATTGTGTTGGAAAAACATTTTACATAATAATATATGGCTTTCTTTTGTATAATGAAACAAATGCTTTGAAAACAAACTTTTAAAAAGGATAATGCTTTTGTTGCACAAGTGAATTACTTAGAAATAAGCGCCTGCTTTTTATTTTTGACTGTGCAGTCCTACTGCTGCCATCGGAAGCTGTGCTTAAATACAGTAGGCCAGGAGTTACTTAATCTGATTAAAGTTCCAAAAGACCCTTA TGTGTGTGTGTGTGTGTTGTGATTGTTTATGTGCTGCAGAGTCTTTCAACTGGGTGCAAAACATTGGATCAGAGTGTTCCATTCAAGGTTTGGTTCGTATTCATGAATGCTCGACTGAGAGTTCCATTCCAATGTCCTGACTTCTTTTGTTGAGGTTCCTCTCTTCGAAAAACACACTTTTCAAGCAGGAAGTTGAAACTCTGCAATTTGCATGATTGTCCACTGACCACATATTCATTTAAATCACTGTAAGATGCTAAAATAAACTCCCACTTCAAAT ] [-] EMBL CA331059 [ TTAAAAAGGATAATGCTTTTGTTGCACAAGTGAATTACTTAGAAATAAGCGCCTGCTTTTTATTTTTGACTGTGCAGTCCTACTGCTGCCATCGGAAGCTGTGCTTAAATACAGTAGGCCAGGAGTTACTTAATCTGATTAAAGTTCCAAAAGACCCTTA TGTGTGTGTGTGTGTGTTGTGATTGTTTATGTGCTGCAGAGTCTTTCAACTGGGTGCAAAACATTGGATCAGAGTGTTCCATTCAAGGTTTGGTTTGTATTCATGAATGCTCGACTGAGAGTTCTATTCCAATGTCCTGACTTCTTTTGTTGAGGTTCCTCTCTTCGAAAAACACACTTTTCAAGCAGGAAGTTGAAACTCTGCAATTTGCATGATTGTCCACTGACCACATATTCATTTAAATCACTGTAAGATGCTAAAATAAACTCCCACTTCAAATGT] [+] EMBL CA845019 [ TCGGAAGCTGTGCTTAAATACAGTAGGCCAGGAGTTACTTAATCTGATTAAAGTTCCAAAAGACCCTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGTGATTGTTTATGTGCTGCAGAGTCTTTCAACTGGGTGCAAAACATTGGATCAGAGTGTTCCATTCAAGGTTTGGTTTGTATTCATGAATGCTCGACTGAGAGTTCTATTCCAATGTCCTGACTTCTTTTGTTGAGGTTCCTCTCTTCGAAAAACACACTTTTCAAGCAGGAAGTTGAAACTCTGCAATTTGCATGATTGTCCACTGACCACATATTCATTTAAATCACTGTAAGATGCTAAAATAAACTCCCACTTCA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Data build on Sat Aug 9 00:50:02 CEST 2003 by Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) |